Doublet Group distance statistics: 48353

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 10, 12, 3, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.010, 0.017, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.013, 0.025, 0.037, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.012, 0.024, 0.037, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.024 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.028, 0.058, 0.087, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.058 std_dev=0.030
N4	A	0, 0.012, 0.054, 0.096, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.054 std_dev=0.042
N3	B	0, 0.181, 0.291, 0.401, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.291 std_dev=0.110
C2	B	0, 0.170, 0.283, 0.396, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.283 std_dev=0.113
C4	B	0, 0.140, 0.261, 0.381, 0.552 max_d=0.552 avg_d=0.261 std_dev=0.120
O4'	A	0, 0.008, 0.148, 0.289, 0.555 max_d=0.555 avg_d=0.148 std_dev=0.140
N1	B	0, 0.144, 0.287, 0.431, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.287 std_dev=0.144
N9	B	0, 0.144, 0.299, 0.453, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.299 std_dev=0.155
C2'	A	0, 0.018, 0.175, 0.332, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.175 std_dev=0.157
N2	B	0, 0.213, 0.373, 0.533, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.373 std_dev=0.160
C5	B	0, 0.178, 0.341, 0.503, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.341 std_dev=0.163
O2'	A	0, 0.077, 0.249, 0.422, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.249 std_dev=0.173
C1'	B	0, 0.203, 0.379, 0.555, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.379 std_dev=0.176
C6	B	0, 0.168, 0.360, 0.552, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.360 std_dev=0.192
C8	B	0, 0.205, 0.402, 0.599, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.402 std_dev=0.197
C4'	A	0, 0.034, 0.234, 0.435, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.234 std_dev=0.200
N7	B	0, 0.239, 0.460, 0.681, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.460 std_dev=0.221
O4'	B	0, 0.233, 0.456, 0.679, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.456 std_dev=0.223
C3'	A	0, 0.017, 0.262, 0.507, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.262 std_dev=0.245
C4'	B	0, 0.371, 0.659, 0.946, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.659 std_dev=0.287
C2'	B	0, 0.304, 0.593, 0.883, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.593 std_dev=0.289
O6	B	0, 0.180, 0.475, 0.769, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.475 std_dev=0.295
C3'	B	0, 0.439, 0.765, 1.090, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.765 std_dev=0.326
O3'	A	0, 0.046, 0.395, 0.745, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.395 std_dev=0.350
C5'	A	0, 0.080, 0.451, 0.822, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.451 std_dev=0.371
O2'	B	0, 0.399, 0.773, 1.146, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.773 std_dev=0.373
C5'	B	0, 0.472, 0.904, 1.337, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.904 std_dev=0.433
O3'	B	0, 0.567, 1.023, 1.479, 1.778 max_d=1.778 avg_d=1.023 std_dev=0.456
O5'	A	0, 0.102, 0.568, 1.034, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.568 std_dev=0.466
P	A	0, 0.282, 0.771, 1.259, 2.643 max_d=2.643 avg_d=0.771 std_dev=0.489
OP1	A	0, 0.306, 0.898, 1.489, 2.575 max_d=2.575 avg_d=0.898 std_dev=0.591
O5'	B	0, 1.268, 1.865, 2.463, 2.739 max_d=2.739 avg_d=1.865 std_dev=0.597
OP2	A	0, 0.226, 1.050, 1.874, 3.381 max_d=3.381 avg_d=1.050 std_dev=0.824
P	B	0, 2.184, 3.117, 4.051, 4.745 max_d=4.745 avg_d=3.117 std_dev=0.933
OP1	B	0, 2.451, 3.449, 4.447, 5.147 max_d=5.147 avg_d=3.449 std_dev=0.998
OP2	B	0, 4.259, 5.626, 6.994, 7.138 max_d=7.138 avg_d=5.626 std_dev=1.368

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.14	0.15	0.26	0.10
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.09	0.03	0.31	0.27	0.45	0.25
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.07	0.02	0.06	0.05	0.13	0.00	0.02	0.01	0.21	0.28	0.16	0.16
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.11	0.05	0.09	0.09	0.14	0.02	0.01	0.01	0.29	0.38	0.12	0.23
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.04	0.45	0.40	0.68	0.39
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.05	0.07	0.07	0.06	0.03	0.01	0.02	0.15	0.25	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.13	0.04	0.47	0.41	0.69	0.40
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.14	0.01	0.15	0.00	0.13	0.08	0.11	0.16	0.08	0.06	0.04	0.02	0.01	0.23	0.33	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.12	0.04	0.41	0.33	0.53	0.31
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.30	0.25	0.40	0.21
N3	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.10	0.03	0.39	0.34	0.58	0.33
N4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.02	0.16	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.06	0.12	0.04	0.49	0.45	0.78	0.44
O2	0.04	0.00	0.13	0.14	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.13	0.16	0.05	0.25	0.24	0.37	0.20
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.03	0.07	0.06	0.13	0.00	0.05	0.05	0.07	0.20	0.16	0.07
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.10	0.03	0.13	0.04	0.12	0.05	0.10	0.12	0.16	0.05	0.00	0.02	0.25	0.47	0.17	0.26
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.10	0.10	0.32	0.13
O5'	0.14	0.31	0.21	0.29	0.45	0.02	0.47	0.01	0.41	0.30	0.39	0.49	0.25	0.07	0.25	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.27	0.28	0.38	0.40	0.15	0.41	0.23	0.33	0.25	0.34	0.45	0.24	0.20	0.47	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.45	0.16	0.12	0.68	0.25	0.69	0.33	0.53	0.40	0.58	0.78	0.37	0.16	0.17	0.32	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.25	0.16	0.23	0.39	0.03	0.40	0.01	0.31	0.21	0.33	0.44	0.20	0.07	0.26	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.16	0.20	0.26	0.17	0.15	0.21	0.21	0.25	0.20	0.22	0.14	0.14	0.23	0.16	0.28	0.35	0.16	0.46	0.30	0.47	0.68	0.49
C2	0.15	0.14	0.19	0.25	0.17	0.16	0.22	0.22	0.25	0.20	0.21	0.13	0.14	0.23	0.17	0.27	0.32	0.16	0.49	0.30	0.49	0.72	0.52
C2'	0.20	0.18	0.27	0.29	0.18	0.20	0.19	0.20	0.21	0.19	0.20	0.20	0.19	0.20	0.19	0.32	0.37	0.21	0.41	0.24	0.39	0.60	0.42
C3'	0.24	0.20	0.28	0.29	0.20	0.23	0.20	0.22	0.21	0.21	0.19	0.22	0.22	0.21	0.22	0.34	0.36	0.26	0.44	0.24	0.41	0.64	0.46
C4	0.15	0.11	0.19	0.25	0.16	0.18	0.22	0.25	0.24	0.23	0.15	0.14	0.12	0.26	0.18	0.26	0.31	0.17	0.58	0.31	0.59	0.87	0.63
C4'	0.17	0.15	0.21	0.26	0.16	0.16	0.19	0.19	0.22	0.18	0.19	0.15	0.15	0.20	0.16	0.29	0.35	0.18	0.46	0.26	0.46	0.67	0.49
C5	0.15	0.12	0.19	0.26	0.17	0.17	0.22	0.25	0.24	0.23	0.16	0.13	0.12	0.26	0.18	0.26	0.32	0.17	0.58	0.30	0.60	0.88	0.64
C5'	0.19	0.16	0.19	0.24	0.18	0.16	0.20	0.20	0.21	0.20	0.18	0.16	0.17	0.22	0.18	0.28	0.32	0.21	0.49	0.26	0.48	0.73	0.53
C6	0.15	0.13	0.19	0.26	0.17	0.16	0.22	0.24	0.24	0.22	0.19	0.12	0.13	0.25	0.17	0.26	0.32	0.16	0.54	0.31	0.56	0.81	0.59
N1	0.14	0.14	0.19	0.25	0.17	0.15	0.22	0.22	0.25	0.20	0.20	0.13	0.14	0.24	0.17	0.27	0.33	0.16	0.50	0.30	0.50	0.74	0.54
N3	0.15	0.12	0.18	0.25	0.17	0.16	0.22	0.23	0.25	0.21	0.19	0.14	0.12	0.24	0.17	0.26	0.30	0.16	0.53	0.31	0.53	0.78	0.57
N4	0.17	0.11	0.19	0.26	0.16	0.20	0.22	0.28	0.21	0.25	0.12	0.16	0.12	0.27	0.19	0.25	0.32	0.19	0.62	0.30	0.65	0.95	0.69
O2	0.15	0.17	0.19	0.26	0.17	0.15	0.21	0.21	0.24	0.19	0.23	0.14	0.15	0.22	0.17	0.27	0.33	0.16	0.44	0.28	0.44	0.65	0.47
O2'	0.22	0.20	0.31	0.35	0.20	0.24	0.20	0.24	0.23	0.20	0.22	0.22	0.20	0.21	0.20	0.37	0.44	0.22	0.37	0.26	0.38	0.55	0.39
O3'	0.31	0.23	0.35	0.34	0.24	0.30	0.22	0.28	0.21	0.24	0.20	0.26	0.26	0.23	0.26	0.42	0.41	0.32	0.43	0.23	0.39	0.60	0.43
O4'	0.15	0.16	0.20	0.27	0.17	0.16	0.22	0.23	0.25	0.20	0.21	0.14	0.15	0.24	0.17	0.29	0.36	0.16	0.49	0.31	0.51	0.72	0.53
O5'	0.39	0.38	0.34	0.38	0.43	0.39	0.50	0.43	0.52	0.50	0.46	0.31	0.37	0.54	0.44	0.38	0.40	0.43	0.65	0.59	0.66	0.86	0.70
OP1	0.40	0.36	0.33	0.36	0.41	0.38	0.46	0.40	0.46	0.47	0.41	0.32	0.37	0.49	0.42	0.38	0.38	0.44	0.67	0.51	0.67	0.92	0.73
OP2	0.58	0.52	0.51	0.54	0.61	0.59	0.69	0.64	0.71	0.71	0.60	0.43	0.52	0.76	0.63	0.52	0.52	0.64	0.90	0.80	0.92	1.13	0.96
P	0.36	0.32	0.29	0.32	0.38	0.35	0.45	0.39	0.46	0.45	0.38	0.26	0.32	0.49	0.40	0.35	0.32	0.41	0.68	0.52	0.69	0.92	0.74

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.20	0.02	0.18	0.36	0.20
C2	0.03	0.00	0.15	0.19	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.23	0.24	0.04	0.40	0.01	0.38	0.60	0.41
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.08	0.03	0.06	0.07	0.09	0.07	0.12	0.18	0.15	0.06	0.03	0.00	0.03	0.01	0.23	0.08	0.26	0.29	0.17
C3'	0.02	0.19	0.01	0.00	0.13	0.00	0.13	0.03	0.15	0.15	0.18	0.22	0.17	0.14	0.09	0.02	0.01	0.02	0.32	0.16	0.38	0.31	0.25
C4	0.01	0.01	0.08	0.13	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.15	0.14	0.02	0.44	0.02	0.39	0.62	0.43
C4'	0.01	0.08	0.03	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.07	0.08	0.09	0.07	0.07	0.04	0.13	0.04	0.00	0.02	0.08	0.14	0.30	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.15	0.02	0.55	0.02	0.52	0.79	0.57
C5'	0.06	0.16	0.07	0.03	0.15	0.01	0.18	0.00	0.19	0.16	0.18	0.15	0.13	0.19	0.12	0.08	0.08	0.02	0.01	0.20	0.20	0.35	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.19	0.02	0.56	0.01	0.55	0.84	0.60
C8	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.17	0.04	0.56	0.03	0.50	0.75	0.55
N1	0.02	0.00	0.12	0.18	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.21	0.22	0.03	0.49	0.01	0.48	0.73	0.52
N2	0.04	0.01	0.18	0.22	0.02	0.09	0.02	0.15	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.26	0.29	0.05	0.35	0.02	0.34	0.54	0.36
N3	0.03	0.01	0.15	0.17	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.21	0.21	0.04	0.35	0.01	0.32	0.52	0.35
N7	0.01	0.02	0.06	0.14	0.01	0.07	0.01	0.19	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.10	0.17	0.04	0.61	0.03	0.59	0.89	0.65
N9	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.09	0.01	0.41	0.02	0.35	0.56	0.39
O2'	0.02	0.23	0.00	0.02	0.15	0.13	0.14	0.08	0.18	0.06	0.21	0.26	0.21	0.10	0.07	0.00	0.04	0.07	0.16	0.17	0.24	0.30	0.16
O3'	0.02	0.24	0.03	0.01	0.14	0.04	0.15	0.08	0.19	0.17	0.22	0.29	0.21	0.17	0.09	0.04	0.00	0.02	0.29	0.20	0.46	0.45	0.31
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.13	0.03	0.16	0.38	0.21
O5'	0.20	0.40	0.23	0.32	0.44	0.02	0.55	0.01	0.56	0.56	0.49	0.35	0.35	0.61	0.41	0.16	0.29	0.13	0.00	0.61	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.16	0.02	0.08	0.02	0.20	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.17	0.20	0.03	0.61	0.00	0.63	0.94	0.68
OP1	0.18	0.38	0.26	0.38	0.39	0.14	0.52	0.20	0.55	0.50	0.48	0.34	0.32	0.59	0.35	0.24	0.46	0.16	0.03	0.63	0.00	0.01	0.01
OP2	0.36	0.60	0.29	0.31	0.62	0.30	0.79	0.35	0.84	0.75	0.73	0.54	0.52	0.89	0.56	0.30	0.45	0.38	0.02	0.94	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.41	0.17	0.25	0.43	0.05	0.57	0.02	0.60	0.55	0.52	0.36	0.35	0.65	0.39	0.16	0.31	0.21	0.01	0.68	0.01	0.01	0.00