Doublet Group distance statistics: 48354

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 3, 5, 5, 4, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.009, 0.019, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.010, 0.024, 0.037, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.024 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.026, 0.055, 0.085, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.055 std_dev=0.029
N4	A	0, 0.024, 0.055, 0.085, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.055 std_dev=0.031
N3	B	0, 0.196, 0.363, 0.529, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.363 std_dev=0.167
C2	B	0, 0.180, 0.352, 0.524, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.352 std_dev=0.172
N1	B	0, 0.191, 0.372, 0.553, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.372 std_dev=0.181
N2	B	0, 0.218, 0.399, 0.581, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.399 std_dev=0.181
N9	B	0, 0.189, 0.377, 0.564, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.377 std_dev=0.188
C4	B	0, 0.150, 0.341, 0.532, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.341 std_dev=0.191
C1'	B	0, 0.235, 0.430, 0.625, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.430 std_dev=0.195
C5	B	0, 0.183, 0.386, 0.588, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.386 std_dev=0.202
C6	B	0, 0.213, 0.419, 0.625, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.419 std_dev=0.206
C8	B	0, 0.197, 0.409, 0.621, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.409 std_dev=0.212
N7	B	0, 0.218, 0.440, 0.663, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.440 std_dev=0.222
O4'	B	0, 0.216, 0.468, 0.719, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.468 std_dev=0.251
O6	B	0, 0.257, 0.513, 0.770, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.513 std_dev=0.257
C2'	B	0, 0.203, 0.465, 0.728, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.465 std_dev=0.262
C2'	A	0, 0.028, 0.300, 0.572, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.300 std_dev=0.272
C4'	B	0, 0.249, 0.520, 0.792, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.520 std_dev=0.272
O4'	A	0, 0.058, 0.330, 0.602, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.330 std_dev=0.272
C3'	B	0, 0.232, 0.535, 0.838, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.535 std_dev=0.303
O2'	B	0, 0.239, 0.565, 0.890, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.565 std_dev=0.325
C5'	B	0, 0.312, 0.676, 1.039, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.676 std_dev=0.363
O5'	A	0, 0.651, 1.046, 1.442, 1.986 max_d=1.986 avg_d=1.046 std_dev=0.395
O3'	B	0, 0.307, 0.714, 1.121, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.714 std_dev=0.407
O2'	A	0, -0.064, 0.368, 0.800, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.368 std_dev=0.432
C4'	A	0, 0.187, 0.660, 1.134, 2.024 max_d=2.024 avg_d=0.660 std_dev=0.473
O5'	B	0, 0.217, 0.721, 1.224, 2.300 max_d=2.300 avg_d=0.721 std_dev=0.503
C3'	A	0, 0.094, 0.615, 1.136, 2.064 max_d=2.064 avg_d=0.615 std_dev=0.521
C5'	A	0, 0.594, 1.140, 1.686, 2.622 max_d=2.622 avg_d=1.140 std_dev=0.546
OP1	A	0, 0.525, 1.117, 1.709, 2.561 max_d=2.561 avg_d=1.117 std_dev=0.592
P	A	0, 0.420, 1.027, 1.634, 3.055 max_d=3.055 avg_d=1.027 std_dev=0.607
P	B	0, 0.222, 0.950, 1.679, 3.644 max_d=3.644 avg_d=0.950 std_dev=0.729
OP2	A	0, 0.445, 1.227, 2.009, 4.110 max_d=4.110 avg_d=1.227 std_dev=0.782
O3'	A	0, 0.029, 0.873, 1.716, 3.206 max_d=3.206 avg_d=0.873 std_dev=0.843
OP1	B	0, 0.333, 1.186, 2.039, 3.767 max_d=3.767 avg_d=1.186 std_dev=0.853
OP2	B	0, 0.111, 1.095, 2.079, 4.511 max_d=4.511 avg_d=1.095 std_dev=0.984

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.20	0.01	0.19	0.18	0.24	0.15
C2	0.02	0.00	0.13	0.20	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.12	0.06	0.25	0.21	0.25	0.21
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.05	0.02	0.08	0.13	0.10	0.02	0.11	0.06	0.22	0.00	0.02	0.01	0.34	0.39	0.42	0.35
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.29	0.01	0.29	0.02	0.25	0.18	0.26	0.32	0.17	0.02	0.01	0.02	0.21	0.26	0.27	0.19
C4	0.02	0.01	0.05	0.29	0.00	0.12	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.23	0.18	0.03	0.35	0.33	0.35	0.32
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.12	0.00	0.15	0.00	0.14	0.08	0.09	0.13	0.07	0.23	0.03	0.01	0.02	0.13	0.21	0.04
C5	0.02	0.01	0.08	0.29	0.00	0.15	0.00	0.23	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.24	0.22	0.05	0.37	0.33	0.38	0.32
C5'	0.06	0.13	0.13	0.02	0.20	0.00	0.23	0.00	0.20	0.13	0.17	0.22	0.11	0.11	0.16	0.02	0.01	0.16	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.25	0.01	0.14	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	0.17	0.07	0.33	0.26	0.30	0.26
N1	0.01	0.01	0.02	0.18	0.01	0.08	0.02	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.14	0.07	0.02	0.25	0.20	0.24	0.19
N3	0.02	0.01	0.11	0.26	0.00	0.09	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.12	0.05	0.30	0.27	0.29	0.27
N4	0.02	0.01	0.06	0.32	0.01	0.13	0.01	0.22	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.25	0.22	0.04	0.38	0.38	0.40	0.36
O2	0.04	0.01	0.22	0.17	0.02	0.07	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.13	0.23	0.09	0.21	0.19	0.24	0.18
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.23	0.23	0.24	0.11	0.21	0.14	0.19	0.25	0.13	0.00	0.05	0.16	0.20	0.29	0.45	0.25
O3'	0.20	0.12	0.02	0.01	0.18	0.03	0.22	0.16	0.17	0.07	0.12	0.22	0.23	0.05	0.00	0.14	0.28	0.38	0.50	0.34
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.05	0.04	0.09	0.16	0.14	0.00	0.18	0.17	0.26	0.16
O5'	0.19	0.25	0.34	0.21	0.35	0.02	0.37	0.01	0.33	0.25	0.30	0.38	0.21	0.20	0.28	0.18	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.18	0.21	0.39	0.26	0.33	0.13	0.33	0.16	0.26	0.20	0.27	0.38	0.19	0.29	0.38	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.25	0.42	0.27	0.35	0.21	0.38	0.23	0.30	0.24	0.29	0.40	0.24	0.45	0.50	0.26	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.21	0.35	0.19	0.32	0.04	0.32	0.02	0.26	0.19	0.27	0.36	0.18	0.25	0.34	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.09	0.21	0.27	0.10	0.14	0.12	0.16	0.14	0.11	0.12	0.10	0.10	0.13	0.10	0.23	0.36	0.08	0.38	0.18	0.55	0.63	0.40
C2	0.08	0.08	0.18	0.24	0.09	0.12	0.12	0.15	0.14	0.11	0.12	0.10	0.08	0.13	0.09	0.20	0.32	0.08	0.39	0.18	0.56	0.64	0.42
C2'	0.28	0.25	0.37	0.38	0.24	0.31	0.20	0.28	0.18	0.22	0.20	0.29	0.27	0.20	0.25	0.42	0.46	0.27	0.39	0.17	0.51	0.54	0.36
C3'	0.29	0.27	0.34	0.35	0.29	0.31	0.29	0.30	0.29	0.30	0.28	0.27	0.28	0.30	0.29	0.36	0.40	0.30	0.40	0.30	0.53	0.58	0.39
C4	0.09	0.10	0.17	0.24	0.09	0.12	0.11	0.17	0.11	0.11	0.09	0.14	0.09	0.13	0.09	0.18	0.31	0.09	0.47	0.16	0.66	0.76	0.53
C4'	0.13	0.13	0.23	0.27	0.13	0.16	0.14	0.16	0.15	0.14	0.13	0.14	0.13	0.15	0.13	0.25	0.35	0.13	0.38	0.17	0.55	0.63	0.39
C5	0.09	0.09	0.17	0.24	0.09	0.12	0.11	0.17	0.11	0.11	0.09	0.12	0.09	0.13	0.09	0.18	0.32	0.09	0.47	0.15	0.68	0.77	0.54
C5'	0.18	0.18	0.25	0.29	0.18	0.20	0.20	0.20	0.21	0.20	0.19	0.18	0.18	0.21	0.19	0.27	0.37	0.18	0.42	0.23	0.59	0.69	0.45
C6	0.08	0.08	0.17	0.24	0.08	0.12	0.11	0.16	0.12	0.11	0.09	0.11	0.08	0.13	0.09	0.19	0.32	0.08	0.44	0.16	0.64	0.73	0.49
N1	0.08	0.08	0.19	0.25	0.09	0.12	0.11	0.16	0.13	0.11	0.10	0.10	0.09	0.13	0.09	0.20	0.33	0.08	0.40	0.17	0.58	0.66	0.43
N3	0.08	0.09	0.17	0.23	0.08	0.12	0.11	0.15	0.13	0.11	0.09	0.13	0.08	0.13	0.09	0.19	0.31	0.08	0.43	0.18	0.60	0.69	0.46
N4	0.12	0.13	0.17	0.24	0.11	0.14	0.12	0.18	0.12	0.13	0.12	0.16	0.12	0.14	0.11	0.19	0.31	0.11	0.52	0.15	0.72	0.82	0.59
O2	0.10	0.11	0.20	0.25	0.11	0.13	0.14	0.15	0.17	0.13	0.15	0.10	0.10	0.15	0.11	0.21	0.32	0.10	0.35	0.20	0.50	0.57	0.36
O2'	0.19	0.17	0.28	0.30	0.18	0.20	0.22	0.18	0.25	0.20	0.22	0.16	0.17	0.23	0.18	0.33	0.40	0.19	0.39	0.29	0.47	0.54	0.34
O3'	0.26	0.23	0.35	0.34	0.22	0.28	0.21	0.25	0.20	0.22	0.20	0.26	0.24	0.22	0.23	0.40	0.42	0.26	0.36	0.21	0.46	0.52	0.31
O4'	0.13	0.12	0.22	0.28	0.13	0.16	0.15	0.19	0.17	0.15	0.14	0.12	0.12	0.17	0.13	0.23	0.37	0.12	0.43	0.20	0.61	0.70	0.47
O5'	0.27	0.27	0.27	0.32	0.29	0.28	0.32	0.32	0.33	0.32	0.30	0.24	0.26	0.34	0.29	0.29	0.36	0.30	0.50	0.36	0.70	0.77	0.56
OP1	0.29	0.27	0.29	0.33	0.30	0.29	0.33	0.33	0.34	0.34	0.30	0.24	0.27	0.36	0.31	0.31	0.36	0.31	0.54	0.38	0.75	0.82	0.61
OP2	0.35	0.29	0.32	0.34	0.33	0.34	0.36	0.38	0.36	0.37	0.32	0.27	0.31	0.39	0.35	0.37	0.37	0.36	0.61	0.40	0.84	0.88	0.69
P	0.29	0.26	0.28	0.32	0.30	0.29	0.33	0.33	0.33	0.34	0.29	0.24	0.27	0.35	0.31	0.31	0.35	0.31	0.55	0.37	0.77	0.84	0.62

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.20	0.02	0.16	0.27	0.12
C2	0.04	0.00	0.15	0.18	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.24	0.06	0.36	0.01	0.45	0.49	0.32
C2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.08	0.02	0.07	0.02	0.08	0.09	0.11	0.18	0.15	0.08	0.03	0.01	0.04	0.01	0.18	0.08	0.20	0.22	0.11
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.14	0.01	0.16	0.02	0.18	0.16	0.18	0.21	0.17	0.18	0.10	0.03	0.01	0.02	0.20	0.19	0.28	0.22	0.17
C4	0.02	0.01	0.08	0.14	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.16	0.03	0.37	0.01	0.43	0.47	0.32
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.11	0.06	0.08	0.06	0.11	0.05	0.10	0.02	0.01	0.02	0.10	0.13	0.25	0.10
C5	0.01	0.01	0.07	0.16	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.20	0.03	0.45	0.02	0.57	0.62	0.45
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.09	0.01	0.14	0.00	0.14	0.16	0.11	0.07	0.06	0.18	0.09	0.09	0.04	0.02	0.01	0.17	0.25	0.27	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.18	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.23	0.04	0.46	0.01	0.62	0.67	0.48
C8	0.01	0.02	0.09	0.16	0.01	0.11	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.19	0.05	0.44	0.03	0.50	0.55	0.42
N1	0.03	0.00	0.11	0.18	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.24	0.04	0.42	0.01	0.55	0.60	0.41
N2	0.05	0.00	0.18	0.21	0.02	0.08	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.19	0.28	0.07	0.33	0.01	0.42	0.46	0.28
N3	0.04	0.01	0.15	0.17	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.21	0.05	0.32	0.01	0.38	0.42	0.26
N7	0.01	0.01	0.08	0.18	0.01	0.11	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.22	0.04	0.49	0.03	0.62	0.69	0.52
N9	0.01	0.02	0.03	0.10	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.11	0.01	0.35	0.02	0.36	0.41	0.28
O2'	0.02	0.15	0.01	0.03	0.07	0.10	0.06	0.09	0.08	0.06	0.11	0.19	0.14	0.06	0.03	0.00	0.07	0.07	0.06	0.07	0.20	0.23	0.17
O3'	0.03	0.24	0.04	0.01	0.16	0.02	0.20	0.04	0.23	0.19	0.24	0.28	0.21	0.22	0.11	0.07	0.00	0.02	0.20	0.26	0.36	0.32	0.25
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.07	0.05	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.17	0.05	0.14	0.31	0.17
O5'	0.20	0.36	0.18	0.20	0.37	0.02	0.45	0.01	0.46	0.44	0.42	0.33	0.32	0.49	0.35	0.06	0.20	0.17	0.00	0.49	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.19	0.01	0.10	0.02	0.17	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.07	0.26	0.05	0.49	0.00	0.69	0.76	0.55
OP1	0.16	0.45	0.20	0.28	0.43	0.13	0.57	0.25	0.62	0.50	0.55	0.42	0.38	0.62	0.36	0.20	0.36	0.14	0.02	0.69	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.49	0.22	0.22	0.47	0.25	0.62	0.27	0.67	0.55	0.60	0.46	0.42	0.69	0.41	0.23	0.32	0.31	0.02	0.76	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.32	0.11	0.17	0.32	0.10	0.45	0.02	0.48	0.42	0.41	0.28	0.26	0.52	0.28	0.17	0.25	0.17	0.01	0.55	0.01	0.01	0.00