Doublet Group distance statistics: 48355

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 7, 4, 5, 5, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, -0.001, 0.008, 0.017, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.008 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.009, 0.022, 0.034, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.011, 0.023, 0.036, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.008, 0.021, 0.035, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.008, 0.022, 0.035, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.022 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.021, 0.054, 0.087, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.054 std_dev=0.033
N4	A	0, 0.019, 0.063, 0.108, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.063 std_dev=0.044
C2	B	0, 0.099, 0.215, 0.330, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.215 std_dev=0.116
C4	B	0, 0.132, 0.275, 0.418, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.275 std_dev=0.143
N1	B	0, 0.139, 0.287, 0.435, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.287 std_dev=0.148
N3	B	0, 0.104, 0.257, 0.409, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.257 std_dev=0.153
N2	B	0, 0.204, 0.386, 0.567, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.386 std_dev=0.182
N9	B	0, 0.141, 0.346, 0.550, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.346 std_dev=0.205
O4'	A	0, 0.011, 0.216, 0.421, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.216 std_dev=0.205
C1'	B	0, 0.161, 0.377, 0.594, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.377 std_dev=0.216
C2'	A	0, 0.032, 0.252, 0.472, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.252 std_dev=0.220
C6	B	0, 0.242, 0.516, 0.791, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.516 std_dev=0.275
C5	B	0, 0.198, 0.483, 0.768, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.483 std_dev=0.285
C2'	B	0, 0.244, 0.545, 0.846, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.545 std_dev=0.301
C4'	A	0, 0.019, 0.354, 0.688, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.354 std_dev=0.334
O2'	B	0, 0.262, 0.597, 0.933, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.597 std_dev=0.335
O4'	B	0, 0.287, 0.628, 0.969, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.628 std_dev=0.341
C3'	A	0, 0.054, 0.407, 0.760, 1.835 max_d=1.835 avg_d=0.407 std_dev=0.353
O2'	A	0, -0.009, 0.358, 0.724, 1.894 max_d=1.894 avg_d=0.358 std_dev=0.366
C8	B	0, 0.192, 0.560, 0.929, 1.484 max_d=1.484 avg_d=0.560 std_dev=0.369
O6	B	0, 0.358, 0.739, 1.120, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.739 std_dev=0.381
C3'	B	0, 0.497, 0.903, 1.309, 1.931 max_d=1.931 avg_d=0.903 std_dev=0.406
N7	B	0, 0.279, 0.704, 1.128, 1.635 max_d=1.635 avg_d=0.704 std_dev=0.425
C4'	B	0, 0.481, 0.929, 1.378, 1.973 max_d=1.973 avg_d=0.929 std_dev=0.449
C5'	A	0, 0.084, 0.567, 1.049, 2.325 max_d=2.325 avg_d=0.567 std_dev=0.482
O3'	A	0, 0.116, 0.634, 1.151, 2.774 max_d=2.774 avg_d=0.634 std_dev=0.517
O3'	B	0, 0.626, 1.150, 1.675, 2.665 max_d=2.665 avg_d=1.150 std_dev=0.525
C5'	B	0, 0.669, 1.341, 2.012, 2.939 max_d=2.939 avg_d=1.341 std_dev=0.671
O5'	A	0, -0.178, 0.676, 1.529, 4.349 max_d=4.349 avg_d=0.676 std_dev=0.853
O5'	B	0, 0.582, 1.450, 2.319, 3.626 max_d=3.626 avg_d=1.450 std_dev=0.868
P	A	0, -0.340, 0.902, 2.144, 6.555 max_d=6.555 avg_d=0.902 std_dev=1.242
OP1	B	0, 1.273, 2.697, 4.120, 6.823 max_d=6.823 avg_d=2.697 std_dev=1.423
P	B	0, 1.007, 2.499, 3.991, 6.240 max_d=6.240 avg_d=2.499 std_dev=1.492
OP1	A	0, -0.515, 1.040, 2.594, 8.273 max_d=8.273 avg_d=1.040 std_dev=1.555
OP2	A	0, -0.576, 1.010, 2.596, 8.377 max_d=8.377 avg_d=1.010 std_dev=1.586
OP2	B	0, 1.635, 3.324, 5.013, 7.457 max_d=7.457 avg_d=3.324 std_dev=1.689

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.14	0.01	0.11	0.07	0.11	0.09
C2	0.01	0.00	0.12	0.16	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.05	0.21	0.14	0.30	0.24
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.01	0.09	0.07	0.11	0.03	0.10	0.07	0.21	0.00	0.02	0.01	0.12	0.19	0.14	0.10
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.20	0.01	0.19	0.03	0.16	0.12	0.19	0.21	0.17	0.02	0.01	0.01	0.20	0.29	0.16	0.13
C4	0.02	0.01	0.06	0.20	0.00	0.10	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.15	0.04	0.34	0.29	0.69	0.49
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.10	0.00	0.12	0.01	0.12	0.06	0.07	0.10	0.06	0.15	0.03	0.00	0.02	0.08	0.30	0.08
C5	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01	0.12	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.16	0.06	0.40	0.38	0.78	0.57
C5'	0.03	0.09	0.07	0.03	0.15	0.01	0.18	0.00	0.16	0.08	0.12	0.17	0.08	0.08	0.10	0.02	0.01	0.18	0.17	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.16	0.01	0.12	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.13	0.08	0.36	0.31	0.57	0.46
N1	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.07	0.03	0.23	0.15	0.29	0.26
N3	0.02	0.00	0.10	0.19	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.15	0.05	0.27	0.19	0.49	0.35
N4	0.02	0.01	0.07	0.21	0.00	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.18	0.04	0.36	0.34	0.81	0.55
O2	0.02	0.01	0.21	0.17	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.19	0.08	0.16	0.16	0.20	0.17
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.17	0.15	0.21	0.08	0.19	0.11	0.13	0.19	0.13	0.00	0.06	0.10	0.16	0.24	0.12	0.10
O3'	0.14	0.13	0.02	0.01	0.15	0.03	0.16	0.10	0.13	0.07	0.15	0.18	0.19	0.06	0.00	0.09	0.22	0.38	0.26	0.17
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.02	0.08	0.03	0.05	0.04	0.08	0.10	0.09	0.00	0.07	0.10	0.18	0.10
O5'	0.11	0.21	0.12	0.20	0.34	0.02	0.40	0.01	0.36	0.23	0.27	0.36	0.16	0.16	0.22	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.14	0.19	0.29	0.29	0.08	0.38	0.18	0.31	0.15	0.19	0.34	0.16	0.24	0.38	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.30	0.14	0.16	0.69	0.30	0.78	0.17	0.57	0.29	0.49	0.81	0.20	0.12	0.26	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.24	0.10	0.13	0.49	0.08	0.57	0.02	0.46	0.26	0.35	0.55	0.17	0.10	0.17	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.08	0.23	0.31	0.08	0.17	0.09	0.27	0.11	0.09	0.09	0.11	0.09	0.11	0.09	0.24	0.39	0.10	0.50	0.15	1.03	0.74	0.62
C2	0.08	0.08	0.19	0.27	0.07	0.15	0.08	0.25	0.10	0.08	0.07	0.12	0.08	0.09	0.07	0.20	0.34	0.08	0.48	0.15	1.01	0.71	0.60
C2'	0.26	0.23	0.34	0.38	0.21	0.28	0.17	0.31	0.16	0.19	0.17	0.27	0.25	0.16	0.22	0.37	0.45	0.25	0.44	0.16	0.94	0.62	0.53
C3'	0.23	0.20	0.29	0.33	0.21	0.24	0.20	0.28	0.20	0.21	0.19	0.20	0.21	0.21	0.22	0.30	0.40	0.24	0.42	0.22	0.95	0.63	0.53
C4	0.07	0.09	0.16	0.25	0.06	0.16	0.08	0.30	0.08	0.08	0.07	0.14	0.08	0.10	0.07	0.16	0.30	0.09	0.53	0.13	1.12	0.79	0.68
C4'	0.10	0.07	0.24	0.32	0.08	0.17	0.09	0.25	0.10	0.09	0.08	0.09	0.08	0.10	0.08	0.24	0.42	0.09	0.47	0.14	1.02	0.72	0.59
C5	0.07	0.09	0.17	0.26	0.06	0.17	0.08	0.30	0.08	0.09	0.06	0.13	0.08	0.11	0.07	0.18	0.32	0.09	0.55	0.13	1.15	0.82	0.70
C5'	0.14	0.12	0.26	0.33	0.12	0.20	0.13	0.27	0.13	0.13	0.11	0.13	0.12	0.14	0.13	0.27	0.43	0.13	0.47	0.16	1.05	0.74	0.60
C6	0.08	0.08	0.19	0.27	0.06	0.16	0.08	0.29	0.09	0.08	0.06	0.13	0.08	0.10	0.07	0.20	0.34	0.08	0.54	0.14	1.12	0.80	0.69
N1	0.09	0.08	0.20	0.29	0.07	0.16	0.08	0.27	0.10	0.08	0.07	0.12	0.08	0.10	0.07	0.21	0.36	0.08	0.51	0.14	1.06	0.75	0.64
N3	0.07	0.08	0.17	0.25	0.06	0.14	0.07	0.26	0.09	0.07	0.06	0.13	0.07	0.09	0.06	0.17	0.30	0.08	0.50	0.14	1.04	0.72	0.62
N4	0.09	0.10	0.16	0.24	0.08	0.18	0.08	0.32	0.07	0.10	0.09	0.14	0.09	0.11	0.08	0.15	0.29	0.11	0.55	0.11	1.14	0.81	0.70
O2	0.10	0.09	0.22	0.29	0.08	0.15	0.10	0.24	0.12	0.09	0.10	0.12	0.09	0.10	0.09	0.22	0.36	0.10	0.45	0.15	0.94	0.65	0.55
O2'	0.21	0.18	0.35	0.40	0.16	0.26	0.16	0.29	0.18	0.16	0.15	0.22	0.20	0.16	0.17	0.38	0.50	0.20	0.44	0.23	0.91	0.62	0.52
O3'	0.25	0.20	0.34	0.38	0.22	0.26	0.22	0.28	0.22	0.23	0.19	0.20	0.22	0.23	0.23	0.34	0.47	0.25	0.39	0.24	0.89	0.58	0.49
O4'	0.16	0.12	0.27	0.36	0.14	0.23	0.15	0.32	0.15	0.16	0.13	0.13	0.14	0.16	0.15	0.28	0.44	0.15	0.55	0.18	1.10	0.82	0.69
O5'	0.21	0.20	0.28	0.34	0.20	0.23	0.22	0.29	0.23	0.21	0.21	0.20	0.20	0.22	0.20	0.31	0.43	0.20	0.46	0.27	1.06	0.72	0.60
OP1	0.36	0.26	0.53	0.59	0.28	0.45	0.24	0.45	0.21	0.27	0.21	0.29	0.30	0.24	0.30	0.56	0.74	0.34	0.53	0.23	1.07	0.75	0.61
OP2	0.35	0.32	0.34	0.34	0.37	0.33	0.46	0.39	0.49	0.45	0.40	0.29	0.32	0.51	0.38	0.40	0.41	0.37	0.49	0.60	1.11	0.77	0.65
P	0.27	0.24	0.32	0.36	0.26	0.28	0.30	0.33	0.33	0.29	0.28	0.23	0.24	0.32	0.27	0.37	0.46	0.27	0.46	0.40	1.07	0.73	0.60

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.12	0.02	0.29	0.16	0.15
C2	0.03	0.00	0.18	0.24	0.01	0.12	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.29	0.05	0.38	0.01	0.76	0.53	0.44
C2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.09	0.01	0.06	0.03	0.08	0.11	0.13	0.23	0.19	0.09	0.03	0.01	0.02	0.01	0.17	0.07	0.28	0.24	0.18
C3'	0.01	0.24	0.01	0.00	0.13	0.01	0.11	0.03	0.14	0.14	0.20	0.30	0.23	0.12	0.06	0.02	0.01	0.02	0.21	0.13	0.33	0.31	0.23
C4	0.01	0.01	0.09	0.13	0.00	0.08	0.01	0.17	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.03	0.35	0.02	0.68	0.42	0.37
C4'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.10	0.08	0.11	0.13	0.10	0.09	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.11	0.16	0.20	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.41	0.01	0.84	0.54	0.47
C5'	0.04	0.19	0.03	0.03	0.17	0.01	0.21	0.00	0.23	0.18	0.22	0.20	0.16	0.21	0.13	0.05	0.04	0.01	0.01	0.24	0.25	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.10	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.17	0.04	0.44	0.01	0.94	0.63	0.53
C8	0.01	0.02	0.11	0.14	0.01	0.08	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.17	0.05	0.34	0.02	0.66	0.41	0.35
N1	0.03	0.00	0.13	0.20	0.02	0.11	0.01	0.22	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.24	0.04	0.43	0.01	0.88	0.60	0.51
N2	0.04	0.01	0.23	0.30	0.01	0.13	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.37	0.06	0.38	0.01	0.74	0.55	0.45
N3	0.03	0.01	0.19	0.23	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.26	0.05	0.33	0.01	0.64	0.44	0.37
N7	0.01	0.01	0.09	0.12	0.01	0.09	0.00	0.21	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.16	0.04	0.41	0.02	0.86	0.57	0.47
N9	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.27	0.02	0.53	0.30	0.27
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.07	0.06	0.06	0.05	0.08	0.06	0.11	0.18	0.14	0.07	0.03	0.00	0.04	0.05	0.07	0.08	0.19	0.21	0.09
O3'	0.01	0.29	0.02	0.01	0.14	0.02	0.12	0.04	0.17	0.17	0.24	0.37	0.26	0.16	0.06	0.04	0.00	0.02	0.20	0.17	0.49	0.44	0.29
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.09	0.04	0.24	0.24	0.21
O5'	0.12	0.38	0.17	0.21	0.35	0.01	0.41	0.01	0.44	0.34	0.43	0.38	0.33	0.41	0.27	0.07	0.20	0.09	0.00	0.47	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.02	0.11	0.01	0.24	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.17	0.04	0.47	0.00	1.03	0.70	0.59
OP1	0.29	0.76	0.28	0.33	0.68	0.16	0.84	0.25	0.94	0.66	0.88	0.74	0.64	0.86	0.53	0.19	0.49	0.24	0.02	1.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.53	0.24	0.31	0.42	0.20	0.54	0.30	0.63	0.41	0.60	0.55	0.44	0.57	0.30	0.21	0.44	0.24	0.02	0.70	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.44	0.18	0.23	0.37	0.06	0.47	0.02	0.53	0.35	0.51	0.45	0.37	0.47	0.27	0.09	0.29	0.21	0.00	0.59	0.01	0.01	0.00