Doublet Group distance statistics: 48358

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 6, 3, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C5	A	0, -0.003, 0.009, 0.021, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.009 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.001, 0.014, 0.026, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.003, 0.017, 0.032, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.017 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.012, 0.040, 0.068, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.040 std_dev=0.028
N4	A	0, 0.013, 0.044, 0.074, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.044 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.037, 0.131, 0.226, 0.363 max_d=0.363 avg_d=0.131 std_dev=0.094
C2'	A	0, 0.037, 0.155, 0.272, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.155 std_dev=0.118
O2'	A	0, 0.124, 0.245, 0.367, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.245 std_dev=0.122
C4'	A	0, 0.072, 0.217, 0.363, 0.610 max_d=0.610 avg_d=0.217 std_dev=0.145
C3'	A	0, 0.085, 0.246, 0.408, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.246 std_dev=0.162
C4	B	0, 0.159, 0.336, 0.513, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.336 std_dev=0.177
N1	B	0, 0.143, 0.323, 0.502, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.323 std_dev=0.180
N9	B	0, 0.219, 0.408, 0.598, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.408 std_dev=0.189
C2	B	0, 0.093, 0.283, 0.472, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.283 std_dev=0.190
N2	B	0, 0.180, 0.371, 0.561, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.371 std_dev=0.190
N3	B	0, 0.108, 0.302, 0.497, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.302 std_dev=0.194
C5	B	0, 0.150, 0.376, 0.602, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.376 std_dev=0.226
O3'	A	0, 0.122, 0.352, 0.581, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.352 std_dev=0.229
C6	B	0, 0.151, 0.381, 0.611, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.381 std_dev=0.230
C8	B	0, 0.258, 0.489, 0.720, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.489 std_dev=0.231
C1'	B	0, 0.221, 0.455, 0.689, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.455 std_dev=0.234
C5'	A	0, 0.153, 0.400, 0.646, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.400 std_dev=0.246
N7	B	0, 0.202, 0.477, 0.753, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.477 std_dev=0.276
O6	B	0, 0.180, 0.476, 0.771, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.476 std_dev=0.295
O4'	B	0, 0.278, 0.632, 0.985, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.632 std_dev=0.353
C2'	B	0, 0.122, 0.553, 0.983, 2.033 max_d=2.033 avg_d=0.553 std_dev=0.430
O5'	A	0, 0.084, 0.585, 1.086, 2.022 max_d=2.022 avg_d=0.585 std_dev=0.501
C3'	B	0, 0.143, 0.655, 1.166, 2.504 max_d=2.504 avg_d=0.655 std_dev=0.512
C4'	B	0, 0.191, 0.709, 1.228, 2.478 max_d=2.478 avg_d=0.709 std_dev=0.519
O2'	B	0, 0.147, 0.736, 1.325, 2.877 max_d=2.877 avg_d=0.736 std_dev=0.589
O3'	B	0, 0.141, 0.786, 1.431, 3.084 max_d=3.084 avg_d=0.786 std_dev=0.645
C5'	B	0, 0.143, 0.882, 1.620, 3.563 max_d=3.563 avg_d=0.882 std_dev=0.738
O5'	B	0, 0.127, 1.037, 1.947, 4.029 max_d=4.029 avg_d=1.037 std_dev=0.910
P	A	0, -0.077, 0.836, 1.749, 4.162 max_d=4.162 avg_d=0.836 std_dev=0.913
P	B	0, 0.195, 1.248, 2.301, 3.693 max_d=3.693 avg_d=1.248 std_dev=1.053
OP1	A	0, -0.074, 1.005, 2.083, 4.925 max_d=4.925 avg_d=1.005 std_dev=1.079
OP2	A	0, -0.188, 1.033, 2.254, 5.706 max_d=5.706 avg_d=1.033 std_dev=1.221
OP1	B	0, 0.114, 1.484, 2.853, 5.039 max_d=5.039 avg_d=1.484 std_dev=1.369
OP2	B	0, 0.114, 1.602, 3.089, 5.488 max_d=5.488 avg_d=1.602 std_dev=1.488

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.15	0.30	0.24	0.12
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.03	0.27	0.16	0.57	0.28
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.06	0.05	0.14	0.00	0.01	0.01	0.16	0.29	0.25	0.08
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.08	0.02	0.09	0.02	0.05	0.04	0.12	0.02	0.01	0.01	0.23	0.21	0.27	0.14
C4	0.02	0.02	0.04	0.03	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.05	0.03	0.42	0.34	0.92	0.56
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.07	0.04	0.02	0.00	0.02	0.32	0.12	0.12
C5	0.02	0.02	0.06	0.08	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.05	0.10	0.04	0.46	0.42	0.95	0.63
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.07	0.08	0.14	0.07	0.05	0.04	0.02	0.01	0.16	0.13	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.10	0.04	0.40	0.29	0.73	0.48
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.28	0.16	0.52	0.28
N3	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.35	0.19	0.75	0.42
N4	0.03	0.01	0.05	0.04	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.04	0.45	0.43	1.04	0.65
O2	0.05	0.01	0.14	0.12	0.02	0.07	0.03	0.07	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.14	0.15	0.05	0.19	0.29	0.41	0.17
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.04	0.05	0.05	0.05	0.02	0.07	0.06	0.14	0.00	0.03	0.03	0.08	0.53	0.17	0.21
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.02	0.10	0.04	0.10	0.02	0.06	0.06	0.15	0.03	0.00	0.02	0.26	0.32	0.28	0.21
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.00	0.15	0.33	0.14	0.17
O5'	0.15	0.27	0.16	0.23	0.42	0.02	0.46	0.01	0.40	0.28	0.35	0.45	0.19	0.08	0.26	0.15	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.30	0.16	0.29	0.21	0.34	0.32	0.42	0.16	0.29	0.16	0.19	0.43	0.29	0.53	0.32	0.33	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.24	0.57	0.25	0.27	0.92	0.12	0.95	0.13	0.73	0.52	0.75	1.04	0.41	0.17	0.28	0.14	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.28	0.08	0.14	0.56	0.12	0.63	0.01	0.48	0.28	0.42	0.65	0.17	0.21	0.21	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.16	0.32	0.25	0.16	0.23	0.19	0.36	0.21	0.17	0.19	0.17	0.15	0.20	0.15	0.34	0.20	0.33	0.47	0.26	0.68	0.92	0.57
C2	0.15	0.16	0.29	0.25	0.16	0.20	0.18	0.33	0.21	0.17	0.18	0.18	0.15	0.19	0.16	0.28	0.19	0.30	0.51	0.24	0.70	0.97	0.61
C2'	0.20	0.20	0.34	0.26	0.20	0.34	0.23	0.47	0.25	0.22	0.23	0.21	0.20	0.24	0.20	0.41	0.30	0.41	0.44	0.28	0.67	0.87	0.57
C3'	0.24	0.22	0.34	0.26	0.23	0.39	0.25	0.54	0.26	0.25	0.24	0.23	0.22	0.26	0.23	0.42	0.31	0.45	0.47	0.30	0.69	0.93	0.61
C4	0.14	0.14	0.22	0.24	0.15	0.18	0.18	0.33	0.20	0.18	0.15	0.19	0.14	0.21	0.15	0.20	0.20	0.26	0.57	0.25	0.78	1.14	0.72
C4'	0.18	0.17	0.32	0.23	0.18	0.30	0.21	0.44	0.23	0.20	0.20	0.18	0.17	0.23	0.18	0.36	0.22	0.38	0.47	0.27	0.68	0.94	0.60
C5	0.15	0.15	0.23	0.24	0.15	0.21	0.19	0.36	0.20	0.19	0.16	0.20	0.15	0.21	0.16	0.22	0.19	0.28	0.56	0.25	0.78	1.14	0.72
C5'	0.21	0.21	0.32	0.25	0.22	0.32	0.25	0.47	0.27	0.25	0.24	0.21	0.21	0.27	0.23	0.37	0.23	0.39	0.50	0.31	0.69	1.01	0.64
C6	0.15	0.16	0.26	0.24	0.16	0.22	0.19	0.37	0.21	0.18	0.17	0.20	0.16	0.21	0.16	0.26	0.19	0.30	0.53	0.25	0.74	1.06	0.67
N1	0.15	0.16	0.30	0.25	0.16	0.22	0.19	0.35	0.21	0.18	0.18	0.19	0.16	0.20	0.16	0.29	0.19	0.31	0.50	0.25	0.71	0.99	0.62
N3	0.14	0.15	0.26	0.26	0.15	0.18	0.19	0.32	0.21	0.18	0.17	0.18	0.14	0.20	0.15	0.23	0.19	0.26	0.55	0.25	0.75	1.05	0.67
N4	0.13	0.13	0.18	0.24	0.13	0.17	0.17	0.32	0.17	0.18	0.12	0.18	0.12	0.21	0.14	0.17	0.21	0.22	0.61	0.24	0.83	1.22	0.78
O2	0.16	0.16	0.33	0.26	0.16	0.20	0.18	0.31	0.20	0.17	0.18	0.17	0.16	0.18	0.16	0.32	0.20	0.31	0.48	0.22	0.65	0.87	0.54
O2'	0.19	0.19	0.36	0.27	0.19	0.33	0.22	0.45	0.24	0.20	0.23	0.19	0.18	0.22	0.19	0.44	0.32	0.41	0.40	0.28	0.65	0.80	0.52
O3'	0.28	0.25	0.36	0.30	0.26	0.47	0.27	0.62	0.28	0.28	0.26	0.26	0.25	0.29	0.27	0.47	0.39	0.51	0.48	0.31	0.71	0.90	0.63
O4'	0.14	0.16	0.32	0.25	0.16	0.22	0.19	0.36	0.21	0.17	0.18	0.17	0.15	0.20	0.15	0.33	0.20	0.32	0.49	0.25	0.70	0.96	0.60
O5'	0.41	0.40	0.38	0.35	0.41	0.46	0.43	0.59	0.43	0.43	0.41	0.40	0.41	0.44	0.42	0.41	0.31	0.54	0.65	0.45	0.56	1.03	0.67
OP1	0.30	0.26	0.37	0.30	0.29	0.37	0.34	0.52	0.35	0.35	0.29	0.26	0.27	0.38	0.31	0.45	0.31	0.43	0.57	0.42	0.70	1.09	0.70
OP2	0.84	0.79	0.75	0.77	0.87	0.87	0.93	0.98	0.94	0.95	0.86	0.71	0.80	0.98	0.88	0.70	0.70	0.93	1.05	1.00	0.64	1.32	0.99
P	0.46	0.44	0.42	0.40	0.49	0.50	0.54	0.63	0.55	0.55	0.49	0.39	0.44	0.58	0.50	0.42	0.33	0.59	0.73	0.61	0.56	1.13	0.75

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.02	0.14	0.01	0.21	0.03	0.37	0.51	0.26
C2	0.04	0.00	0.28	0.22	0.01	0.11	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.15	0.21	0.41	0.01	0.64	0.73	0.47
C2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.14	0.01	0.08	0.14	0.13	0.13	0.22	0.33	0.27	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.26	0.11	0.46	0.76	0.46
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.18	0.00	0.22	0.02	0.24	0.20	0.24	0.23	0.19	0.23	0.14	0.02	0.01	0.02	0.33	0.26	0.45	0.67	0.39
C4	0.02	0.01	0.14	0.18	0.00	0.06	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.11	0.45	0.02	0.61	0.72	0.47
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.09	0.14	0.09	0.14	0.10	0.13	0.06	0.16	0.01	0.00	0.01	0.10	0.26	0.39	0.13
C5	0.01	0.01	0.08	0.22	0.01	0.08	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.15	0.05	0.58	0.01	0.70	0.92	0.61
C5'	0.08	0.23	0.14	0.02	0.19	0.01	0.21	0.00	0.23	0.20	0.24	0.25	0.21	0.22	0.15	0.05	0.12	0.01	0.01	0.24	0.27	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.13	0.24	0.01	0.09	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.17	0.10	0.59	0.01	0.74	0.99	0.64
C8	0.01	0.01	0.13	0.20	0.00	0.14	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.18	0.12	0.61	0.01	0.60	0.82	0.57
N1	0.03	0.00	0.22	0.24	0.01	0.09	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.16	0.15	0.17	0.50	0.01	0.71	0.88	0.57
N2	0.05	0.01	0.33	0.23	0.01	0.14	0.02	0.25	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.35	0.20	0.25	0.35	0.02	0.63	0.68	0.43
N3	0.04	0.01	0.27	0.19	0.00	0.10	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.13	0.21	0.35	0.02	0.58	0.64	0.40
N7	0.01	0.01	0.07	0.23	0.01	0.13	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.20	0.06	0.66	0.01	0.71	1.01	0.68
N9	0.00	0.01	0.02	0.14	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.07	0.01	0.43	0.02	0.53	0.64	0.41
O2'	0.02	0.25	0.00	0.02	0.09	0.16	0.09	0.05	0.09	0.24	0.16	0.35	0.25	0.21	0.08	0.00	0.05	0.12	0.08	0.10	0.40	0.81	0.41
O3'	0.14	0.15	0.02	0.01	0.09	0.01	0.15	0.12	0.17	0.18	0.15	0.20	0.13	0.20	0.07	0.05	0.00	0.14	0.26	0.21	0.49	0.60	0.30
O4'	0.01	0.21	0.01	0.02	0.11	0.00	0.05	0.01	0.10	0.12	0.17	0.25	0.21	0.06	0.01	0.12	0.14	0.00	0.23	0.07	0.37	0.41	0.26
O5'	0.21	0.41	0.26	0.33	0.45	0.01	0.58	0.01	0.59	0.61	0.50	0.35	0.35	0.66	0.43	0.08	0.26	0.23	0.00	0.64	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.01	0.11	0.26	0.02	0.10	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.10	0.21	0.07	0.64	0.00	0.79	1.12	0.72
OP1	0.37	0.64	0.46	0.45	0.61	0.26	0.70	0.27	0.74	0.60	0.71	0.63	0.58	0.71	0.53	0.40	0.49	0.37	0.01	0.79	0.00	0.01	0.01
OP2	0.51	0.73	0.76	0.67	0.72	0.39	0.92	0.30	0.99	0.82	0.88	0.68	0.64	1.01	0.64	0.81	0.60	0.41	0.01	1.12	0.01	0.00	0.01
P	0.26	0.47	0.46	0.39	0.47	0.13	0.61	0.02	0.64	0.57	0.57	0.43	0.40	0.68	0.41	0.41	0.30	0.26	0.00	0.72	0.01	0.01	0.00