Doublet Group distance statistics: 48362

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 5, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.001, 0.010, 0.018, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C5	A	0, -0.001, 0.009, 0.018, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.009 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.002, 0.012, 0.023, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.018 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.008, 0.028, 0.049, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.028 std_dev=0.020
N4	A	0, 0.012, 0.039, 0.065, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.039 std_dev=0.026
C2'	A	0, 0.039, 0.093, 0.147, 0.185 max_d=0.185 avg_d=0.093 std_dev=0.054
O4'	A	0, 0.030, 0.092, 0.154, 0.192 max_d=0.192 avg_d=0.092 std_dev=0.062
O2'	A	0, 0.047, 0.129, 0.211, 0.233 max_d=0.233 avg_d=0.129 std_dev=0.082
C3'	A	0, 0.068, 0.171, 0.274, 0.371 max_d=0.371 avg_d=0.171 std_dev=0.103
C4'	A	0, 0.044, 0.155, 0.266, 0.368 max_d=0.368 avg_d=0.155 std_dev=0.111
C4	B	0, 0.180, 0.317, 0.455, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.317 std_dev=0.137
C5	B	0, 0.225, 0.366, 0.506, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.366 std_dev=0.141
N9	B	0, 0.205, 0.348, 0.491, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.348 std_dev=0.143
C6	B	0, 0.234, 0.381, 0.527, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.381 std_dev=0.147
C1'	B	0, 0.217, 0.373, 0.529, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.373 std_dev=0.156
N3	B	0, 0.153, 0.313, 0.474, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.313 std_dev=0.161
O5'	A	0, 0.118, 0.280, 0.442, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.280 std_dev=0.162
N1	B	0, 0.190, 0.357, 0.524, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.357 std_dev=0.167
O3'	A	0, 0.118, 0.292, 0.467, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.292 std_dev=0.175
C8	B	0, 0.241, 0.419, 0.596, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.419 std_dev=0.177
C5'	A	0, 0.051, 0.229, 0.407, 0.552 max_d=0.552 avg_d=0.229 std_dev=0.178
O6	B	0, 0.263, 0.442, 0.621, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.442 std_dev=0.179
N7	B	0, 0.247, 0.431, 0.616, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.431 std_dev=0.184
C2	B	0, 0.140, 0.330, 0.520, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.330 std_dev=0.190
P	A	0, 0.156, 0.402, 0.648, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.402 std_dev=0.246
N2	B	0, 0.142, 0.392, 0.643, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.392 std_dev=0.250
O4'	B	0, 0.231, 0.495, 0.758, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.495 std_dev=0.264
C2'	B	0, 0.181, 0.460, 0.739, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.460 std_dev=0.279
OP1	A	0, 0.231, 0.512, 0.794, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.512 std_dev=0.282
OP2	A	0, 0.137, 0.469, 0.801, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.469 std_dev=0.332
C4'	B	0, 0.223, 0.561, 0.900, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.561 std_dev=0.338
C3'	B	0, 0.252, 0.590, 0.929, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.590 std_dev=0.338
O2'	B	0, 0.248, 0.661, 1.073, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.661 std_dev=0.412
O3'	B	0, 0.345, 0.821, 1.297, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.821 std_dev=0.476
C5'	B	0, 0.236, 0.877, 1.518, 2.085 max_d=2.085 avg_d=0.877 std_dev=0.641
O5'	B	0, 0.245, 1.019, 1.794, 2.488 max_d=2.488 avg_d=1.019 std_dev=0.775
OP2	B	0, 0.249, 1.377, 2.505, 3.316 max_d=3.316 avg_d=1.377 std_dev=1.128
P	B	0, 0.149, 1.301, 2.454, 4.001 max_d=4.001 avg_d=1.301 std_dev=1.153
OP1	B	0, 0.032, 1.491, 2.950, 5.330 max_d=5.330 avg_d=1.491 std_dev=1.459

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.06	0.11	0.06
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.09	0.04	0.09	0.10	0.18	0.13
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.01	0.04	0.03	0.06	0.06	0.07	0.00	0.02	0.02	0.04	0.09	0.10	0.06
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.10	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.09	0.11	0.07	0.02	0.01	0.01	0.06	0.11	0.10	0.07
C4	0.03	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.12	0.06	0.16	0.21	0.27	0.21
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.04	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.08	0.06	0.03
C5	0.03	0.01	0.05	0.09	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.07	0.17	0.22	0.28	0.22
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.11	0.01	0.13	0.00	0.11	0.05	0.08	0.13	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.08	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.07	0.14	0.16	0.20	0.17
N1	0.02	0.01	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.09	0.09	0.16	0.11
N3	0.02	0.00	0.06	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.04	0.12	0.15	0.23	0.17
N4	0.04	0.01	0.06	0.11	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.14	0.07	0.18	0.27	0.32	0.26
O2	0.04	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.09	0.04	0.07	0.08	0.16	0.11
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.06	0.04	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.07	0.09	0.00	0.06	0.04	0.03	0.10	0.09	0.04
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.12	0.02	0.11	0.02	0.08	0.05	0.11	0.14	0.09	0.06	0.00	0.01	0.09	0.16	0.13	0.10
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.07	0.04	0.04	0.01	0.00	0.06	0.06	0.13	0.08
O5'	0.05	0.09	0.04	0.06	0.16	0.02	0.17	0.01	0.14	0.09	0.12	0.18	0.07	0.03	0.09	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.10	0.09	0.11	0.21	0.08	0.22	0.07	0.16	0.09	0.15	0.27	0.08	0.10	0.16	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.18	0.10	0.10	0.27	0.06	0.28	0.03	0.20	0.16	0.23	0.32	0.16	0.09	0.13	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.13	0.06	0.07	0.21	0.03	0.22	0.01	0.17	0.11	0.17	0.26	0.11	0.04	0.10	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.12	0.10	0.20	0.13	0.13	0.18	0.29	0.20	0.16	0.17	0.13	0.12	0.19	0.13	0.22	0.20	0.13	0.59	0.25	1.24	0.42	0.73
C2	0.12	0.11	0.10	0.19	0.13	0.14	0.17	0.30	0.20	0.16	0.15	0.13	0.11	0.19	0.14	0.20	0.17	0.13	0.60	0.24	1.22	0.42	0.72
C2'	0.13	0.13	0.09	0.19	0.15	0.11	0.18	0.23	0.21	0.17	0.18	0.13	0.13	0.20	0.14	0.18	0.21	0.14	0.49	0.25	1.09	0.37	0.60
C3'	0.12	0.12	0.09	0.19	0.13	0.10	0.17	0.24	0.19	0.16	0.16	0.13	0.12	0.19	0.13	0.16	0.20	0.13	0.48	0.24	1.11	0.38	0.60
C4	0.15	0.12	0.13	0.19	0.16	0.20	0.20	0.37	0.20	0.21	0.14	0.14	0.13	0.24	0.17	0.18	0.15	0.18	0.63	0.26	1.28	0.50	0.74
C4'	0.12	0.12	0.10	0.20	0.13	0.12	0.18	0.28	0.20	0.16	0.16	0.13	0.12	0.19	0.13	0.21	0.21	0.12	0.57	0.26	1.25	0.41	0.72
C5	0.15	0.12	0.12	0.19	0.16	0.19	0.20	0.37	0.20	0.21	0.14	0.13	0.12	0.24	0.17	0.18	0.15	0.18	0.63	0.26	1.31	0.50	0.76
C5'	0.11	0.11	0.09	0.20	0.14	0.13	0.19	0.30	0.22	0.18	0.16	0.12	0.11	0.22	0.14	0.20	0.20	0.12	0.60	0.28	1.31	0.45	0.76
C6	0.13	0.11	0.11	0.19	0.14	0.16	0.19	0.34	0.20	0.19	0.15	0.13	0.12	0.22	0.15	0.19	0.16	0.15	0.62	0.26	1.30	0.47	0.75
N1	0.12	0.11	0.10	0.19	0.14	0.14	0.18	0.31	0.20	0.17	0.15	0.12	0.11	0.20	0.14	0.20	0.17	0.13	0.60	0.25	1.26	0.43	0.74
N3	0.14	0.12	0.12	0.19	0.15	0.18	0.19	0.34	0.21	0.19	0.15	0.13	0.12	0.22	0.16	0.18	0.16	0.16	0.61	0.25	1.23	0.45	0.72
N4	0.18	0.14	0.15	0.20	0.18	0.23	0.21	0.41	0.19	0.24	0.14	0.16	0.15	0.25	0.20	0.18	0.16	0.22	0.64	0.24	1.27	0.54	0.75
O2	0.12	0.10	0.09	0.19	0.11	0.12	0.14	0.27	0.17	0.13	0.14	0.12	0.10	0.15	0.11	0.21	0.19	0.11	0.57	0.20	1.16	0.38	0.69
O2'	0.19	0.18	0.13	0.22	0.18	0.15	0.21	0.23	0.23	0.19	0.21	0.17	0.18	0.21	0.18	0.23	0.24	0.19	0.49	0.26	1.06	0.36	0.61
O3'	0.17	0.15	0.11	0.20	0.17	0.12	0.20	0.22	0.21	0.19	0.18	0.15	0.15	0.21	0.17	0.16	0.21	0.18	0.43	0.25	1.02	0.37	0.53
O4'	0.13	0.13	0.11	0.21	0.15	0.15	0.19	0.32	0.22	0.18	0.17	0.13	0.13	0.21	0.14	0.24	0.21	0.13	0.63	0.28	1.33	0.46	0.80
O5'	0.13	0.13	0.12	0.22	0.18	0.17	0.24	0.34	0.26	0.24	0.19	0.11	0.12	0.28	0.18	0.17	0.21	0.16	0.62	0.32	1.34	0.47	0.77
OP1	0.15	0.13	0.14	0.24	0.20	0.20	0.27	0.37	0.29	0.28	0.21	0.11	0.13	0.32	0.21	0.16	0.22	0.19	0.61	0.36	1.34	0.52	0.77
OP2	0.22	0.17	0.22	0.33	0.25	0.31	0.32	0.50	0.32	0.34	0.24	0.14	0.18	0.38	0.27	0.14	0.30	0.26	0.64	0.39	1.38	0.61	0.82
P	0.17	0.15	0.16	0.27	0.21	0.23	0.27	0.42	0.29	0.28	0.21	0.12	0.15	0.32	0.22	0.16	0.24	0.20	0.64	0.35	1.39	0.55	0.82

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.18	0.01	0.25	0.23	0.15
C2	0.03	0.00	0.08	0.18	0.01	0.09	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.18	0.02	0.45	0.01	0.89	0.31	0.50
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.08	0.05	0.11	0.09	0.08	0.03	0.00	0.02	0.01	0.22	0.04	0.29	0.34	0.26
C3'	0.02	0.18	0.00	0.00	0.11	0.00	0.09	0.02	0.12	0.11	0.16	0.21	0.17	0.10	0.05	0.02	0.00	0.03	0.28	0.11	0.31	0.42	0.30
C4	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.08	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.09	0.01	0.41	0.01	0.74	0.28	0.42
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.11	0.11	0.10	0.08	0.07	0.12	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.12	0.15	0.34	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.11	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.08	0.03	0.48	0.01	0.90	0.35	0.50
C5'	0.05	0.22	0.02	0.02	0.21	0.01	0.28	0.00	0.30	0.25	0.27	0.20	0.18	0.30	0.18	0.05	0.04	0.02	0.01	0.33	0.27	0.41	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.11	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.03	0.51	0.00	1.04	0.37	0.57
C8	0.02	0.01	0.08	0.11	0.00	0.11	0.01	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.13	0.06	0.41	0.01	0.62	0.36	0.37
N1	0.02	0.00	0.05	0.16	0.01	0.10	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.02	0.50	0.01	1.02	0.34	0.56
N2	0.03	0.00	0.11	0.21	0.01	0.08	0.02	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.23	0.03	0.44	0.02	0.89	0.32	0.51
N3	0.03	0.00	0.09	0.17	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.17	0.02	0.40	0.01	0.74	0.28	0.42
N7	0.01	0.01	0.08	0.10	0.00	0.12	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.05	0.47	0.01	0.85	0.42	0.47
N9	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.02	0.35	0.01	0.54	0.26	0.31
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.07	0.05	0.08	0.05	0.09	0.05	0.10	0.12	0.09	0.07	0.04	0.00	0.04	0.05	0.06	0.10	0.14	0.36	0.15
O3'	0.02	0.18	0.02	0.00	0.09	0.02	0.08	0.04	0.10	0.13	0.15	0.23	0.17	0.12	0.05	0.04	0.00	0.02	0.22	0.10	0.32	0.54	0.29
O4'	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.06	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.08	0.04	0.08	0.25	0.10
O5'	0.18	0.45	0.22	0.28	0.41	0.01	0.48	0.01	0.51	0.41	0.50	0.44	0.40	0.47	0.35	0.06	0.22	0.08	0.00	0.53	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.12	0.01	0.33	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.04	0.53	0.00	1.13	0.42	0.61
OP1	0.25	0.89	0.29	0.31	0.74	0.15	0.90	0.27	1.04	0.62	1.02	0.89	0.74	0.85	0.54	0.14	0.32	0.08	0.02	1.13	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.31	0.34	0.42	0.28	0.34	0.35	0.41	0.37	0.36	0.34	0.32	0.28	0.42	0.26	0.36	0.54	0.25	0.02	0.42	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.50	0.26	0.30	0.42	0.05	0.50	0.01	0.57	0.37	0.56	0.51	0.42	0.47	0.31	0.15	0.29	0.10	0.00	0.61	0.00	0.01	0.00