Doublet Group distance statistics: 48363

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.010, 0.019, 0.027, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.013, 0.025, 0.037, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.011, 0.026, 0.042, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.026 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.021, 0.045, 0.070, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.045 std_dev=0.025
O2	A	0, 0.022, 0.062, 0.101, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.062 std_dev=0.039
C2	B	0, 0.271, 0.443, 0.614, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.443 std_dev=0.171
C4	B	0, 0.246, 0.432, 0.618, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.432 std_dev=0.186
N3	B	0, 0.284, 0.478, 0.673, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.478 std_dev=0.195
N9	B	0, 0.263, 0.482, 0.701, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.482 std_dev=0.219
N2	B	0, 0.313, 0.562, 0.811, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.562 std_dev=0.249
N1	B	0, 0.292, 0.563, 0.834, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.563 std_dev=0.271
C1'	B	0, 0.387, 0.660, 0.933, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.660 std_dev=0.273
C5	B	0, 0.359, 0.657, 0.954, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.657 std_dev=0.298
O4'	B	0, 0.359, 0.690, 1.022, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.690 std_dev=0.331
C8	B	0, 0.307, 0.642, 0.978, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.642 std_dev=0.335
C6	B	0, 0.453, 0.791, 1.129, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.791 std_dev=0.338
O4'	A	0, -0.009, 0.371, 0.750, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.371 std_dev=0.380
C2'	B	0, 0.486, 0.890, 1.293, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.890 std_dev=0.404
N7	B	0, 0.433, 0.843, 1.252, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.843 std_dev=0.409
C2'	A	0, 0.037, 0.451, 0.865, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.451 std_dev=0.414
O6	B	0, 0.655, 1.115, 1.575, 1.583 max_d=1.583 avg_d=1.115 std_dev=0.460
P	A	0, 0.522, 0.996, 1.469, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.996 std_dev=0.474
O2'	B	0, 0.575, 1.073, 1.571, 1.614 max_d=1.614 avg_d=1.073 std_dev=0.498
C3'	B	0, 0.467, 0.978, 1.488, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.978 std_dev=0.510
C4'	B	0, 0.391, 0.904, 1.417, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.904 std_dev=0.513
C3'	A	0, 0.153, 0.683, 1.213, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.683 std_dev=0.530
C4'	A	0, 0.060, 0.598, 1.137, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.598 std_dev=0.538
O5'	A	0, 0.428, 0.979, 1.531, 1.874 max_d=1.874 avg_d=0.979 std_dev=0.552
OP2	A	0, 0.522, 1.078, 1.633, 2.150 max_d=2.150 avg_d=1.078 std_dev=0.556
C5'	B	0, 0.345, 0.978, 1.611, 2.062 max_d=2.062 avg_d=0.978 std_dev=0.633
O3'	B	0, 0.512, 1.176, 1.841, 2.331 max_d=2.331 avg_d=1.176 std_dev=0.664
C5'	A	0, 0.228, 0.901, 1.574, 2.152 max_d=2.152 avg_d=0.901 std_dev=0.673
OP1	A	0, 0.527, 1.217, 1.908, 2.366 max_d=2.366 avg_d=1.217 std_dev=0.690
O2'	A	0, 0.053, 0.752, 1.452, 2.020 max_d=2.020 avg_d=0.752 std_dev=0.699
O3'	A	0, 0.282, 1.045, 1.809, 2.390 max_d=2.390 avg_d=1.045 std_dev=0.764
O5'	B	0, 0.572, 1.408, 2.243, 2.802 max_d=2.802 avg_d=1.408 std_dev=0.836
OP2	B	0, 1.250, 2.134, 3.018, 3.320 max_d=3.320 avg_d=2.134 std_dev=0.884
P	B	0, 0.737, 1.772, 2.807, 3.377 max_d=3.377 avg_d=1.772 std_dev=1.035
OP1	B	0, 0.803, 2.162, 3.521, 4.590 max_d=4.590 avg_d=2.162 std_dev=1.359

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.02	0.01	0.03	0.02	0.07	0.02	0.26	0.00	0.18	0.26	0.25	0.20
C2	0.03	0.00	0.19	0.27	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.13	0.14	0.09	0.10	0.13	0.33	0.20
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.07	0.02	0.12	0.18	0.16	0.04	0.15	0.07	0.33	0.00	0.02	0.02	0.41	0.61	0.57	0.48
C3'	0.02	0.27	0.00	0.00	0.35	0.01	0.33	0.05	0.27	0.22	0.34	0.38	0.25	0.02	0.01	0.02	0.05	0.38	0.14	0.13
C4	0.02	0.01	0.07	0.35	0.00	0.12	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.29	0.23	0.05	0.12	0.24	0.44	0.26
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.12	0.00	0.14	0.01	0.13	0.08	0.09	0.12	0.10	0.27	0.03	0.00	0.03	0.22	0.09	0.07
C5	0.02	0.01	0.12	0.33	0.01	0.14	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.33	0.25	0.06	0.13	0.24	0.44	0.26
C5'	0.07	0.09	0.18	0.05	0.13	0.01	0.16	0.00	0.14	0.08	0.10	0.14	0.11	0.11	0.21	0.01	0.01	0.18	0.03	0.04
C6	0.02	0.01	0.16	0.27	0.01	0.13	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.29	0.18	0.07	0.10	0.14	0.35	0.21
N1	0.01	0.01	0.04	0.22	0.01	0.08	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.18	0.10	0.03	0.10	0.13	0.30	0.18
N3	0.03	0.01	0.15	0.34	0.01	0.09	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.20	0.18	0.08	0.10	0.17	0.39	0.23
N4	0.02	0.02	0.07	0.38	0.01	0.12	0.02	0.14	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.31	0.28	0.06	0.14	0.31	0.49	0.30
O2	0.07	0.01	0.33	0.25	0.02	0.10	0.02	0.11	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.15	0.24	0.14	0.13	0.17	0.32	0.21
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.29	0.27	0.33	0.11	0.29	0.18	0.20	0.31	0.15	0.00	0.04	0.19	0.29	0.54	0.65	0.42
O3'	0.26	0.14	0.02	0.01	0.23	0.03	0.25	0.21	0.18	0.10	0.18	0.28	0.24	0.04	0.00	0.19	0.22	0.40	0.24	0.24
O4'	0.00	0.09	0.02	0.02	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.03	0.08	0.06	0.14	0.19	0.19	0.00	0.16	0.21	0.26	0.24
O5'	0.18	0.10	0.41	0.05	0.12	0.03	0.13	0.01	0.10	0.10	0.10	0.14	0.13	0.29	0.22	0.16	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.26	0.13	0.61	0.38	0.24	0.22	0.24	0.18	0.14	0.13	0.17	0.31	0.17	0.54	0.40	0.21	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.33	0.57	0.14	0.44	0.09	0.44	0.03	0.35	0.30	0.39	0.49	0.32	0.65	0.24	0.26	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.20	0.48	0.13	0.26	0.07	0.26	0.04	0.21	0.18	0.23	0.30	0.21	0.42	0.24	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.15	0.17	0.17	0.13	0.13	0.11	0.10	0.12	0.11	0.12	0.20	0.16	0.10	0.13	0.28	0.24	0.16	0.44	0.17	1.13	0.58	0.47
C2	0.16	0.17	0.14	0.13	0.13	0.10	0.12	0.09	0.13	0.11	0.14	0.22	0.17	0.11	0.13	0.25	0.19	0.14	0.45	0.17	1.15	0.56	0.48
C2'	0.34	0.27	0.43	0.44	0.27	0.38	0.19	0.38	0.15	0.24	0.17	0.33	0.32	0.19	0.29	0.50	0.51	0.33	0.39	0.16	1.08	0.53	0.41
C3'	0.35	0.30	0.34	0.35	0.34	0.35	0.34	0.39	0.33	0.36	0.30	0.30	0.33	0.36	0.35	0.36	0.36	0.36	0.43	0.36	1.13	0.58	0.48
C4	0.10	0.16	0.07	0.09	0.10	0.05	0.10	0.14	0.12	0.09	0.13	0.21	0.14	0.11	0.09	0.19	0.13	0.08	0.51	0.16	1.29	0.64	0.56
C4'	0.17	0.14	0.14	0.13	0.12	0.13	0.10	0.10	0.12	0.11	0.11	0.19	0.16	0.11	0.13	0.23	0.19	0.16	0.43	0.17	1.13	0.61	0.46
C5	0.10	0.16	0.08	0.09	0.10	0.05	0.10	0.14	0.11	0.09	0.13	0.22	0.14	0.11	0.09	0.19	0.14	0.08	0.52	0.15	1.32	0.65	0.57
C5'	0.20	0.18	0.16	0.14	0.16	0.15	0.17	0.12	0.18	0.16	0.16	0.21	0.19	0.18	0.17	0.24	0.20	0.18	0.48	0.22	1.17	0.69	0.50
C6	0.13	0.16	0.11	0.11	0.12	0.07	0.11	0.11	0.12	0.10	0.13	0.22	0.16	0.11	0.11	0.22	0.17	0.11	0.50	0.16	1.27	0.62	0.55
N1	0.16	0.16	0.14	0.13	0.13	0.10	0.11	0.09	0.13	0.11	0.13	0.22	0.17	0.11	0.12	0.25	0.19	0.14	0.47	0.17	1.19	0.59	0.50
N3	0.13	0.16	0.10	0.10	0.12	0.07	0.11	0.10	0.13	0.10	0.14	0.22	0.15	0.11	0.11	0.21	0.15	0.11	0.47	0.17	1.20	0.59	0.51
N4	0.09	0.16	0.06	0.09	0.10	0.08	0.10	0.17	0.10	0.10	0.14	0.20	0.13	0.11	0.08	0.17	0.13	0.08	0.55	0.14	1.36	0.67	0.61
O2	0.21	0.18	0.18	0.17	0.16	0.16	0.14	0.11	0.15	0.15	0.16	0.22	0.19	0.13	0.17	0.29	0.23	0.19	0.43	0.17	1.08	0.52	0.46
O2'	0.22	0.15	0.29	0.30	0.16	0.23	0.19	0.19	0.25	0.17	0.21	0.15	0.17	0.20	0.17	0.38	0.43	0.23	0.37	0.34	0.94	0.62	0.37
O3'	0.31	0.20	0.23	0.23	0.24	0.28	0.24	0.28	0.23	0.28	0.18	0.23	0.25	0.28	0.27	0.26	0.23	0.33	0.37	0.29	0.93	0.67	0.38
O4'	0.26	0.23	0.23	0.20	0.22	0.21	0.22	0.13	0.22	0.22	0.22	0.25	0.24	0.22	0.23	0.32	0.24	0.24	0.54	0.25	1.19	0.67	0.55
O5'	0.17	0.16	0.12	0.14	0.15	0.13	0.16	0.17	0.17	0.16	0.15	0.20	0.17	0.17	0.15	0.19	0.19	0.16	0.43	0.22	1.22	0.63	0.48
OP1	0.24	0.23	0.18	0.19	0.24	0.21	0.27	0.28	0.27	0.28	0.23	0.26	0.24	0.31	0.25	0.23	0.21	0.25	0.44	0.33	1.23	0.73	0.50
OP2	0.45	0.44	0.42	0.43	0.45	0.45	0.47	0.52	0.46	0.48	0.44	0.45	0.44	0.49	0.46	0.45	0.43	0.45	0.60	0.49	1.32	0.88	0.65
P	0.27	0.28	0.22	0.23	0.27	0.25	0.28	0.32	0.28	0.29	0.26	0.31	0.28	0.30	0.27	0.26	0.24	0.28	0.48	0.31	1.25	0.75	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.15	0.02	0.48	0.20	0.15
C2	0.03	0.00	0.10	0.14	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.16	0.03	0.36	0.02	0.95	0.47	0.36
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.10	0.06	0.12	0.10	0.09	0.03	0.00	0.01	0.02	0.25	0.05	0.50	0.18	0.21
C3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.11	0.01	0.15	0.02	0.15	0.22	0.14	0.16	0.12	0.22	0.12	0.02	0.01	0.01	0.35	0.17	0.54	0.14	0.29
C4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.12	0.02	0.35	0.01	0.89	0.45	0.34
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.10	0.12	0.09	0.06	0.05	0.12	0.06	0.12	0.02	0.00	0.03	0.11	0.22	0.26	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.15	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.19	0.03	0.41	0.01	1.04	0.60	0.42
C5'	0.03	0.13	0.03	0.02	0.12	0.01	0.16	0.00	0.17	0.16	0.16	0.12	0.10	0.19	0.10	0.11	0.02	0.02	0.01	0.19	0.25	0.44	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.15	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.19	0.03	0.43	0.01	1.13	0.65	0.46
C8	0.02	0.01	0.10	0.22	0.00	0.12	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.25	0.06	0.39	0.01	0.87	0.54	0.38
N1	0.02	0.01	0.06	0.14	0.02	0.09	0.01	0.16	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.14	0.16	0.03	0.40	0.01	1.07	0.58	0.42
N2	0.03	0.01	0.12	0.16	0.01	0.06	0.02	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.22	0.21	0.04	0.35	0.03	0.92	0.45	0.36
N3	0.03	0.01	0.10	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.15	0.04	0.32	0.01	0.84	0.40	0.31
N7	0.02	0.01	0.09	0.22	0.00	0.12	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.26	0.05	0.43	0.02	1.05	0.67	0.45
N9	0.00	0.02	0.03	0.12	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.12	0.02	0.30	0.01	0.76	0.38	0.29
O2'	0.03	0.18	0.00	0.02	0.09	0.12	0.07	0.11	0.10	0.07	0.14	0.22	0.17	0.05	0.03	0.00	0.05	0.11	0.08	0.09	0.28	0.15	0.06
O3'	0.02	0.16	0.01	0.01	0.12	0.02	0.19	0.02	0.19	0.25	0.16	0.21	0.15	0.26	0.12	0.05	0.00	0.02	0.31	0.23	0.59	0.16	0.29
O4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.06	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.11	0.02	0.00	0.11	0.04	0.30	0.25	0.14
O5'	0.15	0.36	0.25	0.35	0.35	0.03	0.41	0.01	0.43	0.39	0.40	0.35	0.32	0.43	0.30	0.08	0.31	0.11	0.00	0.47	0.01	0.03	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.17	0.01	0.11	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.09	0.23	0.04	0.47	0.00	1.22	0.73	0.51
OP1	0.48	0.95	0.50	0.54	0.89	0.22	1.04	0.25	1.13	0.87	1.07	0.92	0.84	1.05	0.76	0.28	0.59	0.30	0.01	1.22	0.00	0.02	0.00
OP2	0.20	0.47	0.18	0.14	0.45	0.26	0.60	0.44	0.65	0.54	0.58	0.45	0.40	0.67	0.38	0.15	0.16	0.25	0.03	0.73	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.36	0.21	0.29	0.34	0.03	0.42	0.02	0.46	0.38	0.42	0.36	0.31	0.45	0.29	0.06	0.29	0.14	0.01	0.51	0.00	0.01	0.00