Doublet Group distance statistics: 48364

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 0, 3, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.007, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.004, 0.006, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.012, 0.032, 0.052, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.032 std_dev=0.020
N4	A	0, 0.006, 0.036, 0.067, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.036 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.112, 0.244, 0.377, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.244 std_dev=0.132
C2'	A	0, 0.122, 0.267, 0.412, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.267 std_dev=0.145
N3	B	0, 0.097, 0.270, 0.443, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.270 std_dev=0.173
O2'	A	0, 0.148, 0.324, 0.501, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.324 std_dev=0.177
C4'	A	0, 0.192, 0.379, 0.566, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.379 std_dev=0.187
C4	B	0, 0.091, 0.279, 0.467, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.279 std_dev=0.188
C2	B	0, 0.139, 0.340, 0.541, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.340 std_dev=0.201
C3'	A	0, 0.199, 0.414, 0.630, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.414 std_dev=0.216
N9	B	0, 0.098, 0.330, 0.562, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.330 std_dev=0.232
N2	B	0, 0.174, 0.438, 0.701, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.438 std_dev=0.263
C8	B	0, 0.176, 0.470, 0.765, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.470 std_dev=0.294
C1'	B	0, 0.151, 0.459, 0.768, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.459 std_dev=0.309
O3'	A	0, 0.259, 0.576, 0.892, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.576 std_dev=0.317
C5'	A	0, 0.385, 0.711, 1.036, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.711 std_dev=0.325
C5	B	0, 0.113, 0.439, 0.766, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.439 std_dev=0.326
N1	B	0, 0.130, 0.469, 0.807, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.469 std_dev=0.338
O4'	B	0, 0.245, 0.602, 0.958, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.602 std_dev=0.357
N7	B	0, 0.173, 0.564, 0.955, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.564 std_dev=0.391
C6	B	0, 0.133, 0.557, 0.980, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.557 std_dev=0.423
C2'	B	0, 0.140, 0.618, 1.097, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.618 std_dev=0.479
C4'	B	0, 0.280, 0.813, 1.346, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.813 std_dev=0.533
C5'	B	0, 0.471, 1.051, 1.630, 1.892 max_d=1.892 avg_d=1.051 std_dev=0.580
O6	B	0, 0.177, 0.766, 1.356, 2.069 max_d=2.069 avg_d=0.766 std_dev=0.590
O5'	A	0, 0.791, 1.385, 1.979, 1.873 max_d=1.873 avg_d=1.385 std_dev=0.594
O5'	B	0, 0.437, 1.046, 1.655, 1.762 max_d=1.762 avg_d=1.046 std_dev=0.609
O2'	B	0, 0.178, 0.793, 1.408, 2.016 max_d=2.016 avg_d=0.793 std_dev=0.615
P	A	0, 1.019, 1.645, 2.271, 2.160 max_d=2.160 avg_d=1.645 std_dev=0.626
C3'	B	0, 0.144, 0.783, 1.423, 1.999 max_d=1.999 avg_d=0.783 std_dev=0.640
OP2	B	0, 0.443, 1.132, 1.822, 2.091 max_d=2.091 avg_d=1.132 std_dev=0.690
P	B	0, 0.430, 1.144, 1.858, 2.014 max_d=2.014 avg_d=1.144 std_dev=0.714
OP1	A	0, 1.088, 1.811, 2.535, 2.459 max_d=2.459 avg_d=1.811 std_dev=0.724
OP1	B	0, 0.645, 1.446, 2.248, 2.522 max_d=2.522 avg_d=1.446 std_dev=0.802
O3'	B	0, 0.203, 1.055, 1.907, 2.734 max_d=2.734 avg_d=1.055 std_dev=0.852
OP2	A	0, 1.099, 2.000, 2.902, 3.740 max_d=3.740 avg_d=2.000 std_dev=0.902

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.23	0.25	0.32	0.26
C2	0.01	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.10	0.03	0.45	0.41	0.70	0.50
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.10	0.02	0.05	0.05	0.15	0.00	0.01	0.01	0.26	0.33	0.11	0.17
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.11	0.02	0.13	0.04	0.08	0.07	0.16	0.02	0.01	0.02	0.33	0.43	0.16	0.22
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.65	0.60	1.12	0.74
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.04	0.06	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.17	0.28	0.04
C5	0.01	0.01	0.09	0.11	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.15	0.04	0.69	0.63	1.16	0.77
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.13	0.00	0.13	0.00	0.11	0.07	0.12	0.15	0.08	0.06	0.02	0.01	0.01	0.24	0.32	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.13	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.15	0.05	0.61	0.54	0.91	0.64
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.45	0.40	0.65	0.48
N3	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.55	0.50	0.92	0.63
N4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.10	0.03	0.69	0.65	1.27	0.81
O2	0.02	0.00	0.15	0.16	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.19	0.06	0.35	0.33	0.54	0.40
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.06	0.06	0.07	0.06	0.07	0.03	0.07	0.08	0.13	0.00	0.03	0.05	0.08	0.18	0.36	0.13
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.08	0.02	0.15	0.02	0.15	0.04	0.09	0.10	0.19	0.03	0.00	0.02	0.24	0.47	0.50	0.29
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.06	0.05	0.02	0.00	0.16	0.19	0.36	0.26
O5'	0.23	0.45	0.26	0.33	0.65	0.01	0.69	0.01	0.61	0.45	0.55	0.69	0.35	0.08	0.24	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.25	0.41	0.33	0.43	0.60	0.17	0.63	0.24	0.54	0.40	0.50	0.65	0.33	0.18	0.47	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	0.70	0.11	0.16	1.12	0.28	1.16	0.32	0.91	0.65	0.92	1.27	0.54	0.36	0.50	0.36	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.26	0.50	0.17	0.22	0.74	0.04	0.77	0.01	0.64	0.48	0.63	0.81	0.40	0.13	0.29	0.26	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.14	0.26	0.28	0.14	0.19	0.17	0.22	0.22	0.15	0.17	0.18	0.16	0.19	0.14	0.34	0.35	0.16	0.35	0.31	0.33	0.44	0.30
C2	0.16	0.14	0.23	0.27	0.14	0.18	0.17	0.25	0.22	0.16	0.17	0.22	0.16	0.19	0.14	0.30	0.31	0.15	0.34	0.30	0.34	0.45	0.31
C2'	0.15	0.17	0.29	0.32	0.15	0.19	0.21	0.23	0.26	0.16	0.24	0.21	0.16	0.21	0.14	0.33	0.38	0.12	0.28	0.34	0.30	0.45	0.27
C3'	0.20	0.25	0.34	0.37	0.23	0.24	0.27	0.30	0.32	0.24	0.29	0.29	0.24	0.28	0.22	0.36	0.41	0.16	0.25	0.38	0.31	0.50	0.31
C4	0.15	0.16	0.18	0.23	0.15	0.17	0.21	0.28	0.24	0.21	0.15	0.26	0.16	0.25	0.16	0.23	0.26	0.17	0.32	0.34	0.34	0.46	0.31
C4'	0.14	0.15	0.27	0.30	0.16	0.19	0.22	0.26	0.27	0.19	0.21	0.18	0.15	0.24	0.15	0.31	0.36	0.12	0.27	0.35	0.31	0.47	0.29
C5	0.15	0.15	0.18	0.23	0.15	0.16	0.21	0.27	0.24	0.21	0.15	0.25	0.15	0.26	0.16	0.24	0.26	0.16	0.31	0.35	0.33	0.46	0.30
C5'	0.21	0.22	0.30	0.34	0.24	0.25	0.30	0.34	0.33	0.29	0.27	0.23	0.22	0.33	0.24	0.32	0.38	0.20	0.23	0.41	0.35	0.54	0.34
C6	0.15	0.15	0.21	0.24	0.14	0.16	0.20	0.25	0.24	0.19	0.16	0.24	0.15	0.24	0.15	0.27	0.28	0.15	0.31	0.34	0.32	0.45	0.29
N1	0.16	0.14	0.23	0.26	0.14	0.17	0.18	0.24	0.23	0.16	0.17	0.21	0.16	0.21	0.14	0.30	0.31	0.15	0.33	0.32	0.33	0.44	0.30
N3	0.15	0.16	0.20	0.24	0.15	0.17	0.19	0.27	0.23	0.18	0.17	0.26	0.17	0.21	0.15	0.26	0.28	0.15	0.33	0.31	0.34	0.45	0.31
N4	0.17	0.17	0.18	0.24	0.16	0.20	0.22	0.32	0.23	0.24	0.15	0.26	0.15	0.28	0.18	0.21	0.27	0.19	0.31	0.35	0.35	0.46	0.32
O2	0.18	0.13	0.27	0.30	0.14	0.21	0.15	0.26	0.20	0.14	0.18	0.18	0.17	0.16	0.15	0.34	0.36	0.17	0.37	0.26	0.36	0.45	0.32
O2'	0.20	0.19	0.28	0.30	0.17	0.20	0.22	0.20	0.27	0.18	0.25	0.20	0.17	0.22	0.17	0.34	0.38	0.19	0.34	0.34	0.33	0.42	0.28
O3'	0.26	0.33	0.40	0.42	0.28	0.29	0.31	0.32	0.35	0.27	0.35	0.37	0.30	0.31	0.27	0.42	0.47	0.21	0.27	0.40	0.33	0.53	0.33
O4'	0.16	0.13	0.26	0.28	0.14	0.19	0.19	0.24	0.23	0.16	0.17	0.18	0.16	0.21	0.14	0.34	0.35	0.15	0.35	0.33	0.34	0.44	0.30
O5'	0.47	0.44	0.29	0.28	0.52	0.41	0.65	0.43	0.70	0.62	0.58	0.33	0.42	0.70	0.53	0.32	0.20	0.53	0.59	0.82	0.48	0.53	0.51
OP1	0.46	0.41	0.26	0.27	0.52	0.41	0.66	0.48	0.70	0.65	0.56	0.28	0.39	0.73	0.53	0.26	0.17	0.53	0.52	0.84	0.47	0.61	0.53
OP2	0.79	0.73	0.61	0.70	0.91	0.80	1.12	0.94	1.19	1.11	0.98	0.50	0.70	1.24	0.92	0.45	0.57	0.88	0.96	1.40	1.03	1.19	1.07
P	0.52	0.47	0.34	0.38	0.59	0.49	0.75	0.57	0.80	0.73	0.65	0.33	0.45	0.83	0.60	0.30	0.27	0.59	0.63	0.95	0.61	0.73	0.65

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.02	0.11	0.27	0.10
C2	0.05	0.00	0.13	0.15	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.18	0.05	0.23	0.01	0.19	0.33	0.19
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.08	0.08	0.10	0.17	0.13	0.07	0.03	0.00	0.03	0.01	0.17	0.08	0.24	0.18	0.09
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.10	0.01	0.12	0.05	0.13	0.16	0.14	0.18	0.14	0.16	0.08	0.01	0.01	0.01	0.23	0.15	0.31	0.22	0.17
C4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.10	0.02	0.24	0.01	0.19	0.33	0.19
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.06	0.09	0.06	0.10	0.05	0.04	0.03	0.00	0.02	0.09	0.15	0.26	0.04
C5	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.14	0.02	0.30	0.01	0.26	0.38	0.26
C5'	0.03	0.12	0.03	0.05	0.12	0.01	0.17	0.00	0.18	0.17	0.15	0.12	0.10	0.20	0.11	0.03	0.08	0.02	0.01	0.21	0.14	0.29	0.02
C6	0.03	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.03	0.30	0.01	0.28	0.40	0.27
C8	0.01	0.01	0.08	0.16	0.00	0.10	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.18	0.04	0.30	0.02	0.25	0.36	0.24
N1	0.04	0.00	0.10	0.14	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.16	0.04	0.27	0.01	0.23	0.37	0.24
N2	0.06	0.00	0.17	0.18	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.23	0.06	0.22	0.02	0.18	0.32	0.17
N3	0.04	0.01	0.13	0.14	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.16	0.05	0.21	0.01	0.17	0.31	0.16
N7	0.01	0.01	0.07	0.16	0.00	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.18	0.03	0.34	0.02	0.30	0.41	0.29
N9	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.22	0.02	0.17	0.31	0.17
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.09	0.04	0.07	0.03	0.10	0.05	0.14	0.21	0.16	0.05	0.03	0.00	0.06	0.03	0.07	0.10	0.23	0.21	0.06
O3'	0.02	0.18	0.03	0.01	0.10	0.03	0.14	0.08	0.15	0.18	0.16	0.23	0.16	0.18	0.08	0.06	0.00	0.02	0.20	0.18	0.40	0.31	0.23
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.03	0.09	0.33	0.16
O5'	0.11	0.23	0.17	0.23	0.24	0.02	0.30	0.01	0.30	0.30	0.27	0.22	0.21	0.34	0.22	0.07	0.20	0.09	0.00	0.33	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.09	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.10	0.18	0.03	0.33	0.00	0.32	0.44	0.31
OP1	0.11	0.19	0.24	0.31	0.19	0.15	0.26	0.14	0.28	0.25	0.23	0.18	0.17	0.30	0.17	0.23	0.40	0.09	0.01	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.33	0.18	0.22	0.33	0.26	0.38	0.29	0.40	0.36	0.37	0.32	0.31	0.41	0.31	0.21	0.31	0.33	0.01	0.44	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.19	0.09	0.17	0.19	0.04	0.26	0.02	0.27	0.24	0.24	0.17	0.16	0.29	0.17	0.06	0.23	0.16	0.00	0.31	0.01	0.00	0.00