Doublet Group distance statistics: 48365

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 0, 3, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.017, 0.027, 0.037, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.027 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.013, 0.026, 0.039, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.018, 0.032, 0.045, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.032 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.018, 0.033, 0.048, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.033 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.038, 0.061, 0.084, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.061 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.070, 0.114, 0.159, 0.175 max_d=0.175 avg_d=0.114 std_dev=0.045
N4	A	0, 0.037, 0.085, 0.133, 0.174 max_d=0.174 avg_d=0.085 std_dev=0.048
N3	B	0, 0.124, 0.251, 0.378, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.251 std_dev=0.127
C4	B	0, 0.138, 0.283, 0.429, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.283 std_dev=0.146
C2	B	0, 0.134, 0.294, 0.454, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.294 std_dev=0.160
O4'	A	0, 0.114, 0.276, 0.438, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.276 std_dev=0.162
C2'	A	0, 0.159, 0.364, 0.569, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.364 std_dev=0.205
N1	B	0, 0.140, 0.364, 0.588, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.364 std_dev=0.224
N2	B	0, 0.223, 0.456, 0.688, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.456 std_dev=0.232
C5	B	0, 0.191, 0.434, 0.676, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.434 std_dev=0.242
N9	B	0, 0.108, 0.359, 0.609, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.359 std_dev=0.250
C4'	A	0, 0.176, 0.433, 0.690, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.433 std_dev=0.257
O2'	A	0, 0.209, 0.482, 0.754, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.482 std_dev=0.272
C1'	B	0, 0.097, 0.382, 0.666, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.382 std_dev=0.284
C6	B	0, 0.186, 0.483, 0.781, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.483 std_dev=0.297
C2'	B	0, 0.129, 0.426, 0.724, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.426 std_dev=0.297
C3'	A	0, 0.238, 0.553, 0.868, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.553 std_dev=0.315
O2'	B	0, 0.211, 0.556, 0.902, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.556 std_dev=0.346
O4'	B	0, 0.205, 0.558, 0.910, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.558 std_dev=0.352
C8	B	0, 0.172, 0.532, 0.892, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.532 std_dev=0.360
N7	B	0, 0.230, 0.603, 0.976, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.603 std_dev=0.373
C4'	B	0, 0.311, 0.694, 1.077, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.694 std_dev=0.383
C3'	B	0, 0.277, 0.664, 1.051, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.664 std_dev=0.387
O5'	B	0, 0.370, 0.810, 1.250, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.810 std_dev=0.440
O6	B	0, 0.238, 0.682, 1.127, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.682 std_dev=0.445
O3'	B	0, 0.438, 0.898, 1.357, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.898 std_dev=0.459
C5'	A	0, 0.301, 0.764, 1.227, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.764 std_dev=0.463
O3'	A	0, 0.350, 0.814, 1.278, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.814 std_dev=0.464
P	B	0, 0.477, 1.056, 1.636, 1.601 max_d=1.601 avg_d=1.056 std_dev=0.579
C5'	B	0, 0.540, 1.120, 1.700, 2.045 max_d=2.045 avg_d=1.120 std_dev=0.580
OP1	B	0, 0.523, 1.225, 1.927, 2.080 max_d=2.080 avg_d=1.225 std_dev=0.702
O5'	A	0, -0.055, 0.824, 1.702, 3.114 max_d=3.114 avg_d=0.824 std_dev=0.879
OP2	B	0, 0.373, 1.515, 2.656, 4.252 max_d=4.252 avg_d=1.515 std_dev=1.142
P	A	0, 0.467, 1.826, 3.185, 5.291 max_d=5.291 avg_d=1.826 std_dev=1.359
OP1	A	0, 0.880, 2.402, 3.923, 6.105 max_d=6.105 avg_d=2.402 std_dev=1.522
OP2	A	0, 0.066, 2.170, 4.275, 7.825 max_d=7.825 avg_d=2.170 std_dev=2.104

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.29	0.26	0.15	0.15
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.02	0.53	0.09	0.66	0.45
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.05	0.07	0.11	0.00	0.01	0.01	0.17	0.17	0.10	0.06
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.10	0.01	0.14	0.02	0.13	0.06	0.08	0.12	0.10	0.02	0.01	0.01	0.15	0.16	0.15	0.12
C4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.14	0.02	0.76	0.27	1.29	0.83
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.03	0.06	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.25	0.25	0.12
C5	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.18	0.02	0.80	0.34	1.40	0.91
C5'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.08	0.00	0.10	0.00	0.08	0.04	0.06	0.09	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.09	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.16	0.03	0.71	0.20	1.05	0.72
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.53	0.07	0.64	0.45
N3	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.65	0.11	0.98	0.64
N4	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.16	0.02	0.81	0.36	1.50	0.95
O2	0.02	0.01	0.11	0.10	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.12	0.03	0.40	0.22	0.38	0.28
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.04	0.05	0.05	0.05	0.04	0.02	0.06	0.06	0.12	0.00	0.03	0.03	0.07	0.34	0.47	0.23
O3'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.14	0.02	0.18	0.04	0.16	0.07	0.10	0.16	0.12	0.03	0.00	0.02	0.16	0.25	0.39	0.20
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.00	0.24	0.35	0.14	0.13
O5'	0.29	0.53	0.17	0.15	0.76	0.02	0.80	0.01	0.71	0.53	0.65	0.81	0.40	0.07	0.16	0.24	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.26	0.09	0.17	0.16	0.27	0.25	0.34	0.09	0.20	0.07	0.11	0.36	0.22	0.34	0.25	0.35	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.66	0.10	0.15	1.29	0.25	1.40	0.06	1.05	0.64	0.98	1.50	0.38	0.47	0.39	0.14	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.45	0.06	0.12	0.83	0.12	0.91	0.01	0.72	0.45	0.64	0.95	0.28	0.23	0.20	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.09	0.08	0.10	0.08	0.06	0.16	0.36	0.22	0.13	0.15	0.17	0.09	0.19	0.07	0.21	0.13	0.07	0.37	0.33	0.29	0.93	0.48
C2	0.06	0.09	0.09	0.11	0.09	0.09	0.18	0.40	0.24	0.16	0.14	0.19	0.08	0.22	0.09	0.19	0.14	0.07	0.38	0.34	0.30	1.00	0.51
C2'	0.09	0.08	0.13	0.15	0.10	0.11	0.17	0.34	0.22	0.14	0.16	0.11	0.08	0.19	0.09	0.22	0.20	0.10	0.29	0.30	0.18	0.81	0.38
C3'	0.13	0.12	0.17	0.17	0.15	0.15	0.21	0.36	0.24	0.20	0.18	0.12	0.12	0.24	0.15	0.24	0.22	0.14	0.31	0.32	0.19	0.86	0.41
C4	0.13	0.13	0.15	0.16	0.13	0.16	0.20	0.47	0.19	0.23	0.10	0.22	0.10	0.27	0.15	0.20	0.20	0.14	0.41	0.29	0.32	1.17	0.58
C4'	0.05	0.07	0.08	0.10	0.09	0.06	0.18	0.35	0.23	0.15	0.15	0.12	0.07	0.21	0.08	0.20	0.14	0.07	0.35	0.33	0.26	0.93	0.47
C5	0.11	0.11	0.14	0.15	0.12	0.15	0.19	0.46	0.19	0.22	0.09	0.21	0.09	0.27	0.15	0.20	0.19	0.13	0.41	0.29	0.33	1.18	0.58
C5'	0.09	0.09	0.10	0.11	0.13	0.09	0.22	0.37	0.25	0.21	0.16	0.13	0.08	0.27	0.13	0.21	0.15	0.11	0.38	0.35	0.28	1.01	0.51
C6	0.08	0.09	0.10	0.13	0.10	0.11	0.19	0.43	0.21	0.19	0.10	0.19	0.08	0.24	0.11	0.19	0.16	0.09	0.40	0.31	0.31	1.10	0.55
N1	0.05	0.08	0.09	0.11	0.09	0.08	0.18	0.40	0.22	0.16	0.13	0.18	0.07	0.22	0.09	0.20	0.14	0.07	0.38	0.33	0.30	1.02	0.52
N3	0.10	0.11	0.13	0.14	0.11	0.13	0.19	0.44	0.22	0.19	0.09	0.22	0.09	0.24	0.12	0.20	0.17	0.10	0.40	0.33	0.30	1.08	0.55
N4	0.16	0.17	0.18	0.19	0.15	0.20	0.20	0.51	0.15	0.26	0.15	0.25	0.13	0.28	0.18	0.21	0.22	0.18	0.42	0.21	0.33	1.25	0.60
O2	0.06	0.09	0.07	0.10	0.10	0.06	0.18	0.36	0.25	0.14	0.20	0.17	0.08	0.19	0.09	0.20	0.13	0.07	0.37	0.34	0.29	0.90	0.48
O2'	0.13	0.08	0.17	0.19	0.09	0.14	0.13	0.32	0.19	0.09	0.15	0.11	0.11	0.14	0.09	0.25	0.24	0.14	0.28	0.28	0.22	0.71	0.35
O3'	0.17	0.14	0.21	0.22	0.17	0.19	0.22	0.36	0.25	0.22	0.20	0.14	0.15	0.25	0.18	0.28	0.27	0.18	0.28	0.32	0.18	0.78	0.35
O4'	0.06	0.10	0.09	0.11	0.09	0.07	0.17	0.37	0.22	0.14	0.14	0.17	0.09	0.21	0.08	0.22	0.14	0.07	0.40	0.33	0.34	1.00	0.53
O5'	0.52	0.49	0.44	0.48	0.58	0.52	0.69	0.70	0.72	0.69	0.61	0.39	0.48	0.76	0.59	0.39	0.44	0.55	0.60	0.84	0.58	1.14	0.71
OP1	0.14	0.14	0.25	0.24	0.15	0.16	0.24	0.39	0.25	0.26	0.13	0.24	0.15	0.32	0.17	0.35	0.33	0.14	0.43	0.36	0.32	1.12	0.55
OP2	0.63	0.58	0.45	0.53	0.77	0.64	0.99	0.88	1.05	1.00	0.82	0.39	0.56	1.13	0.79	0.33	0.41	0.73	0.81	1.26	0.84	1.42	0.98
P	0.45	0.41	0.34	0.37	0.54	0.45	0.69	0.65	0.72	0.69	0.56	0.30	0.40	0.78	0.56	0.30	0.30	0.51	0.58	0.87	0.55	1.21	0.73

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.29	0.02	0.27	0.36	0.25
C2	0.04	0.00	0.15	0.16	0.01	0.09	0.01	0.35	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.22	0.20	0.04	0.33	0.01	0.21	0.77	0.39
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.08	0.03	0.07	0.05	0.10	0.06	0.13	0.18	0.15	0.05	0.02	0.00	0.01	0.03	0.19	0.09	0.26	0.19	0.17
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.10	0.01	0.09	0.03	0.10	0.14	0.13	0.19	0.15	0.12	0.08	0.02	0.01	0.03	0.14	0.09	0.27	0.13	0.14
C4	0.01	0.01	0.08	0.10	0.00	0.11	0.00	0.40	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.12	0.09	0.03	0.36	0.01	0.21	0.79	0.41
C4'	0.01	0.09	0.03	0.01	0.11	0.00	0.18	0.01	0.17	0.25	0.12	0.10	0.08	0.25	0.13	0.08	0.03	0.00	0.02	0.20	0.25	0.17	0.06
C5	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.18	0.00	0.53	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.08	0.04	0.42	0.01	0.29	1.04	0.54
C5'	0.13	0.35	0.05	0.03	0.40	0.01	0.53	0.00	0.54	0.59	0.45	0.30	0.30	0.63	0.38	0.08	0.13	0.02	0.01	0.60	0.30	0.28	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.10	0.01	0.17	0.01	0.54	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.12	0.05	0.43	0.00	0.33	1.11	0.57
C8	0.03	0.02	0.06	0.14	0.01	0.25	0.01	0.59	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.05	0.45	0.02	0.25	0.97	0.52
N1	0.03	0.00	0.13	0.13	0.01	0.12	0.01	0.45	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.17	0.05	0.38	0.01	0.27	0.96	0.49
N2	0.05	0.01	0.18	0.19	0.02	0.10	0.01	0.30	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.25	0.25	0.05	0.29	0.02	0.21	0.68	0.35
N3	0.03	0.01	0.15	0.15	0.00	0.08	0.00	0.30	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.17	0.03	0.31	0.01	0.20	0.65	0.34
N7	0.02	0.01	0.05	0.12	0.00	0.25	0.00	0.63	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.06	0.48	0.02	0.35	1.18	0.62
N9	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.13	0.01	0.38	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.02	0.36	0.02	0.19	0.70	0.38
O2'	0.03	0.22	0.00	0.02	0.12	0.08	0.10	0.08	0.14	0.05	0.19	0.25	0.19	0.06	0.04	0.00	0.05	0.12	0.11	0.14	0.31	0.22	0.13
O3'	0.01	0.20	0.01	0.01	0.09	0.03	0.08	0.13	0.12	0.14	0.17	0.25	0.17	0.11	0.06	0.05	0.00	0.03	0.21	0.11	0.30	0.33	0.19
O4'	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.06	0.02	0.12	0.03	0.00	0.33	0.06	0.37	0.29	0.27
O5'	0.29	0.33	0.19	0.14	0.36	0.02	0.42	0.01	0.43	0.45	0.38	0.29	0.31	0.48	0.36	0.11	0.21	0.33	0.00	0.46	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.09	0.01	0.20	0.01	0.60	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.14	0.11	0.06	0.46	0.00	0.41	1.26	0.65
OP1	0.27	0.21	0.26	0.27	0.21	0.25	0.29	0.30	0.33	0.25	0.27	0.21	0.20	0.35	0.19	0.31	0.30	0.37	0.03	0.41	0.00	0.00	0.01
OP2	0.36	0.77	0.19	0.13	0.79	0.17	1.04	0.28	1.11	0.97	0.96	0.68	0.65	1.18	0.70	0.22	0.33	0.29	0.02	1.26	0.00	0.00	0.00
P	0.25	0.39	0.17	0.14	0.41	0.06	0.54	0.02	0.57	0.52	0.49	0.35	0.34	0.62	0.38	0.13	0.19	0.27	0.01	0.65	0.01	0.00	0.00