Doublet Group distance statistics: 48366

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N3	A	0, -0.002, 0.010, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.010 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.014, 0.039, 0.064, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.039 std_dev=0.025
N4	A	0, 0.016, 0.053, 0.091, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.053 std_dev=0.037
C4	B	0, 0.103, 0.243, 0.382, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.243 std_dev=0.139
N9	B	0, 0.142, 0.302, 0.463, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.302 std_dev=0.160
O4'	A	0, 0.095, 0.302, 0.509, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.302 std_dev=0.207
C2'	A	0, 0.116, 0.325, 0.535, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.325 std_dev=0.210
O2'	A	0, 0.170, 0.403, 0.636, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.403 std_dev=0.233
C2	B	0, 0.159, 0.403, 0.646, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.403 std_dev=0.243
N1	B	0, 0.072, 0.330, 0.587, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.330 std_dev=0.258
N3	B	0, 0.210, 0.477, 0.744, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.477 std_dev=0.267
C4'	A	0, 0.155, 0.459, 0.763, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.459 std_dev=0.304
C3'	A	0, 0.206, 0.533, 0.860, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.533 std_dev=0.327
C1'	B	0, 0.321, 0.668, 1.015, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.668 std_dev=0.347
C5	B	0, 0.114, 0.475, 0.836, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.475 std_dev=0.361
C8	B	0, 0.110, 0.493, 0.876, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.493 std_dev=0.383
C6	B	0, 0.230, 0.621, 1.011, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.621 std_dev=0.391
N2	B	0, 0.277, 0.702, 1.126, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.702 std_dev=0.425
O3'	B	0, 0.204, 0.647, 1.090, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.647 std_dev=0.443
C3'	B	0, 0.388, 0.837, 1.286, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.837 std_dev=0.449
O3'	A	0, 0.337, 0.811, 1.286, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.811 std_dev=0.475
O4'	B	0, 0.606, 1.088, 1.570, 1.688 max_d=1.688 avg_d=1.088 std_dev=0.482
N7	B	0, 0.251, 0.763, 1.276, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.763 std_dev=0.512
C5'	A	0, 0.269, 0.790, 1.310, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.790 std_dev=0.520
C4'	B	0, 0.631, 1.166, 1.700, 1.924 max_d=1.924 avg_d=1.166 std_dev=0.535
O6	B	0, 0.473, 1.023, 1.572, 1.844 max_d=1.844 avg_d=1.023 std_dev=0.549
C2'	B	0, 0.941, 1.675, 2.408, 2.189 max_d=2.189 avg_d=1.675 std_dev=0.734
C5'	B	0, 1.189, 2.273, 3.358, 3.806 max_d=3.806 avg_d=2.273 std_dev=1.085
O5'	A	0, 1.481, 2.612, 3.742, 3.704 max_d=3.704 avg_d=2.612 std_dev=1.131
O2'	B	0, 1.943, 3.320, 4.697, 4.053 max_d=4.053 avg_d=3.320 std_dev=1.377
P	A	0, 1.954, 3.415, 4.875, 4.724 max_d=4.724 avg_d=3.415 std_dev=1.461
O5'	B	0, 2.212, 3.837, 5.462, 5.374 max_d=5.374 avg_d=3.837 std_dev=1.625
OP2	A	0, 2.655, 4.549, 6.443, 5.908 max_d=5.908 avg_d=4.549 std_dev=1.894
OP1	A	0, 2.870, 4.947, 7.025, 6.765 max_d=6.765 avg_d=4.947 std_dev=2.078
P	B	0, 3.551, 6.089, 8.626, 8.119 max_d=8.119 avg_d=6.089 std_dev=2.537
OP1	B	0, 4.028, 6.904, 9.781, 9.126 max_d=9.126 avg_d=6.904 std_dev=2.877
OP2	B	0, 4.511, 7.660, 10.810, 9.726 max_d=9.726 avg_d=7.660 std_dev=3.149

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.09	0.12	0.11	0.08
C2	0.01	0.00	0.07	0.10	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.11	0.02	0.18	0.19	0.31	0.21
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.05	0.12	0.00	0.01	0.01	0.10	0.19	0.09	0.10
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.08	0.05	0.10	0.09	0.14	0.03	0.01	0.01	0.12	0.25	0.07	0.11
C4	0.02	0.02	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.03	0.26	0.25	0.46	0.30
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.05	0.08	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.12	0.08	0.01
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.09	0.02	0.27	0.25	0.45	0.30
C5'	0.03	0.07	0.01	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.12	0.07	0.08	0.13	0.07	0.06	0.02	0.01	0.01	0.14	0.11	0.02
C6	0.00	0.01	0.06	0.08	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.09	0.02	0.25	0.22	0.34	0.24
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.18	0.17	0.26	0.18
N3	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.05	0.02	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.12	0.02	0.22	0.22	0.40	0.26
N4	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.08	0.02	0.13	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.11	0.04	0.28	0.28	0.53	0.34
O2	0.02	0.01	0.12	0.14	0.02	0.05	0.02	0.07	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.09	0.16	0.04	0.16	0.18	0.27	0.18
O2'	0.02	0.06	0.00	0.03	0.04	0.06	0.04	0.06	0.04	0.03	0.06	0.05	0.09	0.00	0.03	0.06	0.05	0.17	0.08	0.06
O3'	0.02	0.11	0.01	0.01	0.09	0.02	0.09	0.02	0.09	0.05	0.12	0.11	0.16	0.03	0.00	0.02	0.10	0.30	0.13	0.10
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.06	0.02	0.00	0.05	0.08	0.07	0.06
O5'	0.09	0.18	0.10	0.12	0.26	0.01	0.27	0.01	0.25	0.18	0.22	0.28	0.16	0.05	0.10	0.05	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.12	0.19	0.19	0.25	0.25	0.12	0.25	0.14	0.22	0.17	0.22	0.28	0.18	0.17	0.30	0.08	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.31	0.09	0.07	0.46	0.08	0.45	0.11	0.34	0.26	0.40	0.53	0.27	0.08	0.13	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.21	0.10	0.11	0.30	0.01	0.30	0.02	0.24	0.18	0.26	0.34	0.18	0.06	0.10	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.05	0.26	0.29	0.07	0.13	0.11	0.17	0.15	0.11	0.11	0.04	0.04	0.13	0.07	0.21	0.35	0.12	0.30	0.20	0.56	0.46	0.32
C2	0.06	0.04	0.22	0.23	0.07	0.09	0.12	0.12	0.15	0.11	0.10	0.10	0.04	0.14	0.07	0.18	0.27	0.11	0.26	0.21	0.43	0.44	0.25
C2'	0.13	0.14	0.23	0.20	0.14	0.08	0.18	0.09	0.20	0.17	0.18	0.12	0.12	0.19	0.14	0.22	0.24	0.19	0.19	0.25	0.37	0.33	0.16
C3'	0.14	0.14	0.22	0.19	0.15	0.11	0.17	0.12	0.19	0.17	0.16	0.14	0.13	0.19	0.15	0.19	0.24	0.21	0.22	0.23	0.35	0.37	0.19
C4	0.05	0.10	0.15	0.17	0.05	0.07	0.09	0.11	0.10	0.11	0.05	0.19	0.07	0.13	0.06	0.14	0.19	0.08	0.32	0.17	0.37	0.58	0.33
C4'	0.05	0.04	0.25	0.29	0.06	0.11	0.10	0.15	0.13	0.10	0.09	0.02	0.02	0.12	0.06	0.20	0.37	0.12	0.29	0.17	0.56	0.48	0.32
C5	0.05	0.08	0.16	0.19	0.05	0.09	0.09	0.13	0.09	0.11	0.05	0.15	0.06	0.13	0.06	0.14	0.21	0.08	0.34	0.15	0.44	0.61	0.37
C5'	0.05	0.05	0.26	0.32	0.05	0.15	0.06	0.21	0.07	0.06	0.05	0.08	0.06	0.07	0.05	0.21	0.41	0.11	0.36	0.11	0.62	0.57	0.40
C6	0.06	0.04	0.19	0.22	0.06	0.10	0.10	0.15	0.12	0.11	0.06	0.11	0.05	0.13	0.07	0.15	0.26	0.09	0.33	0.17	0.49	0.56	0.35
N1	0.06	0.03	0.22	0.25	0.06	0.11	0.11	0.15	0.14	0.11	0.09	0.08	0.04	0.13	0.07	0.18	0.30	0.10	0.30	0.19	0.49	0.49	0.31
N3	0.05	0.08	0.18	0.19	0.06	0.08	0.11	0.10	0.14	0.11	0.07	0.19	0.06	0.14	0.06	0.16	0.22	0.09	0.27	0.21	0.36	0.49	0.27
N4	0.05	0.13	0.10	0.13	0.05	0.06	0.08	0.08	0.07	0.12	0.09	0.22	0.08	0.14	0.06	0.15	0.13	0.08	0.33	0.14	0.33	0.63	0.36
O2	0.08	0.08	0.24	0.23	0.10	0.09	0.14	0.11	0.18	0.13	0.16	0.05	0.06	0.15	0.09	0.22	0.29	0.14	0.21	0.23	0.44	0.35	0.19
O2'	0.16	0.19	0.26	0.20	0.18	0.09	0.20	0.08	0.23	0.19	0.22	0.17	0.16	0.21	0.17	0.28	0.25	0.21	0.15	0.27	0.42	0.26	0.12
O3'	0.22	0.20	0.24	0.19	0.21	0.19	0.23	0.19	0.23	0.24	0.21	0.20	0.21	0.24	0.22	0.24	0.21	0.29	0.23	0.26	0.28	0.33	0.19
O4'	0.11	0.08	0.30	0.36	0.10	0.20	0.12	0.25	0.14	0.13	0.11	0.09	0.09	0.14	0.11	0.25	0.44	0.14	0.38	0.18	0.69	0.57	0.43
O5'	0.13	0.17	0.31	0.34	0.15	0.18	0.16	0.25	0.17	0.14	0.17	0.20	0.16	0.16	0.14	0.22	0.39	0.11	0.45	0.19	0.59	0.66	0.47
OP1	0.15	0.18	0.25	0.29	0.15	0.19	0.14	0.24	0.15	0.12	0.16	0.22	0.18	0.13	0.14	0.23	0.39	0.17	0.38	0.17	0.53	0.57	0.40
OP2	0.33	0.36	0.44	0.43	0.37	0.32	0.41	0.39	0.42	0.40	0.39	0.36	0.35	0.42	0.37	0.32	0.32	0.30	0.64	0.45	0.55	0.88	0.64
P	0.15	0.21	0.29	0.31	0.19	0.18	0.20	0.26	0.22	0.18	0.21	0.23	0.20	0.21	0.18	0.19	0.32	0.13	0.48	0.25	0.56	0.71	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.09	0.00	0.11	0.03	0.13	0.17	0.08
C2	0.03	0.00	0.16	0.15	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.18	0.11	0.22	0.01	0.34	0.36	0.21
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.04	0.06	0.07	0.07	0.12	0.19	0.16	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.23	0.06	0.07
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.01	0.13	0.10	0.14	0.16	0.14	0.11	0.07	0.02	0.01	0.01	0.07	0.13	0.25	0.10	0.11
C4	0.02	0.00	0.09	0.11	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.05	0.25	0.02	0.24	0.40	0.24
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.05	0.10	0.05	0.09	0.06	0.10	0.04	0.10	0.01	0.00	0.01	0.06	0.20	0.08	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.07	0.02	0.35	0.02	0.31	0.58	0.37
C5'	0.03	0.10	0.06	0.01	0.09	0.00	0.13	0.00	0.13	0.16	0.11	0.11	0.08	0.18	0.08	0.07	0.07	0.01	0.01	0.15	0.16	0.07	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.04	0.35	0.01	0.36	0.61	0.38
C8	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.10	0.02	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.05	0.08	0.38	0.03	0.27	0.59	0.41
N1	0.03	0.01	0.12	0.14	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.14	0.08	0.29	0.01	0.35	0.49	0.29
N2	0.04	0.01	0.19	0.16	0.01	0.09	0.02	0.11	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.16	0.22	0.13	0.18	0.02	0.40	0.30	0.19
N3	0.03	0.00	0.16	0.14	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.17	0.11	0.18	0.01	0.29	0.28	0.15
N7	0.02	0.01	0.03	0.11	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.04	0.06	0.42	0.02	0.36	0.70	0.48
N9	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.25	0.02	0.16	0.37	0.23
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.04	0.10	0.08	0.07	0.07	0.15	0.06	0.16	0.11	0.15	0.06	0.00	0.02	0.08	0.07	0.09	0.21	0.06	0.07
O3'	0.09	0.18	0.01	0.01	0.11	0.01	0.07	0.07	0.10	0.05	0.14	0.22	0.17	0.04	0.05	0.02	0.00	0.06	0.10	0.09	0.35	0.19	0.18
O4'	0.00	0.11	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.08	0.13	0.11	0.06	0.00	0.08	0.06	0.00	0.12	0.02	0.16	0.19	0.11
O5'	0.11	0.22	0.04	0.07	0.25	0.01	0.35	0.01	0.35	0.38	0.29	0.18	0.18	0.42	0.25	0.07	0.10	0.12	0.00	0.40	0.01	0.02	0.00
O6	0.03	0.01	0.05	0.13	0.02	0.06	0.02	0.15	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.09	0.02	0.40	0.00	0.41	0.72	0.46
OP1	0.13	0.34	0.23	0.25	0.24	0.20	0.31	0.16	0.36	0.27	0.35	0.40	0.29	0.36	0.16	0.21	0.35	0.16	0.01	0.41	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.36	0.06	0.10	0.40	0.08	0.58	0.07	0.61	0.59	0.49	0.30	0.28	0.70	0.37	0.06	0.19	0.19	0.02	0.72	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.21	0.07	0.11	0.24	0.06	0.37	0.01	0.38	0.41	0.29	0.19	0.15	0.48	0.23	0.07	0.18	0.11	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00