Doublet Group distance statistics: 48367

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.004, 0.027, 0.049, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.027 std_dev=0.023
N4	A	0, 0.003, 0.036, 0.068, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.036 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.030, 0.164, 0.299, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.164 std_dev=0.134
C2'	A	0, 0.004, 0.159, 0.314, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.159 std_dev=0.155
N3	B	0, 0.077, 0.252, 0.428, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.252 std_dev=0.175
C4	B	0, 0.048, 0.231, 0.414, 0.430 max_d=0.430 avg_d=0.231 std_dev=0.183
C2	B	0, 0.066, 0.272, 0.478, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.272 std_dev=0.206
C4'	A	0, 0.044, 0.252, 0.460, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.252 std_dev=0.208
C5	B	0, 0.133, 0.348, 0.564, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.348 std_dev=0.215
O2'	A	0, 0.009, 0.227, 0.445, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.227 std_dev=0.218
N1	B	0, 0.126, 0.352, 0.578, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.352 std_dev=0.226
C3'	A	0, 0.020, 0.264, 0.507, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.264 std_dev=0.243
C6	B	0, 0.177, 0.422, 0.668, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.422 std_dev=0.246
C2'	B	0, 0.261, 0.517, 0.772, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.517 std_dev=0.256
N2	B	0, 0.156, 0.421, 0.687, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.421 std_dev=0.265
N9	B	0, 0.068, 0.339, 0.609, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.339 std_dev=0.270
N7	B	0, 0.200, 0.502, 0.805, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.502 std_dev=0.303
C1'	B	0, 0.193, 0.505, 0.818, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.505 std_dev=0.312
O6	B	0, 0.284, 0.612, 0.939, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.612 std_dev=0.327
C5'	A	0, 0.111, 0.450, 0.788, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.450 std_dev=0.338
O3'	A	0, 0.060, 0.401, 0.743, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.401 std_dev=0.342
C8	B	0, 0.102, 0.451, 0.800, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.451 std_dev=0.349
O2'	B	0, 0.276, 0.650, 1.023, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.650 std_dev=0.373
O5'	A	0, 0.075, 0.467, 0.859, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.467 std_dev=0.392
C3'	B	0, 0.310, 0.703, 1.096, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.703 std_dev=0.393
O3'	B	0, 0.451, 0.896, 1.341, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.896 std_dev=0.445
P	A	0, 0.229, 0.718, 1.208, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.718 std_dev=0.489
OP1	A	0, 0.284, 0.805, 1.326, 1.655 max_d=1.655 avg_d=0.805 std_dev=0.521
O4'	B	0, 0.198, 0.757, 1.316, 1.688 max_d=1.688 avg_d=0.757 std_dev=0.559
O5'	B	0, 0.442, 1.019, 1.596, 1.773 max_d=1.773 avg_d=1.019 std_dev=0.577
OP2	A	0, 0.265, 0.852, 1.438, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.852 std_dev=0.587
C4'	B	0, 0.242, 0.863, 1.484, 1.772 max_d=1.772 avg_d=0.863 std_dev=0.621
P	B	0, 0.523, 1.224, 1.925, 2.398 max_d=2.398 avg_d=1.224 std_dev=0.701
OP1	B	0, 0.508, 1.306, 2.104, 2.525 max_d=2.525 avg_d=1.306 std_dev=0.798
OP2	B	0, 0.536, 1.379, 2.222, 2.545 max_d=2.545 avg_d=1.379 std_dev=0.843
C5'	B	0, 0.294, 1.171, 2.049, 2.581 max_d=2.581 avg_d=1.171 std_dev=0.877

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.05	0.06
C2	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.07	0.03	0.13	0.14	0.13	0.14
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.05	0.03	0.13	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.09	0.07
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.11	0.02	0.12	0.05	0.06	0.07	0.11	0.02	0.00	0.01	0.05	0.07	0.09	0.06
C4	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.18	0.21	0.23	0.22
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.04	0.06	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.05	0.04	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.15	0.05	0.20	0.22	0.22	0.23
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.13	0.01	0.15	0.00	0.13	0.07	0.10	0.14	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.15	0.06	0.16	0.16	0.13	0.17
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.11	0.12	0.09	0.11
N3	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.06	0.02	0.16	0.18	0.19	0.18
N4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03	0.20	0.24	0.27	0.25
O2	0.03	0.00	0.13	0.11	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.13	0.05	0.11	0.12	0.12	0.11
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.06	0.03	0.06	0.04	0.02	0.09	0.06	0.17	0.00	0.02	0.06	0.03	0.07	0.05	0.04
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.09	0.02	0.15	0.02	0.15	0.05	0.06	0.09	0.13	0.02	0.00	0.01	0.04	0.08	0.08	0.05
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.05	0.06	0.01	0.00	0.03	0.06	0.04	0.04
O5'	0.05	0.13	0.06	0.05	0.18	0.02	0.20	0.01	0.16	0.11	0.16	0.20	0.11	0.03	0.04	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.14	0.07	0.07	0.21	0.05	0.22	0.05	0.16	0.12	0.18	0.24	0.12	0.07	0.08	0.06	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.05	0.13	0.09	0.09	0.23	0.04	0.22	0.02	0.13	0.09	0.19	0.27	0.12	0.05	0.08	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.14	0.07	0.06	0.22	0.03	0.23	0.01	0.17	0.11	0.18	0.25	0.11	0.04	0.05	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.13	0.11	0.20	0.18	0.08	0.33	0.21	0.41	0.28	0.30	0.14	0.11	0.38	0.16	0.20	0.26	0.14	0.32	0.55	0.28	0.52	0.25
C2	0.12	0.11	0.10	0.22	0.19	0.14	0.34	0.30	0.42	0.31	0.27	0.22	0.10	0.40	0.19	0.15	0.25	0.14	0.33	0.56	0.34	0.56	0.30
C2'	0.23	0.23	0.11	0.18	0.29	0.17	0.41	0.21	0.47	0.36	0.39	0.12	0.20	0.44	0.28	0.17	0.20	0.27	0.40	0.58	0.33	0.53	0.31
C3'	0.25	0.22	0.14	0.20	0.31	0.22	0.43	0.27	0.47	0.41	0.37	0.10	0.21	0.48	0.31	0.17	0.20	0.32	0.44	0.57	0.40	0.60	0.38
C4	0.14	0.13	0.12	0.23	0.17	0.22	0.32	0.38	0.32	0.36	0.12	0.30	0.09	0.44	0.22	0.10	0.23	0.21	0.40	0.49	0.47	0.64	0.41
C4'	0.18	0.16	0.09	0.18	0.24	0.12	0.38	0.21	0.44	0.35	0.32	0.10	0.15	0.44	0.24	0.18	0.22	0.23	0.38	0.57	0.34	0.58	0.32
C5	0.13	0.11	0.11	0.22	0.18	0.20	0.32	0.36	0.33	0.36	0.14	0.27	0.09	0.44	0.22	0.11	0.23	0.20	0.40	0.48	0.47	0.63	0.41
C5'	0.21	0.17	0.08	0.18	0.28	0.17	0.42	0.27	0.46	0.41	0.32	0.09	0.16	0.50	0.29	0.16	0.20	0.27	0.42	0.60	0.45	0.67	0.43
C6	0.12	0.09	0.10	0.21	0.18	0.15	0.33	0.31	0.37	0.34	0.20	0.22	0.09	0.42	0.20	0.13	0.23	0.17	0.38	0.52	0.41	0.60	0.36
N1	0.12	0.10	0.10	0.21	0.19	0.12	0.34	0.28	0.40	0.31	0.26	0.19	0.10	0.41	0.19	0.15	0.25	0.14	0.34	0.55	0.35	0.57	0.31
N3	0.12	0.11	0.11	0.23	0.19	0.19	0.34	0.35	0.39	0.34	0.18	0.29	0.09	0.42	0.21	0.12	0.24	0.18	0.36	0.55	0.41	0.60	0.36
N4	0.16	0.17	0.13	0.25	0.15	0.27	0.29	0.43	0.24	0.38	0.12	0.34	0.09	0.44	0.23	0.10	0.23	0.25	0.43	0.39	0.54	0.67	0.46
O2	0.12	0.16	0.11	0.23	0.20	0.11	0.34	0.27	0.43	0.28	0.35	0.19	0.13	0.37	0.18	0.18	0.27	0.12	0.30	0.54	0.28	0.53	0.25
O2'	0.30	0.32	0.15	0.18	0.33	0.21	0.43	0.21	0.50	0.38	0.45	0.25	0.28	0.45	0.31	0.24	0.19	0.33	0.42	0.59	0.29	0.47	0.27
O3'	0.30	0.27	0.18	0.22	0.35	0.28	0.44	0.30	0.48	0.43	0.40	0.17	0.26	0.49	0.35	0.20	0.22	0.37	0.46	0.56	0.40	0.60	0.40
O4'	0.12	0.11	0.12	0.21	0.17	0.07	0.32	0.23	0.40	0.28	0.27	0.15	0.10	0.39	0.16	0.22	0.28	0.13	0.32	0.55	0.30	0.55	0.27
O5'	0.29	0.20	0.17	0.23	0.35	0.28	0.48	0.38	0.50	0.51	0.34	0.11	0.22	0.58	0.38	0.19	0.21	0.37	0.51	0.62	0.59	0.78	0.56
OP1	0.35	0.24	0.22	0.27	0.39	0.35	0.52	0.45	0.51	0.57	0.35	0.14	0.26	0.63	0.43	0.23	0.22	0.45	0.58	0.62	0.68	0.87	0.65
OP2	0.44	0.24	0.29	0.34	0.44	0.46	0.56	0.57	0.52	0.65	0.34	0.14	0.30	0.69	0.51	0.29	0.27	0.55	0.66	0.62	0.81	0.97	0.77
P	0.35	0.22	0.21	0.26	0.39	0.35	0.52	0.46	0.51	0.57	0.34	0.13	0.25	0.64	0.43	0.22	0.22	0.44	0.58	0.63	0.70	0.88	0.66

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.08	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.02	0.11	0.43	0.12
C2	0.06	0.00	0.09	0.17	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.19	0.05	0.32	0.01	0.18	0.34	0.16
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.02	0.02	0.03	0.02	0.08	0.06	0.11	0.10	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.23	0.02	0.26	0.26	0.12
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.10	0.01	0.08	0.04	0.10	0.11	0.15	0.20	0.15	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.32	0.10	0.37	0.14	0.21
C4	0.03	0.01	0.04	0.10	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.34	0.00	0.19	0.35	0.17
C4'	0.00	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.04	0.07	0.06	0.05	0.05	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.08	0.12	0.39	0.06
C5	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.08	0.01	0.41	0.01	0.22	0.33	0.20
C5'	0.03	0.16	0.03	0.04	0.14	0.01	0.17	0.00	0.20	0.12	0.19	0.15	0.12	0.16	0.10	0.06	0.05	0.01	0.01	0.22	0.16	0.41	0.01
C6	0.02	0.00	0.02	0.10	0.00	0.07	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.41	0.00	0.23	0.31	0.21
C8	0.02	0.01	0.08	0.11	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.05	0.42	0.02	0.22	0.35	0.20
N1	0.04	0.00	0.06	0.15	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.16	0.03	0.37	0.01	0.21	0.32	0.19
N2	0.08	0.00	0.11	0.20	0.02	0.06	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.07	0.23	0.08	0.30	0.01	0.17	0.34	0.14
N3	0.05	0.01	0.10	0.15	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.16	0.06	0.29	0.00	0.17	0.35	0.14
N7	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.05	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.04	0.46	0.02	0.25	0.31	0.23
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.31	0.01	0.18	0.37	0.15
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.06	0.06	0.06	0.06	0.07	0.05	0.07	0.07	0.06	0.07	0.04	0.00	0.04	0.05	0.06	0.08	0.19	0.33	0.04
O3'	0.01	0.19	0.02	0.01	0.09	0.02	0.08	0.05	0.11	0.12	0.16	0.23	0.16	0.11	0.04	0.04	0.00	0.02	0.24	0.10	0.44	0.09	0.22
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.08	0.06	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.03	0.07	0.51	0.18
O5'	0.14	0.32	0.23	0.32	0.34	0.02	0.41	0.01	0.41	0.42	0.37	0.30	0.29	0.46	0.31	0.06	0.24	0.04	0.00	0.43	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.02	0.10	0.00	0.08	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.10	0.03	0.43	0.00	0.25	0.30	0.23
OP1	0.11	0.18	0.26	0.37	0.19	0.12	0.22	0.16	0.23	0.22	0.21	0.17	0.17	0.25	0.18	0.19	0.44	0.07	0.02	0.25	0.00	0.01	0.00
OP2	0.43	0.34	0.26	0.14	0.35	0.39	0.33	0.41	0.31	0.35	0.32	0.34	0.35	0.31	0.37	0.33	0.09	0.51	0.02	0.30	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.16	0.12	0.21	0.17	0.06	0.20	0.01	0.21	0.20	0.19	0.14	0.14	0.23	0.15	0.04	0.22	0.18	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00