Doublet Group distance statistics: 48368

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.002, 0.012, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.010, 0.031, 0.053, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.031 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.007, 0.032, 0.058, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.032 std_dev=0.025
C4	B	0, 0.092, 0.227, 0.362, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.227 std_dev=0.135
C1'	B	0, 0.108, 0.254, 0.401, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.254 std_dev=0.147
N9	B	0, 0.114, 0.279, 0.444, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.279 std_dev=0.165
N1	B	0, 0.095, 0.260, 0.426, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.260 std_dev=0.166
N3	B	0, 0.093, 0.301, 0.510, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.301 std_dev=0.208
C2	B	0, 0.067, 0.324, 0.581, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.324 std_dev=0.257
C2'	B	0, 0.142, 0.406, 0.671, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.406 std_dev=0.264
C5	B	0, 0.058, 0.324, 0.590, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.324 std_dev=0.266
C6	B	0, 0.001, 0.286, 0.571, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.286 std_dev=0.285
O4'	B	0, 0.158, 0.471, 0.784, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.471 std_dev=0.313
O2'	B	0, 0.158, 0.497, 0.837, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.497 std_dev=0.339
C8	B	0, 0.123, 0.468, 0.813, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.468 std_dev=0.345
C4'	B	0, 0.245, 0.603, 0.961, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.603 std_dev=0.358
C3'	B	0, 0.277, 0.638, 1.000, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.638 std_dev=0.362
C2'	A	0, 0.055, 0.427, 0.799, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.427 std_dev=0.372
O4'	A	0, -0.010, 0.392, 0.795, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.392 std_dev=0.403
O6	B	0, 0.019, 0.422, 0.826, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.422 std_dev=0.404
N7	B	0, 0.092, 0.515, 0.938, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.515 std_dev=0.423
N2	B	0, 0.042, 0.504, 0.966, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.504 std_dev=0.462
O3'	B	0, 0.385, 0.858, 1.331, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.858 std_dev=0.473
O2'	A	0, 0.006, 0.598, 1.190, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.598 std_dev=0.592
O5'	B	0, 0.520, 1.126, 1.733, 2.039 max_d=2.039 avg_d=1.126 std_dev=0.607
C3'	A	0, 0.084, 0.832, 1.580, 1.921 max_d=1.921 avg_d=0.832 std_dev=0.748
C4'	A	0, 0.056, 0.808, 1.559, 1.935 max_d=1.935 avg_d=0.808 std_dev=0.752
C5'	B	0, 0.192, 0.950, 1.709, 2.319 max_d=2.319 avg_d=0.950 std_dev=0.758
OP1	B	0, 0.866, 1.705, 2.545, 2.705 max_d=2.705 avg_d=1.705 std_dev=0.839
P	B	0, 0.593, 1.440, 2.287, 2.681 max_d=2.681 avg_d=1.440 std_dev=0.847
O3'	A	0, 0.190, 1.296, 2.401, 3.108 max_d=3.108 avg_d=1.296 std_dev=1.105
C5'	A	0, -0.024, 1.091, 2.206, 3.136 max_d=3.136 avg_d=1.091 std_dev=1.115
OP2	B	0, 0.600, 1.746, 2.893, 3.302 max_d=3.302 avg_d=1.746 std_dev=1.146
O5'	A	0, -0.228, 1.369, 2.967, 4.837 max_d=4.837 avg_d=1.369 std_dev=1.598
P	A	0, 0.091, 2.210, 4.329, 6.744 max_d=6.744 avg_d=2.210 std_dev=2.119
OP2	A	0, 0.722, 3.108, 5.494, 7.936 max_d=7.936 avg_d=3.108 std_dev=2.386
OP1	A	0, -0.050, 2.721, 5.493, 8.650 max_d=8.650 avg_d=2.721 std_dev=2.771

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.25	0.01	0.21	0.43	0.27	0.17
C2	0.01	0.00	0.15	0.20	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.22	0.10	0.19	0.42	0.57	0.15
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.03	0.02	0.09	0.18	0.12	0.02	0.11	0.03	0.25	0.00	0.02	0.01	0.49	0.46	0.62	0.50
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.34	0.01	0.37	0.02	0.33	0.21	0.27	0.37	0.13	0.02	0.00	0.03	0.34	0.22	0.15	0.23
C4	0.01	0.00	0.03	0.34	0.00	0.18	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.22	0.01	0.61	0.33	1.38	0.80
C4'	0.03	0.02	0.02	0.01	0.18	0.00	0.28	0.01	0.28	0.10	0.06	0.20	0.15	0.24	0.02	0.01	0.03	0.30	0.28	0.14
C5	0.00	0.00	0.09	0.37	0.00	0.28	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.28	0.09	0.85	0.67	1.62	1.10
C5'	0.06	0.10	0.18	0.02	0.35	0.01	0.48	0.00	0.43	0.18	0.19	0.39	0.13	0.10	0.18	0.02	0.01	0.18	0.33	0.03
C6	0.00	0.00	0.12	0.33	0.00	0.28	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.33	0.22	0.12	0.77	0.50	1.27	0.91
N1	0.01	0.00	0.02	0.21	0.00	0.10	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.14	0.01	0.37	0.11	0.69	0.37
N3	0.01	0.00	0.11	0.27	0.00	0.06	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.20	0.07	0.34	0.23	0.92	0.39
N4	0.01	0.01	0.03	0.37	0.00	0.20	0.00	0.39	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.25	0.02	0.68	0.47	1.60	0.93
O2	0.03	0.00	0.25	0.13	0.00	0.15	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.37	0.18	0.13	0.87	0.17	0.26
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.33	0.24	0.38	0.10	0.33	0.19	0.24	0.36	0.14	0.00	0.09	0.18	0.39	0.45	0.68	0.42
O3'	0.25	0.22	0.02	0.00	0.22	0.02	0.28	0.18	0.22	0.14	0.20	0.25	0.37	0.09	0.00	0.18	0.35	0.26	0.28	0.25
O4'	0.01	0.10	0.01	0.03	0.01	0.01	0.09	0.02	0.12	0.01	0.07	0.02	0.18	0.18	0.18	0.00	0.16	0.44	0.14	0.19
O5'	0.21	0.19	0.49	0.34	0.61	0.03	0.85	0.01	0.77	0.37	0.34	0.68	0.13	0.39	0.35	0.16	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.43	0.42	0.46	0.22	0.33	0.30	0.67	0.18	0.50	0.11	0.23	0.47	0.87	0.45	0.26	0.44	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.57	0.62	0.15	1.38	0.28	1.62	0.33	1.27	0.69	0.92	1.60	0.17	0.68	0.28	0.14	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.15	0.50	0.23	0.80	0.14	1.10	0.03	0.91	0.37	0.39	0.93	0.26	0.42	0.25	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.08	0.12	0.23	0.09	0.14	0.11	0.28	0.13	0.10	0.10	0.11	0.08	0.12	0.09	0.12	0.26	0.09	0.34	0.17	0.30	0.44	0.28
C2	0.06	0.07	0.08	0.17	0.07	0.12	0.11	0.26	0.14	0.10	0.09	0.13	0.07	0.13	0.07	0.12	0.17	0.07	0.38	0.20	0.31	0.45	0.31
C2'	0.31	0.25	0.27	0.26	0.28	0.27	0.28	0.25	0.25	0.30	0.24	0.23	0.26	0.29	0.30	0.34	0.30	0.33	0.55	0.24	0.35	0.24	0.33
C3'	0.21	0.16	0.09	0.16	0.22	0.14	0.29	0.19	0.32	0.30	0.24	0.14	0.16	0.34	0.23	0.12	0.21	0.25	0.49	0.39	0.32	0.26	0.31
C4	0.07	0.10	0.06	0.09	0.07	0.09	0.10	0.22	0.11	0.10	0.07	0.16	0.09	0.12	0.07	0.12	0.09	0.07	0.44	0.18	0.32	0.42	0.34
C4'	0.22	0.22	0.34	0.47	0.19	0.34	0.17	0.47	0.18	0.17	0.16	0.29	0.24	0.18	0.20	0.25	0.53	0.22	0.31	0.23	0.40	0.54	0.36
C5	0.06	0.09	0.05	0.09	0.07	0.09	0.09	0.23	0.10	0.09	0.06	0.14	0.08	0.12	0.07	0.12	0.09	0.07	0.43	0.16	0.32	0.41	0.34
C5'	0.19	0.18	0.36	0.49	0.14	0.35	0.11	0.49	0.13	0.11	0.09	0.28	0.21	0.13	0.14	0.29	0.58	0.18	0.35	0.23	0.45	0.58	0.41
C6	0.06	0.07	0.06	0.13	0.06	0.10	0.09	0.24	0.11	0.09	0.06	0.13	0.07	0.11	0.07	0.12	0.13	0.07	0.40	0.16	0.32	0.42	0.32
N1	0.06	0.07	0.08	0.17	0.07	0.12	0.10	0.26	0.12	0.10	0.08	0.12	0.07	0.12	0.07	0.12	0.18	0.07	0.38	0.17	0.31	0.44	0.30
N3	0.06	0.08	0.05	0.11	0.07	0.10	0.11	0.24	0.14	0.10	0.07	0.16	0.08	0.13	0.07	0.12	0.10	0.07	0.41	0.21	0.32	0.44	0.33
N4	0.08	0.12	0.10	0.11	0.08	0.09	0.09	0.21	0.10	0.10	0.09	0.17	0.10	0.12	0.08	0.13	0.14	0.08	0.47	0.17	0.32	0.40	0.36
O2	0.05	0.07	0.12	0.22	0.08	0.13	0.13	0.27	0.16	0.11	0.13	0.11	0.07	0.14	0.08	0.13	0.24	0.06	0.35	0.20	0.31	0.47	0.30
O2'	0.20	0.15	0.19	0.23	0.19	0.18	0.21	0.25	0.22	0.22	0.17	0.17	0.16	0.24	0.20	0.21	0.29	0.23	0.26	0.27	0.14	0.36	0.14
O3'	0.45	0.37	0.44	0.45	0.35	0.42	0.27	0.43	0.22	0.32	0.24	0.48	0.41	0.28	0.37	0.47	0.50	0.46	0.33	0.22	0.21	0.27	0.22
O4'	0.22	0.22	0.30	0.41	0.20	0.32	0.18	0.47	0.17	0.18	0.17	0.28	0.24	0.18	0.20	0.24	0.43	0.22	0.28	0.21	0.42	0.61	0.39
O5'	0.23	0.18	0.46	0.63	0.14	0.45	0.12	0.59	0.16	0.13	0.07	0.31	0.23	0.17	0.16	0.38	0.77	0.23	0.44	0.31	0.51	0.56	0.44
OP1	1.29	1.11	1.63	1.80	1.08	1.58	0.85	1.67	0.69	0.96	0.82	1.27	1.23	0.80	1.13	1.61	2.03	1.27	1.25	0.50	1.41	1.36	1.29
OP2	0.22	0.21	0.32	0.43	0.36	0.27	0.63	0.32	0.75	0.59	0.51	0.16	0.16	0.76	0.37	0.35	0.65	0.27	0.73	1.02	0.63	0.65	0.66
P	0.49	0.38	0.79	0.96	0.34	0.76	0.22	0.87	0.22	0.28	0.17	0.54	0.47	0.26	0.37	0.77	1.17	0.48	0.63	0.40	0.73	0.72	0.64

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.13	0.02	0.10	0.34	0.05
C2	0.03	0.00	0.09	0.12	0.01	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.14	0.03	0.29	0.01	0.15	0.38	0.17
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.08	0.08	0.08	0.10	0.09	0.08	0.04	0.00	0.03	0.00	0.25	0.09	0.21	0.27	0.16
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.04	0.05	0.09	0.09	0.15	0.12	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.36	0.04	0.29	0.23	0.23
C4	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.06	0.01	0.28	0.01	0.13	0.35	0.15
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.06	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.05	0.03	0.00	0.01	0.05	0.15	0.33	0.03
C5	0.01	0.00	0.07	0.03	0.00	0.04	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.05	0.01	0.34	0.01	0.16	0.34	0.20
C5'	0.03	0.15	0.02	0.04	0.13	0.01	0.16	0.00	0.17	0.14	0.17	0.14	0.13	0.16	0.10	0.05	0.06	0.02	0.01	0.19	0.17	0.37	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.05	0.00	0.05	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.07	0.01	0.36	0.00	0.20	0.37	0.23
C8	0.00	0.00	0.08	0.09	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.03	0.33	0.02	0.12	0.31	0.15
N1	0.02	0.00	0.08	0.09	0.00	0.05	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.10	0.02	0.33	0.01	0.18	0.38	0.21
N2	0.04	0.01	0.10	0.15	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.18	0.04	0.27	0.02	0.15	0.38	0.17
N3	0.03	0.00	0.09	0.12	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.13	0.03	0.25	0.00	0.13	0.36	0.14
N7	0.00	0.00	0.08	0.07	0.00	0.05	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.09	0.02	0.36	0.02	0.15	0.31	0.20
N9	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.25	0.01	0.10	0.33	0.11
O2'	0.02	0.16	0.00	0.01	0.10	0.05	0.10	0.05	0.13	0.04	0.15	0.18	0.14	0.07	0.04	0.00	0.05	0.06	0.07	0.13	0.17	0.28	0.03
O3'	0.01	0.14	0.03	0.01	0.06	0.03	0.05	0.06	0.07	0.10	0.10	0.18	0.13	0.09	0.03	0.05	0.00	0.02	0.34	0.08	0.33	0.24	0.25
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.14	0.02	0.14	0.39	0.13
O5'	0.13	0.29	0.25	0.36	0.28	0.01	0.34	0.01	0.36	0.33	0.33	0.27	0.25	0.36	0.25	0.07	0.34	0.14	0.00	0.38	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.04	0.01	0.05	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.08	0.02	0.38	0.00	0.23	0.37	0.26
OP1	0.10	0.15	0.21	0.29	0.13	0.15	0.16	0.17	0.20	0.12	0.18	0.15	0.13	0.15	0.10	0.17	0.33	0.14	0.02	0.23	0.00	0.01	0.00
OP2	0.34	0.38	0.27	0.23	0.35	0.33	0.34	0.37	0.37	0.31	0.38	0.38	0.36	0.31	0.33	0.28	0.24	0.39	0.01	0.37	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.17	0.16	0.23	0.15	0.03	0.20	0.02	0.23	0.15	0.21	0.17	0.14	0.20	0.11	0.03	0.25	0.13	0.01	0.26	0.00	0.00	0.00