Doublet Group distance statistics: 48390

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 9, 5, 3, 5, 8, 12, 3, 1, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.009, 0.017, 0.026, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.014, 0.033, 0.052, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.033 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.024, 0.057, 0.090, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.057 std_dev=0.033
O2'	A	0, 0.038, 0.122, 0.206, 0.315 max_d=0.315 avg_d=0.122 std_dev=0.084
C2'	A	0, 0.049, 0.134, 0.219, 0.327 max_d=0.327 avg_d=0.134 std_dev=0.085
O4'	A	0, 0.064, 0.161, 0.257, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.161 std_dev=0.096
C3'	A	0, 0.116, 0.257, 0.397, 0.555 max_d=0.555 avg_d=0.257 std_dev=0.141
C4'	A	0, 0.117, 0.261, 0.406, 0.551 max_d=0.551 avg_d=0.261 std_dev=0.144
O3'	A	0, 0.150, 0.349, 0.549, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.349 std_dev=0.199
N1	B	0, 0.186, 0.387, 0.587, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.387 std_dev=0.201
C2	B	0, 0.181, 0.393, 0.605, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.393 std_dev=0.212
O5'	A	0, 0.181, 0.401, 0.621, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.401 std_dev=0.220
C5'	A	0, 0.182, 0.406, 0.630, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.406 std_dev=0.224
C6	B	0, 0.194, 0.425, 0.656, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.425 std_dev=0.231
N3	B	0, 0.210, 0.446, 0.682, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.446 std_dev=0.236
N6	B	0, 0.223, 0.475, 0.727, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.475 std_dev=0.252
C4	B	0, 0.218, 0.476, 0.733, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.476 std_dev=0.258
C5	B	0, 0.211, 0.474, 0.737, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.474 std_dev=0.263
P	A	0, 0.286, 0.560, 0.833, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.560 std_dev=0.274
N9	B	0, 0.266, 0.566, 0.867, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.566 std_dev=0.300
OP2	A	0, 0.320, 0.623, 0.927, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.623 std_dev=0.304
N7	B	0, 0.263, 0.575, 0.888, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.575 std_dev=0.312
OP1	A	0, 0.304, 0.617, 0.930, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.617 std_dev=0.313
C1'	B	0, 0.311, 0.634, 0.958, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.634 std_dev=0.323
C8	B	0, 0.290, 0.622, 0.954, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.622 std_dev=0.332
C2'	B	0, 0.352, 0.718, 1.085, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.718 std_dev=0.366
O4'	B	0, 0.359, 0.748, 1.138, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.748 std_dev=0.390
O2'	B	0, 0.394, 0.801, 1.207, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.801 std_dev=0.406
C3'	B	0, 0.409, 0.881, 1.353, 1.955 max_d=1.955 avg_d=0.881 std_dev=0.472
C4'	B	0, 0.408, 0.882, 1.356, 2.006 max_d=2.006 avg_d=0.882 std_dev=0.474
C5'	B	0, 0.442, 0.987, 1.531, 2.250 max_d=2.250 avg_d=0.987 std_dev=0.545
O5'	B	0, 0.419, 0.985, 1.550, 2.226 max_d=2.226 avg_d=0.985 std_dev=0.566
O3'	B	0, 0.475, 1.041, 1.607, 2.275 max_d=2.275 avg_d=1.041 std_dev=0.566
P	B	0, 0.503, 1.160, 1.817, 2.476 max_d=2.476 avg_d=1.160 std_dev=0.657
OP2	B	0, 0.495, 1.153, 1.810, 2.582 max_d=2.582 avg_d=1.153 std_dev=0.658
OP1	B	0, 0.588, 1.328, 2.069, 2.707 max_d=2.707 avg_d=1.328 std_dev=0.741

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.07	0.05
C2	0.01	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.02	0.08	0.08	0.12	0.10
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.04	0.08	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.07	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.05	0.03	0.06	0.06	0.08	0.02	0.01	0.01	0.05	0.07	0.08	0.04
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.10	0.12	0.14	0.13
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.10	0.12	0.13	0.13
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.07	0.04	0.05	0.08	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.03	0.08	0.09	0.10	0.10
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.06	0.07	0.09	0.08
N3	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.02	0.09	0.10	0.14	0.12
N4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.02	0.10	0.14	0.16	0.15
O2	0.02	0.01	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.10	0.02	0.07	0.08	0.12	0.09
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.06	0.04	0.09	0.00	0.03	0.04	0.04	0.08	0.07	0.05
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.06	0.03	0.07	0.08	0.10	0.03	0.00	0.02	0.06	0.10	0.10	0.06
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.00	0.04	0.05	0.06	0.05
O5'	0.04	0.08	0.04	0.05	0.10	0.02	0.10	0.01	0.08	0.06	0.09	0.10	0.07	0.04	0.06	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.05	0.08	0.06	0.07	0.12	0.05	0.12	0.05	0.09	0.07	0.10	0.14	0.08	0.08	0.10	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.12	0.07	0.08	0.14	0.04	0.13	0.02	0.10	0.09	0.14	0.16	0.12	0.07	0.10	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.04	0.04	0.13	0.02	0.13	0.01	0.10	0.08	0.12	0.15	0.09	0.05	0.06	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.15	0.29	0.27	0.16	0.27	0.14	0.24	0.15	0.15	0.15	0.18	0.19	0.14	0.18	0.41	0.33	0.24	0.19	0.19	0.14	0.16
C2	0.23	0.15	0.27	0.25	0.16	0.24	0.14	0.21	0.15	0.15	0.15	0.18	0.19	0.14	0.17	0.37	0.29	0.22	0.17	0.17	0.14	0.15
C2'	0.25	0.13	0.30	0.28	0.15	0.28	0.13	0.26	0.15	0.16	0.15	0.17	0.19	0.14	0.18	0.42	0.34	0.25	0.21	0.21	0.14	0.17
C3'	0.24	0.12	0.28	0.26	0.14	0.26	0.12	0.23	0.13	0.14	0.13	0.15	0.18	0.12	0.17	0.41	0.32	0.24	0.19	0.18	0.13	0.14
C4	0.19	0.17	0.22	0.19	0.15	0.18	0.14	0.16	0.15	0.14	0.14	0.18	0.20	0.14	0.16	0.29	0.22	0.17	0.13	0.12	0.16	0.13
C4'	0.23	0.13	0.28	0.26	0.14	0.26	0.12	0.22	0.13	0.14	0.13	0.17	0.18	0.12	0.17	0.40	0.32	0.23	0.18	0.17	0.13	0.14
C5	0.19	0.16	0.22	0.19	0.15	0.18	0.14	0.15	0.16	0.14	0.14	0.18	0.21	0.15	0.15	0.30	0.22	0.17	0.13	0.12	0.17	0.13
C5'	0.22	0.13	0.27	0.25	0.14	0.24	0.11	0.20	0.12	0.13	0.11	0.17	0.16	0.11	0.16	0.39	0.30	0.22	0.16	0.14	0.12	0.11
C6	0.20	0.15	0.24	0.21	0.15	0.20	0.14	0.17	0.15	0.14	0.14	0.17	0.20	0.14	0.15	0.34	0.25	0.18	0.14	0.12	0.15	0.12
N1	0.22	0.15	0.26	0.24	0.15	0.23	0.13	0.20	0.15	0.14	0.14	0.18	0.19	0.14	0.17	0.37	0.29	0.21	0.16	0.15	0.14	0.13
N3	0.21	0.15	0.24	0.22	0.15	0.21	0.13	0.18	0.14	0.14	0.13	0.18	0.19	0.13	0.16	0.33	0.24	0.19	0.15	0.14	0.14	0.13
N4	0.19	0.20	0.21	0.20	0.17	0.18	0.16	0.16	0.16	0.16	0.16	0.20	0.20	0.16	0.17	0.26	0.21	0.18	0.16	0.15	0.20	0.16
O2	0.26	0.16	0.30	0.29	0.18	0.28	0.15	0.26	0.16	0.18	0.16	0.20	0.19	0.16	0.20	0.40	0.33	0.26	0.22	0.22	0.17	0.19
O2'	0.29	0.15	0.33	0.33	0.18	0.33	0.16	0.31	0.16	0.19	0.16	0.19	0.19	0.16	0.21	0.45	0.39	0.30	0.26	0.26	0.18	0.22
O3'	0.25	0.12	0.30	0.28	0.14	0.28	0.13	0.26	0.14	0.15	0.14	0.15	0.18	0.13	0.18	0.42	0.34	0.25	0.21	0.20	0.14	0.16
O4'	0.24	0.15	0.29	0.27	0.16	0.26	0.13	0.23	0.14	0.15	0.14	0.18	0.19	0.13	0.17	0.40	0.32	0.23	0.18	0.17	0.14	0.14
O5'	0.22	0.14	0.27	0.23	0.14	0.23	0.11	0.19	0.11	0.12	0.11	0.17	0.16	0.11	0.16	0.39	0.28	0.21	0.15	0.13	0.12	0.11
OP1	0.19	0.12	0.23	0.19	0.12	0.19	0.10	0.16	0.11	0.11	0.10	0.14	0.16	0.11	0.13	0.35	0.24	0.18	0.13	0.12	0.14	0.11
OP2	0.23	0.16	0.25	0.20	0.16	0.21	0.13	0.18	0.13	0.14	0.12	0.18	0.17	0.13	0.17	0.37	0.23	0.21	0.15	0.13	0.15	0.12
P	0.23	0.16	0.27	0.22	0.15	0.22	0.12	0.18	0.11	0.13	0.12	0.19	0.15	0.12	0.17	0.39	0.27	0.21	0.15	0.12	0.12	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.06	0.08	0.05
C2	0.03	0.00	0.08	0.07	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.10	0.02	0.06	0.07	0.11	0.07
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.04	0.07	0.09	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.07	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.06	0.09	0.07	0.07	0.08	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.09	0.07	0.06
C4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.06	0.01	0.06	0.07	0.11	0.07
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.03	0.04	0.05	0.06	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.02	0.07	0.09	0.13	0.09
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.07	0.04	0.04	0.07	0.07	0.04	0.06	0.02	0.02	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.02	0.08	0.09	0.14	0.10
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.03	0.08	0.08	0.12	0.08
N1	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.09	0.02	0.07	0.08	0.13	0.09
N3	0.03	0.00	0.09	0.07	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.10	0.02	0.06	0.07	0.10	0.06
N6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.10	0.02	0.09	0.11	0.15	0.12
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.11	0.02	0.09	0.10	0.14	0.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.05	0.06	0.10	0.06
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.07	0.05	0.06	0.06	0.08	0.03	0.12	0.13	0.07	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.05	0.10	0.07	0.06
O3'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.08	0.10	0.09	0.10	0.10	0.11	0.04	0.04	0.00	0.02	0.07	0.13	0.11	0.09
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.06	0.08	0.06
O5'	0.04	0.06	0.04	0.05	0.06	0.02	0.07	0.01	0.08	0.08	0.07	0.06	0.09	0.09	0.05	0.05	0.07	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.06	0.07	0.08	0.09	0.07	0.06	0.09	0.06	0.09	0.08	0.08	0.07	0.11	0.10	0.06	0.10	0.13	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.11	0.07	0.07	0.11	0.03	0.13	0.02	0.14	0.12	0.13	0.10	0.15	0.14	0.10	0.07	0.11	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.07	0.05	0.06	0.07	0.02	0.09	0.02	0.10	0.08	0.09	0.06	0.12	0.10	0.06	0.06	0.09	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00