Doublet Group distance statistics: 48400

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.004, 0.007, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.004 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.009, 0.028, 0.048, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.028 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.013, 0.037, 0.060, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.037 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.027, 0.105, 0.182, 0.275 max_d=0.275 avg_d=0.105 std_dev=0.078
C2'	A	0, 0.041, 0.122, 0.202, 0.235 max_d=0.235 avg_d=0.122 std_dev=0.081
O2'	A	0, 0.032, 0.123, 0.215, 0.313 max_d=0.313 avg_d=0.123 std_dev=0.092
C3'	A	0, 0.062, 0.199, 0.335, 0.469 max_d=0.469 avg_d=0.199 std_dev=0.137
C4'	A	0, 0.028, 0.179, 0.330, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.179 std_dev=0.151
O3'	A	0, 0.111, 0.301, 0.491, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.301 std_dev=0.190
C5'	A	0, 0.028, 0.310, 0.591, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.310 std_dev=0.281
C4	B	0, 0.241, 0.528, 0.815, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.528 std_dev=0.287
C5	B	0, 0.231, 0.534, 0.838, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.534 std_dev=0.304
N3	B	0, 0.228, 0.555, 0.881, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.555 std_dev=0.326
N9	B	0, 0.277, 0.623, 0.970, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.623 std_dev=0.346
N7	B	0, 0.257, 0.615, 0.974, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.615 std_dev=0.358
C8	B	0, 0.289, 0.660, 1.032, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.660 std_dev=0.372
O5'	A	0, -0.031, 0.342, 0.716, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.342 std_dev=0.374
C2	B	0, 0.150, 0.547, 0.945, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.547 std_dev=0.398
C6	B	0, 0.118, 0.545, 0.971, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.545 std_dev=0.426
C1'	B	0, 0.306, 0.760, 1.215, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.760 std_dev=0.454
P	A	0, -0.011, 0.465, 0.940, 1.592 max_d=1.592 avg_d=0.465 std_dev=0.476
N1	B	0, 0.059, 0.539, 1.020, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.539 std_dev=0.480
O4'	B	0, 0.347, 0.880, 1.413, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.880 std_dev=0.533
C2'	B	0, 0.347, 0.882, 1.416, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.882 std_dev=0.535
O5'	B	0, 0.328, 0.891, 1.453, 1.921 max_d=1.921 avg_d=0.891 std_dev=0.562
OP1	A	0, 0.019, 0.595, 1.171, 1.909 max_d=1.909 avg_d=0.595 std_dev=0.576
N6	B	0, -0.002, 0.611, 1.224, 1.962 max_d=1.962 avg_d=0.611 std_dev=0.613
O2'	B	0, 0.334, 0.965, 1.596, 2.061 max_d=2.061 avg_d=0.965 std_dev=0.631
OP2	A	0, -0.063, 0.572, 1.206, 2.143 max_d=2.143 avg_d=0.572 std_dev=0.635
OP2	B	0, 0.303, 0.942, 1.581, 2.180 max_d=2.180 avg_d=0.942 std_dev=0.639
C3'	B	0, 0.357, 0.999, 1.641, 1.922 max_d=1.922 avg_d=0.999 std_dev=0.642
C4'	B	0, 0.359, 1.022, 1.684, 2.011 max_d=2.011 avg_d=1.022 std_dev=0.662
P	B	0, 0.315, 1.010, 1.705, 2.376 max_d=2.376 avg_d=1.010 std_dev=0.695
OP1	B	0, 0.350, 1.119, 1.888, 2.569 max_d=2.569 avg_d=1.119 std_dev=0.769
C5'	B	0, 0.322, 1.109, 1.895, 2.399 max_d=2.399 avg_d=1.109 std_dev=0.786
O3'	B	0, 0.364, 1.163, 1.962, 2.373 max_d=2.373 avg_d=1.163 std_dev=0.799

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.03	0.36	0.12
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.18	0.07	0.37	0.12
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.05	0.07	0.00	0.01	0.00	0.21	0.25	0.16	0.08
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.05	0.04	0.08	0.09	0.08	0.01	0.00	0.01	0.31	0.37	0.08	0.22
C4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.02	0.26	0.12	0.31	0.10
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.06	0.09	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.13	0.27	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.09	0.03	0.27	0.12	0.31	0.09
C5'	0.03	0.10	0.01	0.01	0.17	0.01	0.18	0.00	0.15	0.10	0.14	0.19	0.06	0.03	0.05	0.01	0.00	0.14	0.28	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.03	0.23	0.08	0.35	0.09
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.17	0.05	0.37	0.11
N3	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.10	0.01	0.22	0.10	0.35	0.11
N4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.02	0.27	0.14	0.27	0.09
O2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.03	0.14	0.06	0.38	0.13
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.03	0.05	0.03	0.04	0.02	0.02	0.04	0.04	0.00	0.04	0.02	0.09	0.23	0.21	0.03
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.10	0.02	0.09	0.05	0.07	0.04	0.10	0.12	0.10	0.04	0.00	0.01	0.33	0.56	0.20	0.35
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.06	0.43	0.20
O5'	0.07	0.18	0.21	0.31	0.26	0.01	0.27	0.00	0.23	0.17	0.22	0.27	0.14	0.09	0.33	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.03	0.07	0.25	0.37	0.12	0.13	0.12	0.14	0.08	0.05	0.10	0.14	0.06	0.23	0.56	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.36	0.37	0.16	0.08	0.31	0.27	0.31	0.28	0.35	0.37	0.35	0.27	0.38	0.21	0.20	0.43	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.12	0.08	0.22	0.10	0.03	0.09	0.01	0.09	0.11	0.11	0.09	0.13	0.03	0.35	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.14	0.45	0.46	0.15	0.37	0.15	0.37	0.28	0.12	0.20	0.26	0.49	0.18	0.19	0.51	0.57	0.31	0.32	0.32	0.42	0.41
C2	0.29	0.20	0.38	0.39	0.15	0.30	0.14	0.31	0.27	0.11	0.15	0.29	0.50	0.18	0.17	0.43	0.47	0.25	0.28	0.31	0.41	0.39
C2'	0.45	0.14	0.58	0.57	0.20	0.49	0.16	0.47	0.30	0.18	0.26	0.29	0.52	0.17	0.28	0.66	0.69	0.43	0.43	0.45	0.53	0.54
C3'	0.50	0.18	0.60	0.58	0.24	0.52	0.16	0.49	0.28	0.22	0.22	0.33	0.51	0.18	0.32	0.69	0.69	0.47	0.46	0.50	0.57	0.58
C4	0.23	0.29	0.29	0.27	0.15	0.20	0.12	0.21	0.19	0.11	0.10	0.30	0.49	0.20	0.14	0.33	0.33	0.18	0.22	0.28	0.37	0.34
C4'	0.40	0.16	0.49	0.49	0.18	0.42	0.14	0.41	0.25	0.15	0.17	0.28	0.47	0.17	0.24	0.57	0.60	0.38	0.36	0.38	0.48	0.48
C5	0.26	0.27	0.32	0.29	0.15	0.22	0.12	0.23	0.19	0.12	0.08	0.30	0.47	0.20	0.15	0.38	0.37	0.21	0.23	0.29	0.37	0.35
C5'	0.45	0.24	0.51	0.50	0.25	0.45	0.14	0.44	0.18	0.20	0.11	0.36	0.39	0.17	0.30	0.59	0.59	0.43	0.41	0.44	0.54	0.54
C6	0.29	0.23	0.37	0.36	0.15	0.28	0.13	0.28	0.22	0.11	0.09	0.29	0.48	0.19	0.17	0.43	0.44	0.24	0.25	0.30	0.39	0.37
N1	0.31	0.19	0.40	0.40	0.15	0.32	0.14	0.32	0.26	0.11	0.14	0.28	0.49	0.18	0.18	0.46	0.49	0.27	0.29	0.31	0.41	0.39
N3	0.25	0.27	0.32	0.31	0.15	0.24	0.12	0.25	0.24	0.11	0.08	0.30	0.52	0.19	0.15	0.36	0.38	0.20	0.25	0.29	0.40	0.36
N4	0.19	0.31	0.22	0.19	0.14	0.14	0.11	0.16	0.14	0.13	0.16	0.29	0.44	0.21	0.12	0.27	0.24	0.14	0.19	0.28	0.35	0.32
O2	0.31	0.13	0.42	0.44	0.14	0.34	0.14	0.36	0.28	0.11	0.23	0.26	0.46	0.16	0.18	0.46	0.53	0.28	0.31	0.31	0.43	0.41
O2'	0.41	0.12	0.56	0.57	0.15	0.48	0.18	0.46	0.34	0.15	0.33	0.21	0.53	0.17	0.23	0.64	0.71	0.40	0.41	0.41	0.50	0.50
O3'	0.56	0.18	0.67	0.65	0.27	0.59	0.19	0.56	0.31	0.27	0.27	0.34	0.54	0.21	0.37	0.77	0.77	0.55	0.52	0.58	0.64	0.65
O4'	0.31	0.15	0.41	0.42	0.14	0.34	0.15	0.35	0.26	0.12	0.16	0.25	0.48	0.19	0.18	0.48	0.53	0.29	0.29	0.29	0.39	0.38
O5'	0.17	0.14	0.32	0.34	0.13	0.21	0.30	0.24	0.41	0.23	0.28	0.16	0.65	0.37	0.11	0.39	0.45	0.12	0.16	0.19	0.24	0.22
OP1	0.31	0.25	0.43	0.43	0.19	0.32	0.13	0.32	0.15	0.14	0.12	0.30	0.32	0.16	0.21	0.48	0.53	0.26	0.30	0.35	0.45	0.42
OP2	0.57	0.58	0.69	0.66	0.45	0.55	0.27	0.52	0.21	0.30	0.37	0.61	0.16	0.20	0.45	0.76	0.76	0.49	0.49	0.53	0.59	0.58
P	0.37	0.33	0.50	0.48	0.23	0.37	0.09	0.36	0.11	0.11	0.13	0.38	0.31	0.13	0.23	0.56	0.60	0.30	0.30	0.34	0.42	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.07	0.21	0.18
C2	0.01	0.00	0.15	0.23	0.00	0.10	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.28	0.02	0.20	0.22	0.43	0.33
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.01	0.10	0.04	0.13	0.15	0.09	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.14	0.18	0.13	0.14
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.17	0.00	0.17	0.01	0.21	0.06	0.24	0.21	0.21	0.11	0.09	0.01	0.01	0.01	0.23	0.29	0.14	0.22
C4	0.01	0.00	0.09	0.17	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.18	0.01	0.18	0.22	0.40	0.32
C4'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.13	0.09	0.12	0.08	0.14	0.11	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.09	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.17	0.00	0.12	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.19	0.01	0.23	0.31	0.48	0.38
C5'	0.04	0.19	0.01	0.01	0.18	0.00	0.23	0.00	0.25	0.20	0.23	0.16	0.28	0.25	0.15	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.17	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.21	0.00	0.13	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.25	0.01	0.24	0.34	0.51	0.40
C8	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.09	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.02	0.20	0.29	0.41	0.36
N1	0.01	0.00	0.13	0.24	0.00	0.12	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.28	0.02	0.23	0.29	0.48	0.37
N3	0.01	0.00	0.15	0.21	0.00	0.08	0.01	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.23	0.02	0.17	0.18	0.38	0.29
N6	0.01	0.01	0.09	0.21	0.00	0.14	0.00	0.28	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.25	0.01	0.26	0.40	0.55	0.43
N7	0.00	0.01	0.03	0.11	0.00	0.11	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.01	0.23	0.36	0.51	0.41
N9	0.00	0.00	0.03	0.09	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.00	0.15	0.19	0.34	0.29
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.06	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.05	0.16	0.08	0.07
O3'	0.02	0.28	0.02	0.01	0.18	0.02	0.19	0.04	0.25	0.07	0.28	0.23	0.25	0.12	0.09	0.02	0.00	0.02	0.25	0.45	0.21	0.29
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.11	0.13	0.20	0.19
O5'	0.07	0.20	0.14	0.23	0.18	0.01	0.23	0.01	0.24	0.20	0.23	0.17	0.26	0.23	0.15	0.05	0.25	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.22	0.18	0.29	0.22	0.08	0.31	0.05	0.34	0.29	0.29	0.18	0.40	0.36	0.19	0.16	0.45	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.21	0.43	0.13	0.14	0.40	0.09	0.48	0.17	0.51	0.41	0.48	0.38	0.55	0.51	0.34	0.08	0.21	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.18	0.33	0.14	0.22	0.32	0.03	0.38	0.01	0.40	0.36	0.37	0.29	0.43	0.41	0.29	0.07	0.29	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00