Doublet Group distance statistics: 48404

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.007, 0.020, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C6	A	0, 0.010, 0.029, 0.048, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.029 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.009, 0.029, 0.049, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.029 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.008, 0.029, 0.051, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.029 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.009, 0.036, 0.062, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.036 std_dev=0.027
C2	A	0, 0.009, 0.040, 0.070, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.040 std_dev=0.031
N4	A	0, 0.032, 0.086, 0.141, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.086 std_dev=0.055
O2	A	0, 0.018, 0.101, 0.185, 0.206 max_d=0.206 avg_d=0.101 std_dev=0.084
N1	B	0, 0.087, 0.444, 0.801, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.444 std_dev=0.357
O4'	A	0, 0.031, 0.398, 0.765, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.398 std_dev=0.367
O2'	A	0, 0.147, 0.521, 0.894, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.521 std_dev=0.373
C2	B	0, 0.128, 0.519, 0.910, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.519 std_dev=0.391
C2'	A	0, 0.071, 0.464, 0.857, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.464 std_dev=0.393
C6	B	0, 0.035, 0.451, 0.868, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.451 std_dev=0.417
N6	B	0, -0.019, 0.436, 0.890, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.436 std_dev=0.455
N3	B	0, 0.082, 0.565, 1.049, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.565 std_dev=0.484
C5	B	0, 0.033, 0.552, 1.072, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.552 std_dev=0.519
C4	B	0, 0.052, 0.586, 1.120, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.586 std_dev=0.534
C4'	A	0, 0.073, 0.656, 1.239, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.656 std_dev=0.583
N7	B	0, 0.050, 0.672, 1.294, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.672 std_dev=0.622
C3'	A	0, 0.061, 0.686, 1.311, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.686 std_dev=0.625
C2'	B	0, -0.042, 0.611, 1.264, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.611 std_dev=0.653
N9	B	0, 0.034, 0.705, 1.376, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.705 std_dev=0.671
C3'	B	0, 0.047, 0.747, 1.447, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.747 std_dev=0.700
C8	B	0, 0.046, 0.746, 1.447, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.746 std_dev=0.700
C1'	B	0, 0.002, 0.736, 1.469, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.736 std_dev=0.733
O4'	B	0, 0.130, 0.889, 1.648, 1.938 max_d=1.938 avg_d=0.889 std_dev=0.759
O2'	B	0, -0.183, 0.578, 1.338, 1.884 max_d=1.884 avg_d=0.578 std_dev=0.760
O3'	B	0, 0.044, 0.808, 1.571, 1.960 max_d=1.960 avg_d=0.808 std_dev=0.764
O3'	A	0, 0.090, 0.916, 1.741, 2.069 max_d=2.069 avg_d=0.916 std_dev=0.825
C4'	B	0, 0.046, 0.872, 1.698, 2.069 max_d=2.069 avg_d=0.872 std_dev=0.826
O5'	A	0, 0.145, 1.073, 2.001, 2.177 max_d=2.177 avg_d=1.073 std_dev=0.928
C5'	B	0, 0.063, 1.028, 1.994, 2.221 max_d=2.221 avg_d=1.028 std_dev=0.966
C5'	A	0, 0.102, 1.073, 2.043, 2.356 max_d=2.356 avg_d=1.073 std_dev=0.971
OP2	A	0, 0.182, 1.267, 2.352, 2.493 max_d=2.493 avg_d=1.267 std_dev=1.085
P	A	0, 0.128, 1.250, 2.373, 2.586 max_d=2.586 avg_d=1.250 std_dev=1.122
O5'	B	0, 0.015, 1.233, 2.451, 3.134 max_d=3.134 avg_d=1.233 std_dev=1.218
OP1	A	0, 0.043, 1.448, 2.853, 3.256 max_d=3.256 avg_d=1.448 std_dev=1.405
OP1	B	0, 0.367, 1.812, 3.257, 3.505 max_d=3.505 avg_d=1.812 std_dev=1.445
P	B	0, 0.114, 1.576, 3.039, 3.667 max_d=3.667 avg_d=1.576 std_dev=1.463
OP2	B	0, 0.562, 2.149, 3.737, 3.814 max_d=3.814 avg_d=2.149 std_dev=1.588

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.00	0.03	0.04	0.09	0.04	0.04	0.01	0.06	0.05	0.09	0.05
C2	0.04	0.00	0.14	0.16	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.09	0.18	0.09	0.20	0.19	0.25	0.19
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.04	0.05	0.08	0.04	0.10	0.02	0.10	0.06	0.24	0.01	0.03	0.04	0.06	0.06	0.12	0.08
C3'	0.03	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.03	0.03	0.05	0.08	0.16	0.09	0.21	0.02	0.01	0.02	0.12	0.09	0.15	0.13
C4	0.03	0.02	0.04	0.09	0.00	0.03	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.10	0.06	0.26	0.28	0.33	0.26
C4'	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.06	0.02	0.06	0.04	0.04	0.03	0.06	0.11	0.06	0.01	0.04	0.04	0.07	0.05
C5	0.04	0.01	0.08	0.03	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.04	0.05	0.28	0.30	0.32	0.29
C5'	0.02	0.06	0.04	0.03	0.08	0.02	0.13	0.00	0.13	0.07	0.07	0.08	0.08	0.10	0.09	0.03	0.02	0.06	0.03	0.03
C6	0.04	0.01	0.10	0.05	0.02	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.08	0.07	0.06	0.26	0.26	0.25	0.24
N1	0.00	0.01	0.02	0.08	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.08	0.03	0.19	0.18	0.20	0.17
N3	0.03	0.01	0.10	0.16	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.06	0.18	0.08	0.24	0.24	0.30	0.23
N4	0.04	0.04	0.06	0.09	0.01	0.03	0.03	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.05	0.07	0.10	0.08	0.25	0.29	0.34	0.26
O2	0.09	0.02	0.24	0.21	0.04	0.06	0.02	0.08	0.03	0.03	0.03	0.05	0.00	0.19	0.24	0.13	0.18	0.16	0.24	0.17
O2'	0.04	0.09	0.01	0.02	0.05	0.11	0.09	0.10	0.08	0.02	0.06	0.07	0.19	0.00	0.01	0.12	0.09	0.12	0.11	0.10
O3'	0.04	0.18	0.03	0.01	0.10	0.06	0.04	0.09	0.07	0.08	0.18	0.10	0.24	0.01	0.00	0.04	0.19	0.18	0.23	0.21
O4'	0.01	0.09	0.04	0.02	0.06	0.01	0.05	0.03	0.06	0.03	0.08	0.08	0.13	0.12	0.04	0.00	0.05	0.05	0.09	0.05
O5'	0.06	0.20	0.06	0.12	0.26	0.04	0.28	0.02	0.26	0.19	0.24	0.25	0.18	0.09	0.19	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02
OP1	0.05	0.19	0.06	0.09	0.28	0.04	0.30	0.06	0.26	0.18	0.24	0.29	0.16	0.12	0.18	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.25	0.12	0.15	0.33	0.07	0.32	0.03	0.25	0.20	0.30	0.34	0.24	0.11	0.23	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.19	0.08	0.13	0.26	0.05	0.29	0.03	0.24	0.17	0.23	0.26	0.17	0.10	0.21	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.24	0.12	0.12	0.07	0.08	0.05	0.05	0.03	0.10	0.16	0.19	0.19	0.15	0.04	0.19	0.17	0.05	0.58	0.72	1.32	0.87
C2	0.07	0.21	0.06	0.13	0.07	0.10	0.10	0.11	0.07	0.16	0.19	0.13	0.17	0.19	0.08	0.12	0.17	0.11	0.70	0.85	1.42	1.00
C2'	0.24	0.40	0.27	0.18	0.23	0.18	0.14	0.15	0.17	0.12	0.32	0.35	0.20	0.14	0.18	0.43	0.18	0.18	0.48	0.54	1.17	0.73
C3'	0.30	0.44	0.29	0.18	0.29	0.22	0.22	0.19	0.24	0.20	0.37	0.39	0.22	0.20	0.26	0.46	0.15	0.26	0.53	0.60	1.22	0.79
C4	0.17	0.23	0.14	0.22	0.15	0.20	0.16	0.23	0.16	0.24	0.24	0.16	0.17	0.25	0.18	0.18	0.26	0.22	0.84	1.06	1.60	1.19
C4'	0.07	0.22	0.09	0.11	0.07	0.04	0.06	0.04	0.05	0.10	0.14	0.18	0.18	0.15	0.04	0.20	0.18	0.05	0.61	0.77	1.38	0.92
C5	0.14	0.21	0.12	0.20	0.12	0.19	0.15	0.22	0.14	0.23	0.21	0.14	0.16	0.25	0.16	0.15	0.24	0.20	0.83	1.06	1.61	1.19
C5'	0.06	0.21	0.09	0.16	0.06	0.07	0.05	0.08	0.04	0.10	0.15	0.16	0.13	0.14	0.04	0.14	0.25	0.07	0.67	0.88	1.46	1.00
C6	0.08	0.19	0.07	0.15	0.07	0.14	0.12	0.17	0.09	0.20	0.17	0.12	0.17	0.22	0.11	0.11	0.20	0.14	0.77	0.97	1.54	1.11
N1	0.04	0.19	0.05	0.12	0.04	0.09	0.09	0.11	0.06	0.16	0.15	0.12	0.18	0.20	0.07	0.11	0.17	0.10	0.70	0.86	1.44	1.00
N3	0.13	0.23	0.11	0.18	0.12	0.16	0.14	0.18	0.14	0.20	0.24	0.15	0.15	0.22	0.14	0.15	0.23	0.17	0.78	0.97	1.51	1.11
N4	0.21	0.25	0.18	0.26	0.18	0.24	0.19	0.27	0.20	0.26	0.27	0.18	0.20	0.25	0.21	0.21	0.31	0.25	0.88	1.15	1.65	1.27
O2	0.06	0.20	0.07	0.12	0.05	0.10	0.10	0.09	0.07	0.14	0.15	0.13	0.24	0.19	0.07	0.13	0.16	0.10	0.65	0.76	1.33	0.91
O2'	0.19	0.31	0.26	0.20	0.15	0.16	0.06	0.13	0.07	0.07	0.18	0.28	0.23	0.12	0.11	0.40	0.23	0.13	0.39	0.44	1.08	0.63
O3'	0.38	0.50	0.38	0.27	0.35	0.31	0.26	0.26	0.28	0.23	0.41	0.47	0.24	0.22	0.32	0.58	0.26	0.33	0.48	0.51	1.13	0.70
O4'	0.12	0.22	0.19	0.24	0.11	0.17	0.13	0.16	0.11	0.17	0.15	0.18	0.22	0.21	0.11	0.15	0.31	0.12	0.68	0.89	1.46	1.00
O5'	0.24	0.39	0.18	0.11	0.25	0.14	0.20	0.11	0.23	0.16	0.35	0.34	0.16	0.15	0.22	0.32	0.14	0.22	0.56	0.75	1.33	0.89
OP1	0.23	0.37	0.14	0.09	0.24	0.11	0.19	0.08	0.22	0.16	0.33	0.32	0.15	0.15	0.21	0.29	0.16	0.21	0.58	0.82	1.37	0.94
OP2	0.29	0.46	0.20	0.14	0.32	0.16	0.27	0.13	0.32	0.21	0.43	0.39	0.25	0.20	0.27	0.33	0.18	0.26	0.55	0.80	1.34	0.92
P	0.21	0.37	0.13	0.11	0.23	0.09	0.18	0.06	0.22	0.14	0.34	0.31	0.15	0.14	0.19	0.26	0.19	0.19	0.60	0.84	1.40	0.96

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.20	0.16	0.32	0.20
C2	0.02	0.00	0.03	0.07	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.08	0.10	0.02	0.35	0.25	0.72	0.43
C2'	0.01	0.03	0.00	0.02	0.05	0.03	0.08	0.03	0.08	0.08	0.06	0.02	0.07	0.10	0.04	0.01	0.03	0.01	0.24	0.07	0.38	0.21
C3'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.08	0.01	0.11	0.02	0.12	0.12	0.10	0.05	0.13	0.14	0.06	0.09	0.01	0.01	0.31	0.19	0.37	0.29
C4	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.09	0.03	0.36	0.27	0.69	0.44
C4'	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.05	0.02	0.06	0.07	0.03	0.10	0.03	0.01	0.03	0.16	0.02	0.03
C5	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.14	0.05	0.43	0.41	0.86	0.58
C5'	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.06	0.05	0.04	0.02	0.08	0.07	0.03	0.12	0.03	0.05	0.02	0.08	0.13	0.03
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.16	0.05	0.44	0.45	0.92	0.61
C8	0.03	0.02	0.08	0.12	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.12	0.07	0.42	0.39	0.76	0.56
N1	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.04	0.41	0.37	0.86	0.54
N3	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.09	0.07	0.02	0.31	0.19	0.62	0.36
N6	0.02	0.02	0.07	0.13	0.01	0.06	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.17	0.07	0.46	0.52	1.01	0.68
N7	0.03	0.02	0.10	0.14	0.02	0.07	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.06	0.16	0.07	0.47	0.49	0.92	0.66
N9	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.06	0.04	0.33	0.23	0.59	0.39
O2'	0.03	0.08	0.01	0.09	0.06	0.10	0.05	0.12	0.06	0.05	0.06	0.09	0.05	0.06	0.04	0.00	0.14	0.05	0.14	0.11	0.22	0.10
O3'	0.01	0.10	0.03	0.01	0.09	0.03	0.14	0.03	0.16	0.12	0.14	0.07	0.17	0.16	0.06	0.14	0.00	0.02	0.26	0.24	0.29	0.25
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.02	0.07	0.07	0.04	0.05	0.02	0.00	0.17	0.26	0.18	0.18
O5'	0.20	0.35	0.24	0.31	0.36	0.03	0.43	0.02	0.44	0.42	0.41	0.31	0.46	0.47	0.33	0.14	0.26	0.17	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.16	0.25	0.07	0.19	0.27	0.16	0.41	0.08	0.45	0.39	0.37	0.19	0.52	0.49	0.23	0.11	0.24	0.26	0.02	0.00	0.05	0.00
OP2	0.32	0.72	0.38	0.37	0.69	0.02	0.86	0.13	0.92	0.76	0.86	0.62	1.01	0.92	0.59	0.22	0.29	0.18	0.02	0.05	0.00	0.02
P	0.20	0.43	0.21	0.29	0.44	0.03	0.58	0.03	0.61	0.56	0.54	0.36	0.68	0.66	0.39	0.10	0.25	0.18	0.01	0.00	0.02	0.00