Doublet Group distance statistics: 48406

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.007, 0.025, 0.044, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.005, 0.026, 0.047, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.029 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.002, 0.026, 0.050, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.026 std_dev=0.024
N1	A	0, 0.002, 0.041, 0.080, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.041 std_dev=0.039
O2	A	0, 0.012, 0.052, 0.092, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.052 std_dev=0.040
N4	A	0, -0.012, 0.049, 0.109, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.049 std_dev=0.060
O4'	A	0, -0.004, 0.198, 0.400, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.198 std_dev=0.202
N6	B	0, 0.070, 0.327, 0.584, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.327 std_dev=0.257
C6	B	0, 0.098, 0.418, 0.739, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.418 std_dev=0.321
N1	B	0, 0.116, 0.442, 0.768, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.442 std_dev=0.326
C2'	A	0, -0.019, 0.311, 0.641, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.311 std_dev=0.330
P	A	0, 0.088, 0.434, 0.780, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.434 std_dev=0.346
C4'	A	0, -0.042, 0.324, 0.689, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.324 std_dev=0.365
O5'	A	0, 0.028, 0.434, 0.839, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.434 std_dev=0.405
C3'	A	0, -0.061, 0.350, 0.761, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.350 std_dev=0.411
C5	B	0, 0.114, 0.531, 0.948, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.531 std_dev=0.417
C2	B	0, 0.148, 0.576, 1.004, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.576 std_dev=0.428
C5'	A	0, -0.012, 0.419, 0.850, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.419 std_dev=0.431
O2'	B	0, 0.183, 0.626, 1.068, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.626 std_dev=0.442
N7	B	0, 0.104, 0.586, 1.068, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.586 std_dev=0.482
C4	B	0, 0.149, 0.641, 1.133, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.641 std_dev=0.492
N3	B	0, 0.170, 0.678, 1.185, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.678 std_dev=0.507
C2'	B	0, 0.197, 0.718, 1.238, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.718 std_dev=0.521
C8	B	0, 0.134, 0.707, 1.281, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.707 std_dev=0.573
N9	B	0, 0.173, 0.754, 1.335, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.754 std_dev=0.581
O2'	A	0, -0.056, 0.615, 1.285, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.615 std_dev=0.671
C1'	B	0, 0.184, 0.880, 1.577, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.880 std_dev=0.696
O3'	A	0, -0.097, 0.600, 1.298, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.600 std_dev=0.697
OP1	A	0, 0.089, 0.843, 1.596, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.843 std_dev=0.753
O4'	B	0, 0.074, 1.258, 2.443, 2.845 max_d=2.845 avg_d=1.258 std_dev=1.185
OP1	B	0, -0.039, 1.465, 2.969, 3.533 max_d=3.533 avg_d=1.465 std_dev=1.504
OP2	A	0, -0.239, 1.279, 2.797, 3.411 max_d=3.411 avg_d=1.279 std_dev=1.518
C3'	B	0, 0.005, 1.533, 3.060, 3.617 max_d=3.617 avg_d=1.533 std_dev=1.527
C4'	B	0, -0.025, 1.558, 3.141, 3.729 max_d=3.729 avg_d=1.558 std_dev=1.583
O5'	B	0, -0.100, 1.535, 3.169, 3.799 max_d=3.799 avg_d=1.535 std_dev=1.634
P	B	0, -0.110, 1.562, 3.234, 3.881 max_d=3.881 avg_d=1.562 std_dev=1.672
C5'	B	0, -0.125, 1.701, 3.528, 4.235 max_d=4.235 avg_d=1.701 std_dev=1.826
OP2	B	0, -0.194, 1.633, 3.461, 4.185 max_d=4.185 avg_d=1.633 std_dev=1.827
O3'	B	0, -0.122, 2.033, 4.189, 5.017 max_d=5.017 avg_d=2.033 std_dev=2.156

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.20	0.01	0.12	0.28	0.08	0.11
C2	0.04	0.00	0.10	0.20	0.00	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.04	0.02	0.02	0.44	0.54	0.05
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.14	0.13	0.15	0.03	0.07	0.06	0.21	0.02	0.02	0.03	0.29	0.51	0.21	0.46
C3'	0.02	0.20	0.00	0.00	0.24	0.00	0.22	0.00	0.19	0.17	0.25	0.24	0.18	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.14	0.20
C4	0.02	0.00	0.05	0.24	0.00	0.09	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.31	0.10	0.02	0.01	0.61	0.88	0.17
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.08	0.07	0.10	0.07	0.08	0.22	0.01	0.01	0.01	0.17	0.25	0.06
C5	0.02	0.02	0.14	0.22	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.34	0.13	0.02	0.01	0.60	0.88	0.19
C5'	0.04	0.02	0.13	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.09	0.19	0.01	0.01	0.33	0.40	0.01
C6	0.02	0.01	0.15	0.19	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.28	0.09	0.03	0.03	0.49	0.65	0.13
N1	0.01	0.01	0.03	0.17	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.20	0.03	0.01	0.04	0.39	0.45	0.04
N3	0.05	0.01	0.07	0.25	0.00	0.10	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.24	0.04	0.02	0.01	0.53	0.75	0.12
N4	0.01	0.01	0.06	0.24	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.34	0.12	0.01	0.01	0.70	0.98	0.18
O2	0.07	0.01	0.21	0.18	0.02	0.08	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.12	0.02	0.02	0.37	0.42	0.01
O2'	0.03	0.19	0.02	0.01	0.31	0.22	0.34	0.09	0.28	0.20	0.24	0.34	0.05	0.00	0.08	0.13	0.17	0.41	0.23	0.41
O3'	0.20	0.04	0.02	0.01	0.10	0.01	0.13	0.19	0.09	0.03	0.04	0.12	0.12	0.08	0.00	0.11	0.28	0.45	0.03	0.05
O4'	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.13	0.11	0.00	0.05	0.02	0.03	0.05
O5'	0.12	0.02	0.29	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.02	0.17	0.28	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.28	0.44	0.51	0.01	0.61	0.17	0.60	0.33	0.49	0.39	0.53	0.70	0.37	0.41	0.45	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.08	0.54	0.21	0.14	0.88	0.25	0.88	0.40	0.65	0.45	0.75	0.98	0.42	0.23	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.11	0.05	0.46	0.20	0.17	0.06	0.19	0.01	0.13	0.04	0.12	0.18	0.01	0.41	0.05	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.06	0.28	0.46	0.04	0.04	0.02	0.06	0.02	0.01	0.06	0.05	0.04	0.01	0.05	0.10	0.12	0.31	0.52	0.06	0.12	0.25
C2	0.02	0.10	0.29	0.52	0.07	0.05	0.07	0.05	0.07	0.06	0.09	0.10	0.06	0.06	0.05	0.08	0.22	0.20	0.57	0.05	0.13	0.27
C2'	0.11	0.18	0.46	0.55	0.17	0.05	0.16	0.05	0.16	0.16	0.17	0.18	0.15	0.16	0.15	0.16	0.17	0.17	0.60	0.12	0.15	0.31
C3'	0.10	0.12	0.25	0.37	0.04	0.11	0.03	0.08	0.01	0.05	0.08	0.10	0.08	0.08	0.03	0.12	0.05	0.34	0.52	0.11	0.18	0.30
C4	0.18	0.19	0.35	0.74	0.21	0.30	0.22	0.30	0.20	0.24	0.18	0.21	0.21	0.24	0.21	0.05	0.52	0.06	0.84	0.30	0.49	0.57
C4'	0.23	0.22	0.14	0.32	0.17	0.15	0.13	0.11	0.13	0.11	0.19	0.21	0.08	0.09	0.18	0.28	0.04	0.42	0.44	0.02	0.11	0.21
C5	0.11	0.10	0.32	0.71	0.13	0.26	0.15	0.29	0.13	0.18	0.09	0.12	0.14	0.18	0.13	0.10	0.48	0.04	0.83	0.31	0.51	0.57
C5'	0.24	0.23	0.12	0.36	0.19	0.11	0.14	0.07	0.14	0.12	0.21	0.22	0.10	0.10	0.19	0.33	0.03	0.40	0.48	0.05	0.19	0.26
C6	0.03	0.04	0.29	0.62	0.06	0.15	0.08	0.18	0.06	0.10	0.03	0.05	0.08	0.11	0.05	0.12	0.35	0.14	0.72	0.22	0.38	0.46
N1	0.04	0.05	0.27	0.52	0.01	0.05	0.02	0.07	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.12	0.21	0.23	0.59	0.10	0.20	0.32
N3	0.13	0.19	0.32	0.63	0.18	0.18	0.18	0.16	0.18	0.17	0.18	0.19	0.19	0.17	0.16	0.05	0.38	0.05	0.70	0.15	0.27	0.40
N4	0.32	0.29	0.42	0.87	0.34	0.47	0.35	0.48	0.31	0.38	0.27	0.32	0.32	0.38	0.34	0.05	0.69	0.24	1.01	0.45	0.69	0.74
O2	0.07	0.10	0.25	0.39	0.04	0.10	0.03	0.15	0.02	0.04	0.07	0.08	0.06	0.04	0.04	0.09	0.05	0.32	0.40	0.10	0.09	0.09
O2'	0.06	0.10	0.36	0.35	0.03	0.21	0.04	0.28	0.04	0.07	0.05	0.09	0.10	0.08	0.04	0.15	0.04	0.42	0.29	0.17	0.22	0.03
O3'	0.57	0.58	0.21	0.17	0.49	0.63	0.40	0.58	0.40	0.38	0.52	0.56	0.30	0.33	0.48	0.54	0.64	0.83	0.03	0.34	0.28	0.17
O4'	0.24	0.22	0.14	0.37	0.19	0.11	0.16	0.08	0.16	0.14	0.21	0.21	0.13	0.13	0.20	0.30	0.05	0.41	0.45	0.02	0.12	0.21
O5'	0.17	0.18	0.15	0.42	0.12	0.06	0.08	0.04	0.10	0.05	0.17	0.17	0.05	0.03	0.12	0.29	0.09	0.33	0.56	0.12	0.27	0.34
OP1	0.42	0.36	0.09	0.19	0.38	0.33	0.38	0.33	0.38	0.38	0.38	0.36	0.39	0.38	0.40	0.49	0.07	0.62	0.23	0.25	0.09	0.03
OP2	0.36	0.16	0.64	0.98	0.38	0.57	0.50	0.72	0.43	0.62	0.23	0.23	0.56	0.66	0.44	0.13	0.62	0.28	1.33	1.00	1.19	1.22
P	0.03	0.12	0.31	0.61	0.02	0.12	0.06	0.20	0.03	0.13	0.09	0.09	0.08	0.15	0.03	0.15	0.30	0.19	0.79	0.40	0.55	0.60

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.07	0.05	0.04	0.06	0.08	0.05	0.05	0.02	0.01	0.37	0.00	0.03	0.23	0.56	0.22
C2	0.08	0.00	0.34	0.23	0.02	0.16	0.01	0.18	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.11	0.26	0.35	0.22	0.16	0.34	0.07
C2'	0.01	0.34	0.00	0.01	0.19	0.01	0.12	0.23	0.20	0.15	0.30	0.32	0.17	0.05	0.01	0.00	0.03	0.03	0.42	0.63	0.78	0.60
C3'	0.02	0.23	0.01	0.00	0.26	0.01	0.35	0.01	0.38	0.30	0.33	0.16	0.42	0.37	0.23	0.01	0.00	0.01	0.08	0.02	0.18	0.09
C4	0.05	0.02	0.19	0.26	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.15	0.23	0.26	0.17	0.37	0.06
C4'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.15	0.10	0.16	0.02	0.11	0.07	0.28	0.05	0.01	0.01	0.20	0.35	0.05
C5	0.05	0.01	0.12	0.35	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.18	0.03	0.18	0.40	0.12	0.22	0.06
C5'	0.07	0.18	0.23	0.01	0.09	0.00	0.05	0.00	0.07	0.11	0.13	0.19	0.03	0.09	0.02	0.04	0.16	0.01	0.01	0.35	0.32	0.02
C6	0.05	0.01	0.20	0.38	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.12	0.02	0.24	0.42	0.09	0.16	0.09
C8	0.04	0.03	0.15	0.30	0.02	0.15	0.00	0.11	0.00	0.00	0.02	0.04	0.03	0.00	0.02	0.36	0.09	0.05	0.43	0.17	0.33	0.03
N1	0.06	0.01	0.30	0.33	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.11	0.31	0.34	0.11	0.22	0.03
N3	0.08	0.00	0.32	0.16	0.01	0.16	0.01	0.19	0.02	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.12	0.34	0.33	0.15	0.20	0.42	0.12
N6	0.05	0.01	0.17	0.42	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.18	0.11	0.21	0.50	0.04	0.03	0.18
N7	0.05	0.03	0.05	0.37	0.02	0.11	0.01	0.09	0.00	0.00	0.02	0.03	0.03	0.00	0.03	0.34	0.14	0.06	0.50	0.11	0.16	0.13
N9	0.02	0.04	0.01	0.23	0.02	0.07	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.00	0.19	0.11	0.04	0.25	0.19	0.43	0.08
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.07	0.28	0.18	0.04	0.12	0.36	0.02	0.12	0.18	0.34	0.19	0.00	0.03	0.20	0.35	0.64	0.81	0.57
O3'	0.37	0.26	0.03	0.00	0.15	0.05	0.03	0.16	0.02	0.09	0.11	0.34	0.11	0.14	0.11	0.03	0.00	0.30	0.10	0.44	0.03	0.17
O4'	0.00	0.35	0.03	0.01	0.23	0.01	0.18	0.01	0.24	0.05	0.31	0.33	0.21	0.06	0.04	0.20	0.30	0.00	0.18	0.11	0.46	0.03
O5'	0.03	0.22	0.42	0.08	0.26	0.01	0.40	0.01	0.42	0.43	0.34	0.15	0.50	0.50	0.25	0.35	0.10	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.23	0.16	0.63	0.02	0.17	0.20	0.12	0.35	0.09	0.17	0.11	0.20	0.04	0.11	0.19	0.64	0.44	0.11	0.01	0.00	0.03	0.01
OP2	0.56	0.34	0.78	0.18	0.37	0.35	0.22	0.32	0.16	0.33	0.22	0.42	0.03	0.16	0.43	0.81	0.03	0.46	0.00	0.03	0.00	0.01
P	0.22	0.07	0.60	0.09	0.06	0.05	0.06	0.02	0.09	0.03	0.03	0.12	0.18	0.13	0.08	0.57	0.17	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00