Doublet Group distance statistics: 48409

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.000, 0.027, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.000, 0.161, 0.321, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.161 std_dev=0.161
C2'	A	0, 0.000, 0.185, 0.370, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.185 std_dev=0.185
O2'	A	0, 0.000, 0.206, 0.412, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.206 std_dev=0.206
C4'	A	0, 0.000, 0.279, 0.557, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.279 std_dev=0.279
C3'	A	0, 0.000, 0.289, 0.578, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.289 std_dev=0.289
N6	B	0, 0.000, 0.307, 0.614, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.307 std_dev=0.307
C6	B	0, 0.000, 0.387, 0.774, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.387 std_dev=0.387
O3'	A	0, 0.000, 0.419, 0.837, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.419 std_dev=0.419
O5'	A	0, 0.000, 0.443, 0.886, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.443 std_dev=0.443
N1	B	0, 0.000, 0.463, 0.925, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.463 std_dev=0.463
C5	B	0, 0.000, 0.478, 0.956, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.478 std_dev=0.478
C5'	A	0, 0.000, 0.487, 0.974, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.487 std_dev=0.487
P	A	0, 0.000, 0.545, 1.089, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.545 std_dev=0.545
N7	B	0, 0.000, 0.554, 1.108, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.554 std_dev=0.554
C3'	B	0, 0.000, 0.571, 1.141, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.571 std_dev=0.571
C4	B	0, 0.000, 0.582, 1.164, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.582 std_dev=0.582
C2	B	0, 0.000, 0.588, 1.175, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.588 std_dev=0.588
OP2	A	0, 0.000, 0.589, 1.178, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.589 std_dev=0.589
OP1	A	0, 0.000, 0.590, 1.180, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.590 std_dev=0.590
N3	B	0, 0.000, 0.641, 1.283, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.641 std_dev=0.641
C8	B	0, 0.000, 0.663, 1.327, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.663 std_dev=0.663
N9	B	0, 0.000, 0.678, 1.356, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.678 std_dev=0.678
C1'	B	0, 0.000, 0.845, 1.690, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.845 std_dev=0.845
C2'	B	0, 0.000, 0.878, 1.756, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.878 std_dev=0.878
O2'	B	0, 0.000, 0.953, 1.907, 1.907 max_d=1.907 avg_d=0.953 std_dev=0.953
O3'	B	0, 0.000, 0.959, 1.917, 1.917 max_d=1.917 avg_d=0.959 std_dev=0.959
O4'	B	0, 0.000, 1.002, 2.005, 2.005 max_d=2.005 avg_d=1.002 std_dev=1.002
O5'	B	0, 0.000, 1.014, 2.027, 2.027 max_d=2.027 avg_d=1.014 std_dev=1.014
OP2	B	0, 0.000, 1.017, 2.033, 2.033 max_d=2.033 avg_d=1.017 std_dev=1.017
C4'	B	0, 0.000, 1.028, 2.056, 2.056 max_d=2.056 avg_d=1.028 std_dev=1.028
P	B	0, 0.000, 1.243, 2.487, 2.487 max_d=2.487 avg_d=1.243 std_dev=1.243
C5'	B	0, 0.000, 1.280, 2.560, 2.560 max_d=2.560 avg_d=1.280 std_dev=1.280
OP1	B	0, 0.000, 1.644, 3.289, 3.289 max_d=3.289 avg_d=1.644 std_dev=1.644

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.09	0.06
C2	0.00	0.00	0.06	0.05	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.05	0.03	0.14	0.15	0.21	0.16
C2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.07	0.11	0.12	0.08
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.07	0.00	0.04	0.02	0.08	0.02	0.00	0.01	0.06	0.12	0.09	0.09
C4	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.21	0.25	0.32	0.26
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.02	0.06	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00
C5	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.22	0.26	0.31	0.26
C5'	0.03	0.08	0.01	0.01	0.14	0.00	0.16	0.00	0.14	0.08	0.10	0.16	0.04	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00
C6	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.19	0.20	0.22	0.19
N1	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.14	0.17	0.13
N3	0.00	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.05	0.03	0.17	0.20	0.27	0.21
N4	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.22	0.29	0.37	0.29
O2	0.01	0.00	0.10	0.08	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.10	0.03	0.11	0.11	0.19	0.13
O2'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.08	0.04
O3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.04	0.08	0.00	0.05	0.01	0.10	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.07	0.06
O4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03
O5'	0.07	0.14	0.07	0.06	0.21	0.00	0.22	0.01	0.19	0.13	0.17	0.22	0.11	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.07	0.15	0.11	0.12	0.25	0.02	0.26	0.01	0.20	0.14	0.20	0.29	0.11	0.05	0.11	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01
OP2	0.09	0.21	0.12	0.09	0.32	0.01	0.31	0.01	0.22	0.17	0.27	0.37	0.19	0.08	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01
P	0.06	0.16	0.08	0.09	0.26	0.00	0.26	0.00	0.19	0.13	0.21	0.29	0.13	0.04	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.38	0.13	0.35	0.25	0.26	0.41	0.22	0.42	0.14	0.30	0.08	0.23	0.10	0.25	0.32	0.17	0.25	0.44	0.40	0.35	0.02	0.26
C2	0.25	0.05	0.21	0.20	0.17	0.26	0.16	0.24	0.10	0.22	0.03	0.13	0.08	0.19	0.21	0.02	0.25	0.29	0.29	0.18	0.13	0.12
C2'	0.50	0.16	0.46	0.34	0.35	0.54	0.32	0.60	0.21	0.44	0.12	0.29	0.18	0.38	0.43	0.34	0.21	0.58	0.52	0.53	0.16	0.43
C3'	0.52	0.15	0.48	0.37	0.34	0.58	0.30	0.66	0.19	0.44	0.10	0.28	0.15	0.37	0.44	0.37	0.19	0.61	0.55	0.58	0.20	0.47
C4	0.13	0.03	0.11	0.16	0.07	0.15	0.06	0.12	0.01	0.11	0.05	0.03	0.00	0.08	0.10	0.12	0.25	0.16	0.17	0.01	0.23	0.02
C4'	0.47	0.13	0.43	0.31	0.29	0.53	0.23	0.57	0.12	0.35	0.06	0.26	0.07	0.28	0.37	0.30	0.21	0.56	0.50	0.49	0.08	0.38
C5	0.18	0.01	0.16	0.17	0.10	0.20	0.08	0.18	0.03	0.14	0.02	0.07	0.01	0.11	0.14	0.05	0.27	0.21	0.20	0.06	0.19	0.02
C5'	0.42	0.06	0.38	0.28	0.22	0.49	0.14	0.52	0.03	0.28	0.02	0.19	0.04	0.19	0.30	0.25	0.23	0.51	0.44	0.42	0.01	0.32
C6	0.25	0.05	0.22	0.19	0.16	0.27	0.13	0.27	0.07	0.20	0.02	0.13	0.04	0.16	0.20	0.02	0.28	0.29	0.27	0.16	0.13	0.11
N1	0.29	0.08	0.25	0.21	0.19	0.31	0.16	0.30	0.09	0.23	0.04	0.16	0.07	0.19	0.24	0.05	0.27	0.33	0.31	0.22	0.10	0.16
N3	0.16	0.02	0.13	0.17	0.09	0.17	0.09	0.14	0.04	0.14	0.04	0.05	0.03	0.12	0.13	0.12	0.24	0.18	0.21	0.06	0.20	0.02
N4	0.06	0.07	0.05	0.14	0.00	0.08	0.00	0.03	0.04	0.04	0.09	0.02	0.05	0.02	0.03	0.19	0.23	0.07	0.10	0.09	0.29	0.11
O2	0.30	0.09	0.25	0.22	0.23	0.31	0.21	0.28	0.14	0.27	0.06	0.18	0.11	0.24	0.27	0.01	0.24	0.34	0.34	0.24	0.08	0.18
O2'	0.57	0.19	0.53	0.37	0.39	0.62	0.35	0.68	0.24	0.48	0.15	0.33	0.20	0.41	0.48	0.44	0.19	0.65	0.58	0.63	0.22	0.51
O3'	0.60	0.16	0.56	0.43	0.39	0.68	0.35	0.80	0.22	0.52	0.12	0.31	0.18	0.44	0.51	0.49	0.15	0.71	0.65	0.73	0.33	0.61
O4'	0.36	0.11	0.33	0.22	0.22	0.40	0.17	0.40	0.09	0.26	0.05	0.21	0.04	0.20	0.28	0.15	0.27	0.43	0.38	0.33	0.06	0.24
O5'	0.27	0.04	0.24	0.17	0.09	0.33	0.02	0.35	0.08	0.14	0.12	0.07	0.14	0.06	0.17	0.10	0.33	0.35	0.28	0.23	0.14	0.14
OP1	0.28	0.06	0.26	0.18	0.07	0.34	0.01	0.38	0.11	0.13	0.15	0.06	0.19	0.03	0.16	0.15	0.33	0.35	0.27	0.23	0.15	0.13
OP2	0.08	0.19	0.06	0.02	0.09	0.12	0.16	0.13	0.25	0.06	0.28	0.09	0.32	0.14	0.02	0.07	0.45	0.13	0.06	0.04	0.36	0.11
P	0.22	0.07	0.20	0.14	0.04	0.28	0.04	0.29	0.14	0.07	0.17	0.04	0.21	0.01	0.11	0.07	0.35	0.29	0.21	0.14	0.22	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.23	0.00	0.02	0.04	0.40	0.13
C2	0.03	0.00	0.07	0.09	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.23	0.01	0.04	0.11	0.43	0.18
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.19	0.03	0.03	0.05	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.02	0.40	0.11
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.15	0.00	0.23	0.01	0.21	0.29	0.16	0.07	0.25	0.30	0.18	0.00	0.00	0.01	0.30	0.30	0.05	0.23
C4	0.01	0.00	0.03	0.15	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.10	0.01	0.07	0.11	0.43	0.17
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.24	0.01	0.00	0.01	0.08	0.23	0.02
C5	0.01	0.00	0.02	0.23	0.00	0.03	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.05	0.02	0.10	0.15	0.42	0.18
C5'	0.10	0.09	0.19	0.01	0.11	0.00	0.13	0.00	0.13	0.15	0.11	0.08	0.15	0.15	0.12	0.06	0.17	0.01	0.00	0.08	0.27	0.00
C6	0.01	0.00	0.03	0.21	0.00	0.02	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.01	0.02	0.09	0.17	0.42	0.20
C8	0.01	0.00	0.03	0.29	0.00	0.04	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.19	0.01	0.15	0.12	0.42	0.15
N1	0.02	0.00	0.05	0.16	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.11	0.01	0.06	0.15	0.43	0.20
N3	0.03	0.00	0.07	0.07	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.26	0.00	0.04	0.09	0.43	0.16
N6	0.00	0.00	0.01	0.25	0.00	0.02	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.26	0.08	0.03	0.09	0.21	0.40	0.21
N7	0.00	0.00	0.01	0.30	0.00	0.03	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.20	0.02	0.14	0.17	0.41	0.17
N9	0.00	0.01	0.01	0.18	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.03	0.01	0.08	0.08	0.42	0.14
O2'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.18	0.24	0.22	0.06	0.24	0.16	0.22	0.15	0.26	0.21	0.13	0.00	0.01	0.17	0.20	0.18	0.35	0.03
O3'	0.23	0.23	0.00	0.00	0.10	0.01	0.05	0.17	0.01	0.19	0.11	0.26	0.08	0.20	0.03	0.01	0.00	0.20	0.35	0.61	0.24	0.41
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.17	0.20	0.00	0.06	0.03	0.36	0.12
O5'	0.02	0.04	0.06	0.30	0.07	0.01	0.10	0.00	0.09	0.15	0.06	0.04	0.09	0.14	0.08	0.20	0.35	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.04	0.11	0.02	0.30	0.11	0.08	0.15	0.08	0.17	0.12	0.15	0.09	0.21	0.17	0.08	0.18	0.61	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.40	0.43	0.40	0.05	0.43	0.23	0.42	0.27	0.42	0.42	0.43	0.43	0.40	0.41	0.42	0.35	0.24	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.13	0.18	0.11	0.23	0.17	0.02	0.18	0.00	0.20	0.15	0.20	0.16	0.21	0.17	0.14	0.03	0.41	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00