Doublet Group distance statistics: 48422

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 1, 3, 3, 3, 4, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N4	A	0, 0.020, 0.041, 0.063, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.041 std_dev=0.022
O2	A	0, 0.014, 0.042, 0.070, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.042 std_dev=0.028
C2'	A	0, 0.052, 0.122, 0.192, 0.242 max_d=0.242 avg_d=0.122 std_dev=0.070
O4'	A	0, 0.034, 0.113, 0.191, 0.334 max_d=0.334 avg_d=0.113 std_dev=0.079
O2'	A	0, 0.106, 0.221, 0.336, 0.453 max_d=0.453 avg_d=0.221 std_dev=0.115
C4'	A	0, 0.104, 0.233, 0.361, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.233 std_dev=0.128
C3'	A	0, 0.099, 0.233, 0.368, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.233 std_dev=0.135
O3'	A	0, 0.123, 0.330, 0.537, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.330 std_dev=0.207
C5'	A	0, 0.192, 0.402, 0.612, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.402 std_dev=0.210
C2	B	0, 0.384, 0.616, 0.848, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.616 std_dev=0.232
N3	B	0, 0.342, 0.578, 0.813, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.578 std_dev=0.235
O2	B	0, 0.418, 0.654, 0.890, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.654 std_dev=0.236
C4	B	0, 0.391, 0.643, 0.896, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.643 std_dev=0.252
N4	B	0, 0.414, 0.687, 0.961, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.687 std_dev=0.274
N1	B	0, 0.388, 0.680, 0.973, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.680 std_dev=0.292
C5	B	0, 0.427, 0.722, 1.018, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.722 std_dev=0.296
O5'	A	0, 0.136, 0.445, 0.753, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.445 std_dev=0.309
C6	B	0, 0.408, 0.728, 1.047, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.728 std_dev=0.319
C1'	B	0, 0.432, 0.765, 1.098, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.765 std_dev=0.333
C2'	B	0, 0.538, 0.901, 1.265, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.901 std_dev=0.363
O4'	B	0, 0.426, 0.824, 1.222, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.824 std_dev=0.398
O2'	B	0, 0.591, 0.992, 1.392, 1.808 max_d=1.808 avg_d=0.992 std_dev=0.401
C3'	B	0, 0.569, 1.004, 1.438, 1.957 max_d=1.957 avg_d=1.004 std_dev=0.435
C4'	B	0, 0.496, 0.961, 1.425, 1.970 max_d=1.970 avg_d=0.961 std_dev=0.465
O5'	B	0, 0.544, 1.022, 1.500, 2.121 max_d=2.121 avg_d=1.022 std_dev=0.478
C5'	B	0, 0.558, 1.059, 1.559, 2.209 max_d=2.209 avg_d=1.059 std_dev=0.500
O3'	B	0, 0.651, 1.155, 1.660, 2.257 max_d=2.257 avg_d=1.155 std_dev=0.504
P	A	0, 0.240, 0.757, 1.275, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.757 std_dev=0.517
OP2	B	0, 0.604, 1.123, 1.641, 2.256 max_d=2.256 avg_d=1.123 std_dev=0.519
P	B	0, 0.590, 1.116, 1.642, 2.314 max_d=2.314 avg_d=1.116 std_dev=0.526
OP1	B	0, 0.673, 1.292, 1.910, 2.624 max_d=2.624 avg_d=1.292 std_dev=0.619
OP1	A	0, 0.206, 1.000, 1.794, 2.828 max_d=2.828 avg_d=1.000 std_dev=0.794
OP2	A	0, 0.238, 1.215, 2.191, 3.151 max_d=3.151 avg_d=1.215 std_dev=0.977

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.10	0.30	0.40	0.18
C2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.02	0.03	0.02	0.09	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.08	0.02	0.18	0.42	0.43	0.19
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.07	0.04	0.11	0.01	0.03	0.01	0.14	0.19	0.26	0.12
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.03	0.09	0.05	0.08	0.09	0.09	0.01	0.01	0.01	0.17	0.14	0.16	0.13
C4	0.02	0.02	0.04	0.08	0.00	0.06	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.09	0.03	0.26	0.58	0.59	0.29
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.04	0.07	0.04	0.04	0.02	0.00	0.03	0.15	0.33	0.10
C5	0.02	0.02	0.03	0.10	0.01	0.09	0.00	0.20	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.11	0.04	0.28	0.59	0.63	0.32
C5'	0.04	0.09	0.03	0.03	0.17	0.01	0.20	0.00	0.17	0.10	0.12	0.19	0.06	0.04	0.04	0.02	0.01	0.24	0.27	0.01
C6	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.10	0.04	0.24	0.47	0.48	0.25
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.17	0.39	0.40	0.19
N3	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.04	0.02	0.12	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.09	0.10	0.02	0.22	0.51	0.50	0.23
N4	0.02	0.03	0.04	0.09	0.01	0.07	0.02	0.19	0.02	0.02	0.02	0.00	0.05	0.07	0.10	0.03	0.28	0.64	0.67	0.32
O2	0.03	0.01	0.11	0.09	0.04	0.04	0.04	0.06	0.03	0.02	0.03	0.05	0.00	0.13	0.11	0.04	0.15	0.37	0.41	0.17
O2'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.06	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.09	0.07	0.13	0.00	0.05	0.04	0.09	0.17	0.35	0.12
O3'	0.02	0.08	0.03	0.01	0.09	0.02	0.11	0.04	0.10	0.05	0.10	0.10	0.11	0.05	0.00	0.02	0.18	0.20	0.20	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.00	0.10	0.31	0.49	0.26
O5'	0.10	0.18	0.14	0.17	0.26	0.03	0.28	0.01	0.24	0.17	0.22	0.28	0.15	0.09	0.18	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.30	0.42	0.19	0.14	0.58	0.15	0.59	0.24	0.47	0.39	0.51	0.64	0.37	0.17	0.20	0.31	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.40	0.43	0.26	0.16	0.59	0.33	0.63	0.27	0.48	0.40	0.50	0.67	0.41	0.35	0.20	0.49	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.19	0.12	0.13	0.29	0.10	0.32	0.01	0.25	0.19	0.23	0.32	0.17	0.12	0.16	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.12	0.17	0.17	0.12	0.15	0.11	0.14	0.10	0.12	0.09	0.18	0.19	0.22	0.20	0.14	0.13	0.17	0.16	0.13
C2	0.13	0.14	0.13	0.09	0.11	0.10	0.11	0.09	0.10	0.12	0.10	0.18	0.21	0.16	0.10	0.13	0.08	0.11	0.14	0.10
C2'	0.17	0.15	0.19	0.17	0.13	0.16	0.11	0.14	0.11	0.14	0.12	0.18	0.23	0.23	0.21	0.17	0.13	0.13	0.11	0.11
C3'	0.17	0.15	0.19	0.17	0.13	0.16	0.11	0.14	0.11	0.15	0.12	0.18	0.23	0.23	0.21	0.18	0.13	0.13	0.10	0.10
C4	0.13	0.15	0.13	0.11	0.14	0.12	0.15	0.12	0.13	0.13	0.14	0.17	0.21	0.14	0.11	0.14	0.11	0.14	0.17	0.14
C4'	0.14	0.12	0.17	0.17	0.11	0.14	0.10	0.13	0.09	0.11	0.09	0.17	0.19	0.22	0.22	0.14	0.12	0.17	0.16	0.13
C5	0.12	0.13	0.11	0.08	0.12	0.09	0.14	0.09	0.12	0.12	0.11	0.17	0.20	0.15	0.09	0.12	0.09	0.12	0.15	0.11
C5'	0.15	0.13	0.19	0.19	0.14	0.16	0.13	0.15	0.11	0.12	0.11	0.19	0.19	0.23	0.24	0.14	0.16	0.21	0.21	0.17
C6	0.12	0.12	0.12	0.09	0.11	0.09	0.12	0.08	0.10	0.10	0.09	0.17	0.19	0.17	0.11	0.11	0.08	0.11	0.13	0.09
N1	0.12	0.12	0.14	0.11	0.11	0.11	0.11	0.09	0.09	0.11	0.09	0.18	0.19	0.18	0.13	0.12	0.09	0.12	0.13	0.10
N3	0.13	0.15	0.13	0.10	0.12	0.11	0.13	0.10	0.12	0.13	0.13	0.17	0.21	0.15	0.11	0.13	0.10	0.12	0.16	0.11
N4	0.16	0.17	0.16	0.17	0.17	0.17	0.19	0.18	0.17	0.16	0.16	0.18	0.21	0.16	0.18	0.17	0.18	0.21	0.23	0.20
O2	0.13	0.13	0.14	0.11	0.11	0.11	0.10	0.09	0.09	0.12	0.08	0.18	0.22	0.17	0.12	0.13	0.10	0.12	0.14	0.11
O2'	0.18	0.16	0.20	0.19	0.16	0.17	0.14	0.16	0.14	0.16	0.15	0.20	0.21	0.24	0.24	0.18	0.15	0.15	0.15	0.14
O3'	0.20	0.17	0.19	0.18	0.15	0.19	0.14	0.17	0.15	0.18	0.15	0.19	0.23	0.24	0.23	0.22	0.16	0.15	0.12	0.14
O4'	0.16	0.13	0.20	0.21	0.13	0.18	0.13	0.18	0.12	0.13	0.11	0.19	0.19	0.25	0.26	0.15	0.17	0.23	0.21	0.18
O5'	0.20	0.20	0.22	0.21	0.22	0.20	0.22	0.20	0.20	0.20	0.20	0.26	0.24	0.26	0.24	0.20	0.21	0.24	0.24	0.22
OP1	0.37	0.39	0.36	0.37	0.46	0.38	0.46	0.41	0.43	0.40	0.42	0.50	0.39	0.33	0.36	0.38	0.45	0.48	0.52	0.49
OP2	0.42	0.40	0.46	0.44	0.44	0.42	0.42	0.42	0.40	0.40	0.41	0.51	0.44	0.50	0.47	0.41	0.45	0.46	0.51	0.48
P	0.17	0.17	0.17	0.16	0.18	0.16	0.18	0.17	0.15	0.16	0.16	0.24	0.21	0.20	0.17	0.16	0.20	0.23	0.26	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02	0.02	0.00	0.03	0.05	0.07	0.04
C2	0.03	0.00	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.11	0.02	0.09	0.10	0.13	0.09
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.07	0.07	0.11	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.06	0.05
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.10	0.01	0.07	0.01	0.06	0.05	0.11	0.12	0.12	0.02	0.01	0.01	0.07	0.08	0.09	0.07
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.13	0.04	0.12	0.13	0.17	0.13
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.08	0.04	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.09	0.05	0.10	0.11	0.14	0.10
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.08	0.01	0.07	0.00	0.05	0.04	0.07	0.09	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.08	0.07	0.10	0.06
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.06	0.07	0.09	0.07
N3	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.14	0.02	0.11	0.13	0.16	0.12
N4	0.02	0.02	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.09	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.06	0.15	0.04	0.13	0.16	0.20	0.15
O2	0.06	0.01	0.11	0.12	0.02	0.08	0.02	0.07	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.10	0.15	0.05	0.09	0.11	0.12	0.09
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.05	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.06	0.06	0.10	0.00	0.04	0.04	0.04	0.09	0.05	0.04
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.13	0.02	0.09	0.03	0.06	0.05	0.14	0.15	0.15	0.04	0.00	0.01	0.10	0.13	0.14	0.11
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.05	0.04	0.01	0.00	0.05	0.05	0.08	0.05
O5'	0.03	0.09	0.04	0.07	0.12	0.01	0.10	0.01	0.08	0.06	0.11	0.13	0.09	0.04	0.10	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.05	0.10	0.07	0.08	0.13	0.06	0.11	0.06	0.07	0.07	0.13	0.16	0.11	0.09	0.13	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.13	0.06	0.09	0.17	0.02	0.14	0.02	0.10	0.09	0.16	0.20	0.12	0.05	0.14	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.09	0.05	0.07	0.13	0.02	0.10	0.01	0.06	0.07	0.12	0.15	0.09	0.04	0.11	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00