Doublet Group distance statistics: 48430

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 19, 19, 12, 1, 1, 0, 2, 2, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.008, 0.016, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.002, 0.016, 0.031, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.016 std_dev=0.014
N4	A	0, 0.016, 0.047, 0.077, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.047 std_dev=0.031
O2	A	0, -0.004, 0.041, 0.086, 0.291 max_d=0.291 avg_d=0.041 std_dev=0.045
O4'	A	0, -0.053, 0.105, 0.263, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.105 std_dev=0.158
C2'	A	0, -0.041, 0.121, 0.283, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.121 std_dev=0.162
O4	B	0, 0.216, 0.406, 0.596, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.406 std_dev=0.190
C4	B	0, 0.170, 0.366, 0.562, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.366 std_dev=0.196
N3	B	0, 0.142, 0.355, 0.569, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.355 std_dev=0.213
C5	B	0, 0.164, 0.414, 0.663, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.414 std_dev=0.249
C3'	A	0, -0.044, 0.207, 0.457, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.207 std_dev=0.251
C4'	A	0, -0.083, 0.179, 0.442, 1.968 max_d=1.968 avg_d=0.179 std_dev=0.263
O2'	A	0, -0.033, 0.231, 0.495, 2.163 max_d=2.163 avg_d=0.231 std_dev=0.264
C2	B	0, 0.119, 0.389, 0.659, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.389 std_dev=0.270
C6	B	0, 0.142, 0.441, 0.740, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.441 std_dev=0.299
O2	B	0, 0.114, 0.420, 0.725, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.420 std_dev=0.305
N1	B	0, 0.116, 0.426, 0.736, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.426 std_dev=0.310
OP2	A	0, 0.070, 0.417, 0.763, 2.371 max_d=2.371 avg_d=0.417 std_dev=0.347
O3'	A	0, -0.057, 0.308, 0.673, 2.650 max_d=2.650 avg_d=0.308 std_dev=0.365
O5'	A	0, -0.074, 0.296, 0.666, 2.421 max_d=2.421 avg_d=0.296 std_dev=0.370
C5'	A	0, -0.100, 0.277, 0.655, 2.650 max_d=2.650 avg_d=0.277 std_dev=0.377
C1'	B	0, 0.100, 0.490, 0.880, 1.828 max_d=1.828 avg_d=0.490 std_dev=0.390
P	A	0, -0.052, 0.342, 0.737, 2.646 max_d=2.646 avg_d=0.342 std_dev=0.394
O4'	B	0, 0.172, 0.585, 0.999, 2.166 max_d=2.166 avg_d=0.585 std_dev=0.413
C2'	B	0, 0.041, 0.496, 0.950, 2.157 max_d=2.157 avg_d=0.496 std_dev=0.455
C3'	B	0, 0.099, 0.579, 1.059, 2.493 max_d=2.493 avg_d=0.579 std_dev=0.480
C4'	B	0, 0.111, 0.622, 1.134, 2.682 max_d=2.682 avg_d=0.622 std_dev=0.512
O5'	B	0, 0.130, 0.651, 1.171, 2.736 max_d=2.736 avg_d=0.651 std_dev=0.520
OP1	A	0, -0.103, 0.444, 0.990, 3.585 max_d=3.585 avg_d=0.444 std_dev=0.547
O2'	B	0, -0.009, 0.549, 1.107, 2.690 max_d=2.690 avg_d=0.549 std_dev=0.558
C5'	B	0, 0.147, 0.722, 1.297, 3.077 max_d=3.077 avg_d=0.722 std_dev=0.575
O3'	B	0, 0.069, 0.656, 1.243, 3.070 max_d=3.070 avg_d=0.656 std_dev=0.587
OP2	B	0, 0.097, 0.693, 1.288, 2.777 max_d=2.777 avg_d=0.693 std_dev=0.595
P	B	0, 0.094, 0.709, 1.323, 2.964 max_d=2.964 avg_d=0.709 std_dev=0.615
OP1	B	0, 0.080, 0.801, 1.523, 3.215 max_d=3.215 avg_d=0.801 std_dev=0.721

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.08	0.00	0.08	0.09	0.13	0.08
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.04	0.13	0.11	0.14	0.11
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.02	0.06	0.05	0.06	0.02	0.07	0.06	0.12	0.01	0.02	0.01	0.16	0.16	0.23	0.17
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.15	0.01	0.16	0.03	0.14	0.09	0.13	0.17	0.09	0.02	0.01	0.02	0.10	0.12	0.11	0.08
C4	0.02	0.01	0.05	0.15	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.12	0.04	0.20	0.19	0.22	0.19
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.11	0.05	0.05	0.09	0.07	0.11	0.02	0.00	0.02	0.07	0.09	0.02
C5	0.02	0.01	0.06	0.16	0.01	0.11	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.13	0.06	0.22	0.20	0.21	0.20
C5'	0.03	0.06	0.05	0.03	0.13	0.01	0.16	0.00	0.14	0.07	0.09	0.14	0.07	0.07	0.08	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.11	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.14	0.10	0.07	0.18	0.15	0.14	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.05	0.02	0.12	0.10	0.12	0.10
N3	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.10	0.03	0.16	0.15	0.18	0.15
N4	0.02	0.01	0.06	0.17	0.01	0.09	0.02	0.14	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.15	0.14	0.04	0.22	0.23	0.26	0.22
O2	0.05	0.01	0.12	0.09	0.02	0.07	0.02	0.07	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.09	0.14	0.08	0.12	0.11	0.13	0.11
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.14	0.11	0.16	0.07	0.14	0.08	0.10	0.15	0.09	0.00	0.04	0.08	0.10	0.12	0.24	0.13
O3'	0.08	0.09	0.02	0.01	0.12	0.02	0.13	0.08	0.10	0.05	0.10	0.14	0.14	0.04	0.00	0.04	0.12	0.18	0.14	0.13
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.03	0.04	0.08	0.08	0.04	0.00	0.06	0.07	0.10	0.06
O5'	0.08	0.13	0.16	0.10	0.20	0.02	0.22	0.01	0.18	0.12	0.16	0.22	0.12	0.10	0.12	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.09	0.11	0.16	0.12	0.19	0.07	0.20	0.08	0.15	0.10	0.15	0.23	0.11	0.12	0.18	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.14	0.23	0.11	0.22	0.09	0.21	0.12	0.14	0.12	0.18	0.26	0.13	0.24	0.14	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.11	0.17	0.08	0.19	0.02	0.20	0.02	0.14	0.10	0.15	0.22	0.11	0.13	0.13	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.16	0.22	0.19	0.16	0.16	0.16	0.12	0.14	0.15	0.15	0.20	0.28	0.25	0.20	0.15	0.16	0.23	0.36	0.23
C2	0.16	0.16	0.21	0.19	0.17	0.15	0.17	0.13	0.15	0.15	0.15	0.19	0.25	0.23	0.22	0.14	0.17	0.22	0.34	0.23
C2'	0.21	0.21	0.27	0.22	0.19	0.19	0.19	0.13	0.18	0.19	0.19	0.25	0.33	0.28	0.23	0.18	0.13	0.18	0.32	0.19
C3'	0.21	0.21	0.25	0.21	0.23	0.19	0.23	0.14	0.21	0.20	0.21	0.24	0.31	0.25	0.26	0.20	0.15	0.20	0.32	0.20
C4	0.11	0.12	0.14	0.12	0.12	0.11	0.14	0.16	0.12	0.11	0.11	0.16	0.18	0.14	0.17	0.11	0.22	0.31	0.41	0.30
C4'	0.15	0.15	0.20	0.17	0.15	0.13	0.16	0.11	0.14	0.14	0.14	0.19	0.26	0.22	0.19	0.14	0.16	0.24	0.37	0.24
C5	0.11	0.12	0.14	0.11	0.12	0.11	0.14	0.17	0.12	0.11	0.11	0.16	0.18	0.13	0.15	0.11	0.24	0.34	0.44	0.33
C5'	0.15	0.15	0.18	0.14	0.15	0.13	0.16	0.15	0.14	0.14	0.14	0.19	0.24	0.18	0.18	0.14	0.22	0.31	0.43	0.30
C6	0.12	0.13	0.16	0.13	0.13	0.11	0.14	0.15	0.12	0.11	0.11	0.17	0.21	0.16	0.17	0.11	0.21	0.31	0.42	0.30
N1	0.14	0.14	0.19	0.16	0.15	0.13	0.15	0.12	0.13	0.13	0.13	0.18	0.24	0.21	0.19	0.13	0.18	0.25	0.38	0.25
N3	0.14	0.14	0.17	0.15	0.16	0.13	0.16	0.13	0.13	0.13	0.13	0.17	0.21	0.19	0.21	0.13	0.18	0.25	0.36	0.25
N4	0.12	0.13	0.13	0.12	0.11	0.13	0.14	0.19	0.12	0.11	0.12	0.16	0.16	0.13	0.14	0.12	0.25	0.34	0.43	0.33
O2	0.20	0.20	0.26	0.24	0.20	0.20	0.19	0.16	0.18	0.19	0.19	0.22	0.30	0.30	0.24	0.18	0.16	0.19	0.30	0.20
O2'	0.21	0.21	0.27	0.25	0.24	0.21	0.23	0.18	0.21	0.20	0.21	0.24	0.33	0.31	0.29	0.19	0.22	0.26	0.41	0.29
O3'	0.21	0.22	0.26	0.23	0.25	0.19	0.25	0.16	0.23	0.21	0.22	0.24	0.31	0.27	0.29	0.19	0.18	0.22	0.33	0.23
O4'	0.15	0.15	0.20	0.18	0.14	0.14	0.14	0.14	0.13	0.13	0.13	0.18	0.25	0.23	0.18	0.14	0.19	0.28	0.40	0.27
O5'	0.18	0.18	0.18	0.15	0.20	0.16	0.22	0.20	0.20	0.18	0.18	0.20	0.23	0.17	0.23	0.19	0.27	0.36	0.47	0.36
OP1	0.19	0.19	0.18	0.15	0.20	0.18	0.23	0.24	0.21	0.19	0.18	0.21	0.22	0.15	0.23	0.20	0.31	0.42	0.52	0.41
OP2	0.23	0.22	0.20	0.20	0.23	0.25	0.26	0.34	0.25	0.23	0.22	0.24	0.22	0.18	0.24	0.26	0.40	0.50	0.58	0.49
P	0.18	0.17	0.15	0.14	0.19	0.18	0.21	0.26	0.19	0.18	0.17	0.20	0.19	0.13	0.21	0.20	0.33	0.44	0.54	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.13	0.07
C2	0.02	0.00	0.07	0.05	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.01	0.03	0.14	0.16	0.26	0.17
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.11	0.00	0.02	0.04	0.01	0.07	0.11	0.14	0.08
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.02	0.11	0.04	0.05	0.09	0.02	0.01	0.07	0.02	0.07	0.14	0.13	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.23	0.29	0.39	0.29
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.04	0.04	0.05	0.05	0.02	0.08	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02
C5	0.02	0.02	0.05	0.10	0.01	0.10	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.12	0.02	0.04	0.25	0.30	0.38	0.29
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.16	0.00	0.19	0.00	0.17	0.09	0.11	0.05	0.06	0.04	0.18	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.12	0.01	0.03	0.21	0.22	0.28	0.22
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.14	0.15	0.22	0.15
N3	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.01	0.03	0.19	0.23	0.33	0.23
O2	0.04	0.01	0.11	0.09	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.14	0.13	0.02	0.04	0.11	0.12	0.23	0.13
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.06	0.04	0.03	0.08	0.14	0.00	0.04	0.06	0.04	0.05	0.10	0.11	0.06
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.07	0.02	0.12	0.04	0.12	0.04	0.07	0.13	0.04	0.00	0.09	0.01	0.10	0.20	0.16	0.14
O4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.08	0.02	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.09	0.00	0.04	0.25	0.33	0.43	0.32
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.04	0.00	0.07	0.07	0.10	0.09
O5'	0.07	0.14	0.07	0.07	0.23	0.02	0.25	0.01	0.21	0.14	0.19	0.11	0.05	0.10	0.25	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.07	0.16	0.11	0.14	0.29	0.05	0.30	0.05	0.22	0.15	0.23	0.12	0.10	0.20	0.33	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.26	0.14	0.13	0.39	0.04	0.38	0.02	0.28	0.22	0.33	0.23	0.11	0.16	0.43	0.10	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.17	0.08	0.10	0.29	0.02	0.29	0.01	0.22	0.15	0.23	0.13	0.06	0.14	0.32	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00