Doublet Group distance statistics: 48435

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 5, 2, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, -0.004, 0.013, 0.030, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.013 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.020, 0.041, 0.062, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.041 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.015, 0.046, 0.077, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.046 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.066, 0.149, 0.232, 0.320 max_d=0.320 avg_d=0.149 std_dev=0.083
C2'	A	0, 0.077, 0.183, 0.290, 0.337 max_d=0.337 avg_d=0.183 std_dev=0.106
C4'	A	0, 0.099, 0.224, 0.350, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.224 std_dev=0.126
C3'	A	0, 0.149, 0.302, 0.455, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.302 std_dev=0.153
O2'	A	0, 0.066, 0.248, 0.431, 0.594 max_d=0.594 avg_d=0.248 std_dev=0.182
C5'	A	0, 0.170, 0.378, 0.585, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.378 std_dev=0.208
O3'	A	0, 0.253, 0.467, 0.681, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.467 std_dev=0.214
C5	B	0, 0.270, 0.485, 0.701, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.485 std_dev=0.215
C6	B	0, 0.249, 0.471, 0.694, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.471 std_dev=0.223
O4	B	0, 0.281, 0.517, 0.754, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.517 std_dev=0.237
C4	B	0, 0.216, 0.457, 0.697, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.457 std_dev=0.241
O5'	A	0, 0.156, 0.411, 0.666, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.411 std_dev=0.255
O5'	B	0, 0.334, 0.614, 0.894, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.614 std_dev=0.280
C2'	B	0, 0.209, 0.504, 0.799, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.504 std_dev=0.295
N1	B	0, 0.138, 0.440, 0.742, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.440 std_dev=0.302
P	B	0, 0.296, 0.603, 0.910, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.603 std_dev=0.307
OP2	B	0, 0.396, 0.719, 1.041, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.719 std_dev=0.323
N3	B	0, 0.131, 0.454, 0.777, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.454 std_dev=0.323
OP1	A	0, 0.253, 0.577, 0.901, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.577 std_dev=0.324
C1'	B	0, 0.179, 0.506, 0.833, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.506 std_dev=0.327
P	A	0, 0.182, 0.511, 0.841, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.511 std_dev=0.329
C3'	B	0, 0.265, 0.596, 0.926, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.596 std_dev=0.331
O2'	B	0, 0.241, 0.600, 0.960, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.600 std_dev=0.360
OP1	B	0, 0.265, 0.626, 0.988, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.626 std_dev=0.362
OP2	A	0, 0.230, 0.596, 0.961, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.596 std_dev=0.365
C2	B	0, 0.083, 0.453, 0.823, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.453 std_dev=0.370
O3'	B	0, 0.322, 0.702, 1.082, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.702 std_dev=0.380
O4'	B	0, 0.247, 0.640, 1.033, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.640 std_dev=0.393
C4'	B	0, 0.229, 0.643, 1.057, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.643 std_dev=0.414
O2	B	0, 0.125, 0.564, 1.002, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.564 std_dev=0.438
C5'	B	0, 0.247, 0.851, 1.455, 1.848 max_d=1.848 avg_d=0.851 std_dev=0.604

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.02	0.00	0.05	0.06	0.07	0.05
C2	0.03	0.00	0.08	0.09	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.12	0.02	0.10	0.10	0.12	0.09
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.03	0.04	0.02	0.05	0.02	0.07	0.05	0.14	0.01	0.02	0.01	0.06	0.09	0.11	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.08	0.05	0.10	0.10	0.13	0.02	0.01	0.02	0.08	0.10	0.13	0.08
C4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.12	0.03	0.13	0.14	0.18	0.14
C4'	0.02	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.06	0.08	0.03	0.00	0.02	0.07	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02	0.14	0.15	0.18	0.15
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.07	0.04	0.05	0.07	0.05	0.09	0.06	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.03	0.12	0.12	0.13	0.11
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.09	0.09	0.10	0.08
N3	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.13	0.02	0.11	0.12	0.16	0.12
N4	0.01	0.02	0.05	0.10	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.14	0.03	0.13	0.16	0.20	0.16
O2	0.05	0.01	0.14	0.13	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.14	0.16	0.04	0.09	0.10	0.11	0.08
O2'	0.03	0.08	0.01	0.02	0.03	0.08	0.02	0.09	0.02	0.02	0.07	0.03	0.14	0.00	0.05	0.04	0.08	0.06	0.10	0.08
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.12	0.03	0.12	0.06	0.10	0.06	0.13	0.14	0.16	0.05	0.00	0.03	0.13	0.13	0.17	0.11
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.00	0.04	0.05	0.09	0.07
O5'	0.05	0.10	0.06	0.08	0.13	0.02	0.14	0.02	0.12	0.09	0.11	0.13	0.09	0.08	0.13	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.10	0.09	0.10	0.14	0.07	0.15	0.06	0.12	0.09	0.12	0.16	0.10	0.06	0.13	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.07	0.12	0.11	0.13	0.18	0.05	0.18	0.03	0.13	0.10	0.16	0.20	0.11	0.10	0.17	0.09	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.09	0.06	0.08	0.14	0.03	0.15	0.02	0.11	0.08	0.12	0.16	0.08	0.08	0.11	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.20	0.18	0.18	0.16	0.25	0.17	0.51	0.19	0.20	0.17	0.23	0.27	0.12	0.16	0.23	0.19	0.24	0.46	0.28
C2	0.19	0.17	0.14	0.18	0.14	0.23	0.16	0.51	0.17	0.17	0.15	0.18	0.23	0.13	0.14	0.20	0.19	0.24	0.46	0.28
C2'	0.27	0.25	0.24	0.22	0.21	0.29	0.22	0.52	0.23	0.25	0.23	0.29	0.32	0.20	0.21	0.29	0.17	0.19	0.40	0.22
C3'	0.25	0.24	0.22	0.22	0.22	0.28	0.23	0.52	0.23	0.23	0.23	0.27	0.30	0.20	0.23	0.27	0.17	0.15	0.34	0.17
C4	0.13	0.12	0.13	0.18	0.12	0.23	0.13	0.54	0.13	0.12	0.11	0.12	0.19	0.18	0.13	0.13	0.20	0.27	0.44	0.28
C4'	0.21	0.19	0.17	0.17	0.16	0.24	0.16	0.51	0.17	0.19	0.17	0.22	0.26	0.12	0.17	0.22	0.18	0.24	0.44	0.26
C5	0.13	0.12	0.13	0.18	0.12	0.23	0.13	0.54	0.13	0.12	0.12	0.14	0.20	0.18	0.13	0.13	0.21	0.28	0.44	0.28
C5'	0.20	0.19	0.16	0.16	0.16	0.24	0.16	0.53	0.17	0.18	0.17	0.22	0.26	0.09	0.16	0.21	0.23	0.31	0.49	0.32
C6	0.15	0.15	0.13	0.17	0.13	0.23	0.14	0.54	0.14	0.14	0.13	0.17	0.21	0.15	0.14	0.16	0.20	0.27	0.45	0.28
N1	0.18	0.17	0.14	0.17	0.14	0.23	0.15	0.52	0.16	0.17	0.15	0.19	0.23	0.13	0.14	0.19	0.19	0.25	0.46	0.28
N3	0.15	0.14	0.13	0.18	0.13	0.23	0.15	0.53	0.15	0.15	0.13	0.14	0.21	0.15	0.14	0.16	0.19	0.25	0.45	0.28
N4	0.10	0.09	0.12	0.20	0.11	0.23	0.13	0.56	0.12	0.10	0.09	0.09	0.17	0.21	0.12	0.10	0.21	0.28	0.43	0.28
O2	0.21	0.19	0.16	0.18	0.15	0.24	0.18	0.49	0.20	0.20	0.15	0.20	0.24	0.11	0.14	0.23	0.19	0.24	0.48	0.28
O2'	0.33	0.30	0.29	0.25	0.23	0.33	0.24	0.54	0.27	0.29	0.26	0.34	0.38	0.23	0.22	0.35	0.21	0.24	0.46	0.28
O3'	0.30	0.29	0.27	0.26	0.28	0.32	0.29	0.52	0.29	0.29	0.28	0.32	0.35	0.25	0.29	0.32	0.20	0.14	0.29	0.15
O4'	0.20	0.18	0.16	0.17	0.14	0.24	0.15	0.52	0.17	0.18	0.15	0.21	0.26	0.10	0.14	0.21	0.22	0.29	0.49	0.31
O5'	0.22	0.23	0.20	0.17	0.20	0.27	0.20	0.58	0.20	0.21	0.21	0.26	0.30	0.10	0.21	0.23	0.26	0.36	0.53	0.37
OP1	0.23	0.25	0.20	0.16	0.22	0.27	0.22	0.59	0.22	0.22	0.23	0.29	0.30	0.10	0.23	0.24	0.29	0.39	0.53	0.39
OP2	0.21	0.22	0.18	0.20	0.21	0.29	0.21	0.62	0.21	0.21	0.22	0.26	0.25	0.17	0.21	0.22	0.35	0.45	0.56	0.45
P	0.19	0.20	0.16	0.15	0.18	0.25	0.18	0.58	0.18	0.18	0.19	0.23	0.26	0.10	0.18	0.20	0.30	0.41	0.54	0.41

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.09	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.28	0.31	0.20	0.25
C2	0.02	0.00	0.12	0.13	0.01	0.08	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.15	0.01	0.05	0.29	0.25	0.29	0.25
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.05	0.05	0.08	0.03	0.10	0.03	0.09	0.20	0.00	0.03	0.06	0.02	0.14	0.17	0.19	0.11
C3'	0.03	0.13	0.01	0.00	0.19	0.00	0.25	0.03	0.24	0.13	0.14	0.17	0.04	0.01	0.20	0.03	0.05	0.13	0.21	0.05
C4	0.02	0.01	0.05	0.19	0.00	0.21	0.01	0.51	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.21	0.00	0.04	0.29	0.28	0.42	0.31
C4'	0.02	0.08	0.05	0.00	0.21	0.00	0.27	0.01	0.25	0.12	0.14	0.07	0.14	0.03	0.22	0.00	0.02	0.19	0.20	0.03
C5	0.02	0.01	0.08	0.25	0.01	0.27	0.00	0.56	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.28	0.01	0.03	0.28	0.30	0.41	0.32
C5'	0.09	0.29	0.03	0.03	0.51	0.01	0.56	0.00	0.49	0.31	0.40	0.18	0.15	0.07	0.55	0.03	0.01	0.34	0.30	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.24	0.01	0.25	0.00	0.49	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.26	0.01	0.04	0.28	0.26	0.32	0.27
N1	0.01	0.01	0.03	0.13	0.01	0.12	0.01	0.31	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.11	0.01	0.02	0.29	0.26	0.26	0.25
N3	0.02	0.00	0.09	0.14	0.00	0.14	0.01	0.40	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.16	0.01	0.05	0.29	0.25	0.36	0.27
O2	0.04	0.00	0.20	0.17	0.01	0.07	0.01	0.18	0.02	0.02	0.01	0.00	0.26	0.23	0.02	0.06	0.30	0.28	0.25	0.24
O2'	0.02	0.16	0.00	0.04	0.09	0.14	0.06	0.15	0.07	0.04	0.15	0.26	0.00	0.09	0.10	0.10	0.07	0.20	0.15	0.08
O3'	0.02	0.15	0.03	0.01	0.21	0.03	0.28	0.07	0.26	0.11	0.16	0.23	0.09	0.00	0.22	0.02	0.24	0.21	0.37	0.26
O4	0.02	0.01	0.06	0.20	0.00	0.22	0.01	0.55	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.22	0.00	0.04	0.29	0.32	0.46	0.33
O4'	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.00	0.03	0.03	0.04	0.02	0.05	0.06	0.10	0.02	0.04	0.00	0.34	0.41	0.21	0.33
O5'	0.28	0.29	0.14	0.05	0.29	0.02	0.28	0.01	0.28	0.29	0.29	0.30	0.07	0.24	0.29	0.34	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.31	0.25	0.17	0.13	0.28	0.19	0.30	0.34	0.26	0.26	0.25	0.28	0.20	0.21	0.32	0.41	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.29	0.19	0.21	0.42	0.20	0.41	0.30	0.32	0.26	0.36	0.25	0.15	0.37	0.46	0.21	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.25	0.25	0.11	0.05	0.31	0.03	0.32	0.01	0.27	0.25	0.27	0.24	0.08	0.26	0.33	0.33	0.01	0.01	0.01	0.00