Doublet Group distance statistics: 48438

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.009, 0.025, 0.040, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.022 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.009, 0.028, 0.046, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.028 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.002, 0.022, 0.042, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.020
N4	A	0, 0.012, 0.061, 0.110, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.061 std_dev=0.049
O2	A	0, 0.010, 0.060, 0.111, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.060 std_dev=0.051
C2'	A	0, 0.041, 0.114, 0.188, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.114 std_dev=0.074
O4'	A	0, 0.061, 0.151, 0.240, 0.272 max_d=0.272 avg_d=0.151 std_dev=0.089
C4'	A	0, 0.063, 0.199, 0.335, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.199 std_dev=0.136
C3'	A	0, 0.073, 0.226, 0.379, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.226 std_dev=0.153
O2'	A	0, 0.081, 0.265, 0.450, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.265 std_dev=0.185
C5'	A	0, 0.144, 0.341, 0.538, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.341 std_dev=0.197
O5'	A	0, 0.054, 0.283, 0.512, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.283 std_dev=0.229
O3'	A	0, 0.081, 0.318, 0.555, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.318 std_dev=0.237
P	A	0, 0.102, 0.391, 0.681, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.391 std_dev=0.290
N3	B	0, 0.192, 0.503, 0.813, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.503 std_dev=0.311
C4	B	0, 0.235, 0.557, 0.880, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.557 std_dev=0.322
O2	B	0, 0.193, 0.523, 0.853, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.523 std_dev=0.330
C2	B	0, 0.190, 0.524, 0.858, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.524 std_dev=0.334
O4	B	0, 0.258, 0.622, 0.987, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.622 std_dev=0.365
OP1	A	0, 0.164, 0.531, 0.898, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.531 std_dev=0.367
OP2	A	0, 0.107, 0.498, 0.889, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.498 std_dev=0.391
C5	B	0, 0.223, 0.656, 1.088, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.656 std_dev=0.433
N1	B	0, 0.147, 0.628, 1.108, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.628 std_dev=0.481
C6	B	0, 0.132, 0.679, 1.226, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.679 std_dev=0.547
C1'	B	0, 0.104, 0.739, 1.375, 2.167 max_d=2.167 avg_d=0.739 std_dev=0.636
O5'	B	0, 0.249, 0.898, 1.546, 1.794 max_d=1.794 avg_d=0.898 std_dev=0.648
C2'	B	0, 0.107, 0.832, 1.558, 2.377 max_d=2.377 avg_d=0.832 std_dev=0.726
O4'	B	0, 0.189, 0.916, 1.643, 2.436 max_d=2.436 avg_d=0.916 std_dev=0.727
P	B	0, 0.180, 0.969, 1.757, 2.374 max_d=2.374 avg_d=0.969 std_dev=0.788
C3'	B	0, 0.195, 0.992, 1.789, 2.451 max_d=2.451 avg_d=0.992 std_dev=0.797
OP2	B	0, 0.201, 1.009, 1.817, 2.412 max_d=2.412 avg_d=1.009 std_dev=0.808
C4'	B	0, 0.115, 0.971, 1.827, 2.674 max_d=2.674 avg_d=0.971 std_dev=0.856
O2'	B	0, 0.094, 0.958, 1.822, 2.901 max_d=2.901 avg_d=0.958 std_dev=0.864
C5'	B	0, 0.076, 1.003, 1.929, 2.614 max_d=2.614 avg_d=1.003 std_dev=0.927
O3'	B	0, 0.175, 1.172, 2.168, 2.962 max_d=2.962 avg_d=1.172 std_dev=0.996
OP1	B	0, 0.191, 1.247, 2.303, 3.352 max_d=3.352 avg_d=1.247 std_dev=1.056

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.09	0.02	0.02	0.01	0.06	0.07	0.17	0.12
C2	0.04	0.00	0.03	0.07	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.07	0.04	0.08	0.10	0.22	0.15
C2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.07	0.04	0.07	0.03	0.06	0.02	0.04	0.08	0.04	0.01	0.02	0.02	0.05	0.17	0.10	0.06
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.11	0.01	0.11	0.01	0.10	0.05	0.09	0.13	0.06	0.06	0.01	0.02	0.06	0.22	0.11	0.09
C4	0.04	0.03	0.07	0.11	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.08	0.14	0.04	0.11	0.19	0.31	0.21
C4'	0.01	0.04	0.04	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.06	0.06	0.15	0.04	0.00	0.02	0.11	0.06	0.04
C5	0.02	0.02	0.07	0.11	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.05	0.14	0.04	0.12	0.20	0.32	0.22
C5'	0.01	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.04	0.03	0.04	0.05	0.06	0.15	0.03	0.01	0.01	0.11	0.04	0.03
C6	0.02	0.02	0.06	0.10	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.04	0.11	0.04	0.12	0.14	0.26	0.19
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.06	0.02	0.08	0.09	0.21	0.15
N3	0.03	0.01	0.04	0.09	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.11	0.03	0.09	0.14	0.27	0.19
N4	0.05	0.04	0.08	0.13	0.02	0.06	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.00	0.05	0.09	0.18	0.06	0.12	0.23	0.34	0.23
O2	0.09	0.01	0.04	0.06	0.03	0.06	0.03	0.06	0.04	0.04	0.02	0.05	0.00	0.13	0.06	0.09	0.07	0.09	0.19	0.12
O2'	0.02	0.08	0.01	0.06	0.08	0.15	0.05	0.15	0.04	0.03	0.09	0.09	0.13	0.00	0.10	0.10	0.09	0.22	0.08	0.10
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.14	0.04	0.14	0.03	0.11	0.06	0.11	0.18	0.06	0.10	0.00	0.03	0.08	0.32	0.18	0.15
O4'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.06	0.09	0.10	0.03	0.00	0.10	0.10	0.21	0.18
O5'	0.06	0.08	0.05	0.06	0.11	0.02	0.12	0.01	0.12	0.08	0.09	0.12	0.07	0.09	0.08	0.10	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.07	0.10	0.17	0.22	0.19	0.11	0.20	0.11	0.14	0.09	0.14	0.23	0.09	0.22	0.32	0.10	0.03	0.00	0.04	0.02
OP2	0.17	0.22	0.10	0.11	0.31	0.06	0.32	0.04	0.26	0.21	0.27	0.34	0.19	0.08	0.18	0.21	0.03	0.04	0.00	0.02
P	0.12	0.15	0.06	0.09	0.21	0.04	0.22	0.03	0.19	0.15	0.19	0.23	0.12	0.10	0.15	0.18	0.01	0.02	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.20	0.32	0.40	0.21	0.28	0.18	0.27	0.17	0.19	0.21	0.24	0.26	0.50	0.27	0.20	0.25	0.81	0.42	0.27
C2	0.18	0.19	0.27	0.33	0.18	0.23	0.16	0.21	0.14	0.17	0.18	0.24	0.21	0.40	0.25	0.18	0.20	0.76	0.44	0.21
C2'	0.20	0.18	0.30	0.35	0.20	0.23	0.17	0.22	0.15	0.17	0.18	0.22	0.25	0.45	0.27	0.19	0.20	0.70	0.44	0.21
C3'	0.21	0.19	0.29	0.33	0.19	0.23	0.17	0.21	0.16	0.18	0.17	0.25	0.24	0.44	0.25	0.22	0.17	0.69	0.49	0.16
C4	0.18	0.21	0.22	0.27	0.15	0.20	0.14	0.18	0.15	0.18	0.18	0.26	0.18	0.33	0.19	0.20	0.15	0.85	0.49	0.14
C4'	0.21	0.20	0.32	0.40	0.18	0.27	0.16	0.26	0.16	0.18	0.19	0.25	0.26	0.52	0.24	0.20	0.24	0.83	0.43	0.25
C5	0.18	0.20	0.23	0.29	0.14	0.20	0.13	0.18	0.13	0.17	0.18	0.25	0.18	0.37	0.18	0.19	0.15	0.88	0.50	0.15
C5'	0.19	0.19	0.30	0.38	0.17	0.25	0.15	0.23	0.14	0.17	0.17	0.24	0.24	0.50	0.23	0.19	0.21	0.86	0.46	0.23
C6	0.18	0.19	0.27	0.33	0.15	0.22	0.12	0.20	0.13	0.17	0.17	0.25	0.21	0.43	0.21	0.18	0.18	0.86	0.47	0.19
N1	0.19	0.19	0.29	0.35	0.18	0.24	0.15	0.22	0.14	0.17	0.18	0.24	0.23	0.45	0.24	0.18	0.21	0.81	0.45	0.22
N3	0.18	0.20	0.24	0.28	0.17	0.21	0.16	0.19	0.15	0.18	0.17	0.25	0.19	0.34	0.24	0.19	0.17	0.79	0.46	0.16
N4	0.21	0.23	0.22	0.25	0.17	0.21	0.18	0.20	0.20	0.22	0.21	0.26	0.20	0.30	0.16	0.24	0.14	0.88	0.50	0.12
O2	0.20	0.18	0.29	0.34	0.20	0.25	0.18	0.23	0.16	0.18	0.19	0.22	0.23	0.42	0.26	0.19	0.23	0.69	0.43	0.24
O2'	0.23	0.21	0.38	0.44	0.26	0.31	0.23	0.30	0.20	0.20	0.25	0.22	0.35	0.55	0.32	0.22	0.30	0.76	0.37	0.33
O3'	0.21	0.18	0.29	0.32	0.21	0.22	0.20	0.20	0.18	0.18	0.18	0.23	0.25	0.44	0.28	0.23	0.17	0.64	0.50	0.16
O4'	0.21	0.21	0.34	0.42	0.21	0.30	0.18	0.30	0.18	0.20	0.21	0.25	0.27	0.54	0.27	0.21	0.28	0.89	0.42	0.31
O5'	0.16	0.17	0.23	0.28	0.16	0.18	0.15	0.16	0.14	0.16	0.15	0.23	0.18	0.39	0.22	0.18	0.11	0.76	0.57	0.10
OP1	0.16	0.17	0.25	0.29	0.14	0.17	0.15	0.13	0.14	0.16	0.13	0.24	0.21	0.40	0.21	0.18	0.06	0.71	0.65	0.07
OP2	0.19	0.20	0.25	0.28	0.22	0.19	0.23	0.19	0.21	0.20	0.18	0.24	0.22	0.36	0.29	0.21	0.18	0.65	0.80	0.22
P	0.18	0.18	0.24	0.27	0.16	0.17	0.17	0.15	0.16	0.17	0.14	0.23	0.20	0.38	0.21	0.19	0.11	0.70	0.69	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.06	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.21	0.14	0.06
C2	0.03	0.00	0.10	0.11	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.03	0.04	0.09	0.48	0.36	0.11
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.02	0.06	0.02	0.07	0.03	0.10	0.15	0.01	0.02	0.11	0.02	0.07	0.25	0.29	0.14
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.13	0.01	0.12	0.02	0.11	0.05	0.13	0.14	0.01	0.01	0.19	0.02	0.11	0.32	0.28	0.17
C4	0.03	0.02	0.07	0.13	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.16	0.01	0.06	0.11	0.78	0.50	0.15
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.04	0.03	0.05	0.06	0.08	0.02	0.10	0.01	0.02	0.23	0.09	0.04
C5	0.03	0.02	0.06	0.12	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.15	0.03	0.08	0.13	0.75	0.47	0.15
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.05	0.04	0.05	0.06	0.08	0.03	0.10	0.02	0.01	0.28	0.22	0.02
C6	0.03	0.02	0.07	0.11	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.02	0.05	0.13	0.04	0.08	0.14	0.53	0.34	0.13
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.05	0.03	0.01	0.10	0.41	0.29	0.11
N3	0.02	0.01	0.10	0.13	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.02	0.00	0.02	0.10	0.16	0.03	0.04	0.09	0.64	0.45	0.13
O2	0.06	0.01	0.15	0.14	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.17	0.18	0.04	0.09	0.09	0.41	0.34	0.11
O2'	0.02	0.11	0.01	0.01	0.06	0.08	0.04	0.08	0.05	0.04	0.10	0.17	0.00	0.02	0.09	0.06	0.06	0.26	0.18	0.09
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.16	0.02	0.15	0.03	0.13	0.05	0.16	0.18	0.02	0.00	0.24	0.03	0.16	0.51	0.32	0.23
O4	0.04	0.03	0.11	0.19	0.01	0.10	0.03	0.10	0.04	0.03	0.03	0.04	0.09	0.24	0.00	0.07	0.15	0.91	0.53	0.20
O4'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.06	0.01	0.08	0.02	0.08	0.01	0.04	0.09	0.06	0.03	0.07	0.00	0.08	0.13	0.13	0.09
O5'	0.05	0.09	0.07	0.11	0.11	0.02	0.13	0.01	0.14	0.10	0.09	0.09	0.06	0.16	0.15	0.08	0.00	0.05	0.02	0.02
OP1	0.21	0.48	0.25	0.32	0.78	0.23	0.75	0.28	0.53	0.41	0.64	0.41	0.26	0.51	0.91	0.13	0.05	0.00	0.04	0.02
OP2	0.14	0.36	0.29	0.28	0.50	0.09	0.47	0.22	0.34	0.29	0.45	0.34	0.18	0.32	0.53	0.13	0.02	0.04	0.00	0.02
P	0.06	0.11	0.14	0.17	0.15	0.04	0.15	0.02	0.13	0.11	0.13	0.11	0.09	0.23	0.20	0.09	0.02	0.02	0.02	0.00