Doublet Group distance statistics: 48440

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.002, 0.019, 0.035, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.006, 0.024, 0.041, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.018
C5	A	0, -0.001, 0.017, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.003, 0.022, 0.041, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.006, 0.030, 0.053, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.030 std_dev=0.024
O2	A	0, 0.014, 0.049, 0.083, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.049 std_dev=0.034
C2'	A	0, 0.007, 0.051, 0.095, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.051 std_dev=0.044
N4	A	0, 0.000, 0.048, 0.095, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.048 std_dev=0.047
O3'	A	0, 0.011, 0.063, 0.115, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.063 std_dev=0.052
O2'	A	0, 0.002, 0.066, 0.130, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.066 std_dev=0.064
O4'	A	0, 0.010, 0.075, 0.141, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.075 std_dev=0.065
C3'	A	0, 0.017, 0.085, 0.153, 0.167 max_d=0.167 avg_d=0.085 std_dev=0.068
C4'	A	0, 0.024, 0.128, 0.231, 0.254 max_d=0.254 avg_d=0.128 std_dev=0.104
C5'	A	0, 0.042, 0.181, 0.321, 0.339 max_d=0.339 avg_d=0.181 std_dev=0.140
O5'	A	0, 0.041, 0.236, 0.430, 0.477 max_d=0.477 avg_d=0.236 std_dev=0.195
O2	B	0, 0.095, 0.346, 0.597, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.346 std_dev=0.251
C2	B	0, 0.111, 0.391, 0.671, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.391 std_dev=0.280
N3	B	0, 0.130, 0.453, 0.777, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.453 std_dev=0.323
N1	B	0, 0.182, 0.627, 1.072, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.627 std_dev=0.445
P	A	0, 0.156, 0.610, 1.064, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.610 std_dev=0.454
OP1	A	0, 0.197, 0.728, 1.258, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.728 std_dev=0.530
C4	B	0, 0.211, 0.749, 1.287, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.749 std_dev=0.538
C1'	B	0, 0.224, 0.765, 1.306, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.765 std_dev=0.541
C6	B	0, 0.235, 0.824, 1.412, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.824 std_dev=0.589
OP2	A	0, 0.225, 0.841, 1.457, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.841 std_dev=0.616
C5	B	0, 0.251, 0.891, 1.531, 1.473 max_d=1.473 avg_d=0.891 std_dev=0.640
O4	B	0, 0.265, 0.936, 1.607, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.936 std_dev=0.671
C2'	B	0, 0.294, 1.005, 1.716, 1.508 max_d=1.508 avg_d=1.005 std_dev=0.711
O4'	B	0, 0.313, 1.067, 1.822, 1.607 max_d=1.607 avg_d=1.067 std_dev=0.755
O2'	B	0, 0.310, 1.065, 1.820, 1.660 max_d=1.660 avg_d=1.065 std_dev=0.755
C3'	B	0, 0.386, 1.323, 2.259, 2.038 max_d=2.038 avg_d=1.323 std_dev=0.936
C4'	B	0, 0.412, 1.408, 2.405, 2.153 max_d=2.153 avg_d=1.408 std_dev=0.996
O3'	B	0, 0.485, 1.659, 2.834, 2.548 max_d=2.548 avg_d=1.659 std_dev=1.174
O5'	B	0, 0.499, 1.706, 2.913, 2.592 max_d=2.592 avg_d=1.706 std_dev=1.207
C5'	B	0, 0.522, 1.786, 3.050, 2.749 max_d=2.749 avg_d=1.786 std_dev=1.264
OP2	B	0, 0.504, 1.790, 3.077, 2.968 max_d=2.968 avg_d=1.790 std_dev=1.287
P	B	0, 0.554, 1.921, 3.287, 3.064 max_d=3.064 avg_d=1.921 std_dev=1.366
OP1	B	0, 0.599, 2.114, 3.628, 3.471 max_d=3.471 avg_d=2.114 std_dev=1.515

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.00	0.00	0.08	0.06	0.15	0.10
C2	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.12	0.11	0.22	0.15
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.05	0.02
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.02	0.04	0.07	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.03	0.04
C4	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.08	0.11	0.22	0.14
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.03	0.06	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01
C5	0.03	0.01	0.04	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.06	0.08	0.13	0.25	0.15
C5'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.04	0.02	0.04	0.08	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00
C6	0.03	0.01	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.11	0.13	0.25	0.17
N1	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.12	0.11	0.22	0.16
N3	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.10	0.11	0.22	0.14
N4	0.02	0.02	0.02	0.04	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.06	0.10	0.19	0.11
O2	0.07	0.00	0.07	0.07	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.07	0.07	0.06	0.14	0.13	0.22	0.16
O2'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.03	0.01
O3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.02	0.03	0.07	0.02	0.00	0.01	0.09	0.18	0.10	0.11
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.04	0.06	0.01	0.01	0.00	0.09	0.06	0.14	0.11
O5'	0.08	0.12	0.01	0.03	0.08	0.01	0.08	0.00	0.11	0.12	0.10	0.06	0.14	0.01	0.09	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.06	0.11	0.07	0.10	0.11	0.06	0.13	0.04	0.13	0.11	0.11	0.10	0.13	0.09	0.18	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.22	0.05	0.03	0.22	0.02	0.25	0.01	0.25	0.22	0.22	0.19	0.22	0.03	0.10	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.15	0.02	0.04	0.14	0.01	0.15	0.00	0.17	0.16	0.14	0.11	0.16	0.01	0.11	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.06	0.32	0.35	0.08	0.27	0.06	0.26	0.07	0.10	0.04	0.11	0.35	0.46	0.15	0.15	0.22	0.24	0.18	0.21
C2	0.17	0.07	0.31	0.33	0.06	0.25	0.06	0.24	0.09	0.11	0.03	0.11	0.32	0.41	0.11	0.15	0.21	0.22	0.19	0.21
C2'	0.18	0.07	0.33	0.35	0.07	0.27	0.04	0.25	0.08	0.11	0.03	0.11	0.37	0.45	0.13	0.15	0.22	0.25	0.18	0.21
C3'	0.16	0.06	0.31	0.32	0.10	0.23	0.06	0.20	0.07	0.10	0.05	0.10	0.35	0.42	0.17	0.12	0.17	0.19	0.14	0.16
C4	0.07	0.02	0.19	0.21	0.12	0.12	0.10	0.09	0.07	0.05	0.08	0.07	0.19	0.27	0.17	0.04	0.07	0.08	0.10	0.08
C4'	0.17	0.07	0.31	0.34	0.11	0.25	0.09	0.23	0.08	0.11	0.06	0.12	0.35	0.44	0.19	0.14	0.19	0.20	0.16	0.18
C5	0.06	0.02	0.19	0.21	0.16	0.11	0.13	0.08	0.08	0.04	0.10	0.07	0.20	0.28	0.22	0.04	0.05	0.06	0.09	0.06
C5'	0.15	0.07	0.30	0.32	0.13	0.22	0.11	0.19	0.08	0.10	0.07	0.13	0.33	0.42	0.21	0.12	0.15	0.16	0.14	0.14
C6	0.10	0.02	0.24	0.27	0.14	0.17	0.11	0.14	0.07	0.06	0.08	0.09	0.26	0.35	0.21	0.07	0.11	0.12	0.11	0.11
N1	0.15	0.05	0.30	0.32	0.09	0.23	0.07	0.21	0.07	0.09	0.05	0.11	0.31	0.41	0.16	0.13	0.18	0.19	0.16	0.18
N3	0.13	0.06	0.26	0.28	0.06	0.20	0.06	0.18	0.08	0.09	0.03	0.11	0.26	0.34	0.11	0.11	0.16	0.16	0.16	0.16
N4	0.02	0.03	0.11	0.12	0.13	0.04	0.12	0.02	0.09	0.04	0.09	0.04	0.13	0.17	0.17	0.04	0.02	0.02	0.08	0.03
O2	0.21	0.09	0.35	0.38	0.05	0.31	0.08	0.30	0.13	0.15	0.03	0.12	0.36	0.46	0.09	0.21	0.27	0.28	0.25	0.27
O2'	0.20	0.08	0.35	0.38	0.05	0.31	0.04	0.30	0.10	0.13	0.02	0.11	0.39	0.49	0.12	0.19	0.27	0.30	0.21	0.26
O3'	0.15	0.05	0.30	0.31	0.09	0.23	0.05	0.19	0.06	0.09	0.06	0.09	0.36	0.41	0.17	0.11	0.17	0.19	0.13	0.15
O4'	0.16	0.07	0.31	0.35	0.12	0.26	0.10	0.24	0.09	0.10	0.06	0.12	0.34	0.45	0.19	0.15	0.21	0.22	0.17	0.19
O5'	0.10	0.04	0.24	0.25	0.15	0.16	0.11	0.12	0.03	0.04	0.09	0.10	0.31	0.35	0.23	0.06	0.11	0.13	0.03	0.07
OP1	0.06	0.10	0.17	0.16	0.29	0.09	0.25	0.07	0.15	0.09	0.21	0.07	0.27	0.26	0.39	0.07	0.12	0.13	0.14	0.10
OP2	0.15	0.20	0.14	0.11	0.36	0.15	0.33	0.18	0.25	0.20	0.29	0.14	0.24	0.16	0.44	0.19	0.24	0.24	0.23	0.22
P	0.07	0.11	0.15	0.14	0.27	0.09	0.24	0.09	0.16	0.10	0.20	0.08	0.24	0.23	0.36	0.09	0.13	0.14	0.12	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.07	0.08	0.04	0.04
C2	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.04	0.04	0.02	0.08	0.02
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.04	0.10	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.12	0.02	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.03	0.08	0.04	0.07	0.07	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.13	0.01	0.03
C4	0.02	0.00	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.03	0.03	0.04	0.12	0.06
C4'	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.06	0.02	0.03	0.01	0.02	0.09	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.09	0.02	0.06	0.02	0.05	0.12	0.07
C5'	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.06	0.03	0.02	0.02	0.01	0.08	0.02	0.01
C6	0.02	0.02	0.05	0.08	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.09	0.02	0.07	0.04	0.01	0.09	0.05
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.05	0.04	0.06	0.03
N3	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.09	0.01	0.03	0.02	0.02	0.11	0.05
O2	0.03	0.01	0.10	0.07	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.13	0.10	0.01	0.08	0.06	0.06	0.07	0.01
O2'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.06	0.06	0.04	0.06	0.04	0.03	0.06	0.13	0.00	0.01	0.07	0.04	0.02	0.07	0.02	0.03
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.09	0.04	0.09	0.10	0.01	0.00	0.08	0.02	0.04	0.13	0.02	0.03
O4	0.03	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.04	0.04	0.06	0.12	0.07
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.07	0.01	0.03	0.08	0.04	0.02	0.04	0.00	0.10	0.09	0.07	0.07
O5'	0.07	0.04	0.05	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02	0.06	0.02	0.04	0.04	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.08	0.02	0.12	0.13	0.04	0.09	0.05	0.08	0.01	0.04	0.02	0.06	0.07	0.13	0.06	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.08	0.02	0.01	0.12	0.03	0.12	0.02	0.09	0.06	0.11	0.07	0.02	0.02	0.12	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.02	0.04	0.03	0.06	0.02	0.07	0.01	0.05	0.03	0.05	0.01	0.03	0.03	0.07	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00