Doublet Group distance statistics: 48448

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 13, 9, 3, 1, 2, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.003, 0.018, 0.032, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.018 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.002, 0.019, 0.035, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.019 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.002, 0.019, 0.035, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.019 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.005, 0.026, 0.046, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.026 std_dev=0.020
C2	A	0, -0.007, 0.014, 0.034, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.014 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.006, 0.027, 0.049, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.027 std_dev=0.021
C1'	A	0, -0.006, 0.016, 0.038, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.016 std_dev=0.022
N2	A	0, -0.007, 0.028, 0.063, 0.211 max_d=0.211 avg_d=0.028 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.013, 0.088, 0.164, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.088 std_dev=0.075
C2'	A	0, 0.016, 0.098, 0.181, 0.420 max_d=0.420 avg_d=0.098 std_dev=0.082
OP2	B	0, 0.108, 0.295, 0.482, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.295 std_dev=0.187
OP1	B	0, 0.124, 0.327, 0.530, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.327 std_dev=0.203
C3'	B	0, 0.177, 0.381, 0.586, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.381 std_dev=0.205
C4'	A	0, -0.029, 0.180, 0.389, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.180 std_dev=0.209
P	B	0, 0.069, 0.285, 0.500, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.285 std_dev=0.215
C5'	A	0, 0.049, 0.268, 0.487, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.268 std_dev=0.219
O5'	B	0, 0.071, 0.347, 0.622, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.347 std_dev=0.276
C2'	B	0, 0.184, 0.473, 0.763, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.473 std_dev=0.290
O2'	A	0, -0.107, 0.196, 0.499, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.196 std_dev=0.303
C3'	A	0, -0.102, 0.207, 0.516, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.207 std_dev=0.309
C5'	B	0, 0.047, 0.400, 0.753, 1.871 max_d=1.871 avg_d=0.400 std_dev=0.353
C4'	B	0, 0.024, 0.423, 0.821, 1.833 max_d=1.833 avg_d=0.423 std_dev=0.398
O3'	B	0, 0.088, 0.497, 0.907, 2.159 max_d=2.159 avg_d=0.497 std_dev=0.410
O2'	B	0, 0.151, 0.597, 1.044, 2.597 max_d=2.597 avg_d=0.597 std_dev=0.447
O5'	A	0, -0.006, 0.496, 0.998, 1.999 max_d=1.999 avg_d=0.496 std_dev=0.502
O3'	A	0, -0.246, 0.341, 0.927, 2.813 max_d=2.813 avg_d=0.341 std_dev=0.586
P	A	0, -0.182, 0.556, 1.295, 3.687 max_d=3.687 avg_d=0.556 std_dev=0.738
C1'	B	0, -0.214, 0.629, 1.472, 3.898 max_d=3.898 avg_d=0.629 std_dev=0.843
O4'	B	0, -0.284, 0.598, 1.479, 4.055 max_d=4.055 avg_d=0.598 std_dev=0.882
OP2	A	0, -0.101, 0.802, 1.704, 4.520 max_d=4.520 avg_d=0.802 std_dev=0.903
OP1	A	0, -0.387, 0.819, 2.025, 5.749 max_d=5.749 avg_d=0.819 std_dev=1.206
N9	B	0, -0.501, 0.761, 2.023, 5.913 max_d=5.913 avg_d=0.761 std_dev=1.262
C8	B	0, -0.681, 0.836, 2.354, 7.046 max_d=7.046 avg_d=0.836 std_dev=1.517
C4	B	0, -0.727, 0.902, 2.530, 7.550 max_d=7.550 avg_d=0.902 std_dev=1.628
N3	B	0, -0.697, 0.955, 2.607, 7.618 max_d=7.618 avg_d=0.955 std_dev=1.652
N7	B	0, -1.007, 1.011, 3.029, 9.249 max_d=9.249 avg_d=1.011 std_dev=2.018
C2	B	0, -0.943, 1.110, 3.163, 9.426 max_d=9.426 avg_d=1.110 std_dev=2.053
C5	B	0, -1.022, 1.034, 3.091, 9.461 max_d=9.461 avg_d=1.034 std_dev=2.056
N1	B	0, -1.223, 1.221, 3.665, 11.182 max_d=11.182 avg_d=1.221 std_dev=2.444
C6	B	0, -1.285, 1.200, 3.686, 11.356 max_d=11.356 avg_d=1.200 std_dev=2.486
N6	B	0, -1.595, 1.367, 4.329, 13.440 max_d=13.440 avg_d=1.367 std_dev=2.962

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.11	0.00	0.29	0.02	0.40	0.34	0.20
C2	0.04	0.00	0.10	0.15	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.12	0.04	0.32	0.01	0.51	0.34	0.31
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.07	0.05	0.04	0.08	0.11	0.09	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.29	0.04	0.44	0.33	0.31
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.15	0.00	0.20	0.02	0.21	0.20	0.19	0.13	0.13	0.22	0.14	0.02	0.01	0.01	0.19	0.23	0.35	0.28	0.18
C4	0.02	0.01	0.05	0.15	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.17	0.07	0.02	0.35	0.01	0.50	0.35	0.33
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.12	0.09	0.07	0.06	0.12	0.07	0.17	0.03	0.00	0.01	0.11	0.45	0.32	0.10
C5	0.01	0.01	0.03	0.20	0.01	0.10	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.13	0.02	0.39	0.01	0.60	0.41	0.41
C5'	0.03	0.08	0.07	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.13	0.14	0.11	0.07	0.06	0.16	0.08	0.09	0.09	0.02	0.01	0.15	0.39	0.26	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.21	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.14	0.02	0.39	0.00	0.64	0.43	0.43
C8	0.01	0.01	0.04	0.20	0.00	0.12	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.12	0.15	0.03	0.41	0.01	0.54	0.43	0.40
N1	0.04	0.00	0.08	0.19	0.02	0.09	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	0.12	0.03	0.35	0.01	0.58	0.37	0.37
N2	0.05	0.00	0.11	0.13	0.02	0.07	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.19	0.16	0.06	0.29	0.01	0.49	0.34	0.28
N3	0.04	0.01	0.09	0.13	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.17	0.11	0.04	0.30	0.01	0.47	0.34	0.27
N7	0.01	0.01	0.03	0.22	0.01	0.12	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.18	0.03	0.42	0.01	0.64	0.48	0.46
N9	0.00	0.02	0.01	0.14	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.10	0.05	0.01	0.36	0.01	0.46	0.34	0.30
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.17	0.17	0.19	0.09	0.21	0.12	0.21	0.19	0.17	0.17	0.10	0.00	0.05	0.13	0.09	0.22	0.40	0.47	0.16
O3'	0.11	0.12	0.02	0.01	0.07	0.03	0.13	0.09	0.14	0.15	0.12	0.16	0.11	0.18	0.05	0.05	0.00	0.07	0.36	0.18	0.36	0.45	0.20
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.06	0.04	0.03	0.01	0.13	0.07	0.00	0.28	0.02	0.44	0.33	0.13
O5'	0.29	0.32	0.29	0.19	0.35	0.01	0.39	0.01	0.39	0.41	0.35	0.29	0.30	0.42	0.36	0.09	0.36	0.28	0.00	0.41	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.23	0.01	0.11	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.18	0.02	0.41	0.00	0.71	0.49	0.49
OP1	0.40	0.51	0.44	0.35	0.50	0.45	0.60	0.39	0.64	0.54	0.58	0.49	0.47	0.64	0.46	0.40	0.36	0.44	0.02	0.71	0.00	0.01	0.01
OP2	0.34	0.34	0.33	0.28	0.35	0.32	0.41	0.26	0.43	0.43	0.37	0.34	0.34	0.48	0.34	0.47	0.45	0.33	0.01	0.49	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.31	0.31	0.18	0.33	0.10	0.41	0.01	0.43	0.40	0.37	0.28	0.27	0.46	0.30	0.16	0.20	0.13	0.00	0.49	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.42	0.11	0.12	0.51	0.13	0.80	0.28	0.85	0.79	0.66	0.31	1.08	0.98	0.48	0.13	0.26	0.20	0.16	0.20	0.14	0.14
C2	0.31	0.54	0.10	0.10	0.56	0.15	0.75	0.24	0.79	0.71	0.68	0.46	0.93	0.84	0.52	0.13	0.24	0.38	0.10	0.14	0.10	0.11
C2'	0.19	0.54	0.13	0.17	0.61	0.17	0.94	0.26	1.02	0.89	0.81	0.40	1.28	1.13	0.55	0.22	0.34	0.22	0.23	0.21	0.20	0.18
C3'	0.37	0.75	0.23	0.18	0.82	0.22	1.17	0.45	1.25	1.10	1.04	0.60	1.52	1.35	0.76	0.11	0.21	0.38	0.14	0.27	0.13	0.15
C4	0.25	0.51	0.07	0.08	0.57	0.10	0.81	0.27	0.87	0.78	0.71	0.41	1.06	0.96	0.52	0.08	0.24	0.29	0.08	0.16	0.10	0.10
C4'	0.24	0.50	0.16	0.14	0.60	0.17	0.92	0.38	0.99	0.90	0.77	0.38	1.25	1.12	0.56	0.14	0.22	0.25	0.17	0.27	0.13	0.17
C5	0.28	0.56	0.08	0.08	0.60	0.11	0.85	0.26	0.91	0.80	0.76	0.45	1.11	0.98	0.55	0.09	0.24	0.32	0.08	0.15	0.09	0.10
C5'	0.25	0.54	0.18	0.15	0.64	0.18	0.98	0.38	1.06	0.94	0.83	0.41	1.34	1.18	0.59	0.15	0.22	0.26	0.17	0.27	0.13	0.17
C6	0.32	0.59	0.09	0.08	0.62	0.14	0.83	0.25	0.90	0.77	0.77	0.49	1.07	0.94	0.56	0.11	0.24	0.38	0.10	0.14	0.10	0.12
C8	0.22	0.51	0.09	0.10	0.58	0.11	0.87	0.28	0.94	0.83	0.75	0.39	1.17	1.04	0.53	0.10	0.25	0.25	0.10	0.17	0.11	0.11
N1	0.34	0.58	0.11	0.10	0.59	0.16	0.78	0.24	0.83	0.72	0.73	0.49	0.98	0.86	0.54	0.14	0.24	0.40	0.12	0.14	0.11	0.12
N2	0.34	0.53	0.13	0.13	0.54	0.19	0.68	0.23	0.72	0.64	0.64	0.47	0.82	0.75	0.50	0.17	0.24	0.43	0.14	0.14	0.13	0.13
N3	0.26	0.50	0.07	0.08	0.55	0.11	0.76	0.26	0.81	0.74	0.67	0.41	0.97	0.89	0.51	0.09	0.24	0.32	0.08	0.15	0.10	0.10
N7	0.25	0.55	0.08	0.08	0.60	0.10	0.88	0.27	0.95	0.83	0.78	0.43	1.18	1.03	0.55	0.08	0.24	0.29	0.08	0.15	0.09	0.10
N9	0.21	0.48	0.09	0.10	0.55	0.11	0.83	0.28	0.89	0.80	0.70	0.36	1.10	1.00	0.51	0.10	0.25	0.24	0.11	0.18	0.11	0.12
O2'	0.24	0.56	0.17	0.22	0.66	0.20	1.01	0.34	1.07	0.98	0.84	0.43	1.33	1.22	0.61	0.25	0.42	0.27	0.23	0.24	0.17	0.19
O3'	0.62	0.99	0.48	0.43	1.07	0.47	1.40	0.72	1.48	1.35	1.27	0.84	1.73	1.59	1.01	0.29	0.34	0.63	0.30	0.52	0.25	0.35
O4'	0.18	0.36	0.14	0.14	0.46	0.17	0.76	0.31	0.81	0.76	0.60	0.26	1.04	0.95	0.44	0.16	0.25	0.20	0.19	0.24	0.15	0.17
O5'	0.26	0.53	0.18	0.17	0.65	0.21	1.02	0.41	1.10	1.00	0.84	0.40	1.41	1.25	0.61	0.23	0.29	0.29	0.18	0.33	0.20	0.24
O6	0.34	0.63	0.10	0.09	0.64	0.15	0.85	0.25	0.92	0.77	0.80	0.52	1.09	0.94	0.57	0.13	0.24	0.40	0.11	0.14	0.11	0.13
OP1	0.45	0.45	0.45	0.51	0.53	0.57	0.88	0.46	0.96	0.85	0.70	0.42	1.31	1.12	0.51	0.56	0.69	0.50	0.53	0.56	0.47	0.50
OP2	0.67	0.56	0.68	0.71	0.54	0.72	0.73	0.48	0.80	0.72	0.61	0.61	1.09	0.93	0.54	0.86	0.91	0.67	0.61	0.54	0.45	0.50
P	0.32	0.48	0.28	0.31	0.57	0.35	0.96	0.34	1.05	0.92	0.78	0.38	1.39	1.20	0.53	0.41	0.50	0.34	0.27	0.31	0.21	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.21	0.01	0.03	0.18	0.19	0.03
C2	0.02	0.00	0.13	0.11	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.24	0.08	0.04	0.23	0.31	0.05
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.12	0.05	0.08	0.10	0.13	0.04	0.05	0.02	0.00	0.06	0.01	0.19	0.17	0.11	0.17
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.11	0.01	0.15	0.02	0.15	0.14	0.13	0.09	0.17	0.16	0.10	0.02	0.01	0.01	0.19	0.12	0.12	0.14
C4	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.17	0.05	0.05	0.19	0.35	0.06
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.07	0.03	0.04	0.05	0.07	0.03	0.16	0.03	0.00	0.01	0.17	0.07	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.15	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.13	0.03	0.08	0.16	0.47	0.10
C5'	0.05	0.05	0.12	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.05	0.06	0.05	0.07	0.05	0.05	0.13	0.01	0.01	0.07	0.18	0.02
C6	0.02	0.00	0.05	0.15	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.15	0.04	0.07	0.17	0.48	0.10
C8	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.18	0.08	0.05	0.09	0.12	0.48	0.12
N1	0.02	0.00	0.10	0.13	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.20	0.07	0.06	0.21	0.40	0.07
N3	0.02	0.00	0.13	0.09	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.25	0.08	0.03	0.23	0.27	0.04
N6	0.02	0.01	0.04	0.17	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.19	0.14	0.04	0.09	0.16	0.56	0.13
N7	0.01	0.01	0.05	0.16	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.20	0.10	0.03	0.10	0.12	0.55	0.14
N9	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.10	0.13	0.01	0.05	0.17	0.34	0.06
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.10	0.16	0.16	0.05	0.16	0.18	0.13	0.09	0.19	0.20	0.10	0.00	0.10	0.11	0.06	0.07	0.11	0.06
O3'	0.21	0.24	0.06	0.01	0.17	0.03	0.13	0.13	0.15	0.08	0.20	0.25	0.14	0.10	0.13	0.10	0.00	0.16	0.18	0.17	0.25	0.18
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.07	0.08	0.04	0.03	0.01	0.11	0.16	0.00	0.13	0.19	0.29	0.09
O5'	0.03	0.04	0.19	0.19	0.05	0.01	0.08	0.01	0.07	0.09	0.06	0.03	0.09	0.10	0.05	0.06	0.18	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.18	0.23	0.17	0.12	0.19	0.17	0.16	0.07	0.17	0.12	0.21	0.23	0.16	0.12	0.17	0.07	0.17	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.31	0.11	0.12	0.35	0.07	0.47	0.18	0.48	0.48	0.40	0.27	0.56	0.55	0.34	0.11	0.25	0.29	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.05	0.17	0.14	0.06	0.05	0.10	0.02	0.10	0.12	0.07	0.04	0.13	0.14	0.06	0.06	0.18	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00