Doublet Group distance statistics: 48453

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 2, 7, 5, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.003, 0.017, 0.030, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.015, 0.029, 0.042, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.018, 0.032, 0.047, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.032 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.020, 0.035, 0.050, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.035 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.034, 0.059, 0.085, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.059 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.040, 0.070, 0.099, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.070 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.043, 0.075, 0.106, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.075 std_dev=0.031
O6	A	0, 0.035, 0.066, 0.098, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.066 std_dev=0.031
C2'	A	0, 0.098, 0.158, 0.218, 0.317 max_d=0.317 avg_d=0.158 std_dev=0.060
O4'	A	0, 0.101, 0.165, 0.228, 0.283 max_d=0.283 avg_d=0.165 std_dev=0.064
C4'	A	0, 0.116, 0.191, 0.265, 0.332 max_d=0.332 avg_d=0.191 std_dev=0.075
C3'	A	0, 0.130, 0.209, 0.288, 0.362 max_d=0.362 avg_d=0.209 std_dev=0.079
O3'	A	0, 0.132, 0.225, 0.317, 0.368 max_d=0.368 avg_d=0.225 std_dev=0.093
O2'	A	0, 0.179, 0.283, 0.387, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.283 std_dev=0.104
C5'	A	0, 0.159, 0.294, 0.430, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.294 std_dev=0.136
O5'	B	0, 0.188, 0.347, 0.507, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.347 std_dev=0.160
P	B	0, 0.173, 0.335, 0.497, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.335 std_dev=0.162
OP1	B	0, 0.212, 0.382, 0.552, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.382 std_dev=0.170
N7	B	0, 0.248, 0.427, 0.606, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.427 std_dev=0.179
N6	B	0, 0.192, 0.372, 0.553, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.372 std_dev=0.180
C5	B	0, 0.219, 0.401, 0.582, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.401 std_dev=0.182
O5'	A	0, 0.216, 0.398, 0.581, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.398 std_dev=0.183
C6	B	0, 0.198, 0.385, 0.571, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.385 std_dev=0.186
C8	B	0, 0.271, 0.459, 0.647, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.459 std_dev=0.188
N9	B	0, 0.258, 0.454, 0.649, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.454 std_dev=0.196
C4	B	0, 0.216, 0.414, 0.611, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.414 std_dev=0.198
C5'	B	0, 0.230, 0.432, 0.635, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.432 std_dev=0.203
C3'	B	0, 0.274, 0.477, 0.681, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.477 std_dev=0.204
OP2	B	0, 0.151, 0.356, 0.560, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.356 std_dev=0.204
O4'	B	0, 0.301, 0.506, 0.711, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.506 std_dev=0.205
P	A	0, 0.237, 0.447, 0.657, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.447 std_dev=0.210
C1'	B	0, 0.297, 0.511, 0.724, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.511 std_dev=0.213
C4'	B	0, 0.282, 0.496, 0.709, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.496 std_dev=0.214
N1	B	0, 0.182, 0.398, 0.614, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.398 std_dev=0.216
C2'	B	0, 0.302, 0.525, 0.749, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.525 std_dev=0.223
N3	B	0, 0.186, 0.412, 0.638, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.412 std_dev=0.226
C2	B	0, 0.173, 0.408, 0.642, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.408 std_dev=0.235
O3'	B	0, 0.304, 0.553, 0.803, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.553 std_dev=0.249
OP2	A	0, 0.341, 0.593, 0.846, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.593 std_dev=0.253
O2'	B	0, 0.383, 0.653, 0.923, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.653 std_dev=0.270
OP1	A	0, 0.185, 0.458, 0.732, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.458 std_dev=0.274

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.03	0.06	0.07	0.03
C2	0.03	0.00	0.04	0.04	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.05	0.05	0.02	0.06	0.10	0.04
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.07	0.06	0.04
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.04	0.06	0.04	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.09	0.04	0.04
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.04	0.01	0.06	0.10	0.05
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.03	0.06	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.06	0.05	0.03
C5	0.02	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.05	0.03	0.06	0.01	0.07	0.12	0.06
C5'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.05	0.06	0.05	0.07	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.08	0.02	0.06	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.05	0.03	0.06	0.00	0.07	0.12	0.07
C8	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.04	0.08	0.03	0.08	0.11	0.07
N1	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.04	0.05	0.02	0.06	0.11	0.05
N2	0.04	0.00	0.05	0.06	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.08	0.07	0.06	0.02	0.08	0.10	0.05
N3	0.02	0.00	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.06	0.05	0.05	0.01	0.06	0.10	0.04
N7	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04	0.08	0.03	0.09	0.12	0.08
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.04	0.03	0.06	0.09	0.04
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.03	0.06	0.04	0.07	0.09	0.07	0.05	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.08	0.07	0.04
O3'	0.03	0.07	0.02	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.05	0.05	0.06	0.08	0.06	0.05	0.04	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.11	0.03	0.06
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.07	0.05	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.05	0.08	0.03
O5'	0.02	0.05	0.03	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.06	0.05	0.08	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.07	0.05	0.04	0.08	0.00	0.09	0.14	0.09
OP1	0.06	0.06	0.07	0.09	0.06	0.06	0.07	0.02	0.07	0.08	0.06	0.08	0.06	0.09	0.06	0.08	0.11	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01
OP2	0.07	0.10	0.06	0.04	0.10	0.05	0.12	0.06	0.12	0.11	0.11	0.10	0.10	0.12	0.09	0.07	0.03	0.08	0.01	0.14	0.02	0.00	0.01
P	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.06	0.01	0.07	0.07	0.05	0.05	0.04	0.08	0.04	0.04	0.06	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.14	0.09	0.09	0.11	0.08	0.12	0.09	0.15	0.09	0.16	0.12	0.17	0.10	0.09	0.09	0.10	0.09	0.11	0.11	0.14	0.09
C2	0.09	0.17	0.10	0.10	0.13	0.10	0.14	0.11	0.18	0.09	0.18	0.15	0.19	0.12	0.10	0.10	0.11	0.10	0.11	0.12	0.16	0.11
C2'	0.09	0.15	0.09	0.10	0.11	0.08	0.12	0.10	0.15	0.09	0.16	0.12	0.17	0.10	0.09	0.09	0.11	0.09	0.11	0.11	0.13	0.09
C3'	0.09	0.14	0.09	0.09	0.11	0.08	0.12	0.09	0.15	0.09	0.15	0.12	0.17	0.11	0.10	0.09	0.10	0.10	0.11	0.11	0.14	0.10
C4	0.09	0.16	0.09	0.10	0.12	0.09	0.13	0.10	0.16	0.09	0.17	0.13	0.18	0.10	0.10	0.09	0.11	0.09	0.11	0.12	0.15	0.09
C4'	0.10	0.14	0.09	0.09	0.12	0.09	0.13	0.09	0.15	0.11	0.15	0.13	0.17	0.12	0.11	0.09	0.10	0.10	0.11	0.11	0.15	0.10
C5	0.11	0.18	0.11	0.11	0.14	0.10	0.15	0.11	0.18	0.11	0.20	0.16	0.20	0.12	0.12	0.11	0.11	0.11	0.11	0.12	0.15	0.10
C5'	0.11	0.16	0.10	0.10	0.14	0.09	0.14	0.10	0.17	0.12	0.17	0.14	0.19	0.13	0.12	0.10	0.10	0.10	0.11	0.11	0.15	0.10
C6	0.13	0.21	0.13	0.13	0.16	0.12	0.17	0.12	0.21	0.13	0.23	0.18	0.23	0.15	0.14	0.13	0.13	0.13	0.12	0.13	0.16	0.11
C8	0.10	0.16	0.10	0.10	0.13	0.09	0.13	0.10	0.16	0.10	0.18	0.14	0.18	0.11	0.11	0.10	0.11	0.10	0.11	0.11	0.15	0.09
N1	0.12	0.20	0.12	0.12	0.16	0.12	0.17	0.12	0.20	0.12	0.22	0.17	0.22	0.14	0.13	0.12	0.12	0.12	0.12	0.13	0.16	0.12
N2	0.09	0.17	0.10	0.10	0.14	0.10	0.16	0.11	0.18	0.10	0.18	0.15	0.19	0.14	0.10	0.10	0.11	0.09	0.11	0.13	0.16	0.11
N3	0.08	0.15	0.09	0.09	0.11	0.08	0.13	0.10	0.16	0.08	0.16	0.13	0.18	0.10	0.09	0.09	0.11	0.08	0.11	0.12	0.16	0.10
N7	0.11	0.18	0.11	0.11	0.14	0.10	0.14	0.10	0.18	0.11	0.20	0.16	0.20	0.12	0.12	0.11	0.11	0.11	0.11	0.12	0.15	0.10
N9	0.09	0.15	0.09	0.09	0.12	0.08	0.12	0.10	0.16	0.09	0.17	0.13	0.18	0.10	0.10	0.09	0.10	0.09	0.11	0.11	0.15	0.09
O2'	0.09	0.13	0.10	0.11	0.10	0.10	0.10	0.12	0.13	0.08	0.14	0.11	0.16	0.09	0.08	0.11	0.13	0.10	0.12	0.13	0.13	0.11
O3'	0.10	0.12	0.09	0.09	0.10	0.09	0.11	0.10	0.13	0.09	0.13	0.11	0.15	0.10	0.09	0.09	0.10	0.10	0.11	0.11	0.14	0.10
O4'	0.11	0.15	0.11	0.11	0.13	0.10	0.14	0.10	0.16	0.11	0.16	0.14	0.17	0.13	0.12	0.11	0.11	0.11	0.12	0.10	0.15	0.10
O5'	0.11	0.16	0.10	0.10	0.13	0.10	0.14	0.10	0.16	0.12	0.17	0.14	0.18	0.13	0.12	0.10	0.10	0.11	0.12	0.13	0.15	0.11
O6	0.16	0.25	0.16	0.16	0.19	0.15	0.20	0.14	0.24	0.16	0.27	0.22	0.26	0.17	0.17	0.17	0.15	0.15	0.13	0.14	0.17	0.12
OP1	0.10	0.13	0.10	0.10	0.11	0.10	0.12	0.11	0.14	0.10	0.15	0.12	0.17	0.11	0.10	0.10	0.11	0.10	0.12	0.13	0.17	0.12
OP2	0.14	0.21	0.14	0.13	0.18	0.12	0.19	0.12	0.22	0.15	0.22	0.19	0.24	0.17	0.16	0.14	0.13	0.13	0.14	0.11	0.15	0.11
P	0.10	0.15	0.09	0.09	0.13	0.08	0.14	0.09	0.16	0.11	0.17	0.13	0.18	0.12	0.11	0.09	0.09	0.09	0.11	0.10	0.15	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.07	0.07	0.04
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.07	0.07	0.12	0.07
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.07	0.03
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.05	0.06	0.06	0.06	0.05	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.06	0.06	0.04
C4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.06	0.07	0.11	0.07
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.08	0.08	0.13	0.09
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.05	0.03	0.06	0.06	0.03	0.03	0.04	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.08	0.09	0.14	0.09
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.07	0.08	0.13	0.08
N1	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.08	0.08	0.13	0.09
N3	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.06	0.07	0.10	0.06
N6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.09	0.10	0.16	0.10
N7	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02	0.08	0.09	0.15	0.09
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.06	0.07	0.10	0.06
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.06	0.06	0.05	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.08	0.05	0.03
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.04	0.06	0.05	0.07	0.07	0.07	0.05	0.02	0.03	0.00	0.02	0.06	0.09	0.08	0.06
O4'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.09	0.07	0.05
O5'	0.04	0.07	0.03	0.04	0.06	0.01	0.08	0.01	0.08	0.07	0.08	0.06	0.09	0.08	0.06	0.03	0.06	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.07	0.06	0.06	0.07	0.07	0.08	0.07	0.09	0.08	0.08	0.07	0.10	0.09	0.07	0.08	0.09	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.07	0.12	0.07	0.06	0.11	0.03	0.13	0.03	0.14	0.13	0.13	0.10	0.16	0.15	0.10	0.05	0.08	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.04	0.07	0.03	0.04	0.07	0.02	0.09	0.01	0.09	0.08	0.09	0.06	0.10	0.09	0.06	0.03	0.06	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00