Doublet Group distance statistics: 48456

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 5, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.008, 0.021, 0.033, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.018 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.011, 0.030, 0.049, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.012, 0.031, 0.051, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.003, 0.023, 0.043, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.023 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.002, 0.024, 0.046, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.024 std_dev=0.022
N2	A	0, 0.004, 0.043, 0.083, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.043 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.067, 0.171, 0.274, 0.386 max_d=0.386 avg_d=0.171 std_dev=0.104
C2'	A	0, 0.080, 0.189, 0.298, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.189 std_dev=0.109
C4'	A	0, 0.114, 0.262, 0.410, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.262 std_dev=0.148
O2'	A	0, 0.117, 0.275, 0.433, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.275 std_dev=0.158
C3'	A	0, 0.130, 0.291, 0.453, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.291 std_dev=0.161
P	B	0, 0.411, 0.620, 0.829, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.620 std_dev=0.209
O5'	B	0, 0.341, 0.554, 0.768, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.554 std_dev=0.213
OP1	B	0, 0.414, 0.638, 0.863, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.638 std_dev=0.225
OP2	B	0, 0.468, 0.712, 0.956, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.712 std_dev=0.244
N9	B	0, 0.418, 0.674, 0.931, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.674 std_dev=0.256
O3'	A	0, 0.181, 0.439, 0.698, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.439 std_dev=0.259
C5'	A	0, 0.201, 0.470, 0.739, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.470 std_dev=0.269
C3'	B	0, 0.413, 0.694, 0.976, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.694 std_dev=0.281
C8	B	0, 0.422, 0.705, 0.988, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.705 std_dev=0.283
O4'	B	0, 0.454, 0.738, 1.022, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.738 std_dev=0.284
N7	B	0, 0.404, 0.705, 1.007, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.705 std_dev=0.301
C4'	B	0, 0.300, 0.614, 0.927, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.614 std_dev=0.313
C5	B	0, 0.378, 0.693, 1.008, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.693 std_dev=0.315
C4	B	0, 0.222, 0.544, 0.867, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.544 std_dev=0.323
C5'	B	0, 0.286, 0.635, 0.985, 1.371 max_d=1.371 avg_d=0.635 std_dev=0.349
N3	B	0, 0.211, 0.564, 0.918, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.564 std_dev=0.354
C1'	B	0, 0.449, 0.844, 1.240, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.844 std_dev=0.395
C2	B	0, 0.347, 0.760, 1.173, 1.598 max_d=1.598 avg_d=0.760 std_dev=0.413
C6	B	0, 0.549, 0.965, 1.380, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.965 std_dev=0.416
N1	B	0, 0.516, 0.999, 1.482, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.999 std_dev=0.483
C2'	B	0, 0.510, 1.067, 1.624, 1.958 max_d=1.958 avg_d=1.067 std_dev=0.557
N6	B	0, 0.642, 1.234, 1.827, 2.053 max_d=2.053 avg_d=1.234 std_dev=0.593
O3'	B	0, 0.492, 1.095, 1.698, 2.176 max_d=2.176 avg_d=1.095 std_dev=0.603
O5'	A	0, 0.648, 1.559, 2.469, 2.698 max_d=2.698 avg_d=1.559 std_dev=0.910
OP2	A	0, 0.718, 1.674, 2.630, 3.142 max_d=3.142 avg_d=1.674 std_dev=0.956
P	A	0, 0.725, 1.740, 2.756, 3.266 max_d=3.266 avg_d=1.740 std_dev=1.015
O2'	B	0, 0.662, 1.852, 3.043, 3.429 max_d=3.429 avg_d=1.852 std_dev=1.190
OP1	A	0, 0.829, 2.144, 3.459, 4.107 max_d=4.107 avg_d=2.144 std_dev=1.315

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.22	0.02	0.24	0.15	0.15
C2	0.05	0.00	0.09	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.12	0.05	0.51	0.02	0.51	0.40	0.43
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.04	0.04	0.07	0.12	0.10	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.30	0.04	0.39	0.10	0.23
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.10	0.07	0.11	0.08	0.08	0.04	0.03	0.01	0.01	0.39	0.06	0.51	0.07	0.30
C4	0.03	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.03	0.53	0.02	0.50	0.36	0.42
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.04	0.07	0.05	0.08	0.03	0.06	0.03	0.00	0.02	0.07	0.17	0.33	0.04
C5	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.03	0.65	0.02	0.62	0.52	0.55
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.13	0.15	0.11	0.07	0.06	0.17	0.08	0.06	0.05	0.01	0.02	0.16	0.24	0.48	0.02
C6	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.07	0.06	0.03	0.67	0.01	0.66	0.59	0.59
C8	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.08	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.10	0.05	0.65	0.03	0.56	0.38	0.50
N1	0.04	0.01	0.07	0.07	0.02	0.04	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.09	0.04	0.60	0.01	0.60	0.52	0.52
N2	0.06	0.01	0.12	0.11	0.02	0.07	0.02	0.07	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.17	0.16	0.06	0.45	0.04	0.48	0.37	0.39
N3	0.05	0.01	0.10	0.08	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.11	0.05	0.45	0.02	0.45	0.31	0.36
N7	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.08	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.05	0.72	0.03	0.66	0.56	0.61
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.48	0.02	0.44	0.25	0.35
O2'	0.02	0.13	0.01	0.03	0.07	0.06	0.06	0.06	0.07	0.03	0.11	0.17	0.13	0.03	0.03	0.00	0.06	0.06	0.06	0.07	0.19	0.17	0.05
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.05	0.03	0.05	0.05	0.06	0.10	0.09	0.16	0.11	0.09	0.04	0.06	0.00	0.02	0.30	0.07	0.53	0.09	0.28
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.06	0.05	0.05	0.02	0.06	0.02	0.00	0.07	0.04	0.10	0.31	0.11
O5'	0.22	0.51	0.30	0.39	0.53	0.02	0.65	0.02	0.67	0.65	0.60	0.45	0.45	0.72	0.48	0.06	0.30	0.07	0.00	0.72	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.04	0.06	0.02	0.07	0.02	0.16	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.07	0.07	0.04	0.72	0.00	0.71	0.68	0.65
OP1	0.24	0.51	0.39	0.51	0.50	0.17	0.62	0.24	0.66	0.56	0.60	0.48	0.45	0.66	0.44	0.19	0.53	0.10	0.03	0.71	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.40	0.10	0.07	0.36	0.33	0.52	0.48	0.59	0.38	0.52	0.37	0.31	0.56	0.25	0.17	0.09	0.31	0.02	0.68	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.43	0.23	0.30	0.42	0.04	0.55	0.02	0.59	0.50	0.52	0.39	0.36	0.61	0.35	0.05	0.28	0.11	0.01	0.65	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.18	0.49	0.28	0.13	0.13	0.17	0.13	0.24	0.27	0.25	0.13	0.36	0.24	0.21	1.04	0.41	0.14	0.14	0.15	0.14	0.14
C2	0.26	0.14	0.62	0.19	0.15	0.16	0.16	0.17	0.18	0.22	0.17	0.14	0.22	0.18	0.20	0.89	0.48	0.18	0.17	0.19	0.17	0.19
C2'	0.18	0.16	0.40	0.28	0.12	0.09	0.14	0.13	0.19	0.19	0.19	0.13	0.27	0.16	0.15	0.87	0.33	0.09	0.12	0.13	0.13	0.12
C3'	0.14	0.13	0.33	0.30	0.07	0.07	0.07	0.14	0.13	0.14	0.16	0.09	0.20	0.10	0.11	0.81	0.30	0.07	0.11	0.13	0.14	0.12
C4	0.27	0.15	0.59	0.21	0.13	0.14	0.15	0.16	0.20	0.24	0.20	0.12	0.28	0.20	0.20	1.01	0.44	0.15	0.16	0.17	0.16	0.17
C4'	0.18	0.17	0.32	0.34	0.07	0.10	0.10	0.08	0.21	0.20	0.24	0.09	0.33	0.17	0.14	0.91	0.36	0.09	0.08	0.10	0.10	0.09
C5	0.26	0.15	0.61	0.20	0.14	0.14	0.16	0.17	0.20	0.23	0.20	0.13	0.28	0.19	0.20	1.02	0.45	0.15	0.17	0.18	0.17	0.18
C5'	0.17	0.19	0.30	0.34	0.07	0.09	0.09	0.09	0.19	0.19	0.25	0.10	0.29	0.15	0.13	0.90	0.37	0.09	0.08	0.12	0.12	0.11
C6	0.26	0.14	0.63	0.19	0.14	0.16	0.15	0.18	0.18	0.22	0.18	0.13	0.24	0.18	0.20	0.97	0.47	0.17	0.17	0.19	0.17	0.19
C8	0.26	0.19	0.55	0.24	0.14	0.13	0.17	0.16	0.24	0.25	0.25	0.13	0.34	0.21	0.20	1.07	0.42	0.14	0.15	0.17	0.16	0.17
N1	0.26	0.13	0.63	0.19	0.15	0.16	0.15	0.18	0.17	0.21	0.16	0.14	0.22	0.18	0.20	0.90	0.49	0.18	0.18	0.20	0.17	0.19
N2	0.27	0.16	0.61	0.19	0.18	0.18	0.18	0.18	0.18	0.22	0.17	0.17	0.20	0.19	0.21	0.79	0.50	0.20	0.19	0.19	0.17	0.20
N3	0.27	0.14	0.60	0.21	0.14	0.14	0.15	0.16	0.19	0.24	0.18	0.13	0.25	0.19	0.21	0.96	0.45	0.15	0.16	0.18	0.16	0.17
N7	0.26	0.18	0.58	0.22	0.14	0.14	0.17	0.17	0.22	0.24	0.23	0.13	0.31	0.20	0.20	1.06	0.44	0.15	0.16	0.18	0.16	0.18
N9	0.26	0.17	0.55	0.24	0.14	0.13	0.16	0.16	0.22	0.26	0.23	0.13	0.32	0.21	0.20	1.05	0.42	0.14	0.15	0.17	0.16	0.16
O2'	0.17	0.16	0.33	0.34	0.11	0.11	0.15	0.10	0.22	0.19	0.20	0.12	0.32	0.20	0.14	0.83	0.34	0.09	0.11	0.14	0.15	0.12
O3'	0.12	0.11	0.25	0.32	0.08	0.10	0.08	0.18	0.09	0.13	0.11	0.09	0.09	0.11	0.11	0.67	0.25	0.10	0.15	0.16	0.16	0.15
O4'	0.26	0.21	0.44	0.32	0.14	0.14	0.17	0.13	0.26	0.28	0.28	0.14	0.40	0.24	0.21	1.06	0.42	0.15	0.14	0.15	0.14	0.14
O5'	0.31	0.27	0.53	0.21	0.23	0.10	0.16	0.11	0.13	0.24	0.20	0.28	0.16	0.19	0.26	1.23	0.22	0.13	0.14	0.27	0.26	0.21
O6	0.26	0.14	0.64	0.18	0.14	0.16	0.15	0.18	0.18	0.22	0.17	0.13	0.24	0.18	0.20	0.97	0.48	0.17	0.18	0.20	0.17	0.19
OP1	0.23	0.13	0.39	0.31	0.16	0.20	0.18	0.19	0.18	0.24	0.12	0.16	0.29	0.25	0.20	1.10	0.25	0.18	0.23	0.32	0.33	0.29
OP2	0.37	0.33	0.61	0.16	0.30	0.08	0.24	0.12	0.22	0.28	0.27	0.34	0.16	0.23	0.32	1.27	0.21	0.15	0.11	0.24	0.21	0.17
P	0.31	0.22	0.53	0.20	0.21	0.08	0.14	0.08	0.11	0.23	0.15	0.24	0.17	0.18	0.25	1.24	0.21	0.13	0.11	0.22	0.21	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.02	0.03	0.04	0.06	0.03	0.02	0.01	0.03	0.33	0.01	0.22	0.25	0.25	0.21
C2	0.05	0.00	0.39	0.37	0.01	0.05	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.20	0.11	0.20	0.12	0.12	0.13	0.11
C2'	0.00	0.39	0.00	0.00	0.20	0.01	0.09	0.26	0.18	0.20	0.31	0.39	0.11	0.11	0.02	0.01	0.02	0.01	0.52	0.62	0.68	0.60
C3'	0.01	0.37	0.00	0.00	0.34	0.01	0.42	0.02	0.45	0.31	0.43	0.31	0.48	0.40	0.26	0.04	0.01	0.02	0.06	0.17	0.05	0.07
C4	0.02	0.01	0.20	0.34	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.17	0.07	0.12	0.12	0.12	0.11	0.11
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.15	0.06	0.05	0.10	0.14	0.08	0.37	0.02	0.00	0.02	0.09	0.03	0.02
C5	0.01	0.02	0.09	0.42	0.01	0.09	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.30	0.17	0.07	0.13	0.13	0.15	0.12
C5'	0.11	0.11	0.26	0.02	0.09	0.01	0.09	0.00	0.10	0.11	0.10	0.11	0.12	0.11	0.07	0.11	0.24	0.02	0.01	0.09	0.02	0.02
C6	0.02	0.02	0.18	0.45	0.01	0.08	0.01	0.10	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.26	0.20	0.12	0.13	0.14	0.18	0.13
C8	0.03	0.02	0.20	0.31	0.01	0.15	0.01	0.11	0.03	0.00	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.41	0.16	0.11	0.13	0.13	0.13	0.12
N1	0.04	0.01	0.31	0.43	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.18	0.14	0.18	0.12	0.13	0.16	0.12
N3	0.06	0.01	0.39	0.31	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.15	0.19	0.13	0.13	0.12	0.12
N6	0.03	0.02	0.11	0.48	0.02	0.10	0.03	0.12	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.06	0.03	0.34	0.28	0.11	0.14	0.18	0.24	0.15
N7	0.02	0.02	0.11	0.40	0.01	0.14	0.01	0.11	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.43	0.25	0.05	0.15	0.15	0.17	0.14
N9	0.01	0.02	0.02	0.26	0.01	0.08	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.21	0.06	0.02	0.13	0.15	0.14	0.13
O2'	0.03	0.20	0.01	0.04	0.17	0.37	0.30	0.11	0.26	0.41	0.18	0.20	0.34	0.43	0.21	0.00	0.06	0.26	0.39	0.51	0.80	0.53
O3'	0.33	0.11	0.02	0.01	0.07	0.02	0.17	0.24	0.20	0.16	0.14	0.15	0.28	0.25	0.06	0.06	0.00	0.25	0.29	0.34	0.34	0.31
O4'	0.01	0.20	0.01	0.02	0.12	0.00	0.07	0.02	0.12	0.11	0.18	0.19	0.11	0.05	0.02	0.26	0.25	0.00	0.08	0.11	0.07	0.08
O5'	0.22	0.12	0.52	0.06	0.12	0.02	0.13	0.01	0.13	0.13	0.12	0.13	0.14	0.15	0.13	0.39	0.29	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.25	0.12	0.62	0.17	0.12	0.09	0.13	0.09	0.14	0.13	0.13	0.13	0.18	0.15	0.15	0.51	0.34	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.13	0.68	0.05	0.11	0.03	0.15	0.02	0.18	0.13	0.16	0.12	0.24	0.17	0.14	0.80	0.34	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.11	0.60	0.07	0.11	0.02	0.12	0.02	0.13	0.12	0.12	0.12	0.15	0.14	0.13	0.53	0.31	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00