Doublet Group distance statistics: 48461

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.016, 0.035, 0.053, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.035 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.017, 0.039, 0.060, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.039 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.015, 0.038, 0.061, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.038 std_dev=0.023
N1	A	0, 0.010, 0.033, 0.056, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.033 std_dev=0.023
C5	A	0, -0.001, 0.027, 0.055, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.027 std_dev=0.028
C4	A	0, 0.002, 0.041, 0.080, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.041 std_dev=0.039
O6	A	0, 0.001, 0.055, 0.109, 0.168 max_d=0.168 avg_d=0.055 std_dev=0.054
N9	A	0, 0.009, 0.065, 0.121, 0.169 max_d=0.169 avg_d=0.065 std_dev=0.056
N7	A	0, 0.002, 0.059, 0.117, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.059 std_dev=0.057
C8	A	0, -0.006, 0.076, 0.157, 0.236 max_d=0.236 avg_d=0.076 std_dev=0.082
C2'	A	0, 0.031, 0.166, 0.302, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.166 std_dev=0.136
O4'	A	0, 0.035, 0.173, 0.311, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.173 std_dev=0.138
C3'	A	0, 0.043, 0.235, 0.427, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.235 std_dev=0.192
C4'	A	0, 0.013, 0.258, 0.503, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.258 std_dev=0.245
P	A	0, 0.170, 0.447, 0.724, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.447 std_dev=0.277
O2'	A	0, -0.012, 0.312, 0.636, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.312 std_dev=0.324
O3'	A	0, 0.058, 0.382, 0.707, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.382 std_dev=0.324
OP1	B	0, 0.043, 0.392, 0.742, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.392 std_dev=0.350
O5'	A	0, 0.042, 0.402, 0.762, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.402 std_dev=0.360
P	B	0, 0.079, 0.449, 0.820, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.449 std_dev=0.371
C5'	A	0, 0.041, 0.417, 0.793, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.417 std_dev=0.376
OP1	A	0, 0.252, 0.660, 1.067, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.660 std_dev=0.407
OP2	A	0, 0.366, 0.778, 1.189, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.778 std_dev=0.411
O5'	B	0, 0.105, 0.532, 0.959, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.532 std_dev=0.427
OP2	B	0, 0.075, 0.510, 0.946, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.510 std_dev=0.435
C5'	B	0, 0.165, 0.604, 1.043, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.604 std_dev=0.439
C4'	B	0, 0.156, 0.673, 1.191, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.673 std_dev=0.517
C3'	B	0, 0.175, 0.699, 1.223, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.699 std_dev=0.524
O3'	B	0, 0.213, 0.757, 1.302, 1.771 max_d=1.771 avg_d=0.757 std_dev=0.544
O4'	B	0, 0.121, 0.700, 1.279, 2.025 max_d=2.025 avg_d=0.700 std_dev=0.579
C2'	B	0, 0.181, 0.775, 1.369, 2.102 max_d=2.102 avg_d=0.775 std_dev=0.594
C1'	B	0, 0.127, 0.745, 1.363, 2.209 max_d=2.209 avg_d=0.745 std_dev=0.618
O2'	B	0, 0.251, 0.869, 1.487, 2.240 max_d=2.240 avg_d=0.869 std_dev=0.618
C8	B	0, 0.064, 0.699, 1.334, 2.266 max_d=2.266 avg_d=0.699 std_dev=0.635
N9	B	0, 0.110, 0.751, 1.393, 2.300 max_d=2.300 avg_d=0.751 std_dev=0.642
N7	B	0, 0.046, 0.743, 1.439, 2.505 max_d=2.505 avg_d=0.743 std_dev=0.696
C4	B	0, 0.115, 0.814, 1.513, 2.513 max_d=2.513 avg_d=0.814 std_dev=0.699
N3	B	0, 0.146, 0.884, 1.622, 2.623 max_d=2.623 avg_d=0.884 std_dev=0.738
C5	B	0, 0.076, 0.818, 1.561, 2.673 max_d=2.673 avg_d=0.818 std_dev=0.742
C2	B	0, 0.133, 0.959, 1.785, 2.909 max_d=2.909 avg_d=0.959 std_dev=0.826
C6	B	0, 0.060, 0.915, 1.769, 3.054 max_d=3.054 avg_d=0.915 std_dev=0.855
N1	B	0, 0.093, 0.979, 1.864, 3.132 max_d=3.132 avg_d=0.979 std_dev=0.886
N6	B	0, 0.006, 0.952, 1.897, 3.374 max_d=3.374 avg_d=0.952 std_dev=0.945

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.08	0.29	0.10
C2	0.03	0.00	0.10	0.09	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.12	0.07	0.16	0.01	0.19	0.25	0.13
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.10	0.04	0.11	0.11	0.09	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.09	0.31	0.10
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.11	0.10	0.10	0.09	0.08	0.11	0.06	0.03	0.00	0.02	0.13	0.11	0.15	0.28	0.12
C4	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.09	0.05	0.17	0.01	0.18	0.26	0.13
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.08	0.11	0.05	0.05	0.03	0.11	0.05	0.08	0.02	0.01	0.02	0.10	0.09	0.22	0.06
C5	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.12	0.06	0.25	0.02	0.23	0.25	0.18
C5'	0.03	0.10	0.02	0.01	0.12	0.01	0.18	0.00	0.19	0.19	0.15	0.09	0.08	0.21	0.11	0.08	0.03	0.02	0.01	0.22	0.12	0.16	0.03
C6	0.02	0.01	0.10	0.11	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.14	0.07	0.28	0.00	0.27	0.24	0.21
C8	0.02	0.02	0.04	0.10	0.01	0.11	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.05	0.26	0.03	0.19	0.25	0.16
N1	0.02	0.00	0.11	0.10	0.01	0.05	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.20	0.14	0.07	0.22	0.01	0.24	0.24	0.18
N2	0.05	0.00	0.11	0.09	0.02	0.05	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.21	0.13	0.09	0.13	0.02	0.18	0.25	0.11
N3	0.03	0.01	0.09	0.08	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.15	0.10	0.07	0.12	0.01	0.16	0.26	0.11
N7	0.02	0.02	0.05	0.11	0.01	0.11	0.01	0.21	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.08	0.13	0.06	0.30	0.03	0.25	0.25	0.21
N9	0.00	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.06	0.02	0.15	0.03	0.14	0.27	0.11
O2'	0.02	0.19	0.01	0.03	0.12	0.08	0.13	0.08	0.17	0.04	0.20	0.21	0.15	0.08	0.05	0.00	0.04	0.08	0.08	0.18	0.12	0.26	0.07
O3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.09	0.02	0.12	0.03	0.14	0.11	0.14	0.13	0.10	0.13	0.06	0.04	0.00	0.01	0.16	0.15	0.22	0.25	0.17
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.05	0.07	0.09	0.07	0.06	0.02	0.08	0.01	0.00	0.12	0.09	0.10	0.32	0.17
O5'	0.05	0.16	0.09	0.13	0.17	0.02	0.25	0.01	0.28	0.26	0.22	0.13	0.12	0.30	0.15	0.08	0.16	0.12	0.00	0.33	0.02	0.03	0.01
O6	0.02	0.01	0.10	0.11	0.01	0.10	0.02	0.22	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.18	0.15	0.09	0.33	0.00	0.32	0.24	0.26
OP1	0.08	0.19	0.09	0.15	0.18	0.09	0.23	0.12	0.27	0.19	0.24	0.18	0.16	0.25	0.14	0.12	0.22	0.10	0.02	0.32	0.00	0.03	0.01
OP2	0.29	0.25	0.31	0.28	0.26	0.22	0.25	0.16	0.24	0.25	0.24	0.25	0.26	0.25	0.27	0.26	0.25	0.32	0.03	0.24	0.03	0.00	0.01
P	0.10	0.13	0.10	0.12	0.13	0.06	0.18	0.03	0.21	0.16	0.18	0.11	0.11	0.21	0.11	0.07	0.17	0.17	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.09	0.16	0.15	0.10	0.17	0.08	0.15	0.09	0.10	0.08	0.12	0.13	0.08	0.13	0.21	0.16	0.18	0.12	0.13	0.07	0.10
C2	0.18	0.16	0.16	0.15	0.17	0.17	0.18	0.16	0.19	0.18	0.17	0.17	0.20	0.19	0.18	0.22	0.16	0.19	0.15	0.13	0.09	0.12
C2'	0.14	0.09	0.13	0.11	0.09	0.13	0.11	0.11	0.14	0.08	0.12	0.10	0.19	0.11	0.09	0.17	0.12	0.14	0.05	0.09	0.07	0.05
C3'	0.15	0.09	0.14	0.12	0.08	0.13	0.07	0.10	0.10	0.07	0.09	0.10	0.14	0.07	0.10	0.19	0.12	0.15	0.07	0.11	0.07	0.07
C4	0.13	0.09	0.13	0.12	0.09	0.13	0.09	0.12	0.11	0.09	0.10	0.10	0.13	0.10	0.10	0.19	0.13	0.15	0.11	0.13	0.07	0.10
C4'	0.20	0.13	0.19	0.18	0.15	0.18	0.12	0.16	0.11	0.15	0.11	0.16	0.13	0.12	0.17	0.24	0.18	0.21	0.18	0.19	0.16	0.17
C5	0.15	0.10	0.14	0.14	0.11	0.15	0.10	0.14	0.10	0.10	0.10	0.12	0.11	0.10	0.12	0.20	0.15	0.16	0.14	0.15	0.09	0.12
C5'	0.22	0.16	0.22	0.22	0.18	0.21	0.16	0.20	0.14	0.19	0.14	0.19	0.15	0.16	0.20	0.25	0.22	0.23	0.23	0.24	0.24	0.23
C6	0.19	0.15	0.18	0.18	0.16	0.19	0.15	0.19	0.14	0.16	0.14	0.17	0.14	0.15	0.17	0.24	0.20	0.20	0.16	0.15	0.09	0.13
C8	0.14	0.07	0.13	0.13	0.08	0.14	0.06	0.13	0.06	0.07	0.06	0.10	0.08	0.06	0.10	0.18	0.14	0.15	0.12	0.15	0.10	0.12
N1	0.21	0.18	0.20	0.19	0.19	0.21	0.19	0.20	0.18	0.20	0.18	0.20	0.18	0.19	0.20	0.26	0.20	0.22	0.17	0.14	0.08	0.14
N2	0.22	0.21	0.19	0.17	0.22	0.20	0.24	0.19	0.24	0.24	0.23	0.22	0.25	0.26	0.23	0.24	0.17	0.23	0.18	0.14	0.16	0.17
N3	0.14	0.11	0.13	0.12	0.11	0.14	0.13	0.12	0.15	0.12	0.13	0.11	0.18	0.14	0.12	0.19	0.13	0.15	0.11	0.12	0.08	0.10
N7	0.14	0.08	0.13	0.13	0.09	0.14	0.07	0.14	0.07	0.08	0.07	0.10	0.08	0.06	0.11	0.19	0.15	0.15	0.14	0.16	0.12	0.13
N9	0.14	0.07	0.13	0.12	0.08	0.14	0.07	0.12	0.09	0.07	0.07	0.09	0.12	0.07	0.10	0.19	0.13	0.15	0.11	0.13	0.07	0.10
O2'	0.14	0.11	0.14	0.11	0.10	0.13	0.13	0.10	0.16	0.09	0.14	0.11	0.22	0.14	0.10	0.21	0.13	0.14	0.08	0.12	0.09	0.09
O3'	0.15	0.13	0.14	0.11	0.12	0.13	0.11	0.09	0.14	0.09	0.14	0.14	0.18	0.11	0.12	0.21	0.12	0.15	0.07	0.10	0.07	0.07
O4'	0.26	0.19	0.25	0.24	0.20	0.25	0.17	0.23	0.15	0.21	0.16	0.21	0.14	0.17	0.23	0.28	0.24	0.26	0.23	0.23	0.20	0.22
O5'	0.16	0.07	0.14	0.14	0.08	0.16	0.08	0.14	0.10	0.09	0.09	0.09	0.15	0.08	0.11	0.19	0.14	0.18	0.15	0.15	0.16	0.13
O6	0.22	0.17	0.22	0.21	0.18	0.23	0.16	0.22	0.15	0.18	0.15	0.19	0.13	0.16	0.20	0.28	0.23	0.22	0.18	0.16	0.10	0.14
OP1	0.25	0.20	0.24	0.24	0.21	0.24	0.19	0.23	0.18	0.22	0.19	0.22	0.18	0.20	0.23	0.25	0.24	0.25	0.24	0.23	0.26	0.23
OP2	0.23	0.21	0.21	0.20	0.22	0.20	0.21	0.20	0.22	0.21	0.21	0.22	0.24	0.21	0.22	0.28	0.20	0.22	0.24	0.22	0.23	0.23
P	0.13	0.05	0.11	0.09	0.07	0.11	0.06	0.09	0.07	0.08	0.06	0.07	0.11	0.06	0.09	0.15	0.09	0.14	0.13	0.10	0.15	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.04	0.10	0.05
C2	0.03	0.00	0.07	0.10	0.02	0.06	0.02	0.08	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.12	0.02	0.11	0.11	0.11	0.09
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.07	0.07	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.08	0.03
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.08	0.04	0.09	0.09	0.08	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.06	0.07	0.04
C4	0.01	0.02	0.04	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.09	0.08	0.11	0.07
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.05	0.06	0.03
C5	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.07	0.03	0.10	0.08	0.11	0.08
C5'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.07	0.07	0.08	0.07	0.08	0.07	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02
C6	0.02	0.02	0.05	0.08	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.10	0.03	0.11	0.09	0.11	0.09
C8	0.03	0.03	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.06	0.10	0.09	0.15	0.09
N1	0.02	0.01	0.07	0.09	0.02	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.12	0.03	0.11	0.11	0.12	0.09
N3	0.03	0.01	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.06	0.10	0.02	0.10	0.10	0.11	0.07
N6	0.02	0.02	0.06	0.08	0.02	0.04	0.02	0.08	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.11	0.04	0.11	0.08	0.10	0.08
N7	0.03	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.03	0.03	0.06	0.10	0.09	0.13	0.09
N9	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.08	0.07	0.11	0.07
O2'	0.03	0.07	0.01	0.03	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.03	0.06	0.06	0.04	0.03	0.03	0.00	0.07	0.07	0.04	0.07	0.08	0.05
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.10	0.03	0.12	0.10	0.11	0.03	0.02	0.07	0.00	0.02	0.07	0.06	0.07	0.04
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.06	0.03	0.02	0.04	0.06	0.02	0.07	0.02	0.00	0.05	0.06	0.12	0.08
O5'	0.04	0.11	0.02	0.05	0.09	0.02	0.10	0.01	0.11	0.10	0.11	0.10	0.11	0.10	0.08	0.04	0.07	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.04	0.11	0.05	0.06	0.08	0.05	0.08	0.06	0.09	0.09	0.11	0.10	0.08	0.09	0.07	0.07	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.11	0.08	0.07	0.11	0.06	0.11	0.03	0.11	0.15	0.12	0.11	0.10	0.13	0.11	0.08	0.07	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.09	0.03	0.04	0.07	0.03	0.08	0.02	0.09	0.09	0.09	0.07	0.08	0.09	0.07	0.05	0.04	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00