Doublet Group distance statistics: 48471

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.001, 0.008, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C8	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N2	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.004, 0.020, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.001, 0.020, 0.038, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.020 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.008, 0.032, 0.056, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.032 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.013, 0.057, 0.101, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.057 std_dev=0.044
C2'	A	0, -0.005, 0.056, 0.116, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.056 std_dev=0.061
C3'	A	0, 0.012, 0.112, 0.212, 0.231 max_d=0.231 avg_d=0.112 std_dev=0.100
O2'	A	0, 0.020, 0.143, 0.266, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.143 std_dev=0.123
O3'	A	0, 0.025, 0.158, 0.292, 0.327 max_d=0.327 avg_d=0.158 std_dev=0.133
C4'	A	0, 0.009, 0.145, 0.281, 0.320 max_d=0.320 avg_d=0.145 std_dev=0.136
P	A	0, 0.025, 0.217, 0.409, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.217 std_dev=0.192
OP1	B	0, 0.000, 0.217, 0.434, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.217 std_dev=0.217
C5'	A	0, 0.000, 0.239, 0.477, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.239 std_dev=0.239
OP2	A	0, 0.011, 0.278, 0.545, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.278 std_dev=0.267
C5'	B	0, 0.001, 0.298, 0.596, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.298 std_dev=0.297
O5'	A	0, -0.020, 0.293, 0.607, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.293 std_dev=0.313
P	B	0, 0.000, 0.340, 0.680, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.340 std_dev=0.340
O5'	B	0, 0.007, 0.349, 0.691, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.349 std_dev=0.342
C4'	B	0, 0.004, 0.429, 0.854, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.429 std_dev=0.425
C3'	B	0, 0.025, 0.538, 1.051, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.538 std_dev=0.513
OP1	A	0, -0.058, 0.455, 0.969, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.455 std_dev=0.514
O4'	B	0, -0.050, 0.470, 0.990, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.470 std_dev=0.520
OP2	B	0, -0.023, 0.521, 1.066, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.521 std_dev=0.544
O3'	B	0, 0.050, 0.602, 1.153, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.602 std_dev=0.551
C2'	B	0, 0.017, 0.622, 1.226, 1.558 max_d=1.558 avg_d=0.622 std_dev=0.604
C1'	B	0, -0.031, 0.573, 1.178, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.573 std_dev=0.605
O2'	B	0, 0.028, 0.676, 1.323, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.676 std_dev=0.647
C8	B	0, -0.013, 0.636, 1.284, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.636 std_dev=0.648
N9	B	0, -0.044, 0.616, 1.276, 1.707 max_d=1.707 avg_d=0.616 std_dev=0.660
N7	B	0, -0.037, 0.673, 1.384, 1.852 max_d=1.852 avg_d=0.673 std_dev=0.710
C4	B	0, -0.081, 0.657, 1.394, 1.889 max_d=1.889 avg_d=0.657 std_dev=0.737
C5	B	0, -0.082, 0.686, 1.453, 1.973 max_d=1.973 avg_d=0.686 std_dev=0.767
N3	B	0, -0.101, 0.686, 1.472, 2.001 max_d=2.001 avg_d=0.686 std_dev=0.786
C6	B	0, -0.109, 0.744, 1.598, 2.184 max_d=2.184 avg_d=0.744 std_dev=0.853
C2	B	0, -0.102, 0.759, 1.620, 2.197 max_d=2.197 avg_d=0.759 std_dev=0.861
N6	B	0, -0.128, 0.766, 1.659, 2.284 max_d=2.284 avg_d=0.766 std_dev=0.893
N1	B	0, -0.107, 0.791, 1.689, 2.296 max_d=2.296 avg_d=0.791 std_dev=0.898

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.26	0.02	0.23	0.19	0.09
C2	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.05	0.02	0.29	0.01	0.02	0.25	0.02
C2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.00	0.04	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.21	0.04	0.22	0.15	0.09
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.21	0.17	0.02
C4	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.03	0.01	0.32	0.01	0.09	0.23	0.05
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.08	0.08	0.04	0.04	0.09	0.05	0.00	0.01	0.00	0.02	0.07	0.23	0.20	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.07	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.02	0.02	0.33	0.01	0.07	0.24	0.07
C5'	0.04	0.16	0.03	0.01	0.14	0.01	0.17	0.00	0.18	0.15	0.19	0.14	0.13	0.18	0.12	0.03	0.02	0.01	0.01	0.18	0.23	0.22	0.00
C6	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.07	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.03	0.02	0.32	0.00	0.07	0.24	0.07
C8	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.03	0.03	0.34	0.03	0.14	0.22	0.08
N1	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.09	0.03	0.03	0.29	0.01	0.06	0.26	0.05
N2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.01	0.28	0.02	0.01	0.24	0.02
N3	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.02	0.13	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.09	0.05	0.01	0.30	0.02	0.08	0.23	0.04
N7	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.03	0.03	0.33	0.03	0.09	0.24	0.09
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.32	0.02	0.15	0.22	0.07
O2'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.08	0.00	0.09	0.03	0.10	0.05	0.09	0.11	0.09	0.07	0.05	0.00	0.04	0.00	0.21	0.11	0.22	0.13	0.10
O3'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.08	0.05	0.03	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.22	0.18	0.02
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.22	0.02	0.28	0.17	0.10
O5'	0.26	0.29	0.21	0.05	0.32	0.02	0.33	0.01	0.32	0.34	0.29	0.28	0.30	0.33	0.32	0.21	0.02	0.22	0.00	0.33	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.07	0.01	0.18	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.11	0.03	0.02	0.33	0.00	0.10	0.22	0.09
OP1	0.23	0.02	0.22	0.21	0.09	0.23	0.07	0.23	0.07	0.14	0.06	0.01	0.08	0.09	0.15	0.22	0.22	0.28	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.25	0.15	0.17	0.23	0.20	0.24	0.22	0.24	0.22	0.26	0.24	0.23	0.24	0.22	0.13	0.18	0.17	0.01	0.22	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.02	0.09	0.02	0.05	0.02	0.07	0.00	0.07	0.08	0.05	0.02	0.04	0.09	0.07	0.10	0.02	0.10	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.10	0.04	0.06	0.09	0.02	0.10	0.05	0.10	0.10	0.10	0.10	0.11	0.11	0.09	0.02	0.11	0.08	0.14	0.21	0.38	0.27
C2	0.16	0.11	0.15	0.15	0.13	0.15	0.13	0.18	0.11	0.17	0.11	0.13	0.10	0.14	0.15	0.16	0.19	0.18	0.13	0.13	0.28	0.19
C2'	0.03	0.06	0.03	0.06	0.05	0.02	0.05	0.03	0.05	0.04	0.05	0.07	0.06	0.04	0.04	0.03	0.11	0.06	0.11	0.19	0.30	0.23
C3'	0.08	0.04	0.09	0.11	0.02	0.10	0.03	0.07	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.11	0.14	0.08	0.07	0.15	0.23	0.17
C4	0.10	0.09	0.08	0.08	0.10	0.08	0.11	0.12	0.10	0.13	0.09	0.10	0.10	0.12	0.11	0.08	0.12	0.12	0.14	0.20	0.36	0.24
C4'	0.07	0.03	0.09	0.09	0.02	0.09	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.11	0.13	0.07	0.09	0.20	0.29	0.21
C5	0.07	0.05	0.08	0.08	0.07	0.06	0.08	0.10	0.06	0.12	0.05	0.07	0.07	0.10	0.09	0.09	0.13	0.09	0.10	0.18	0.33	0.21
C5'	0.09	0.03	0.10	0.09	0.03	0.09	0.03	0.07	0.02	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.13	0.12	0.08	0.12	0.27	0.32	0.24
C6	0.09	0.04	0.10	0.10	0.07	0.08	0.08	0.12	0.06	0.13	0.04	0.07	0.07	0.10	0.10	0.12	0.15	0.11	0.09	0.14	0.29	0.18
C8	0.04	0.07	0.07	0.08	0.07	0.03	0.08	0.06	0.07	0.10	0.06	0.08	0.08	0.10	0.08	0.07	0.14	0.06	0.11	0.21	0.37	0.25
N1	0.13	0.07	0.13	0.13	0.10	0.13	0.10	0.16	0.08	0.15	0.07	0.09	0.08	0.12	0.13	0.15	0.18	0.15	0.11	0.13	0.26	0.17
N2	0.20	0.14	0.20	0.21	0.16	0.20	0.15	0.21	0.12	0.19	0.13	0.16	0.11	0.15	0.19	0.22	0.25	0.22	0.13	0.06	0.21	0.14
N3	0.14	0.12	0.12	0.12	0.14	0.13	0.13	0.15	0.12	0.16	0.12	0.13	0.12	0.14	0.15	0.12	0.15	0.17	0.16	0.19	0.34	0.25
N7	0.05	0.05	0.08	0.08	0.06	0.04	0.07	0.07	0.05	0.10	0.04	0.07	0.06	0.09	0.07	0.09	0.14	0.06	0.10	0.19	0.35	0.22
N9	0.07	0.09	0.05	0.06	0.09	0.04	0.10	0.08	0.10	0.12	0.09	0.10	0.11	0.12	0.10	0.04	0.11	0.10	0.14	0.22	0.38	0.26
O2'	0.07	0.12	0.08	0.11	0.10	0.06	0.09	0.06	0.09	0.08	0.11	0.13	0.08	0.08	0.09	0.06	0.16	0.08	0.12	0.11	0.27	0.21
O3'	0.07	0.05	0.08	0.10	0.02	0.09	0.02	0.08	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.03	0.10	0.14	0.07	0.06	0.08	0.20	0.14
O4'	0.02	0.06	0.04	0.06	0.05	0.03	0.06	0.03	0.06	0.06	0.06	0.06	0.08	0.07	0.04	0.07	0.12	0.05	0.12	0.20	0.36	0.25
O5'	0.24	0.23	0.30	0.32	0.22	0.26	0.22	0.21	0.22	0.22	0.22	0.22	0.21	0.22	0.23	0.29	0.38	0.21	0.16	0.02	0.06	0.02
O6	0.09	0.03	0.11	0.10	0.07	0.08	0.07	0.12	0.05	0.13	0.03	0.06	0.07	0.10	0.09	0.13	0.16	0.10	0.08	0.14	0.28	0.17
OP1	0.19	0.16	0.21	0.20	0.17	0.19	0.17	0.13	0.16	0.18	0.16	0.16	0.16	0.17	0.18	0.22	0.22	0.18	0.09	0.10	0.12	0.05
OP2	0.03	0.04	0.08	0.07	0.01	0.03	0.04	0.11	0.03	0.06	0.01	0.05	0.06	0.07	0.02	0.13	0.13	0.04	0.17	0.38	0.43	0.34
P	0.15	0.14	0.19	0.19	0.12	0.15	0.11	0.09	0.11	0.10	0.12	0.14	0.09	0.10	0.12	0.21	0.23	0.12	0.06	0.16	0.22	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.05	0.00	0.08	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.11	0.06
C2	0.09	0.00	0.03	0.02	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.07	0.03	0.10	0.10	0.10	0.22	0.14
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.04	0.03	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.06	0.14	0.10
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.08	0.03	0.02	0.03	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.10	0.08	0.12	0.10
C4	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.06	0.08	0.09	0.20	0.13
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.07	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03
C5	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.03	0.08	0.12	0.22	0.15
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.00	0.06	0.08	0.07	0.08	0.05	0.08	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.02
C6	0.05	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.03	0.05	0.08	0.12	0.24	0.16
C8	0.00	0.03	0.06	0.08	0.02	0.04	0.02	0.08	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.10	0.12	0.20	0.15
N1	0.08	0.01	0.04	0.03	0.02	0.06	0.01	0.07	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.07	0.03	0.08	0.09	0.11	0.23	0.15
N3	0.09	0.00	0.03	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.05	0.03	0.11	0.09	0.09	0.20	0.13
N6	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.07	0.04	0.03	0.07	0.13	0.24	0.16
N7	0.02	0.02	0.05	0.06	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.07	0.00	0.09	0.14	0.23	0.16
N9	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.06	0.03	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.08	0.08	0.17	0.12
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.06	0.04	0.07	0.05	0.07	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.05	0.10	0.05
O3'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.08	0.03	0.03	0.04	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01	0.10	0.09	0.11	0.10
O4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.01	0.08	0.11	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.03	0.05	0.02
O5'	0.04	0.10	0.08	0.10	0.08	0.02	0.08	0.01	0.08	0.10	0.09	0.09	0.07	0.09	0.08	0.05	0.10	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.03	0.10	0.06	0.08	0.09	0.04	0.12	0.05	0.12	0.12	0.11	0.09	0.13	0.14	0.08	0.05	0.09	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.22	0.14	0.12	0.20	0.06	0.22	0.03	0.24	0.20	0.23	0.20	0.24	0.23	0.17	0.10	0.11	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.14	0.10	0.10	0.13	0.03	0.15	0.02	0.16	0.15	0.15	0.13	0.16	0.16	0.12	0.05	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00