Doublet Group distance statistics: 48475

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.010, 0.033, 0.057, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.033 std_dev=0.024
N1	A	0, 0.013, 0.043, 0.074, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.043 std_dev=0.031
O6	A	0, 0.013, 0.045, 0.077, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.045 std_dev=0.032
N7	A	0, 0.013, 0.046, 0.079, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.046 std_dev=0.033
C4	A	0, 0.014, 0.047, 0.080, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.047 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.016, 0.056, 0.095, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.056 std_dev=0.039
N9	A	0, 0.018, 0.061, 0.104, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.061 std_dev=0.043
C2	A	0, 0.020, 0.069, 0.117, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.069 std_dev=0.049
N3	A	0, 0.022, 0.076, 0.129, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.076 std_dev=0.053
C1'	A	0, 0.025, 0.085, 0.146, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.085 std_dev=0.060
N2	A	0, 0.028, 0.096, 0.165, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.096 std_dev=0.068
P	B	0, 0.201, 0.686, 1.170, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.686 std_dev=0.485
OP1	B	0, 0.212, 0.726, 1.240, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.726 std_dev=0.514
OP2	B	0, 0.274, 0.937, 1.599, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.937 std_dev=0.663
O4'	A	0, 0.354, 1.207, 2.061, 1.816 max_d=1.816 avg_d=1.207 std_dev=0.854
C2'	A	0, 0.427, 1.459, 2.490, 2.193 max_d=2.193 avg_d=1.459 std_dev=1.032
C4'	A	0, 0.533, 1.819, 3.105, 2.730 max_d=2.730 avg_d=1.819 std_dev=1.286
C3'	A	0, 0.539, 1.839, 3.139, 2.759 max_d=2.759 avg_d=1.839 std_dev=1.300
O3'	A	0, 0.565, 1.930, 3.295, 2.899 max_d=2.899 avg_d=1.930 std_dev=1.365
O5'	B	0, 0.600, 2.049, 3.498, 3.105 max_d=3.105 avg_d=2.049 std_dev=1.449
O2'	A	0, 0.609, 2.079, 3.549, 3.133 max_d=3.133 avg_d=2.079 std_dev=1.470
C5'	A	0, 0.887, 3.028, 5.169, 4.552 max_d=4.552 avg_d=3.028 std_dev=2.141
C5'	B	0, 1.061, 3.621, 6.182, 5.457 max_d=5.457 avg_d=3.621 std_dev=2.561
O5'	A	0, 1.235, 4.216, 7.197, 6.336 max_d=6.336 avg_d=4.216 std_dev=2.981
OP2	A	0, 1.257, 4.291, 7.325, 6.462 max_d=6.462 avg_d=4.291 std_dev=3.034
O4'	B	0, 1.379, 4.709, 8.039, 7.092 max_d=7.092 avg_d=4.709 std_dev=3.330
P	A	0, 1.426, 4.870, 8.314, 7.328 max_d=7.328 avg_d=4.870 std_dev=3.444
C4'	B	0, 1.457, 4.975, 8.493, 7.493 max_d=7.493 avg_d=4.975 std_dev=3.518
C3'	B	0, 1.858, 6.343, 10.828, 9.542 max_d=9.542 avg_d=6.343 std_dev=4.485
C1'	B	0, 1.867, 6.373, 10.879, 9.587 max_d=9.587 avg_d=6.373 std_dev=4.506
OP1	A	0, 1.882, 6.426, 10.970, 9.663 max_d=9.663 avg_d=6.426 std_dev=4.544
C8	B	0, 1.900, 6.488, 11.075, 9.746 max_d=9.746 avg_d=6.488 std_dev=4.587
N9	B	0, 1.934, 6.603, 11.272, 9.924 max_d=9.924 avg_d=6.603 std_dev=4.669
N7	B	0, 2.156, 7.360, 12.564, 11.048 max_d=11.048 avg_d=7.360 std_dev=5.204
C4	B	0, 2.184, 7.458, 12.732, 11.200 max_d=11.200 avg_d=7.458 std_dev=5.274
C2'	B	0, 2.191, 7.482, 12.772, 11.252 max_d=11.252 avg_d=7.482 std_dev=5.290
O3'	B	0, 2.203, 7.521, 12.839, 11.309 max_d=11.309 avg_d=7.521 std_dev=5.318
C5	B	0, 2.314, 7.899, 13.485, 11.857 max_d=11.857 avg_d=7.899 std_dev=5.586
N3	B	0, 2.360, 8.059, 13.757, 12.100 max_d=12.100 avg_d=8.059 std_dev=5.698
O2'	B	0, 2.490, 8.503, 14.516, 12.783 max_d=12.783 avg_d=8.503 std_dev=6.013
C2	B	0, 2.617, 8.933, 15.250, 13.408 max_d=13.408 avg_d=8.933 std_dev=6.317
C6	B	0, 2.638, 9.007, 15.377, 13.518 max_d=13.518 avg_d=9.007 std_dev=6.369
N1	B	0, 2.762, 9.431, 16.099, 14.153 max_d=14.153 avg_d=9.431 std_dev=6.669
N6	B	0, 2.889, 9.864, 16.839, 14.805 max_d=14.805 avg_d=9.864 std_dev=6.975

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.06	0.07	0.00	0.01	0.00	0.13	0.00	0.07	0.02	0.18	0.57	0.31
C2	0.06	0.00	0.34	0.27	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.29	0.16	0.21	0.19	0.01	0.84	0.72	0.75
C2'	0.00	0.34	0.00	0.00	0.17	0.02	0.07	0.07	0.13	0.18	0.26	0.41	0.34	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.08	0.05	0.58	0.24
C3'	0.01	0.27	0.00	0.00	0.23	0.00	0.24	0.00	0.27	0.16	0.29	0.27	0.24	0.21	0.16	0.01	0.00	0.02	0.23	0.27	0.25	0.25	0.02
C4	0.03	0.01	0.17	0.23	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.11	0.06	0.01	0.48	0.57	0.46
C4'	0.00	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.04	0.19	0.02	0.12	0.07	0.16	0.07	0.18	0.00	0.00	0.00	0.07	0.08	0.39	0.15
C5	0.02	0.01	0.07	0.24	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.14	0.03	0.24	0.01	0.35	0.37	0.27
C5'	0.02	0.16	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.02	0.26	0.09	0.24	0.15	0.22	0.06	0.10	0.11	0.00	0.00	0.06	0.21	0.27	0.00
C6	0.03	0.01	0.13	0.27	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.18	0.08	0.16	0.00	0.51	0.40	0.37
C8	0.01	0.01	0.18	0.16	0.00	0.19	0.01	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.39	0.06	0.16	0.56	0.02	0.11	0.14	0.13
N1	0.05	0.00	0.26	0.29	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.19	0.15	0.04	0.01	0.75	0.58	0.60
N2	0.06	0.00	0.41	0.27	0.01	0.12	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.43	0.16	0.26	0.34	0.01	1.01	0.82	0.89
N3	0.07	0.00	0.34	0.24	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.30	0.12	0.21	0.17	0.01	0.73	0.74	0.71
N7	0.00	0.01	0.10	0.21	0.00	0.16	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.35	0.12	0.10	0.52	0.02	0.01	0.08	0.08
N9	0.01	0.02	0.01	0.16	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.12	0.03	0.01	0.21	0.01	0.21	0.48	0.26
O2'	0.00	0.29	0.00	0.01	0.04	0.18	0.13	0.10	0.06	0.39	0.13	0.43	0.30	0.35	0.12	0.00	0.03	0.13	0.19	0.14	0.09	0.54	0.15
O3'	0.13	0.16	0.01	0.00	0.10	0.00	0.14	0.11	0.18	0.06	0.19	0.16	0.12	0.12	0.03	0.03	0.00	0.07	0.26	0.20	0.46	0.11	0.14
O4'	0.00	0.21	0.00	0.02	0.11	0.00	0.03	0.00	0.08	0.16	0.15	0.26	0.21	0.10	0.01	0.13	0.07	0.00	0.04	0.05	0.19	0.57	0.35
O5'	0.07	0.19	0.10	0.23	0.06	0.00	0.24	0.00	0.16	0.56	0.04	0.34	0.17	0.52	0.21	0.19	0.26	0.04	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.08	0.27	0.01	0.07	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.14	0.20	0.05	0.24	0.00	0.44	0.26	0.26
OP1	0.18	0.84	0.05	0.25	0.48	0.08	0.35	0.21	0.51	0.11	0.75	1.01	0.73	0.01	0.21	0.09	0.46	0.19	0.01	0.44	0.00	0.00	0.00
OP2	0.57	0.72	0.58	0.25	0.57	0.39	0.37	0.27	0.40	0.14	0.58	0.82	0.74	0.08	0.48	0.54	0.11	0.57	0.01	0.26	0.00	0.00	0.00
P	0.31	0.75	0.24	0.02	0.46	0.15	0.27	0.00	0.37	0.13	0.60	0.89	0.71	0.08	0.26	0.15	0.14	0.35	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	1.26	2.22	1.59	1.70	1.39	1.47	0.87	1.29	1.07	0.31	1.74	2.10	0.63	0.20	1.01	1.73	2.04	1.18	0.64	0.04	0.21	0.20
C2	0.27	0.44	0.54	0.80	0.08	0.95	0.71	1.05	0.65	0.95	0.08	0.53	1.11	1.27	0.23	0.83	1.20	0.48	0.44	0.21	0.11	0.26
C2'	0.88	1.98	1.18	1.23	1.10	1.00	0.64	0.79	0.91	0.03	1.57	1.79	0.53	0.03	0.69	1.32	1.55	0.77	0.15	0.48	0.71	0.28
C3'	1.38	2.49	1.66	1.63	1.64	1.37	1.21	1.11	1.47	0.61	2.11	2.28	1.09	0.57	1.23	1.76	1.88	1.21	0.49	0.14	0.47	0.04
C4	0.80	1.20	1.14	1.39	0.58	1.35	0.05	1.30	0.03	0.38	0.65	1.24	0.48	0.65	0.36	1.40	1.85	0.89	0.61	0.18	0.01	0.29
C4'	2.04	3.02	2.35	2.29	2.26	1.96	1.79	1.61	1.98	1.23	2.58	2.90	1.54	1.15	1.87	2.44	2.51	1.81	1.00	0.27	0.06	0.45
C5	0.64	0.83	1.04	1.31	0.28	1.29	0.39	1.25	0.39	0.60	0.23	0.92	0.95	0.94	0.14	1.35	1.85	0.78	0.55	0.19	0.06	0.29
C5'	2.43	3.06	2.82	2.66	2.49	2.29	2.00	1.84	2.09	1.58	2.62	3.05	1.64	1.43	2.20	2.98	2.93	2.14	1.20	0.42	0.07	0.59
C6	0.31	0.25	0.69	1.00	0.20	1.07	0.90	1.11	0.96	0.98	0.37	0.40	1.55	1.40	0.26	1.05	1.56	0.53	0.45	0.21	0.13	0.27
C8	1.05	1.53	1.47	1.66	0.87	1.50	0.25	1.36	0.32	0.09	0.97	1.54	0.21	0.36	0.63	1.73	2.19	1.06	0.65	0.14	0.04	0.29
N1	0.12	0.06	0.44	0.75	0.39	0.90	1.07	0.99	1.10	1.16	0.52	0.20	1.64	1.57	0.45	0.79	1.24	0.37	0.38	0.22	0.16	0.25
N2	0.04	0.15	0.17	0.40	0.36	0.64	0.93	0.79	0.84	1.22	0.31	0.21	1.22	1.49	0.52	0.45	0.73	0.22	0.31	0.23	0.18	0.22
N3	0.65	1.07	0.92	1.16	0.46	1.22	0.13	1.25	0.04	0.50	0.56	1.11	0.49	0.74	0.23	1.16	1.53	0.79	0.58	0.19	0.02	0.29
N7	0.82	1.07	1.25	1.49	0.49	1.40	0.17	1.31	0.16	0.39	0.47	1.15	0.73	0.73	0.33	1.57	2.07	0.91	0.60	0.17	0.03	0.29
N9	1.08	1.70	1.45	1.64	0.99	1.49	0.39	1.36	0.51	0.02	1.16	1.68	0.02	0.24	0.71	1.67	2.09	1.09	0.66	0.13	0.08	0.28
O2'	0.54	1.90	0.78	0.81	0.90	0.60	0.52	0.43	0.88	0.21	1.57	1.60	0.57	0.18	0.42	0.88	1.07	0.42	0.15	0.80	0.90	0.55
O3'	1.37	2.73	1.54	1.49	1.79	1.29	1.46	1.08	1.81	0.76	2.46	2.41	1.49	0.80	1.32	1.58	1.61	1.22	0.53	0.07	0.39	0.13
O4'	1.97	2.78	2.32	2.39	2.06	2.08	1.51	1.77	1.65	1.01	2.27	2.75	1.18	0.87	1.71	2.45	2.69	1.82	1.12	0.41	0.12	0.58
O5'	2.73	2.92	3.17	2.99	2.56	2.61	1.99	2.12	1.96	1.75	2.42	3.05	1.44	1.49	2.40	3.37	3.26	2.45	1.45	0.70	0.27	0.82
O6	0.17	0.08	0.58	0.91	0.45	0.99	1.17	1.04	1.30	1.13	0.72	0.13	1.93	1.60	0.44	0.96	1.50	0.42	0.40	0.22	0.16	0.26
OP1	3.33	2.97	3.80	3.52	2.80	3.26	2.19	2.67	2.04	2.17	2.45	3.22	1.49	1.80	2.81	4.31	3.90	3.08	1.98	1.10	0.79	1.27
OP2	2.64	2.62	3.13	3.15	2.25	2.88	1.60	2.49	1.51	1.47	2.03	2.80	0.93	1.12	2.16	3.48	3.71	2.53	1.74	1.02	0.72	1.18
P	3.05	2.95	3.54	3.45	2.66	3.12	2.02	2.62	1.92	1.90	2.39	3.16	1.36	1.56	2.58	3.89	3.92	2.86	1.90	1.10	0.77	1.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.13	0.02
C2	0.02	0.00	0.10	0.59	0.01	0.57	0.00	0.89	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.64	0.28	0.76	1.15	0.62	1.00
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.08	0.10	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.18	0.22	0.12
C3'	0.00	0.59	0.00	0.00	0.29	0.00	0.15	0.01	0.27	0.21	0.46	0.58	0.19	0.10	0.03	0.00	0.00	0.00	0.21	0.38	0.21	0.19
C4	0.01	0.01	0.06	0.29	0.00	0.27	0.00	0.40	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.29	0.15	0.31	0.63	0.03	0.41
C4'	0.00	0.57	0.00	0.00	0.27	0.00	0.13	0.00	0.26	0.24	0.44	0.54	0.18	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.16	0.08	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.15	0.00	0.13	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.17	0.06	0.10	0.54	0.29	0.20
C5'	0.00	0.89	0.01	0.01	0.40	0.00	0.21	0.00	0.42	0.35	0.72	0.81	0.30	0.19	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.23	0.19	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.27	0.00	0.26	0.00	0.42	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.31	0.12	0.30	0.81	0.06	0.46
C8	0.00	0.01	0.04	0.21	0.00	0.24	0.00	0.35	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.19	0.18	0.46	0.08	0.85	0.45
N1	0.02	0.00	0.08	0.46	0.01	0.44	0.01	0.72	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.52	0.22	0.59	1.09	0.37	0.83
N3	0.02	0.00	0.10	0.58	0.00	0.54	0.00	0.81	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.59	0.29	0.68	0.95	0.51	0.84
N6	0.01	0.01	0.04	0.19	0.00	0.18	0.00	0.30	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.24	0.07	0.17	0.74	0.27	0.32
N7	0.01	0.01	0.01	0.10	0.00	0.13	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.10	0.32	0.12	0.81	0.30
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.23	0.31	0.01
O2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.06	0.02	0.03	0.01	0.06	0.05	0.10	0.13	0.04	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.05	0.17	0.06	0.05
O3'	0.00	0.64	0.00	0.00	0.29	0.01	0.17	0.02	0.31	0.19	0.52	0.59	0.24	0.09	0.03	0.02	0.00	0.01	0.24	0.60	0.16	0.25
O4'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.15	0.00	0.06	0.00	0.12	0.18	0.22	0.29	0.07	0.10	0.01	0.03	0.01	0.00	0.11	0.17	0.05	0.10
O5'	0.00	0.76	0.13	0.21	0.31	0.01	0.10	0.00	0.30	0.46	0.59	0.68	0.17	0.32	0.04	0.05	0.24	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	1.15	0.18	0.38	0.63	0.16	0.54	0.23	0.81	0.08	1.09	0.95	0.74	0.12	0.23	0.17	0.60	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.62	0.22	0.21	0.03	0.08	0.29	0.19	0.06	0.85	0.37	0.51	0.27	0.81	0.31	0.06	0.16	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.02	1.00	0.12	0.19	0.41	0.01	0.20	0.01	0.46	0.45	0.83	0.84	0.32	0.30	0.01	0.05	0.25	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00