Doublet Group distance statistics: 48482

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N2	A	0, 0.000, 0.019, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C6	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.000, 0.028, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.028
N3	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N1	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
C5	A	0, 0.000, 0.044, 0.089, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.044 std_dev=0.044
C4	A	0, 0.000, 0.054, 0.108, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.054 std_dev=0.054
N9	A	0, 0.000, 0.059, 0.119, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.059 std_dev=0.059
O6	A	0, 0.000, 0.076, 0.153, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.076 std_dev=0.076
N7	A	0, 0.000, 0.098, 0.195, 0.195 max_d=0.195 avg_d=0.098 std_dev=0.098
C8	A	0, 0.000, 0.117, 0.235, 0.235 max_d=0.235 avg_d=0.117 std_dev=0.117
O4'	A	0, 0.000, 0.126, 0.251, 0.251 max_d=0.251 avg_d=0.126 std_dev=0.126
OP2	B	0, 0.000, 0.172, 0.343, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.172 std_dev=0.172
OP1	B	0, 0.000, 0.230, 0.459, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.230 std_dev=0.230
C2'	A	0, 0.000, 0.267, 0.534, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.267 std_dev=0.267
C4'	A	0, 0.000, 0.339, 0.678, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.339 std_dev=0.339
C3'	A	0, 0.000, 0.399, 0.799, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.399 std_dev=0.399
C5'	A	0, 0.000, 0.400, 0.801, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.400 std_dev=0.400
P	B	0, 0.000, 0.471, 0.941, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.471 std_dev=0.471
O3'	A	0, 0.000, 0.741, 1.482, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.741 std_dev=0.741
O2'	A	0, 0.000, 0.761, 1.522, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.761 std_dev=0.761
O5'	A	0, 0.000, 0.777, 1.554, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.777 std_dev=0.777
OP2	A	0, 0.000, 1.009, 2.018, 2.018 max_d=2.018 avg_d=1.009 std_dev=1.009
P	A	0, 0.000, 1.184, 2.369, 2.369 max_d=2.369 avg_d=1.184 std_dev=1.184
O5'	B	0, 0.000, 1.489, 2.977, 2.977 max_d=2.977 avg_d=1.489 std_dev=1.489
OP1	A	0, 0.000, 1.963, 3.926, 3.926 max_d=3.926 avg_d=1.963 std_dev=1.963
C5'	B	0, 0.000, 2.066, 4.132, 4.132 max_d=4.132 avg_d=2.066 std_dev=2.066
C4'	B	0, 0.000, 3.078, 6.157, 6.157 max_d=6.157 avg_d=3.078 std_dev=3.078
O4'	B	0, 0.000, 3.364, 6.728, 6.728 max_d=6.728 avg_d=3.364 std_dev=3.364
C3'	B	0, 0.000, 3.540, 7.079, 7.079 max_d=7.079 avg_d=3.540 std_dev=3.540
C8	B	0, 0.000, 3.872, 7.744, 7.744 max_d=7.744 avg_d=3.872 std_dev=3.872
C1'	B	0, 0.000, 4.223, 8.445, 8.445 max_d=8.445 avg_d=4.223 std_dev=4.223
N9	B	0, 0.000, 4.270, 8.541, 8.541 max_d=8.541 avg_d=4.270 std_dev=4.270
O3'	B	0, 0.000, 4.289, 8.578, 8.578 max_d=8.578 avg_d=4.289 std_dev=4.289
N7	B	0, 0.000, 4.364, 8.728, 8.728 max_d=8.728 avg_d=4.364 std_dev=4.364
C2'	B	0, 0.000, 4.397, 8.794, 8.794 max_d=8.794 avg_d=4.397 std_dev=4.397
C4	B	0, 0.000, 4.996, 9.992, 9.992 max_d=9.992 avg_d=4.996 std_dev=4.996
C5	B	0, 0.000, 5.006, 10.011, 10.011 max_d=10.011 avg_d=5.006 std_dev=5.006
O2'	B	0, 0.000, 5.390, 10.780, 10.780 max_d=10.780 avg_d=5.390 std_dev=5.390
N3	B	0, 0.000, 5.722, 11.443, 11.443 max_d=11.443 avg_d=5.722 std_dev=5.722
C6	B	0, 0.000, 5.785, 11.569, 11.569 max_d=11.569 avg_d=5.785 std_dev=5.785
N6	B	0, 0.000, 6.082, 12.163, 12.163 max_d=12.163 avg_d=6.082 std_dev=6.082
C2	B	0, 0.000, 6.343, 12.685, 12.685 max_d=12.685 avg_d=6.343 std_dev=6.343
N1	B	0, 0.000, 6.401, 12.803, 12.803 max_d=12.803 avg_d=6.401 std_dev=6.401

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.17	0.02	0.27	0.39	0.09
C2	0.01	0.00	0.02	0.16	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.37	0.08	0.02	0.29	0.01	0.58	0.58	0.04
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.07	0.07	0.07	0.03	0.05	0.05	0.09	0.03	0.00	0.01	0.01	0.40	0.10	0.65	0.16	0.27
C3'	0.03	0.16	0.00	0.00	0.19	0.00	0.21	0.01	0.20	0.20	0.18	0.14	0.15	0.22	0.17	0.01	0.00	0.02	0.31	0.20	0.44	0.20	0.23
C4	0.01	0.00	0.01	0.19	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.13	0.01	0.27	0.01	0.50	0.59	0.08
C4'	0.00	0.05	0.03	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.09	0.11	0.07	0.04	0.04	0.12	0.07	0.22	0.01	0.00	0.01	0.10	0.03	0.21	0.05
C5	0.01	0.00	0.06	0.21	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.31	0.19	0.00	0.30	0.00	0.58	0.66	0.08
C5'	0.02	0.06	0.07	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.11	0.12	0.09	0.05	0.05	0.14	0.07	0.14	0.08	0.01	0.00	0.12	0.08	0.08	0.00
C6	0.02	0.01	0.07	0.20	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.38	0.19	0.00	0.33	0.00	0.66	0.66	0.04
C8	0.00	0.00	0.07	0.20	0.00	0.11	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.20	0.01	0.24	0.00	0.39	0.64	0.15
N1	0.01	0.00	0.03	0.18	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.40	0.14	0.01	0.32	0.00	0.65	0.63	0.03
N2	0.01	0.00	0.05	0.14	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.36	0.04	0.02	0.28	0.01	0.58	0.56	0.03
N3	0.01	0.00	0.05	0.15	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.06	0.02	0.26	0.01	0.50	0.55	0.06
N7	0.01	0.01	0.09	0.22	0.00	0.12	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.24	0.01	0.28	0.00	0.52	0.69	0.12
N9	0.01	0.00	0.03	0.17	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.11	0.00	0.23	0.01	0.39	0.54	0.11
O2'	0.01	0.37	0.00	0.01	0.28	0.22	0.31	0.14	0.38	0.14	0.40	0.36	0.31	0.23	0.15	0.00	0.04	0.18	0.11	0.40	0.42	0.29	0.07
O3'	0.06	0.08	0.01	0.00	0.13	0.01	0.19	0.08	0.19	0.20	0.14	0.04	0.06	0.24	0.11	0.04	0.00	0.03	0.17	0.21	0.30	0.22	0.18
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.18	0.03	0.00	0.03	0.00	0.02	0.35	0.24
O5'	0.17	0.29	0.40	0.31	0.27	0.01	0.30	0.00	0.33	0.24	0.32	0.28	0.26	0.28	0.23	0.11	0.17	0.03	0.00	0.35	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.10	0.20	0.01	0.10	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.40	0.21	0.00	0.35	0.00	0.71	0.67	0.03
OP1	0.27	0.58	0.65	0.44	0.50	0.03	0.58	0.08	0.66	0.39	0.65	0.58	0.50	0.52	0.39	0.42	0.30	0.02	0.01	0.71	0.00	0.01	0.00
OP2	0.39	0.58	0.16	0.20	0.59	0.21	0.66	0.08	0.66	0.64	0.63	0.56	0.55	0.69	0.54	0.29	0.22	0.35	0.02	0.67	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.04	0.27	0.23	0.08	0.05	0.08	0.00	0.04	0.15	0.03	0.03	0.06	0.12	0.11	0.07	0.18	0.24	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	1.73	1.90	1.65	1.10	1.58	1.23	1.25	0.47	1.32	0.97	1.63	1.94	1.08	0.89	1.44	2.25	1.11	1.48	0.55	0.03	0.03	0.14
C2	0.63	0.45	0.82	0.69	0.28	0.72	0.05	0.31	0.07	0.14	0.18	0.55	0.32	0.32	0.26	1.30	1.04	0.55	0.11	0.01	0.07	0.08
C2'	2.21	2.21	2.23	1.70	1.94	1.77	1.57	0.94	1.59	1.34	1.91	2.29	1.31	1.21	1.84	2.91	1.79	1.93	0.87	0.07	0.16	0.30
C3'	2.18	2.33	2.21	1.58	1.99	1.61	1.62	0.76	1.67	1.35	2.02	2.38	1.39	1.23	1.85	2.95	1.65	1.83	0.72	0.05	0.02	0.18
C4	1.13	1.14	1.22	0.89	0.88	0.94	0.54	0.34	0.57	0.34	0.87	1.20	0.32	0.21	0.79	1.78	1.11	0.95	0.27	0.01	0.05	0.01
C4'	2.10	2.51	2.00	1.28	2.07	1.34	1.73	0.51	1.85	1.36	2.22	2.50	1.60	1.31	1.85	2.69	1.21	1.72	0.60	0.10	0.03	0.13
C5	1.02	1.07	1.17	0.86	0.77	0.86	0.42	0.29	0.45	0.21	0.77	1.12	0.18	0.07	0.68	1.74	1.13	0.83	0.18	0.01	0.06	0.04
C5'	2.11	2.66	2.03	1.29	2.15	1.31	1.81	0.48	1.96	1.38	2.37	2.62	1.70	1.35	1.88	2.72	1.23	1.69	0.57	0.09	0.02	0.12
C6	0.75	0.70	0.97	0.76	0.44	0.73	0.07	0.25	0.08	0.08	0.39	0.78	0.20	0.25	0.38	1.52	1.12	0.59	0.07	0.03	0.07	0.09
C8	1.42	1.66	1.46	0.99	1.29	1.01	0.94	0.32	1.02	0.64	1.38	1.68	0.76	0.55	1.12	2.08	1.13	1.15	0.32	0.02	0.04	0.04
N1	0.57	0.41	0.80	0.68	0.21	0.66	0.15	0.26	0.17	0.25	0.11	0.51	0.44	0.44	0.18	1.31	1.07	0.46	0.03	0.03	0.07	0.12
N2	0.35	0.06	0.57	0.55	0.05	0.58	0.37	0.30	0.41	0.40	0.19	0.18	0.65	0.60	0.03	1.00	0.94	0.32	0.03	0.01	0.07	0.14
N3	0.95	0.85	1.05	0.82	0.65	0.90	0.33	0.38	0.33	0.20	0.59	0.93	0.09	0.05	0.61	1.57	1.07	0.84	0.27	0.02	0.05	0.00
N7	1.21	1.38	1.32	0.92	1.03	0.91	0.66	0.28	0.73	0.40	1.08	1.41	0.46	0.29	0.88	1.93	1.14	0.96	0.22	0.00	0.05	0.01
N9	1.43	1.58	1.45	1.00	1.26	1.06	0.92	0.38	0.98	0.66	1.30	1.61	0.73	0.56	1.12	2.04	1.12	1.20	0.38	0.02	0.04	0.06
O2'	2.36	2.30	2.34	1.74	2.05	1.83	1.65	0.91	1.66	1.42	1.98	2.41	1.37	1.27	1.96	3.03	1.75	2.05	0.82	0.19	0.12	0.11
O3'	2.19	2.32	2.27	1.59	1.99	1.56	1.61	0.69	1.66	1.36	2.00	2.38	1.38	1.24	1.85	3.05	1.69	1.78	0.61	0.26	0.19	0.00
O4'	1.83	2.22	1.69	1.03	1.81	1.13	1.49	0.35	1.61	1.12	1.96	2.21	1.38	1.09	1.59	2.30	0.94	1.51	0.50	0.07	0.01	0.12
O5'	2.10	2.78	1.98	1.22	2.18	1.26	1.82	0.41	2.00	1.32	2.46	2.71	1.73	1.30	1.87	2.67	1.15	1.66	0.50	0.17	0.14	0.03
O6	0.68	0.62	0.93	0.74	0.35	0.68	0.03	0.22	0.03	0.18	0.30	0.70	0.33	0.37	0.29	1.49	1.13	0.51	0.02	0.04	0.07	0.11
OP1	1.94	2.74	1.86	1.10	2.04	1.11	1.64	0.26	1.85	1.09	2.39	2.63	1.54	1.07	1.70	2.58	1.09	1.49	0.31	0.32	0.36	0.18
OP2	2.22	2.75	2.14	1.48	2.24	1.54	1.90	0.79	2.05	1.49	2.46	2.70	1.79	1.46	1.99	2.79	1.46	1.87	0.90	0.46	0.47	0.57
P	2.15	2.80	2.03	1.31	2.21	1.38	1.84	0.57	2.01	1.37	2.48	2.73	1.73	1.34	1.91	2.71	1.26	1.76	0.68	0.12	0.09	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.01	0.51	0.19
C2	0.01	0.00	0.20	0.18	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.26	0.28	0.04	0.10	0.11	0.90	0.34
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.10	0.15	0.21	0.06	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.04	0.45	0.18
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.04	0.18	0.12	0.17	0.01	0.13	0.05	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.28	0.15
C4	0.01	0.00	0.10	0.06	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.10	0.02	0.14	0.19	0.87	0.39
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.00	0.00	0.07	0.07	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.00	0.19	0.35	1.03	0.52
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.05	0.00	0.00	0.13	0.11	0.00
C6	0.01	0.00	0.08	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.08	0.01	0.18	0.36	1.08	0.52
C8	0.01	0.00	0.10	0.18	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.20	0.04	0.24	0.41	0.94	0.55
N1	0.01	0.00	0.15	0.12	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.20	0.03	0.13	0.24	1.01	0.44
N3	0.01	0.00	0.21	0.17	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.26	0.04	0.09	0.06	0.80	0.29
N6	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.03	0.00	0.21	0.47	1.17	0.61
N7	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.03	0.24	0.49	1.07	0.62
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.16	0.20	0.78	0.38
O2'	0.01	0.26	0.00	0.01	0.13	0.06	0.09	0.05	0.14	0.05	0.21	0.25	0.11	0.01	0.02	0.00	0.04	0.05	0.04	0.25	0.22	0.03
O3'	0.01	0.28	0.02	0.01	0.10	0.03	0.01	0.05	0.08	0.20	0.20	0.26	0.03	0.15	0.03	0.04	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.07	0.33	0.10
O5'	0.09	0.10	0.09	0.07	0.14	0.00	0.19	0.00	0.18	0.24	0.13	0.09	0.21	0.24	0.16	0.04	0.03	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.01	0.11	0.04	0.14	0.19	0.07	0.35	0.13	0.36	0.41	0.24	0.06	0.47	0.49	0.20	0.25	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.51	0.90	0.45	0.28	0.87	0.07	1.03	0.11	1.08	0.94	1.01	0.80	1.17	1.07	0.78	0.22	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.34	0.18	0.15	0.39	0.01	0.52	0.00	0.52	0.55	0.44	0.29	0.61	0.62	0.38	0.03	0.02	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00