Doublet Group distance statistics: 48491

back

Distances from reference structure (by RMSD)

9, 11, 9, 4, 6, 3, 1, 1, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.007, 0.020, 0.034, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.016 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.021 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.013, 0.031, 0.050, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.031 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.004, 0.024, 0.044, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.024 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.000, 0.020, 0.041, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.020 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.007, 0.029, 0.051, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.029 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.008, 0.035, 0.063, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.035 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.006, 0.041, 0.076, 0.168 max_d=0.168 avg_d=0.041 std_dev=0.035
OP1	B	0, 0.034, 0.271, 0.508, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.271 std_dev=0.237
P	B	0, 0.057, 0.330, 0.603, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.330 std_dev=0.273
OP2	B	0, 0.086, 0.360, 0.634, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.360 std_dev=0.274
O2'	A	0, -0.113, 0.246, 0.605, 1.926 max_d=1.926 avg_d=0.246 std_dev=0.359
C2'	A	0, -0.198, 0.166, 0.530, 1.889 max_d=1.889 avg_d=0.166 std_dev=0.364
O4'	A	0, -0.238, 0.135, 0.508, 1.912 max_d=1.912 avg_d=0.135 std_dev=0.373
C5'	B	0, -0.134, 0.399, 0.932, 3.118 max_d=3.118 avg_d=0.399 std_dev=0.533
O5'	B	0, -0.113, 0.421, 0.954, 2.693 max_d=2.693 avg_d=0.421 std_dev=0.533
C4'	A	0, -0.349, 0.216, 0.781, 2.904 max_d=2.904 avg_d=0.216 std_dev=0.565
C3'	A	0, -0.348, 0.248, 0.843, 3.069 max_d=3.069 avg_d=0.248 std_dev=0.596
C4'	B	0, -0.269, 0.520, 1.309, 3.945 max_d=3.945 avg_d=0.520 std_dev=0.789
O3'	A	0, -0.469, 0.362, 1.193, 4.280 max_d=4.280 avg_d=0.362 std_dev=0.831
O4'	B	0, -0.312, 0.598, 1.509, 4.350 max_d=4.350 avg_d=0.598 std_dev=0.911
O5'	A	0, -0.531, 0.386, 1.303, 4.737 max_d=4.737 avg_d=0.386 std_dev=0.917
C5'	A	0, -0.560, 0.358, 1.276, 4.719 max_d=4.719 avg_d=0.358 std_dev=0.918
C3'	B	0, -0.377, 0.625, 1.627, 4.447 max_d=4.447 avg_d=0.625 std_dev=1.002
OP2	A	0, -0.587, 0.573, 1.733, 5.966 max_d=5.966 avg_d=0.573 std_dev=1.160
C1'	B	0, -0.500, 0.702, 1.905, 6.185 max_d=6.185 avg_d=0.702 std_dev=1.202
P	A	0, -0.741, 0.530, 1.802, 6.549 max_d=6.549 avg_d=0.530 std_dev=1.272
C2'	B	0, -0.573, 0.747, 2.066, 6.428 max_d=6.428 avg_d=0.747 std_dev=1.319
O3'	B	0, -0.628, 0.758, 2.145, 6.177 max_d=6.177 avg_d=0.758 std_dev=1.387
N1	B	0, -0.698, 0.705, 2.108, 7.337 max_d=7.337 avg_d=0.705 std_dev=1.403
C6	B	0, -0.798, 0.731, 2.260, 7.858 max_d=7.858 avg_d=0.731 std_dev=1.529
C2	B	0, -0.767, 0.856, 2.480, 8.509 max_d=8.509 avg_d=0.856 std_dev=1.623
O2	B	0, -0.725, 0.973, 2.670, 8.839 max_d=8.839 avg_d=0.973 std_dev=1.698
OP1	A	0, -1.108, 0.637, 2.381, 8.969 max_d=8.969 avg_d=0.637 std_dev=1.744
O2'	B	0, -0.807, 0.950, 2.708, 8.207 max_d=8.207 avg_d=0.950 std_dev=1.757
C5	B	0, -1.005, 0.854, 2.713, 9.278 max_d=9.278 avg_d=0.854 std_dev=1.859
N3	B	0, -0.938, 0.950, 2.838, 9.729 max_d=9.729 avg_d=0.950 std_dev=1.888
C4	B	0, -1.058, 0.945, 2.948, 10.055 max_d=10.055 avg_d=0.945 std_dev=2.003
N4	B	0, -1.284, 1.089, 3.462, 11.560 max_d=11.560 avg_d=1.089 std_dev=2.373

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.10	0.05	0.08
C2	0.02	0.00	0.21	0.11	0.01	0.17	0.00	0.32	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.17	0.24	0.30	0.01	0.59	0.33	0.51
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.12	0.01	0.08	0.01	0.12	0.07	0.17	0.24	0.20	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.10	0.05	0.06	0.07
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.08	0.04	0.10	0.12	0.10	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.06	0.05	0.04
C4	0.01	0.01	0.12	0.07	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.10	0.13	0.17	0.01	0.34	0.17	0.31
C4'	0.00	0.17	0.01	0.00	0.08	0.00	0.06	0.00	0.09	0.08	0.14	0.20	0.15	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.09	0.05	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.08	0.06	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.09	0.07	0.15	0.01	0.30	0.16	0.29
C5'	0.02	0.32	0.01	0.01	0.17	0.00	0.13	0.00	0.21	0.10	0.29	0.37	0.27	0.05	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.19	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.12	0.08	0.00	0.09	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.12	0.12	0.22	0.00	0.44	0.26	0.41
C8	0.01	0.01	0.07	0.04	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.04	0.12	0.10	0.01	0.06	0.13	0.06
N1	0.02	0.00	0.17	0.10	0.01	0.14	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.16	0.20	0.28	0.00	0.57	0.33	0.51
N2	0.03	0.00	0.24	0.12	0.01	0.20	0.01	0.37	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.20	0.28	0.34	0.01	0.68	0.37	0.58
N3	0.02	0.00	0.20	0.10	0.00	0.15	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.15	0.23	0.26	0.00	0.48	0.26	0.43
N7	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.05	0.05	0.01	0.09	0.09	0.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.14	0.06	0.13
O2'	0.02	0.24	0.00	0.01	0.12	0.04	0.08	0.04	0.13	0.08	0.20	0.30	0.22	0.03	0.02	0.00	0.03	0.04	0.04	0.11	0.06	0.05	0.05
O3'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.10	0.01	0.09	0.03	0.12	0.04	0.16	0.20	0.15	0.05	0.04	0.03	0.00	0.01	0.05	0.12	0.14	0.06	0.07
O4'	0.00	0.24	0.00	0.01	0.13	0.00	0.07	0.01	0.12	0.12	0.20	0.28	0.23	0.05	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.10	0.10	0.05	0.05
O5'	0.04	0.30	0.05	0.04	0.17	0.01	0.15	0.01	0.22	0.10	0.28	0.34	0.26	0.05	0.06	0.04	0.05	0.03	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.10	0.08	0.01	0.09	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.10	0.20	0.00	0.43	0.26	0.40
OP1	0.10	0.59	0.05	0.06	0.34	0.05	0.30	0.06	0.44	0.06	0.57	0.68	0.48	0.09	0.14	0.06	0.14	0.10	0.01	0.43	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.33	0.06	0.05	0.17	0.02	0.16	0.01	0.26	0.13	0.33	0.37	0.26	0.09	0.06	0.05	0.06	0.05	0.01	0.26	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.51	0.07	0.04	0.31	0.02	0.29	0.01	0.41	0.06	0.51	0.58	0.43	0.10	0.13	0.05	0.07	0.05	0.00	0.40	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.35	0.18	0.41	0.64	0.29	0.54	0.20	0.33	0.23	0.55	0.82	0.27	0.39	0.89	0.19	0.23	0.15	0.13	0.13
C2	0.13	0.26	0.22	0.39	0.56	0.21	0.58	0.14	0.41	0.25	0.41	0.68	0.16	0.43	0.80	0.12	0.20	0.11	0.13	0.16
C2'	0.36	0.69	0.27	0.37	1.01	0.37	0.89	0.43	0.65	0.55	0.91	1.22	0.60	0.33	0.79	0.39	0.22	0.21	0.24	0.23
C3'	0.26	0.43	0.30	0.56	0.80	0.45	0.66	0.37	0.40	0.30	0.68	1.04	0.34	0.54	1.06	0.34	0.26	0.19	0.14	0.15
C4	0.14	0.28	0.23	0.42	0.62	0.26	0.60	0.17	0.40	0.24	0.47	0.78	0.17	0.49	0.89	0.14	0.22	0.11	0.13	0.14
C4'	0.44	0.14	0.56	0.80	0.39	0.62	0.26	0.41	0.13	0.18	0.31	0.62	0.16	0.79	1.31	0.46	0.52	0.40	0.33	0.35
C5	0.16	0.23	0.30	0.46	0.62	0.26	0.64	0.16	0.44	0.22	0.43	0.79	0.12	0.60	0.93	0.13	0.22	0.10	0.13	0.15
C5'	0.77	0.38	0.93	1.13	0.29	0.89	0.26	0.62	0.39	0.50	0.28	0.46	0.47	1.19	1.65	0.74	0.77	0.57	0.52	0.55
C6	0.16	0.19	0.34	0.47	0.58	0.24	0.65	0.14	0.46	0.22	0.37	0.73	0.14	0.65	0.91	0.11	0.21	0.11	0.13	0.16
C8	0.16	0.28	0.27	0.46	0.66	0.29	0.64	0.18	0.41	0.23	0.49	0.86	0.15	0.57	0.96	0.16	0.23	0.11	0.13	0.14
N1	0.15	0.20	0.30	0.43	0.55	0.21	0.62	0.14	0.45	0.23	0.36	0.68	0.13	0.57	0.85	0.11	0.20	0.13	0.13	0.16
N2	0.14	0.28	0.19	0.33	0.51	0.17	0.53	0.14	0.41	0.27	0.40	0.60	0.19	0.31	0.68	0.12	0.17	0.14	0.14	0.16
N3	0.13	0.31	0.18	0.38	0.59	0.23	0.56	0.16	0.38	0.25	0.47	0.73	0.21	0.39	0.82	0.14	0.21	0.11	0.13	0.14
N7	0.17	0.24	0.32	0.48	0.65	0.28	0.66	0.16	0.44	0.22	0.45	0.84	0.12	0.64	0.96	0.14	0.22	0.10	0.13	0.15
N9	0.15	0.31	0.22	0.43	0.65	0.28	0.59	0.18	0.38	0.23	0.51	0.83	0.20	0.48	0.91	0.16	0.23	0.12	0.13	0.14
O2'	0.49	0.87	0.39	0.31	1.13	0.40	0.96	0.49	0.74	0.70	1.07	1.33	0.81	0.31	0.60	0.48	0.30	0.28	0.35	0.34
O3'	0.35	0.58	0.30	0.55	0.95	0.51	0.78	0.46	0.51	0.43	0.84	1.22	0.51	0.50	1.03	0.44	0.27	0.22	0.19	0.21
O4'	0.46	0.19	0.56	0.77	0.32	0.60	0.22	0.40	0.19	0.24	0.26	0.50	0.23	0.78	1.26	0.47	0.59	0.46	0.39	0.44
O5'	0.74	0.35	0.92	1.10	0.31	0.86	0.25	0.57	0.30	0.44	0.25	0.51	0.47	1.24	1.65	0.69	0.72	0.50	0.47	0.51
O6	0.18	0.16	0.39	0.48	0.57	0.23	0.67	0.14	0.48	0.21	0.32	0.72	0.19	0.74	0.92	0.12	0.20	0.12	0.13	0.16
OP1	1.39	0.98	1.61	1.73	0.62	1.43	0.65	1.06	0.88	1.07	0.75	0.55	1.13	1.96	2.28	1.28	1.20	0.85	0.88	0.90
OP2	0.91	0.54	1.13	1.24	0.33	0.97	0.31	0.62	0.39	0.59	0.35	0.49	0.72	1.52	1.80	0.81	0.79	0.50	0.51	0.55
P	1.13	0.74	1.32	1.45	0.44	1.19	0.44	0.85	0.63	0.82	0.54	0.46	0.90	1.68	2.01	1.04	1.01	0.70	0.70	0.75

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.00	0.27	0.27	0.29	0.28
C2	0.01	0.00	0.14	0.06	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.25	0.17	0.07	0.47	0.49	0.42	0.51
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.12	0.08	0.03	0.12	0.07	0.21	0.00	0.02	0.01	0.32	0.33	0.58	0.43
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.19	0.06	0.05	0.10	0.15	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.31	0.12
C4	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.05	0.03	0.47	0.50	0.19	0.44
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.03	0.13	0.02	0.00	0.01	0.11	0.15	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.04	0.38	0.39	0.23	0.31
C5'	0.05	0.11	0.12	0.01	0.12	0.01	0.11	0.00	0.10	0.09	0.12	0.13	0.11	0.03	0.12	0.03	0.00	0.17	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.19	0.01	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.07	0.34	0.32	0.19	0.27
N1	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.01	0.39	0.37	0.25	0.36
N3	0.01	0.00	0.12	0.05	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.25	0.13	0.07	0.50	0.55	0.36	0.53
N4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.05	0.03	0.48	0.54	0.19	0.46
O2	0.02	0.00	0.21	0.15	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.36	0.28	0.11	0.47	0.51	0.59	0.56
O2'	0.02	0.25	0.00	0.01	0.17	0.13	0.06	0.03	0.04	0.09	0.25	0.19	0.36	0.00	0.03	0.09	0.21	0.25	0.66	0.40
O3'	0.15	0.17	0.02	0.00	0.05	0.02	0.07	0.12	0.07	0.08	0.13	0.05	0.28	0.03	0.00	0.13	0.26	0.29	0.20	0.17
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.03	0.07	0.01	0.07	0.03	0.11	0.09	0.13	0.00	0.15	0.18	0.11	0.12
O5'	0.27	0.47	0.32	0.03	0.47	0.01	0.38	0.00	0.34	0.39	0.50	0.48	0.47	0.21	0.26	0.15	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.27	0.49	0.33	0.09	0.50	0.11	0.39	0.17	0.32	0.37	0.55	0.54	0.51	0.25	0.29	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.42	0.58	0.31	0.19	0.15	0.23	0.10	0.19	0.25	0.36	0.19	0.59	0.66	0.20	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.28	0.51	0.43	0.12	0.44	0.05	0.31	0.01	0.27	0.36	0.53	0.46	0.56	0.40	0.17	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00