Doublet Group distance statistics: 48502

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 6, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.014, 0.026, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.002, 0.017, 0.031, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.004, 0.018, 0.033, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.019, 0.037, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N9	A	0, -0.001, 0.019, 0.039, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.019 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.014, 0.034, 0.055, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.034 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.005, 0.027, 0.049, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.027 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.002, 0.029, 0.057, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.029 std_dev=0.028
C8	A	0, -0.001, 0.033, 0.067, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.033 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.009, 0.060, 0.110, 0.215 max_d=0.215 avg_d=0.060 std_dev=0.051
C2'	A	0, 0.010, 0.074, 0.139, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.074 std_dev=0.065
C4'	A	0, 0.028, 0.107, 0.186, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.107 std_dev=0.079
C3'	A	0, 0.025, 0.106, 0.186, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.106 std_dev=0.081
O5'	A	0, 0.084, 0.170, 0.256, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.170 std_dev=0.086
P	B	0, 0.152, 0.241, 0.331, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.241 std_dev=0.090
O2'	A	0, 0.018, 0.114, 0.210, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.114 std_dev=0.096
C5'	A	0, 0.053, 0.152, 0.252, 0.411 max_d=0.411 avg_d=0.152 std_dev=0.099
P	A	0, 0.126, 0.251, 0.377, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.251 std_dev=0.125
OP2	A	0, 0.129, 0.267, 0.404, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.267 std_dev=0.137
OP1	A	0, 0.172, 0.319, 0.465, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.319 std_dev=0.146
O3'	A	0, 0.036, 0.183, 0.329, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.183 std_dev=0.146
OP2	B	0, 0.162, 0.332, 0.501, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.332 std_dev=0.169
OP1	B	0, -0.157, 0.347, 0.850, 2.126 max_d=2.126 avg_d=0.347 std_dev=0.504
O5'	B	0, -0.322, 0.431, 1.184, 3.125 max_d=3.125 avg_d=0.431 std_dev=0.753
C5'	B	0, -0.505, 0.488, 1.481, 4.052 max_d=4.052 avg_d=0.488 std_dev=0.993
C4'	B	0, -1.018, 0.719, 2.455, 6.967 max_d=6.967 avg_d=0.719 std_dev=1.737
C5	B	0, -0.988, 0.986, 2.959, 8.052 max_d=8.052 avg_d=0.986 std_dev=1.974
C6	B	0, -1.060, 0.951, 2.962, 8.165 max_d=8.165 avg_d=0.951 std_dev=2.011
C3'	B	0, -1.279, 0.834, 2.946, 8.436 max_d=8.436 avg_d=0.834 std_dev=2.112
O4'	B	0, -1.210, 0.912, 3.033, 8.539 max_d=8.539 avg_d=0.912 std_dev=2.121
O3'	B	0, -1.430, 0.848, 3.126, 9.047 max_d=9.047 avg_d=0.848 std_dev=2.278
N4	B	0, -1.331, 1.237, 3.806, 10.446 max_d=10.446 avg_d=1.237 std_dev=2.569
C4	B	0, -1.388, 1.188, 3.764, 10.432 max_d=10.432 avg_d=1.188 std_dev=2.576
N1	B	0, -1.504, 1.109, 3.722, 10.504 max_d=10.504 avg_d=1.109 std_dev=2.613
C1'	B	0, -1.589, 1.077, 3.743, 10.669 max_d=10.669 avg_d=1.077 std_dev=2.666
C2'	B	0, -1.712, 1.065, 3.842, 11.060 max_d=11.060 avg_d=1.065 std_dev=2.777
O2'	B	0, -2.009, 1.146, 4.302, 12.503 max_d=12.503 avg_d=1.146 std_dev=3.155
N3	B	0, -1.814, 1.350, 4.514, 12.724 max_d=12.724 avg_d=1.350 std_dev=3.164
C2	B	0, -1.883, 1.318, 4.518, 12.829 max_d=12.829 avg_d=1.318 std_dev=3.200
O2	B	0, -2.263, 1.481, 5.224, 14.951 max_d=14.951 avg_d=1.481 std_dev=3.743

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.06	0.06	0.04
C2	0.03	0.00	0.08	0.08	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.11	0.02	0.08	0.01	0.09	0.14	0.10
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.07	0.02	0.08	0.09	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.08	0.06	0.06	0.04
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.07	0.03	0.08	0.09	0.06	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.06	0.05	0.05
C4	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.06	0.01	0.08	0.01	0.09	0.13	0.10
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.07	0.01	0.09	0.01	0.11	0.16	0.12
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.05	0.07	0.04	0.05	0.04	0.07	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.01	0.09	0.00	0.11	0.17	0.12
C8	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.10	0.01	0.11	0.13	0.11
N1	0.02	0.00	0.08	0.08	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.12	0.01	0.08	0.00	0.10	0.16	0.11
N2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.12	0.03	0.08	0.01	0.09	0.14	0.09
N3	0.03	0.00	0.07	0.06	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.02	0.08	0.01	0.09	0.12	0.09
N7	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.10	0.01	0.13	0.17	0.13
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.08	0.10	0.08
O2'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.09	0.10	0.07	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.08	0.05	0.05	0.03
O3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.06	0.02	0.07	0.02	0.10	0.04	0.12	0.12	0.08	0.05	0.03	0.03	0.00	0.01	0.06	0.11	0.08	0.07	0.06
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.04
O5'	0.05	0.08	0.04	0.04	0.08	0.01	0.09	0.00	0.09	0.10	0.08	0.08	0.08	0.10	0.08	0.03	0.06	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.08	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.09	0.00	0.12	0.18	0.13
OP1	0.06	0.09	0.06	0.06	0.09	0.04	0.11	0.05	0.11	0.11	0.10	0.09	0.09	0.13	0.08	0.05	0.08	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.14	0.06	0.05	0.13	0.02	0.16	0.01	0.17	0.13	0.16	0.14	0.12	0.17	0.10	0.05	0.07	0.03	0.01	0.18	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.10	0.04	0.05	0.10	0.01	0.12	0.01	0.12	0.11	0.11	0.09	0.09	0.13	0.08	0.03	0.06	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	1.17	1.14	0.97	0.65	0.92	0.89	0.82	0.58	0.89	1.07	1.07	0.87	1.26	1.22	0.45	1.17	0.34	0.42	0.16	0.07
C2	0.07	0.07	0.34	0.50	0.13	0.12	0.16	0.07	0.13	0.08	0.09	0.15	0.09	0.27	0.80	0.19	0.14	0.36	0.16	0.10
C2'	1.11	1.06	1.03	0.75	0.82	0.89	0.72	0.54	0.80	0.99	0.97	0.76	1.18	1.29	0.64	1.05	0.31	0.37	0.16	0.10
C3'	1.09	1.06	1.05	0.75	0.82	0.83	0.70	0.47	0.77	0.97	0.98	0.76	1.21	1.33	0.67	0.99	0.28	0.34	0.16	0.12
C4	0.48	0.48	0.20	0.08	0.44	0.32	0.43	0.26	0.44	0.47	0.46	0.43	0.49	0.34	0.33	0.60	0.13	0.37	0.15	0.07
C4'	1.36	1.35	1.26	0.88	1.05	0.99	0.89	0.58	0.97	1.23	1.25	0.98	1.54	1.57	0.75	1.24	0.35	0.40	0.18	0.10
C5	0.23	0.23	0.17	0.32	0.26	0.12	0.27	0.12	0.26	0.24	0.24	0.27	0.21	0.14	0.63	0.37	0.10	0.33	0.15	0.08
C5'	1.31	1.33	1.20	0.82	1.03	0.93	0.88	0.54	0.95	1.19	1.24	0.97	1.52	1.51	0.68	1.18	0.33	0.38	0.17	0.09
C6	0.21	0.20	0.57	0.69	0.12	0.27	0.13	0.15	0.13	0.17	0.16	0.12	0.27	0.53	1.04	0.11	0.20	0.30	0.15	0.10
C8	0.69	0.68	0.42	0.18	0.59	0.47	0.54	0.33	0.57	0.65	0.65	0.57	0.74	0.60	0.16	0.75	0.18	0.35	0.14	0.07
N1	0.30	0.28	0.67	0.79	0.16	0.35	0.13	0.19	0.15	0.24	0.23	0.13	0.36	0.63	1.14	0.11	0.25	0.30	0.16	0.11
N2	0.18	0.16	0.51	0.64	0.08	0.25	0.09	0.13	0.08	0.13	0.12	0.08	0.22	0.43	0.90	0.06	0.21	0.37	0.17	0.11
N3	0.44	0.43	0.15	0.09	0.41	0.30	0.40	0.26	0.41	0.43	0.42	0.40	0.44	0.28	0.34	0.56	0.12	0.41	0.16	0.08
N7	0.38	0.38	0.13	0.19	0.37	0.22	0.36	0.18	0.36	0.37	0.38	0.37	0.38	0.23	0.47	0.49	0.11	0.32	0.14	0.08
N9	0.80	0.79	0.55	0.29	0.67	0.58	0.61	0.41	0.65	0.75	0.75	0.64	0.85	0.74	0.10	0.86	0.22	0.38	0.15	0.07
O2'	1.43	1.35	1.41	1.08	1.03	1.16	0.89	0.67	1.00	1.26	1.23	0.94	1.52	1.72	1.00	1.32	0.40	0.42	0.19	0.14
O3'	1.10	1.08	1.18	0.89	0.81	0.85	0.68	0.44	0.75	0.98	0.99	0.74	1.25	1.48	0.90	0.94	0.27	0.31	0.17	0.15
O4'	1.35	1.35	1.15	0.77	1.08	0.98	0.94	0.61	1.01	1.24	1.26	1.01	1.51	1.44	0.57	1.29	0.37	0.43	0.16	0.07
O5'	1.06	1.08	0.92	0.60	0.86	0.76	0.75	0.46	0.80	0.98	1.01	0.82	1.21	1.18	0.44	1.00	0.28	0.31	0.13	0.06
O6	0.42	0.41	0.82	0.89	0.25	0.44	0.19	0.24	0.23	0.35	0.35	0.21	0.52	0.82	1.27	0.20	0.28	0.26	0.16	0.11
OP1	1.07	1.10	0.98	0.65	0.87	0.74	0.74	0.43	0.79	0.98	1.04	0.82	1.26	1.25	0.53	0.96	0.27	0.30	0.15	0.08
OP2	0.79	0.81	0.61	0.35	0.69	0.55	0.62	0.37	0.65	0.75	0.78	0.67	0.89	0.80	0.19	0.79	0.24	0.21	0.09	0.07
P	1.01	1.04	0.86	0.54	0.84	0.70	0.73	0.43	0.77	0.94	0.98	0.80	1.17	1.10	0.38	0.95	0.27	0.29	0.12	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.06	0.04
C2	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.07	0.08	0.08	0.06
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.04	0.02
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.10	0.00	0.11	0.01	0.10	0.06	0.08	0.10	0.06	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.04	0.03
C4	0.01	0.00	0.03	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.11	0.12	0.12	0.11
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.07	0.04	0.04	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01
C5	0.00	0.01	0.04	0.11	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.01	0.12	0.13	0.12	0.11
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.09	0.05	0.07	0.09	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.00	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.02	0.10	0.10	0.09	0.08
N1	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.06	0.08	0.07	0.05
N3	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.09	0.10	0.10	0.08
N4	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.01	0.12	0.13	0.14	0.12
O2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.06	0.02	0.06	0.08	0.07	0.05
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02	0.05	0.03	0.02	0.04	0.03	0.08	0.00	0.03	0.04	0.03	0.10	0.04	0.04
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.11	0.02	0.12	0.03	0.10	0.06	0.09	0.12	0.06	0.03	0.00	0.01	0.06	0.10	0.08	0.06
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.00	0.06	0.06	0.07	0.05
O5'	0.04	0.07	0.02	0.03	0.11	0.01	0.12	0.01	0.10	0.06	0.09	0.12	0.06	0.03	0.06	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.08	0.07	0.07	0.12	0.07	0.13	0.06	0.10	0.08	0.10	0.13	0.08	0.10	0.10	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.08	0.04	0.04	0.12	0.02	0.12	0.01	0.09	0.07	0.10	0.14	0.07	0.04	0.08	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.06	0.02	0.03	0.11	0.01	0.11	0.01	0.08	0.05	0.08	0.12	0.05	0.04	0.06	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00