Doublet Group distance statistics: 48505

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 2, 1, 2, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.015, 0.025, 0.036, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.008, 0.021, 0.033, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.011, 0.030, 0.048, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.030 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.016, 0.036, 0.056, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.007, 0.027, 0.048, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.027 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.017, 0.038, 0.060, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.038 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.019, 0.045, 0.071, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.045 std_dev=0.026
N3	A	0, 0.010, 0.039, 0.069, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.039 std_dev=0.029
C2	A	0, 0.010, 0.040, 0.070, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.040 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.025, 0.056, 0.087, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.056 std_dev=0.031
C1'	A	0, 0.000, 0.039, 0.077, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.039 std_dev=0.038
N2	A	0, 0.030, 0.084, 0.139, 0.192 max_d=0.192 avg_d=0.084 std_dev=0.054
O4'	A	0, 0.050, 0.127, 0.203, 0.229 max_d=0.229 avg_d=0.127 std_dev=0.076
C2'	A	0, 0.055, 0.132, 0.210, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.132 std_dev=0.078
O2'	A	0, 0.070, 0.190, 0.310, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.190 std_dev=0.120
C4'	A	0, 0.034, 0.162, 0.290, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.162 std_dev=0.128
C3'	A	0, 0.031, 0.161, 0.291, 0.369 max_d=0.369 avg_d=0.161 std_dev=0.130
C5'	A	0, 0.024, 0.233, 0.442, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.233 std_dev=0.209
OP1	B	0, 0.168, 0.378, 0.589, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.378 std_dev=0.211
OP2	B	0, 0.080, 0.293, 0.505, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.293 std_dev=0.212
O3'	A	0, 0.048, 0.261, 0.473, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.261 std_dev=0.213
P	A	0, 0.079, 0.296, 0.514, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.296 std_dev=0.217
OP2	A	0, 0.061, 0.292, 0.523, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.292 std_dev=0.231
P	B	0, 0.131, 0.379, 0.627, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.379 std_dev=0.248
O5'	A	0, 0.075, 0.338, 0.601, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.338 std_dev=0.263
OP1	A	0, 0.091, 0.358, 0.625, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.358 std_dev=0.267
C5'	B	0, 0.311, 0.651, 0.990, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.651 std_dev=0.339
O5'	B	0, 0.136, 0.490, 0.844, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.490 std_dev=0.354
C4'	B	0, 0.293, 0.698, 1.104, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.698 std_dev=0.406
C3'	B	0, 0.277, 0.709, 1.142, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.709 std_dev=0.432
O3'	B	0, 0.322, 0.764, 1.205, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.764 std_dev=0.442
C5	B	0, 0.196, 0.671, 1.145, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.671 std_dev=0.475
O4'	B	0, 0.226, 0.720, 1.214, 1.884 max_d=1.884 avg_d=0.720 std_dev=0.494
C6	B	0, 0.172, 0.671, 1.170, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.671 std_dev=0.499
C4	B	0, 0.226, 0.743, 1.260, 1.765 max_d=1.765 avg_d=0.743 std_dev=0.517
N4	B	0, 0.225, 0.765, 1.305, 1.768 max_d=1.768 avg_d=0.765 std_dev=0.540
N1	B	0, 0.185, 0.742, 1.299, 2.034 max_d=2.034 avg_d=0.742 std_dev=0.557
N3	B	0, 0.246, 0.812, 1.379, 1.966 max_d=1.966 avg_d=0.812 std_dev=0.566
C2	B	0, 0.226, 0.814, 1.402, 2.105 max_d=2.105 avg_d=0.814 std_dev=0.588
C1'	B	0, 0.176, 0.778, 1.380, 2.219 max_d=2.219 avg_d=0.778 std_dev=0.602
C2'	B	0, 0.181, 0.797, 1.412, 2.184 max_d=2.184 avg_d=0.797 std_dev=0.616
O2	B	0, 0.227, 0.887, 1.547, 2.374 max_d=2.374 avg_d=0.887 std_dev=0.660
O2'	B	0, 0.161, 0.902, 1.642, 2.574 max_d=2.574 avg_d=0.902 std_dev=0.741

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.06	0.12	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.03	0.10	0.05	0.04
C2	0.08	0.00	0.14	0.13	0.02	0.09	0.01	0.09	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.15	0.18	0.08	0.14	0.02	0.16	0.18	0.14
C2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.09	0.03	0.12	0.17	0.13	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.13	0.08	0.05
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.08	0.06	0.12	0.17	0.12	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.14	0.10	0.07
C4	0.03	0.02	0.08	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.13	0.02	0.15	0.16	0.13
C4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.07	0.13	0.08	0.05	0.03	0.04	0.04	0.00	0.02	0.04	0.09	0.03	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.15	0.02	0.17	0.19	0.16
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.08	0.11	0.08	0.12	0.09	0.11	0.07	0.04	0.04	0.01	0.02	0.08	0.08	0.02	0.02
C6	0.04	0.01	0.09	0.08	0.02	0.04	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.09	0.12	0.02	0.14	0.00	0.18	0.21	0.16
C8	0.02	0.03	0.03	0.06	0.02	0.06	0.02	0.11	0.03	0.00	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.04	0.17	0.03	0.16	0.14	0.14
N1	0.06	0.01	0.12	0.12	0.03	0.07	0.01	0.08	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.13	0.16	0.05	0.14	0.02	0.17	0.20	0.15
N2	0.12	0.01	0.17	0.17	0.03	0.13	0.02	0.12	0.02	0.05	0.02	0.00	0.03	0.03	0.06	0.20	0.22	0.12	0.15	0.04	0.17	0.18	0.15
N3	0.08	0.01	0.13	0.12	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.02	0.03	0.13	0.15	0.07	0.13	0.02	0.15	0.15	0.13
N7	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.03	0.16	0.02	0.18	0.20	0.17
N9	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.03	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.13	0.03	0.14	0.11	0.11
O2'	0.02	0.15	0.01	0.01	0.07	0.04	0.05	0.04	0.09	0.02	0.13	0.20	0.13	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.04	0.09	0.12	0.06	0.04
O3'	0.02	0.18	0.01	0.00	0.09	0.04	0.08	0.04	0.12	0.06	0.16	0.22	0.15	0.06	0.03	0.04	0.00	0.03	0.10	0.12	0.18	0.13	0.11
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.05	0.12	0.07	0.03	0.01	0.05	0.03	0.00	0.08	0.02	0.09	0.09	0.08
O5'	0.08	0.14	0.05	0.05	0.13	0.02	0.15	0.02	0.14	0.17	0.14	0.15	0.13	0.16	0.13	0.04	0.10	0.08	0.00	0.14	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.09	0.08	0.02	0.04	0.02	0.08	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.09	0.12	0.02	0.14	0.00	0.19	0.23	0.18
OP1	0.10	0.16	0.13	0.14	0.15	0.09	0.17	0.08	0.18	0.16	0.17	0.17	0.15	0.18	0.14	0.12	0.18	0.09	0.02	0.19	0.00	0.02	0.02
OP2	0.05	0.18	0.08	0.10	0.16	0.03	0.19	0.02	0.21	0.14	0.20	0.18	0.15	0.20	0.11	0.06	0.13	0.09	0.01	0.23	0.02	0.00	0.01
P	0.04	0.14	0.05	0.07	0.13	0.03	0.16	0.02	0.16	0.14	0.15	0.15	0.13	0.17	0.11	0.04	0.11	0.08	0.01	0.18	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.32	0.22	0.17	0.38	0.13	0.34	0.13	0.27	0.26	0.36	0.43	0.32	0.20	0.16	0.18	0.13	0.12	0.12	0.12
C2	0.11	0.09	0.13	0.16	0.17	0.17	0.16	0.17	0.10	0.08	0.13	0.23	0.10	0.18	0.21	0.19	0.16	0.13	0.19	0.17
C2'	0.16	0.27	0.14	0.10	0.34	0.09	0.30	0.08	0.21	0.21	0.32	0.41	0.27	0.13	0.12	0.14	0.08	0.08	0.07	0.07
C3'	0.17	0.29	0.15	0.12	0.35	0.10	0.28	0.08	0.20	0.22	0.35	0.43	0.30	0.15	0.13	0.14	0.10	0.07	0.07	0.07
C4	0.10	0.19	0.13	0.12	0.28	0.08	0.25	0.08	0.17	0.15	0.25	0.34	0.19	0.12	0.17	0.12	0.07	0.06	0.10	0.06
C4'	0.24	0.36	0.25	0.19	0.40	0.15	0.32	0.12	0.25	0.28	0.41	0.47	0.38	0.24	0.19	0.17	0.13	0.10	0.10	0.10
C5	0.09	0.20	0.13	0.13	0.29	0.08	0.25	0.09	0.16	0.14	0.26	0.36	0.19	0.12	0.18	0.13	0.07	0.07	0.11	0.08
C5'	0.23	0.36	0.26	0.20	0.39	0.14	0.30	0.12	0.24	0.28	0.41	0.46	0.38	0.26	0.20	0.16	0.12	0.10	0.10	0.10
C6	0.08	0.14	0.12	0.14	0.23	0.13	0.20	0.15	0.12	0.09	0.20	0.31	0.13	0.15	0.20	0.16	0.12	0.11	0.14	0.13
C8	0.18	0.31	0.20	0.15	0.39	0.09	0.33	0.09	0.25	0.25	0.37	0.46	0.31	0.17	0.17	0.15	0.09	0.07	0.09	0.07
N1	0.12	0.10	0.14	0.16	0.18	0.18	0.16	0.19	0.09	0.08	0.14	0.26	0.10	0.19	0.22	0.20	0.16	0.15	0.18	0.17
N2	0.19	0.14	0.19	0.20	0.15	0.23	0.14	0.24	0.12	0.14	0.13	0.19	0.16	0.26	0.24	0.25	0.23	0.20	0.24	0.24
N3	0.08	0.13	0.11	0.12	0.21	0.10	0.19	0.10	0.12	0.09	0.17	0.27	0.13	0.13	0.17	0.13	0.09	0.07	0.14	0.09
N7	0.14	0.27	0.16	0.14	0.35	0.07	0.30	0.08	0.21	0.20	0.33	0.43	0.27	0.14	0.18	0.13	0.07	0.06	0.09	0.06
N9	0.17	0.28	0.18	0.14	0.35	0.09	0.31	0.09	0.23	0.22	0.33	0.42	0.28	0.16	0.16	0.14	0.08	0.07	0.09	0.07
O2'	0.19	0.28	0.17	0.13	0.34	0.13	0.30	0.13	0.23	0.23	0.32	0.39	0.29	0.16	0.14	0.17	0.13	0.10	0.09	0.12
O3'	0.16	0.27	0.15	0.13	0.33	0.12	0.25	0.11	0.19	0.20	0.33	0.42	0.28	0.15	0.15	0.15	0.13	0.08	0.09	0.10
O4'	0.28	0.40	0.30	0.24	0.44	0.19	0.37	0.18	0.31	0.33	0.43	0.49	0.41	0.29	0.23	0.22	0.18	0.15	0.16	0.15
O5'	0.22	0.35	0.23	0.18	0.40	0.13	0.31	0.11	0.25	0.27	0.40	0.47	0.37	0.22	0.18	0.16	0.12	0.14	0.11	0.11
O6	0.09	0.13	0.13	0.15	0.23	0.15	0.19	0.16	0.11	0.08	0.19	0.31	0.13	0.17	0.22	0.17	0.13	0.13	0.14	0.15
OP1	0.30	0.43	0.30	0.24	0.47	0.19	0.37	0.16	0.31	0.34	0.49	0.54	0.45	0.30	0.22	0.23	0.18	0.17	0.15	0.16
OP2	0.23	0.36	0.21	0.15	0.42	0.13	0.34	0.12	0.27	0.29	0.42	0.50	0.37	0.19	0.13	0.19	0.12	0.17	0.12	0.13
P	0.22	0.35	0.23	0.17	0.40	0.12	0.31	0.10	0.25	0.27	0.41	0.48	0.37	0.22	0.16	0.16	0.11	0.13	0.10	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.06	0.03	0.13	0.08
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.04	0.11	0.10	0.23	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.09	0.02	0.06	0.04	0.16	0.01	0.03	0.01	0.10	0.11	0.14	0.10
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.06	0.01	0.09	0.03	0.11	0.03	0.08	0.07	0.16	0.04	0.01	0.00	0.13	0.14	0.12	0.12
C4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.03	0.14	0.19	0.31	0.23
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.04	0.05	0.06	0.07	0.03	0.00	0.02	0.06	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.10	0.02	0.15	0.21	0.31	0.23
C5'	0.02	0.06	0.02	0.03	0.10	0.01	0.12	0.00	0.11	0.06	0.08	0.12	0.07	0.07	0.05	0.01	0.01	0.06	0.04	0.02
C6	0.02	0.02	0.09	0.11	0.02	0.06	0.01	0.11	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.07	0.11	0.02	0.14	0.15	0.25	0.19
N1	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.10	0.08	0.20	0.14
N3	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.04	0.13	0.14	0.27	0.20
N4	0.03	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.02	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.08	0.04	0.16	0.23	0.34	0.26
O2	0.04	0.01	0.16	0.16	0.02	0.06	0.02	0.07	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.12	0.19	0.06	0.11	0.09	0.22	0.15
O2'	0.03	0.06	0.01	0.04	0.04	0.07	0.06	0.07	0.07	0.04	0.05	0.04	0.12	0.00	0.06	0.05	0.07	0.14	0.11	0.08
O3'	0.01	0.12	0.03	0.01	0.07	0.03	0.10	0.05	0.11	0.03	0.11	0.08	0.19	0.06	0.00	0.02	0.16	0.21	0.15	0.17
O4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.06	0.05	0.02	0.00	0.09	0.08	0.10	0.09
O5'	0.06	0.11	0.10	0.13	0.14	0.02	0.15	0.01	0.14	0.10	0.13	0.16	0.11	0.07	0.16	0.09	0.00	0.02	0.04	0.01
OP1	0.03	0.10	0.11	0.14	0.19	0.06	0.21	0.06	0.15	0.08	0.14	0.23	0.09	0.14	0.21	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.23	0.14	0.12	0.31	0.03	0.31	0.04	0.25	0.20	0.27	0.34	0.22	0.11	0.15	0.10	0.04	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.16	0.10	0.12	0.23	0.02	0.23	0.02	0.19	0.14	0.20	0.26	0.15	0.08	0.17	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00