Doublet Group distance statistics: 48507

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.014, 0.027, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.003, 0.020, 0.038, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.020 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.002, 0.019, 0.037, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.019 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.017, 0.037, 0.056, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.037 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.027, 0.052, 0.076, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.052 std_dev=0.025
C4	A	0, 0.008, 0.034, 0.059, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.034 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.007, 0.038, 0.069, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.038 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.004, 0.039, 0.074, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.039 std_dev=0.035
O6	A	0, -0.004, 0.035, 0.075, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.035 std_dev=0.040
C8	A	0, 0.006, 0.048, 0.091, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.048 std_dev=0.042
C2'	A	0, 0.025, 0.179, 0.334, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.179 std_dev=0.154
O2'	A	0, 0.070, 0.231, 0.393, 0.482 max_d=0.482 avg_d=0.231 std_dev=0.161
O4'	A	0, 0.010, 0.201, 0.391, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.201 std_dev=0.191
OP2	B	0, -0.005, 0.217, 0.439, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.217 std_dev=0.222
O3'	B	0, 0.063, 0.300, 0.537, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.300 std_dev=0.237
C4'	B	0, 0.037, 0.280, 0.524, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.280 std_dev=0.244
C5'	B	0, 0.068, 0.325, 0.583, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.325 std_dev=0.257
C3'	A	0, 0.026, 0.284, 0.542, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.284 std_dev=0.258
P	B	0, -0.027, 0.232, 0.491, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.232 std_dev=0.259
O4'	B	0, 0.063, 0.325, 0.587, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.325 std_dev=0.262
P	A	0, 0.049, 0.316, 0.583, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.316 std_dev=0.267
C6	B	0, 0.081, 0.354, 0.627, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.354 std_dev=0.273
OP1	A	0, 0.094, 0.379, 0.663, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.379 std_dev=0.284
C3'	B	0, 0.030, 0.317, 0.605, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.317 std_dev=0.288
C1'	B	0, 0.035, 0.324, 0.613, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.324 std_dev=0.289
C4'	A	0, 0.011, 0.310, 0.609, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.310 std_dev=0.299
N1	B	0, 0.026, 0.330, 0.635, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.330 std_dev=0.304
O2'	B	0, 0.005, 0.311, 0.618, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.311 std_dev=0.307
C5	B	0, 0.080, 0.392, 0.704, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.392 std_dev=0.312
O3'	A	0, 0.057, 0.369, 0.681, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.369 std_dev=0.312
OP1	B	0, -0.021, 0.294, 0.609, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.294 std_dev=0.315
C2'	B	0, 0.006, 0.321, 0.637, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.321 std_dev=0.315
O5'	A	0, 0.041, 0.368, 0.696, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.368 std_dev=0.327
OP2	A	0, 0.074, 0.409, 0.745, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.409 std_dev=0.336
O5'	B	0, 0.002, 0.340, 0.678, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.340 std_dev=0.338
C4	B	0, 0.010, 0.408, 0.806, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.408 std_dev=0.398
C2	B	0, -0.050, 0.360, 0.771, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.360 std_dev=0.411
N4	B	0, 0.014, 0.450, 0.885, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.450 std_dev=0.436
O2	B	0, -0.089, 0.369, 0.827, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.369 std_dev=0.458
N3	B	0, -0.064, 0.401, 0.867, 1.490 max_d=1.490 avg_d=0.401 std_dev=0.466
C5'	A	0, -0.043, 0.607, 1.258, 1.619 max_d=1.619 avg_d=0.607 std_dev=0.651

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.05	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.03	0.10	0.23	0.03
C2	0.04	0.00	0.04	0.15	0.02	0.06	0.02	0.21	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.15	0.02	0.21	0.02	0.12	0.19	0.07
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.07	0.05	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.18	0.05	0.22	0.10	0.11
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.10	0.01	0.08	0.04	0.11	0.04	0.13	0.18	0.14	0.05	0.05	0.01	0.00	0.01	0.30	0.10	0.32	0.05	0.22
C4	0.03	0.02	0.02	0.10	0.00	0.06	0.01	0.21	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.22	0.02	0.12	0.18	0.06
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.10	0.02	0.10	0.09	0.08	0.06	0.05	0.11	0.05	0.06	0.01	0.00	0.03	0.12	0.07	0.30	0.05
C5	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.10	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.08	0.07	0.04	0.26	0.02	0.10	0.17	0.08
C5'	0.05	0.21	0.04	0.04	0.21	0.02	0.28	0.00	0.30	0.23	0.27	0.19	0.17	0.29	0.16	0.06	0.03	0.03	0.01	0.34	0.12	0.39	0.02
C6	0.02	0.02	0.03	0.11	0.01	0.10	0.01	0.30	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.11	0.10	0.04	0.27	0.00	0.11	0.18	0.10
C8	0.02	0.02	0.05	0.04	0.01	0.09	0.01	0.23	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.06	0.26	0.04	0.10	0.17	0.07
N1	0.03	0.01	0.03	0.13	0.02	0.08	0.01	0.27	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.13	0.13	0.02	0.25	0.01	0.11	0.19	0.09
N2	0.05	0.01	0.07	0.18	0.03	0.06	0.03	0.19	0.03	0.03	0.03	0.00	0.02	0.03	0.03	0.14	0.19	0.03	0.19	0.03	0.12	0.20	0.06
N3	0.05	0.01	0.05	0.14	0.01	0.05	0.02	0.17	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.12	0.14	0.03	0.19	0.01	0.12	0.19	0.05
N7	0.01	0.02	0.05	0.05	0.01	0.11	0.01	0.29	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.04	0.06	0.28	0.04	0.09	0.16	0.08
N9	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.21	0.03	0.12	0.18	0.06
O2'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.08	0.06	0.08	0.06	0.11	0.02	0.13	0.14	0.12	0.05	0.03	0.00	0.05	0.05	0.06	0.12	0.11	0.22	0.06
O3'	0.01	0.15	0.02	0.00	0.09	0.01	0.07	0.03	0.10	0.05	0.13	0.19	0.14	0.04	0.04	0.05	0.00	0.01	0.24	0.09	0.35	0.06	0.23
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.04	0.06	0.02	0.03	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.06	0.07	0.32	0.10
O5'	0.10	0.21	0.18	0.30	0.22	0.03	0.26	0.01	0.27	0.26	0.25	0.19	0.19	0.28	0.21	0.06	0.24	0.08	0.00	0.30	0.01	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.05	0.10	0.02	0.12	0.02	0.34	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.12	0.09	0.06	0.30	0.00	0.13	0.20	0.14
OP1	0.10	0.12	0.22	0.32	0.12	0.07	0.10	0.12	0.11	0.10	0.11	0.12	0.12	0.09	0.12	0.11	0.35	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.19	0.10	0.05	0.18	0.30	0.17	0.39	0.18	0.17	0.19	0.20	0.19	0.16	0.18	0.22	0.06	0.32	0.01	0.20	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.07	0.11	0.22	0.06	0.05	0.08	0.02	0.10	0.07	0.09	0.06	0.05	0.08	0.06	0.06	0.23	0.10	0.01	0.14	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.16	0.16	0.17	0.20	0.15	0.24	0.17	0.24	0.19	0.17	0.18	0.14	0.06	0.15	0.16	0.17	0.22	0.14	0.18
C2	0.13	0.12	0.11	0.13	0.12	0.13	0.15	0.14	0.16	0.14	0.11	0.10	0.11	0.07	0.11	0.13	0.12	0.08	0.09	0.10
C2'	0.17	0.17	0.15	0.15	0.18	0.14	0.21	0.14	0.21	0.18	0.17	0.16	0.17	0.11	0.13	0.16	0.18	0.22	0.22	0.21
C3'	0.24	0.26	0.22	0.20	0.22	0.20	0.23	0.18	0.24	0.24	0.25	0.21	0.28	0.22	0.18	0.24	0.22	0.22	0.21	0.22
C4	0.15	0.15	0.15	0.17	0.17	0.16	0.20	0.18	0.20	0.17	0.15	0.15	0.13	0.08	0.15	0.16	0.18	0.20	0.15	0.18
C4'	0.13	0.13	0.12	0.13	0.15	0.11	0.21	0.12	0.20	0.15	0.13	0.13	0.13	0.06	0.11	0.12	0.11	0.19	0.10	0.13
C5	0.14	0.12	0.13	0.16	0.15	0.14	0.18	0.17	0.18	0.15	0.13	0.13	0.11	0.08	0.14	0.14	0.18	0.18	0.14	0.17
C5'	0.19	0.17	0.16	0.14	0.14	0.15	0.18	0.13	0.18	0.17	0.15	0.12	0.21	0.18	0.12	0.19	0.12	0.20	0.10	0.13
C6	0.11	0.09	0.09	0.12	0.11	0.11	0.14	0.14	0.15	0.12	0.09	0.10	0.08	0.10	0.11	0.11	0.14	0.13	0.11	0.13
C8	0.16	0.15	0.16	0.18	0.18	0.17	0.22	0.19	0.22	0.18	0.16	0.16	0.13	0.09	0.17	0.16	0.21	0.25	0.18	0.21
N1	0.11	0.09	0.09	0.11	0.10	0.11	0.13	0.13	0.14	0.11	0.09	0.09	0.09	0.09	0.10	0.11	0.12	0.08	0.08	0.10
N2	0.13	0.12	0.11	0.11	0.11	0.11	0.13	0.12	0.15	0.13	0.11	0.09	0.12	0.07	0.09	0.13	0.09	0.06	0.06	0.06
N3	0.15	0.15	0.14	0.16	0.16	0.15	0.19	0.17	0.20	0.17	0.14	0.14	0.13	0.07	0.14	0.15	0.16	0.15	0.12	0.15
N7	0.14	0.13	0.14	0.17	0.16	0.15	0.19	0.19	0.19	0.16	0.13	0.14	0.11	0.09	0.16	0.14	0.20	0.22	0.16	0.19
N9	0.17	0.17	0.17	0.18	0.19	0.17	0.23	0.19	0.23	0.19	0.17	0.17	0.15	0.09	0.17	0.17	0.20	0.24	0.17	0.20
O2'	0.21	0.21	0.20	0.18	0.23	0.17	0.27	0.16	0.28	0.24	0.20	0.19	0.19	0.12	0.13	0.20	0.10	0.16	0.13	0.13
O3'	0.27	0.30	0.25	0.22	0.26	0.22	0.26	0.19	0.27	0.27	0.29	0.25	0.32	0.25	0.20	0.27	0.24	0.23	0.25	0.24
O4'	0.16	0.16	0.17	0.19	0.20	0.16	0.25	0.18	0.24	0.19	0.17	0.19	0.14	0.07	0.17	0.15	0.18	0.25	0.15	0.19
O5'	0.19	0.16	0.18	0.19	0.18	0.19	0.23	0.19	0.24	0.20	0.15	0.14	0.13	0.12	0.18	0.18	0.13	0.18	0.09	0.13
O6	0.08	0.07	0.07	0.09	0.08	0.08	0.11	0.11	0.12	0.09	0.07	0.07	0.07	0.12	0.08	0.08	0.12	0.11	0.09	0.11
OP1	0.17	0.15	0.17	0.18	0.20	0.17	0.26	0.18	0.26	0.20	0.15	0.18	0.12	0.09	0.17	0.16	0.13	0.20	0.10	0.15
OP2	0.28	0.28	0.26	0.25	0.26	0.26	0.27	0.25	0.28	0.27	0.27	0.24	0.29	0.24	0.24	0.27	0.27	0.29	0.28	0.28
P	0.15	0.14	0.14	0.15	0.16	0.14	0.22	0.15	0.22	0.17	0.14	0.13	0.12	0.05	0.13	0.15	0.13	0.18	0.10	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.00	0.06	0.07	0.08	0.02
C2	0.02	0.00	0.08	0.06	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.09	0.09	0.02	0.06	0.03	0.12	0.03
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.08	0.06	0.10	0.00	0.02	0.01	0.02	0.07	0.11	0.03
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.09	0.03	0.07	0.05	0.09	0.02	0.01	0.01	0.05	0.08	0.10	0.04
C4	0.01	0.02	0.05	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.06	0.02	0.09	0.02	0.10	0.03
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.05	0.08	0.01	0.01	0.01	0.09	0.05	0.01
C5	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.08	0.02	0.13	0.03	0.08	0.02
C5'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.07	0.04	0.04	0.06	0.05	0.08	0.02	0.02	0.01	0.09	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.09	0.02	0.14	0.06	0.07	0.02
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.05	0.09	0.02
N3	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.10	0.09	0.01	0.06	0.03	0.13	0.04
N4	0.02	0.03	0.06	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.07	0.06	0.03	0.10	0.03	0.09	0.02
O2	0.05	0.00	0.10	0.09	0.03	0.05	0.02	0.05	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.13	0.13	0.05	0.05	0.05	0.12	0.04
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.06	0.08	0.02	0.08	0.05	0.01	0.10	0.07	0.13	0.00	0.04	0.07	0.05	0.14	0.07	0.04
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.06	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.09	0.06	0.13	0.04	0.00	0.02	0.07	0.13	0.10	0.06
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.05	0.07	0.02	0.00	0.09	0.09	0.07	0.05
O5'	0.06	0.06	0.02	0.05	0.09	0.01	0.13	0.01	0.14	0.08	0.06	0.10	0.05	0.05	0.07	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.07	0.03	0.07	0.08	0.02	0.09	0.03	0.09	0.06	0.05	0.03	0.03	0.05	0.14	0.13	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.12	0.11	0.10	0.10	0.05	0.08	0.02	0.07	0.09	0.13	0.09	0.12	0.07	0.10	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.06	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00