Doublet Group distance statistics: 48510

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.001, 0.014, 0.026, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.012, 0.027, 0.042, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.027 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.009, 0.028, 0.046, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.028 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.003, 0.028, 0.052, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.028 std_dev=0.025
C2'	A	0, 0.004, 0.199, 0.394, 0.438 max_d=0.438 avg_d=0.199 std_dev=0.195
O4'	A	0, -0.012, 0.187, 0.386, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.187 std_dev=0.199
O2'	A	0, 0.041, 0.256, 0.471, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.256 std_dev=0.215
P	B	0, 0.042, 0.287, 0.532, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.287 std_dev=0.245
OP2	B	0, 0.054, 0.332, 0.610, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.332 std_dev=0.278
C4'	A	0, -0.023, 0.284, 0.592, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.284 std_dev=0.307
OP1	B	0, 0.012, 0.327, 0.643, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.327 std_dev=0.315
C3'	A	0, -0.014, 0.307, 0.629, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.307 std_dev=0.321
O5'	B	0, 0.092, 0.419, 0.747, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.419 std_dev=0.327
OP1	A	0, -0.005, 0.382, 0.770, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.382 std_dev=0.387
O3'	A	0, 0.012, 0.400, 0.788, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.400 std_dev=0.388
P	A	0, 0.008, 0.398, 0.789, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.398 std_dev=0.390
C5'	B	0, 0.083, 0.521, 0.958, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.521 std_dev=0.438
OP2	A	0, 0.025, 0.512, 1.000, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.512 std_dev=0.488
C6	B	0, 0.103, 0.595, 1.086, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.595 std_dev=0.492
C4'	B	0, 0.111, 0.621, 1.130, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.621 std_dev=0.509
C3'	B	0, 0.165, 0.688, 1.212, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.688 std_dev=0.524
O5'	A	0, -0.037, 0.489, 1.015, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.489 std_dev=0.526
O4'	B	0, 0.070, 0.602, 1.133, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.602 std_dev=0.532
C5	B	0, 0.128, 0.662, 1.195, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.662 std_dev=0.534
C2'	B	0, 0.187, 0.740, 1.294, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.740 std_dev=0.554
C1'	B	0, 0.126, 0.684, 1.241, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.684 std_dev=0.557
N1	B	0, 0.108, 0.676, 1.243, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.676 std_dev=0.567
O3'	B	0, 0.197, 0.768, 1.339, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.768 std_dev=0.571
O2'	B	0, 0.215, 0.787, 1.359, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.787 std_dev=0.572
C5'	A	0, -0.077, 0.571, 1.219, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.571 std_dev=0.648
C4	B	0, 0.095, 0.783, 1.471, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.783 std_dev=0.688
C2	B	0, 0.125, 0.843, 1.561, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.843 std_dev=0.718
N4	B	0, 0.095, 0.863, 1.632, 1.812 max_d=1.812 avg_d=0.863 std_dev=0.768
N3	B	0, 0.090, 0.878, 1.666, 1.927 max_d=1.927 avg_d=0.878 std_dev=0.788
O2	B	0, 0.167, 0.983, 1.800, 2.124 max_d=2.124 avg_d=0.983 std_dev=0.816

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.15	0.02	0.19	0.31	0.07
C2	0.02	0.00	0.13	0.16	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.17	0.05	0.29	0.01	0.21	0.18	0.12
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.06	0.01	0.02	0.05	0.04	0.08	0.10	0.16	0.13	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.24	0.03	0.32	0.20	0.16
C3'	0.00	0.16	0.01	0.00	0.08	0.01	0.07	0.06	0.09	0.10	0.14	0.19	0.14	0.08	0.03	0.04	0.01	0.01	0.31	0.08	0.39	0.16	0.22
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.07	0.03	0.32	0.02	0.23	0.18	0.14
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.05	0.06	0.07	0.04	0.06	0.02	0.08	0.03	0.00	0.04	0.05	0.17	0.35	0.05
C5	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.41	0.01	0.24	0.10	0.19
C5'	0.04	0.12	0.05	0.06	0.09	0.02	0.11	0.00	0.13	0.07	0.13	0.12	0.10	0.10	0.06	0.09	0.08	0.03	0.01	0.13	0.22	0.42	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.02	0.42	0.01	0.24	0.07	0.20
C8	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.03	0.42	0.01	0.25	0.15	0.18
N1	0.01	0.01	0.10	0.14	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.03	0.35	0.01	0.22	0.12	0.16
N2	0.03	0.00	0.16	0.19	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.22	0.07	0.26	0.02	0.20	0.20	0.11
N3	0.02	0.00	0.13	0.14	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.15	0.05	0.26	0.02	0.21	0.22	0.11
N7	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02	0.47	0.01	0.26	0.07	0.23
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.30	0.02	0.22	0.22	0.12
O2'	0.03	0.08	0.01	0.04	0.03	0.08	0.02	0.09	0.02	0.05	0.05	0.10	0.07	0.05	0.01	0.00	0.04	0.05	0.12	0.02	0.25	0.28	0.13
O3'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.07	0.03	0.06	0.08	0.09	0.11	0.15	0.22	0.15	0.10	0.03	0.04	0.00	0.02	0.22	0.08	0.41	0.15	0.22
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.07	0.05	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.08	0.02	0.09	0.42	0.12
O5'	0.15	0.29	0.24	0.31	0.32	0.04	0.41	0.01	0.42	0.42	0.35	0.26	0.26	0.47	0.30	0.12	0.22	0.08	0.00	0.46	0.02	0.04	0.02
O6	0.02	0.01	0.03	0.08	0.02	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.02	0.46	0.00	0.26	0.05	0.24
OP1	0.19	0.21	0.32	0.39	0.23	0.17	0.24	0.22	0.24	0.25	0.22	0.20	0.21	0.26	0.22	0.25	0.41	0.09	0.02	0.26	0.00	0.04	0.03
OP2	0.31	0.18	0.20	0.16	0.18	0.35	0.10	0.42	0.07	0.15	0.12	0.20	0.22	0.07	0.22	0.28	0.15	0.42	0.04	0.05	0.04	0.00	0.02
P	0.07	0.12	0.16	0.22	0.14	0.05	0.19	0.02	0.20	0.18	0.16	0.11	0.11	0.23	0.12	0.13	0.22	0.12	0.02	0.24	0.03	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.56	0.67	0.57	0.56	0.55	0.56	0.46	0.49	0.47	0.54	0.66	0.55	0.77	0.58	0.58	0.55	0.45	0.24	0.15	0.21
C2	0.36	0.37	0.38	0.41	0.31	0.41	0.30	0.40	0.31	0.33	0.35	0.30	0.43	0.36	0.45	0.36	0.30	0.16	0.09	0.13
C2'	0.58	0.72	0.57	0.53	0.58	0.51	0.46	0.38	0.45	0.57	0.71	0.58	0.83	0.58	0.56	0.53	0.37	0.14	0.10	0.12
C3'	0.62	0.84	0.61	0.54	0.68	0.49	0.50	0.33	0.48	0.63	0.83	0.68	0.98	0.63	0.56	0.53	0.37	0.15	0.11	0.14
C4	0.47	0.52	0.49	0.50	0.43	0.51	0.38	0.46	0.39	0.44	0.51	0.42	0.61	0.49	0.54	0.48	0.38	0.19	0.12	0.16
C4'	0.61	0.84	0.60	0.54	0.70	0.50	0.53	0.39	0.50	0.63	0.86	0.71	0.98	0.60	0.55	0.54	0.44	0.21	0.14	0.19
C5	0.47	0.53	0.49	0.50	0.42	0.50	0.37	0.44	0.38	0.44	0.51	0.41	0.63	0.51	0.55	0.47	0.36	0.17	0.11	0.14
C5'	0.63	0.88	0.63	0.55	0.73	0.51	0.54	0.38	0.51	0.65	0.90	0.75	1.04	0.64	0.58	0.55	0.44	0.18	0.13	0.18
C6	0.42	0.46	0.44	0.45	0.36	0.46	0.33	0.40	0.34	0.38	0.44	0.35	0.55	0.45	0.51	0.42	0.31	0.14	0.09	0.12
C8	0.56	0.65	0.57	0.56	0.52	0.56	0.43	0.48	0.44	0.52	0.63	0.51	0.78	0.61	0.61	0.54	0.42	0.21	0.13	0.17
N1	0.37	0.38	0.39	0.41	0.31	0.41	0.29	0.37	0.30	0.33	0.36	0.30	0.45	0.38	0.46	0.37	0.27	0.13	0.09	0.11
N2	0.29	0.28	0.32	0.36	0.24	0.35	0.24	0.35	0.25	0.26	0.27	0.23	0.32	0.29	0.40	0.30	0.26	0.15	0.07	0.11
N3	0.41	0.44	0.43	0.46	0.37	0.47	0.35	0.44	0.36	0.39	0.43	0.36	0.51	0.42	0.49	0.42	0.36	0.19	0.12	0.15
N7	0.53	0.60	0.55	0.54	0.48	0.54	0.41	0.46	0.41	0.49	0.58	0.47	0.73	0.58	0.60	0.51	0.39	0.19	0.12	0.16
N9	0.53	0.61	0.54	0.54	0.50	0.55	0.43	0.48	0.43	0.50	0.60	0.49	0.72	0.56	0.58	0.53	0.42	0.21	0.13	0.18
O2'	0.59	0.72	0.59	0.56	0.62	0.54	0.49	0.43	0.48	0.59	0.72	0.62	0.80	0.60	0.58	0.56	0.39	0.17	0.10	0.13
O3'	0.65	0.91	0.64	0.54	0.74	0.45	0.54	0.27	0.50	0.68	0.91	0.75	1.08	0.66	0.56	0.51	0.37	0.20	0.18	0.19
O4'	0.58	0.73	0.57	0.55	0.62	0.54	0.51	0.48	0.50	0.58	0.74	0.62	0.85	0.58	0.57	0.56	0.48	0.27	0.21	0.25
O5'	0.64	0.88	0.65	0.60	0.74	0.59	0.52	0.52	0.49	0.65	0.91	0.77	1.05	0.69	0.65	0.58	0.51	0.38	0.21	0.30
O6	0.42	0.46	0.44	0.44	0.36	0.44	0.32	0.38	0.33	0.38	0.44	0.35	0.56	0.45	0.50	0.41	0.29	0.12	0.08	0.10
OP1	0.72	0.96	0.75	0.69	0.77	0.65	0.57	0.55	0.56	0.71	0.97	0.79	1.15	0.82	0.74	0.64	0.57	0.40	0.29	0.35
OP2	0.74	0.98	0.74	0.65	0.80	0.60	0.59	0.43	0.56	0.74	0.99	0.82	1.16	0.79	0.69	0.64	0.46	0.20	0.17	0.21
P	0.67	0.91	0.69	0.62	0.73	0.58	0.52	0.47	0.50	0.67	0.93	0.76	1.10	0.75	0.67	0.59	0.48	0.28	0.15	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.06	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.05	0.02
C2	0.04	0.00	0.09	0.12	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.15	0.09	0.07	0.08	0.15	0.07
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.03	0.08	0.05	0.13	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.09	0.06
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.10	0.01	0.05	0.02	0.04	0.06	0.13	0.11	0.14	0.01	0.01	0.02	0.13	0.09	0.09	0.08
C4	0.04	0.00	0.04	0.10	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.13	0.08	0.07	0.09	0.19	0.11
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.07	0.06	0.03	0.01	0.01	0.13	0.05	0.02
C5	0.03	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.05	0.07	0.08	0.16	0.10
C5'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.08	0.01	0.08	0.00	0.07	0.05	0.07	0.08	0.08	0.05	0.04	0.02	0.01	0.15	0.05	0.02
C6	0.03	0.02	0.06	0.04	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.11	0.07
N1	0.02	0.02	0.03	0.06	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.04	0.05	0.06	0.11	0.05
N3	0.04	0.00	0.08	0.13	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.03	0.17	0.09	0.07	0.08	0.18	0.09
N4	0.04	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.15	0.08	0.08	0.12	0.21	0.12
O2	0.06	0.01	0.13	0.14	0.02	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.03	0.03	0.00	0.06	0.17	0.12	0.09	0.11	0.14	0.08
O2'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.05	0.04	0.02	0.03	0.02	0.06	0.00	0.01	0.05	0.07	0.09	0.08	0.06
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.13	0.03	0.07	0.04	0.05	0.07	0.17	0.15	0.17	0.01	0.00	0.02	0.18	0.12	0.12	0.11
O4'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.08	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.09	0.08	0.12	0.05	0.02	0.00	0.14	0.16	0.08	0.08
O5'	0.06	0.07	0.06	0.13	0.07	0.01	0.07	0.01	0.06	0.05	0.07	0.08	0.09	0.07	0.18	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.11	0.08	0.09	0.09	0.09	0.13	0.08	0.15	0.05	0.06	0.08	0.12	0.11	0.09	0.12	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.05	0.15	0.09	0.09	0.19	0.05	0.16	0.05	0.11	0.11	0.18	0.21	0.14	0.08	0.12	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.02	0.07	0.06	0.08	0.11	0.02	0.10	0.02	0.07	0.05	0.09	0.12	0.08	0.06	0.11	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00