Doublet Group distance statistics: 48511

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.025, 0.039, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.025 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.015, 0.036, 0.058, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.036 std_dev=0.021
C5	A	0, 0.022, 0.052, 0.082, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.052 std_dev=0.030
C2	A	0, 0.024, 0.057, 0.091, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.057 std_dev=0.033
N9	A	0, 0.025, 0.060, 0.096, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.060 std_dev=0.035
N7	A	0, 0.026, 0.063, 0.099, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.063 std_dev=0.037
C4	A	0, 0.027, 0.064, 0.101, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.064 std_dev=0.037
C1'	A	0, 0.029, 0.069, 0.108, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.069 std_dev=0.040
N3	A	0, 0.029, 0.069, 0.109, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.069 std_dev=0.040
C8	A	0, 0.028, 0.070, 0.111, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.070 std_dev=0.041
O6	A	0, 0.046, 0.112, 0.178, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.112 std_dev=0.066
N2	A	0, 0.048, 0.115, 0.182, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.115 std_dev=0.067
OP1	B	0, 0.248, 0.588, 0.928, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.588 std_dev=0.340
OP2	B	0, 0.389, 0.937, 1.484, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.937 std_dev=0.547
P	B	0, 0.240, 0.800, 1.360, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.800 std_dev=0.560
C2'	A	0, 0.680, 1.617, 2.554, 2.226 max_d=2.226 avg_d=1.617 std_dev=0.937
O4'	A	0, 0.730, 1.734, 2.738, 2.382 max_d=2.382 avg_d=1.734 std_dev=1.004
C3'	A	0, 0.943, 2.243, 3.542, 3.096 max_d=3.096 avg_d=2.243 std_dev=1.299
O3'	A	0, 0.956, 2.263, 3.569, 3.021 max_d=3.021 avg_d=2.263 std_dev=1.306
O2'	A	0, 0.952, 2.260, 3.568, 3.096 max_d=3.096 avg_d=2.260 std_dev=1.308
C4'	A	0, 1.023, 2.434, 3.844, 3.344 max_d=3.344 avg_d=2.434 std_dev=1.410
O5'	B	0, 1.094, 2.588, 4.083, 3.505 max_d=3.505 avg_d=2.588 std_dev=1.495
N4	B	0, 1.282, 3.049, 4.816, 4.315 max_d=4.315 avg_d=3.049 std_dev=1.767
C5	B	0, 1.405, 3.324, 5.243, 4.452 max_d=4.452 avg_d=3.324 std_dev=1.919
C5'	A	0, 1.516, 3.619, 5.722, 5.041 max_d=5.041 avg_d=3.619 std_dev=2.103
P	A	0, 1.700, 4.046, 6.392, 5.572 max_d=5.572 avg_d=4.046 std_dev=2.346
C4	B	0, 1.733, 4.112, 6.490, 5.719 max_d=5.719 avg_d=4.112 std_dev=2.379
O5'	A	0, 1.726, 4.113, 6.500, 5.685 max_d=5.685 avg_d=4.113 std_dev=2.387
C5'	B	0, 1.764, 4.173, 6.583, 5.603 max_d=5.603 avg_d=4.173 std_dev=2.410
OP1	A	0, 1.754, 4.166, 6.578, 5.705 max_d=5.705 avg_d=4.166 std_dev=2.412
C6	B	0, 1.873, 4.431, 6.990, 5.935 max_d=5.935 avg_d=4.431 std_dev=2.559
OP2	A	0, 2.310, 5.484, 8.658, 7.504 max_d=7.504 avg_d=5.484 std_dev=3.174
N3	B	0, 2.536, 6.014, 9.492, 8.344 max_d=8.344 avg_d=6.014 std_dev=3.478
C4'	B	0, 2.579, 6.103, 9.627, 8.196 max_d=8.196 avg_d=6.103 std_dev=3.524
N1	B	0, 2.665, 6.310, 9.955, 8.600 max_d=8.600 avg_d=6.310 std_dev=3.645
C3'	B	0, 2.755, 6.528, 10.301, 8.984 max_d=8.984 avg_d=6.528 std_dev=3.773
O4'	B	0, 2.815, 6.660, 10.506, 8.915 max_d=8.915 avg_d=6.660 std_dev=3.846
C2	B	0, 3.018, 7.151, 11.284, 9.834 max_d=9.834 avg_d=7.151 std_dev=4.133
O3'	B	0, 3.150, 7.462, 11.774, 10.234 max_d=10.234 avg_d=7.462 std_dev=4.312
C1'	B	0, 3.197, 7.567, 11.937, 10.238 max_d=10.238 avg_d=7.567 std_dev=4.370
C2'	B	0, 3.441, 8.148, 12.855, 11.138 max_d=11.138 avg_d=8.148 std_dev=4.707
O2	B	0, 3.783, 8.960, 14.137, 12.288 max_d=12.288 avg_d=8.960 std_dev=5.177
O2'	B	0, 4.212, 9.969, 15.726, 13.521 max_d=13.521 avg_d=9.969 std_dev=5.757

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.18	0.00	0.06	0.01	0.46	0.12	0.12
C2	0.03	0.00	0.27	0.20	0.01	0.18	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.19	0.30	0.07	0.02	0.51	0.17	0.10
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.15	0.01	0.09	0.16	0.15	0.11	0.22	0.31	0.26	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.17	0.13	0.67	0.28	0.42
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.17	0.00	0.20	0.02	0.22	0.14	0.22	0.20	0.17	0.18	0.11	0.01	0.01	0.01	0.09	0.24	0.30	0.18	0.22
C4	0.01	0.01	0.15	0.17	0.00	0.08	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.15	0.13	0.01	0.50	0.22	0.05
C4'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.08	0.00	0.05	0.00	0.07	0.12	0.14	0.24	0.17	0.09	0.04	0.15	0.02	0.00	0.03	0.06	0.15	0.07	0.05
C5	0.01	0.01	0.09	0.20	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.07	0.24	0.01	0.47	0.36	0.06
C5'	0.08	0.29	0.16	0.02	0.19	0.00	0.14	0.00	0.18	0.02	0.25	0.34	0.27	0.04	0.10	0.01	0.12	0.01	0.00	0.15	0.07	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.15	0.22	0.00	0.07	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.11	0.13	0.23	0.01	0.46	0.38	0.07
C8	0.02	0.01	0.11	0.14	0.01	0.12	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.26	0.03	0.15	0.32	0.03	0.47	0.38	0.08
N1	0.02	0.00	0.22	0.22	0.00	0.14	0.01	0.25	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.15	0.23	0.14	0.02	0.48	0.27	0.05
N2	0.04	0.00	0.31	0.20	0.00	0.24	0.01	0.34	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.34	0.24	0.36	0.08	0.01	0.52	0.10	0.15
N3	0.04	0.00	0.26	0.17	0.00	0.17	0.01	0.27	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.19	0.29	0.05	0.02	0.51	0.13	0.13
N7	0.01	0.01	0.04	0.18	0.01	0.09	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.05	0.08	0.34	0.03	0.44	0.46	0.13
N9	0.00	0.01	0.02	0.11	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.07	0.01	0.16	0.02	0.50	0.22	0.04
O2'	0.01	0.24	0.00	0.01	0.06	0.15	0.05	0.01	0.03	0.26	0.15	0.34	0.24	0.21	0.09	0.00	0.04	0.10	0.13	0.03	0.65	0.30	0.42
O3'	0.18	0.19	0.02	0.01	0.11	0.02	0.08	0.12	0.11	0.03	0.15	0.24	0.19	0.05	0.07	0.04	0.00	0.15	0.10	0.11	0.15	0.21	0.14
O4'	0.00	0.30	0.01	0.01	0.15	0.00	0.07	0.01	0.13	0.15	0.23	0.36	0.29	0.08	0.01	0.10	0.15	0.00	0.15	0.09	0.20	0.18	0.08
O5'	0.06	0.07	0.17	0.09	0.13	0.03	0.24	0.00	0.23	0.32	0.14	0.08	0.05	0.34	0.16	0.13	0.10	0.15	0.00	0.29	0.01	0.04	0.01
O6	0.01	0.02	0.13	0.24	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.11	0.09	0.29	0.00	0.41	0.47	0.14
OP1	0.46	0.51	0.67	0.30	0.50	0.15	0.47	0.07	0.46	0.47	0.48	0.52	0.51	0.44	0.50	0.65	0.15	0.20	0.01	0.41	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.17	0.28	0.18	0.22	0.07	0.36	0.06	0.38	0.38	0.27	0.10	0.13	0.46	0.22	0.30	0.21	0.18	0.04	0.47	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.10	0.42	0.22	0.05	0.05	0.06	0.01	0.07	0.08	0.05	0.15	0.13	0.13	0.04	0.42	0.14	0.08	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.52	0.33	0.29	0.15	0.17	0.48	0.20	0.45	0.32	0.38	0.24	0.10	0.38	0.42	0.09	0.66	0.13	0.23	0.18	0.19
C2	0.19	0.13	0.17	0.15	0.15	0.20	0.16	0.16	0.15	0.15	0.13	0.17	0.12	0.19	0.15	0.21	0.11	0.05	0.06	0.06
C2'	1.03	0.78	0.79	0.63	0.55	1.00	0.60	0.95	0.76	0.85	0.64	0.43	0.84	0.94	0.43	1.18	0.56	0.42	0.36	0.53
C3'	0.74	0.43	0.48	0.31	0.17	0.71	0.25	0.64	0.43	0.52	0.26	0.03	0.52	0.69	0.15	0.89	0.28	0.36	0.35	0.31
C4	0.33	0.21	0.22	0.15	0.13	0.32	0.12	0.29	0.19	0.24	0.16	0.13	0.24	0.29	0.14	0.41	0.03	0.11	0.07	0.08
C4'	0.30	0.04	0.09	0.23	0.14	0.24	0.15	0.23	0.17	0.14	0.08	0.24	0.11	0.16	0.46	0.47	0.28	0.47	0.49	0.32
C5	0.26	0.17	0.19	0.16	0.13	0.25	0.11	0.21	0.15	0.19	0.15	0.14	0.19	0.24	0.19	0.31	0.05	0.07	0.04	0.04
C5'	0.19	0.09	0.25	0.42	0.24	0.15	0.24	0.17	0.20	0.12	0.20	0.33	0.05	0.14	0.69	0.33	0.40	0.54	0.55	0.39
C6	0.18	0.14	0.18	0.18	0.15	0.19	0.15	0.14	0.15	0.15	0.14	0.17	0.13	0.19	0.21	0.19	0.13	0.04	0.04	0.05
C8	0.41	0.27	0.24	0.15	0.15	0.36	0.15	0.33	0.24	0.30	0.20	0.12	0.31	0.33	0.18	0.50	0.05	0.14	0.11	0.13
N1	0.16	0.13	0.17	0.17	0.17	0.18	0.18	0.14	0.18	0.16	0.15	0.19	0.11	0.17	0.19	0.16	0.16	0.07	0.07	0.09
N2	0.16	0.12	0.16	0.16	0.18	0.17	0.21	0.16	0.20	0.16	0.14	0.21	0.09	0.16	0.16	0.16	0.17	0.11	0.11	0.15
N3	0.30	0.19	0.21	0.15	0.12	0.31	0.12	0.28	0.17	0.22	0.15	0.13	0.21	0.28	0.12	0.37	0.04	0.10	0.06	0.05
N7	0.31	0.21	0.21	0.16	0.13	0.29	0.12	0.25	0.18	0.23	0.17	0.13	0.24	0.28	0.21	0.38	0.03	0.09	0.07	0.07
N9	0.43	0.28	0.25	0.15	0.15	0.40	0.16	0.37	0.26	0.32	0.21	0.12	0.32	0.36	0.13	0.54	0.07	0.16	0.12	0.14
O2'	1.46	1.22	1.19	1.01	0.97	1.38	1.01	1.30	1.18	1.29	1.07	0.83	1.29	1.34	0.78	1.60	0.92	0.59	0.61	0.81
O3'	0.83	0.49	0.60	0.40	0.18	0.77	0.27	0.65	0.44	0.57	0.28	0.12	0.62	0.85	0.26	0.96	0.34	0.52	0.55	0.40
O4'	0.09	0.12	0.19	0.35	0.24	0.02	0.20	0.05	0.12	0.04	0.21	0.32	0.11	0.06	0.58	0.25	0.35	0.51	0.49	0.34
O5'	0.19	0.10	0.15	0.30	0.27	0.16	0.20	0.18	0.11	0.03	0.23	0.38	0.08	0.05	0.54	0.38	0.27	0.37	0.46	0.27
O6	0.18	0.16	0.20	0.21	0.19	0.19	0.19	0.15	0.18	0.17	0.17	0.20	0.14	0.20	0.25	0.17	0.18	0.07	0.06	0.09
OP1	0.21	0.02	0.15	0.36	0.22	0.09	0.24	0.13	0.18	0.09	0.14	0.32	0.08	0.06	0.61	0.32	0.44	0.64	0.63	0.47
OP2	0.15	0.21	0.23	0.35	0.33	0.15	0.21	0.15	0.08	0.10	0.32	0.44	0.22	0.14	0.59	0.33	0.23	0.23	0.37	0.16
P	0.18	0.09	0.16	0.32	0.26	0.12	0.21	0.13	0.13	0.04	0.22	0.37	0.08	0.02	0.57	0.35	0.31	0.42	0.49	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.06	0.08	0.02
C2	0.00	0.00	0.10	0.11	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.13	0.02	0.04	0.02	0.13	0.06
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.09	0.05	0.15	0.00	0.02	0.01	0.00	0.08	0.09	0.03
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.03	0.10	0.06	0.15	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.08	0.03
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.07	0.07	0.14	0.08
C4'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.05	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.10	0.09	0.13	0.08
C5'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.02	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.06	0.03	0.10	0.07	0.11	0.06
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.06	0.04	0.11	0.04
N3	0.00	0.00	0.09	0.10	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.14	0.03	0.04	0.04	0.14	0.07
N4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.08	0.10	0.16	0.10
O2	0.01	0.01	0.15	0.15	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.19	0.02	0.05	0.03	0.14	0.06
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.00	0.06	0.03	0.11	0.00	0.03	0.02	0.02	0.08	0.08	0.02
O3'	0.02	0.13	0.02	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.06	0.03	0.14	0.09	0.19	0.03	0.00	0.01	0.09	0.08	0.09	0.05
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.08	0.08	0.06	0.04
O5'	0.05	0.04	0.00	0.04	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.06	0.04	0.08	0.05	0.02	0.09	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.02	0.08	0.08	0.07	0.09	0.09	0.09	0.07	0.04	0.04	0.10	0.03	0.08	0.08	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.08	0.13	0.09	0.08	0.14	0.05	0.13	0.02	0.11	0.11	0.14	0.16	0.14	0.08	0.09	0.06	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.06	0.03	0.03	0.08	0.01	0.08	0.01	0.06	0.04	0.07	0.10	0.06	0.02	0.05	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00