Doublet Group distance statistics: 48515

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, -0.001, 0.004, 0.009, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.004 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.000, 0.006, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C2	A	0, -0.001, 0.006, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.006 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C6	A	0, -0.001, 0.009, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C8	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C1'	A	0, -0.001, 0.015, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N2	A	0, -0.005, 0.014, 0.033, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.019
N9	A	0, -0.004, 0.016, 0.035, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.019
C5'	A	0, -0.013, 0.059, 0.132, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.059 std_dev=0.073
O4'	A	0, -0.035, 0.106, 0.246, 0.304 max_d=0.304 avg_d=0.106 std_dev=0.140
C2'	A	0, -0.045, 0.130, 0.306, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.130 std_dev=0.176
OP1	B	0, -0.020, 0.171, 0.362, 0.438 max_d=0.438 avg_d=0.171 std_dev=0.191
OP2	B	0, -0.036, 0.174, 0.384, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.174 std_dev=0.210
O5'	A	0, -0.077, 0.217, 0.511, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.217 std_dev=0.294
C4'	A	0, -0.105, 0.270, 0.644, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.270 std_dev=0.374
P	A	0, -0.109, 0.298, 0.705, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.298 std_dev=0.407
P	B	0, -0.088, 0.321, 0.730, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.321 std_dev=0.409
O2'	A	0, -0.149, 0.390, 0.928, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.390 std_dev=0.538
C3'	A	0, -0.235, 0.582, 1.399, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.582 std_dev=0.817
OP2	A	0, -0.242, 0.621, 1.485, 1.843 max_d=1.843 avg_d=0.621 std_dev=0.864
O5'	B	0, -0.230, 0.658, 1.546, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.658 std_dev=0.888
C6	B	0, -0.347, 0.868, 2.083, 2.587 max_d=2.587 avg_d=0.868 std_dev=1.215
C4	B	0, -0.357, 0.880, 2.118, 2.630 max_d=2.630 avg_d=0.880 std_dev=1.237
N3	B	0, -0.362, 0.917, 2.196, 2.726 max_d=2.726 avg_d=0.917 std_dev=1.279
C5	B	0, -0.371, 0.914, 2.199, 2.731 max_d=2.731 avg_d=0.914 std_dev=1.285
N4	B	0, -0.398, 0.988, 2.373, 2.947 max_d=2.947 avg_d=0.988 std_dev=1.386
N1	B	0, -0.392, 0.998, 2.387, 2.962 max_d=2.962 avg_d=0.998 std_dev=1.389
C2	B	0, -0.424, 1.069, 2.562, 3.181 max_d=3.181 avg_d=1.069 std_dev=1.493
O3'	A	0, -0.449, 1.100, 2.650, 3.291 max_d=3.291 avg_d=1.100 std_dev=1.549
OP1	A	0, -0.462, 1.155, 2.772, 3.442 max_d=3.442 avg_d=1.155 std_dev=1.617
O4'	B	0, -0.470, 1.181, 2.833, 3.517 max_d=3.517 avg_d=1.181 std_dev=1.652
C1'	B	0, -0.483, 1.217, 2.917, 3.621 max_d=3.621 avg_d=1.217 std_dev=1.700
C5'	B	0, -0.520, 1.310, 3.140, 3.897 max_d=3.897 avg_d=1.310 std_dev=1.830
O2	B	0, -0.541, 1.360, 3.260, 4.047 max_d=4.047 avg_d=1.360 std_dev=1.900
C4'	B	0, -0.560, 1.385, 3.331, 4.137 max_d=4.137 avg_d=1.385 std_dev=1.946
C2'	B	0, -0.600, 1.500, 3.599, 4.469 max_d=4.469 avg_d=1.500 std_dev=2.100
C3'	B	0, -0.607, 1.497, 3.600, 4.471 max_d=4.471 avg_d=1.497 std_dev=2.103
O2'	B	0, -0.702, 1.799, 4.300, 5.336 max_d=5.336 avg_d=1.799 std_dev=2.501
O3'	B	0, -0.732, 1.798, 4.328, 5.376 max_d=5.376 avg_d=1.798 std_dev=2.530

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.32	0.01	0.14	0.03	0.66	0.00	0.27
C2	0.03	0.00	0.15	0.13	0.00	0.07	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.29	0.28	0.01	0.12	0.01	0.99	0.27	0.32
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.11	0.04	0.11	0.20	0.13	0.03	0.14	0.17	0.14	0.07	0.05	0.00	0.01	0.00	0.33	0.13	0.46	0.14	0.36
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.23	0.00	0.35	0.00	0.34	0.41	0.24	0.05	0.09	0.44	0.24	0.04	0.00	0.03	0.13	0.40	0.21	0.20	0.15
C4	0.02	0.00	0.11	0.23	0.00	0.08	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.27	0.12	0.00	0.11	0.02	1.01	0.27	0.33
C4'	0.02	0.07	0.04	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.11	0.12	0.09	0.06	0.06	0.13	0.08	0.38	0.01	0.01	0.04	0.13	0.02	0.18	0.03
C5	0.02	0.01	0.11	0.35	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.06	0.01	0.09	0.01	1.16	0.40	0.35
C5'	0.06	0.03	0.20	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.15	0.20	0.03	0.01	0.00	0.29	0.35	0.01
C6	0.03	0.01	0.13	0.34	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.33	0.03	0.01	0.08	0.01	1.19	0.45	0.34
C8	0.02	0.01	0.03	0.41	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.19	0.03	0.06	0.01	1.12	0.35	0.34
N1	0.02	0.00	0.14	0.24	0.00	0.09	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.34	0.13	0.01	0.11	0.01	1.12	0.37	0.34
N2	0.03	0.00	0.17	0.05	0.01	0.06	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.25	0.40	0.00	0.13	0.00	0.93	0.23	0.31
N3	0.03	0.00	0.14	0.09	0.00	0.06	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.25	0.32	0.00	0.12	0.01	0.91	0.20	0.31
N7	0.02	0.01	0.07	0.44	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.22	0.02	0.05	0.01	1.23	0.47	0.35
N9	0.01	0.01	0.05	0.24	0.01	0.08	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.18	0.07	0.01	0.12	0.02	0.94	0.19	0.32
O2'	0.01	0.29	0.00	0.04	0.27	0.38	0.30	0.15	0.33	0.19	0.34	0.25	0.25	0.26	0.18	0.00	0.08	0.21	0.14	0.34	0.20	0.04	0.19
O3'	0.32	0.28	0.01	0.00	0.12	0.01	0.06	0.20	0.03	0.19	0.13	0.40	0.32	0.22	0.07	0.08	0.00	0.23	0.27	0.12	0.50	0.35	0.35
O4'	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.21	0.23	0.00	0.03	0.01	0.52	0.06	0.14
O5'	0.14	0.12	0.33	0.13	0.11	0.04	0.09	0.01	0.08	0.06	0.11	0.13	0.12	0.05	0.12	0.14	0.27	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.01	0.13	0.40	0.02	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.34	0.12	0.01	0.06	0.00	1.25	0.54	0.34
OP1	0.66	0.99	0.46	0.21	1.01	0.02	1.16	0.29	1.19	1.12	1.12	0.93	0.91	1.23	0.94	0.20	0.50	0.52	0.01	1.25	0.00	0.02	0.00
OP2	0.00	0.27	0.14	0.20	0.27	0.18	0.40	0.35	0.45	0.35	0.37	0.23	0.20	0.47	0.19	0.04	0.35	0.06	0.01	0.54	0.02	0.00	0.01
P	0.27	0.32	0.36	0.15	0.33	0.03	0.35	0.01	0.34	0.34	0.34	0.31	0.31	0.35	0.32	0.19	0.35	0.14	0.00	0.34	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.72	0.91	0.67	0.67	1.13	0.58	1.14	0.64	1.02	0.89	1.02	1.21	0.82	0.60	0.55	0.68	0.30	0.09	0.02	0.24
C2	0.92	1.00	1.09	1.25	1.12	1.08	1.14	1.29	1.10	1.02	1.06	1.14	0.94	1.00	1.31	0.91	0.41	0.11	0.03	0.17
C2'	0.80	1.01	0.72	0.67	1.20	0.60	1.20	0.60	1.08	0.98	1.12	1.28	0.93	0.67	0.52	0.75	0.45	0.23	0.14	0.39
C3'	0.68	0.91	0.48	0.34	1.12	0.37	1.11	0.32	0.97	0.87	1.03	1.22	0.83	0.46	0.12	0.65	0.25	0.08	0.03	0.21
C4	0.94	1.03	1.01	1.08	1.13	0.98	1.13	1.11	1.09	1.03	1.08	1.15	0.98	0.97	1.07	0.93	0.45	0.12	0.04	0.25
C4'	0.75	1.00	0.60	0.51	1.26	0.48	1.26	0.48	1.10	0.96	1.14	1.38	0.90	0.54	0.30	0.71	0.35	0.12	0.16	0.34
C5	1.09	1.12	1.20	1.27	1.12	1.20	1.11	1.30	1.11	1.11	1.12	1.11	1.12	1.21	1.31	1.10	0.54	0.14	0.07	0.28
C5'	0.61	0.82	0.47	0.38	1.02	0.37	0.99	0.35	0.86	0.77	0.93	1.12	0.76	0.45	0.21	0.57	0.23	0.02	0.02	0.19
C6	1.17	1.15	1.35	1.46	1.10	1.38	1.09	1.48	1.12	1.15	1.13	1.07	1.17	1.39	1.56	1.19	0.58	0.14	0.08	0.26
C8	0.99	1.07	1.02	1.03	1.11	0.99	1.10	1.04	1.07	1.05	1.10	1.13	1.06	1.03	1.00	0.99	0.49	0.13	0.07	0.30
N1	1.09	1.10	1.31	1.45	1.10	1.33	1.10	1.48	1.11	1.11	1.09	1.09	1.08	1.29	1.57	1.09	0.51	0.12	0.06	0.20
N2	0.80	0.93	1.02	1.23	1.10	0.98	1.14	1.22	1.07	0.95	1.01	1.15	0.83	0.86	1.32	0.75	0.29	0.09	0.02	0.08
N3	0.83	0.96	0.92	1.02	1.13	0.88	1.16	1.05	1.08	0.97	1.04	1.18	0.88	0.82	1.01	0.81	0.36	0.11	0.02	0.20
N7	1.11	1.14	1.19	1.22	1.11	1.18	1.09	1.24	1.10	1.12	1.13	1.10	1.16	1.23	1.24	1.12	0.56	0.14	0.09	0.31
N9	0.87	1.00	0.89	0.91	1.12	0.84	1.12	0.92	1.05	0.99	1.06	1.16	0.95	0.85	0.86	0.86	0.41	0.11	0.04	0.26
O2'	0.23	0.54	0.17	0.15	0.87	0.02	0.87	0.02	0.66	0.49	0.72	1.01	0.42	0.06	0.02	0.13	0.05	0.08	0.18	0.06
O3'	0.55	0.92	0.22	0.00	1.31	0.05	1.30	0.04	1.05	0.85	1.14	1.49	0.78	0.13	0.35	0.48	0.01	0.47	0.02	0.02
O4'	0.73	0.94	0.64	0.61	1.18	0.55	1.18	0.60	1.04	0.91	1.06	1.28	0.84	0.58	0.46	0.70	0.30	0.08	0.07	0.26
O5'	0.55	0.70	0.46	0.40	0.80	0.39	0.77	0.38	0.69	0.65	0.76	0.85	0.67	0.49	0.30	0.53	0.16	0.09	0.18	0.06
O6	1.27	1.21	1.49	1.59	1.08	1.51	1.05	1.57	1.12	1.20	1.15	1.03	1.27	1.57	1.73	1.29	0.62	0.15	0.10	0.27
OP1	0.41	0.71	0.28	0.20	0.95	0.16	0.89	0.16	0.71	0.62	0.86	1.10	0.63	0.22	0.03	0.36	0.09	0.43	0.18	0.16
OP2	1.06	1.13	0.94	0.82	1.09	0.89	1.04	0.82	1.03	1.08	1.13	1.09	1.17	1.05	0.70	1.05	0.54	0.13	0.06	0.36
P	0.55	0.71	0.47	0.40	0.79	0.40	0.74	0.38	0.67	0.65	0.77	0.85	0.69	0.50	0.30	0.53	0.12	0.17	0.19	0.01

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.41	0.40	0.31	0.34
C2	0.01	0.00	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.03	0.01	0.70	0.73	0.75	0.67
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.07	0.00	0.06	0.01	0.15	0.00	0.03	0.01	0.32	0.39	0.18	0.28
C3'	0.03	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.19	0.07	0.01	0.09	0.11	0.01	0.00	0.01	0.30	0.44	0.06	0.26
C4	0.00	0.00	0.01	0.09	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.10	0.00	0.98	1.12	1.14	1.01
C4'	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.01	0.03	0.03	0.10	0.02	0.00	0.03	0.15	0.20	0.01
C5	0.00	0.00	0.05	0.17	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.02	1.06	1.19	1.18	1.08
C5'	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.10	0.04	0.01	0.05	0.02	0.09	0.02	0.02	0.00	0.24	0.41	0.00
C6	0.00	0.00	0.07	0.19	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.20	0.02	0.97	0.99	0.92	0.90
N1	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.73	0.73	0.67	0.66
N3	0.00	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.01	0.01	0.83	0.93	0.96	0.84
N4	0.00	0.00	0.01	0.09	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.11	0.00	1.03	1.24	1.27	1.11
O2	0.02	0.00	0.15	0.11	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.14	0.03	0.53	0.55	0.59	0.52
O2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.05	0.10	0.01	0.09	0.04	0.03	0.10	0.05	0.18	0.00	0.02	0.06	0.11	0.17	0.04	0.10
O3'	0.03	0.03	0.03	0.00	0.10	0.02	0.20	0.02	0.20	0.07	0.01	0.11	0.14	0.02	0.00	0.02	0.05	0.27	0.15	0.08
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.00	0.30	0.28	0.11	0.22
O5'	0.41	0.70	0.32	0.30	0.98	0.03	1.06	0.00	0.97	0.73	0.83	1.03	0.53	0.11	0.05	0.30	0.00	0.03	0.03	0.00
OP1	0.40	0.73	0.39	0.44	1.12	0.15	1.19	0.24	0.99	0.73	0.93	1.24	0.55	0.17	0.27	0.28	0.03	0.00	0.03	0.02
OP2	0.31	0.75	0.18	0.06	1.14	0.20	1.18	0.41	0.92	0.67	0.96	1.27	0.59	0.04	0.15	0.11	0.03	0.03	0.00	0.00
P	0.34	0.67	0.28	0.26	1.01	0.01	1.08	0.00	0.90	0.66	0.84	1.11	0.52	0.10	0.08	0.22	0.00	0.02	0.00	0.00