Doublet Group distance statistics: 48517

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
O6	A	0, 0.000, 0.004, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N1	A	0, 0.000, 0.037, 0.075, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N3	A	0, 0.000, 0.038, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.038 std_dev=0.038
C2	A	0, 0.000, 0.051, 0.102, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.051 std_dev=0.051
C1'	A	0, 0.000, 0.053, 0.106, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.053 std_dev=0.053
N2	A	0, 0.000, 0.086, 0.172, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.086 std_dev=0.086
C2'	A	0, 0.000, 0.329, 0.658, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.329 std_dev=0.329
P	A	0, 0.000, 0.371, 0.742, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.371 std_dev=0.371
O2'	A	0, 0.000, 0.381, 0.761, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.381 std_dev=0.381
O4'	A	0, 0.000, 0.399, 0.798, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.399 std_dev=0.399
C5'	B	0, 0.000, 0.425, 0.851, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.425 std_dev=0.425
OP1	B	0, 0.000, 0.462, 0.924, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.462 std_dev=0.462
C3'	A	0, 0.000, 0.551, 1.102, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.551 std_dev=0.551
C4'	A	0, 0.000, 0.551, 1.103, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.551 std_dev=0.551
OP2	B	0, 0.000, 0.570, 1.140, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.570 std_dev=0.570
P	B	0, 0.000, 0.631, 1.262, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.631 std_dev=0.631
C4'	B	0, 0.000, 0.740, 1.480, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.740 std_dev=0.740
O5'	A	0, 0.000, 0.807, 1.614, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.807 std_dev=0.807
O3'	A	0, 0.000, 0.842, 1.684, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.842 std_dev=0.842
C5'	A	0, 0.000, 0.978, 1.957, 1.957 max_d=1.957 avg_d=0.978 std_dev=0.978
OP1	A	0, 0.000, 0.989, 1.977, 1.977 max_d=1.977 avg_d=0.989 std_dev=0.989
C3'	B	0, 0.000, 1.082, 2.164, 2.164 max_d=2.164 avg_d=1.082 std_dev=1.082
OP2	A	0, 0.000, 1.087, 2.175, 2.175 max_d=2.175 avg_d=1.087 std_dev=1.087
O5'	B	0, 0.000, 1.206, 2.412, 2.412 max_d=2.412 avg_d=1.206 std_dev=1.206
O3'	B	0, 0.000, 1.468, 2.935, 2.935 max_d=2.935 avg_d=1.468 std_dev=1.468
O4'	B	0, 0.000, 1.729, 3.457, 3.457 max_d=3.457 avg_d=1.729 std_dev=1.729
C2'	B	0, 0.000, 1.838, 3.677, 3.677 max_d=3.677 avg_d=1.838 std_dev=1.838
O2'	B	0, 0.000, 1.884, 3.768, 3.768 max_d=3.768 avg_d=1.884 std_dev=1.884
C1'	B	0, 0.000, 2.250, 4.499, 4.499 max_d=4.499 avg_d=2.250 std_dev=2.250
C6	B	0, 0.000, 2.935, 5.870, 5.870 max_d=5.870 avg_d=2.935 std_dev=2.935
N1	B	0, 0.000, 3.256, 6.513, 6.513 max_d=6.513 avg_d=3.256 std_dev=3.256
C5	B	0, 0.000, 3.846, 7.693, 7.693 max_d=7.693 avg_d=3.846 std_dev=3.846
C2	B	0, 0.000, 4.549, 9.097, 9.097 max_d=9.097 avg_d=4.549 std_dev=4.549
O2	B	0, 0.000, 4.854, 9.708, 9.708 max_d=9.708 avg_d=4.854 std_dev=4.854
C4	B	0, 0.000, 5.165, 10.329, 10.329 max_d=10.329 avg_d=5.165 std_dev=5.165
N3	B	0, 0.000, 5.492, 10.985, 10.985 max_d=10.985 avg_d=5.492 std_dev=5.492
N4	B	0, 0.000, 6.117, 12.234, 12.234 max_d=12.234 avg_d=6.117 std_dev=6.117

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.09	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.03	0.07	0.59	0.17
C2	0.07	0.00	0.09	0.14	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.23	0.10	0.33	0.02	0.37	0.60	0.02
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.09	0.05	0.11	0.10	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.21	0.00	0.26	0.43	0.05
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.08	0.01	0.02	0.02	0.06	0.11	0.10	0.17	0.13	0.07	0.00	0.03	0.01	0.02	0.30	0.04	0.30	0.28	0.19
C4	0.03	0.02	0.05	0.08	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.04	0.33	0.01	0.33	0.62	0.05
C4'	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.08	0.01	0.01	0.00	0.06	0.03	0.09	0.02	0.00	0.00	0.03	0.05	0.31	0.06
C5	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.02	0.42	0.01	0.44	0.61	0.01
C5'	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.05	0.13	0.04	0.01	0.02	0.11	0.06	0.09	0.05	0.01	0.01	0.06	0.18	0.08	0.00
C6	0.03	0.01	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.04	0.44	0.00	0.49	0.58	0.03
C8	0.00	0.02	0.09	0.11	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.11	0.03	0.43	0.01	0.36	0.61	0.02
N1	0.06	0.01	0.05	0.10	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.18	0.08	0.40	0.01	0.45	0.59	0.01
N2	0.09	0.00	0.11	0.17	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.28	0.13	0.31	0.02	0.36	0.60	0.03
N3	0.06	0.01	0.10	0.13	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.21	0.10	0.29	0.01	0.31	0.60	0.05
N7	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.48	0.01	0.47	0.59	0.03
N9	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.29	0.02	0.25	0.62	0.08
O2'	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.09	0.01	0.09	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.04	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.02	0.10	0.46	0.07
O3'	0.01	0.23	0.02	0.01	0.12	0.02	0.06	0.05	0.11	0.11	0.18	0.28	0.21	0.06	0.02	0.02	0.00	0.02	0.29	0.09	0.37	0.12	0.33
O4'	0.00	0.10	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.08	0.13	0.10	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.11	0.03	0.18	0.59	0.32
O5'	0.09	0.33	0.21	0.30	0.33	0.00	0.42	0.01	0.44	0.43	0.40	0.31	0.29	0.48	0.29	0.00	0.29	0.11	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00
O6	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.03	0.48	0.00	0.55	0.55	0.06
OP1	0.07	0.37	0.26	0.30	0.33	0.05	0.44	0.18	0.49	0.36	0.45	0.36	0.31	0.47	0.25	0.10	0.37	0.18	0.00	0.55	0.00	0.06	0.01
OP2	0.59	0.60	0.43	0.28	0.62	0.31	0.61	0.08	0.58	0.61	0.59	0.60	0.60	0.59	0.62	0.46	0.12	0.59	0.00	0.55	0.06	0.00	0.01
P	0.17	0.02	0.05	0.19	0.05	0.06	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.08	0.07	0.33	0.32	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	1.07	1.95	0.56	0.11	1.83	0.41	1.27	0.07	1.04	1.38	2.16	1.99	2.26	0.25	0.29	1.03	0.54	0.01	0.07	0.11
C2	1.20	2.43	0.94	0.32	2.55	0.27	1.83	0.13	1.43	1.73	2.84	2.82	2.57	0.73	0.02	0.89	0.02	0.05	0.33	0.21
C2'	1.12	1.83	0.67	0.23	1.70	0.58	1.23	0.31	1.05	1.35	1.98	1.83	2.08	0.39	0.22	1.14	0.84	0.34	0.24	0.44
C3'	1.07	1.80	0.59	0.17	1.73	0.55	1.25	0.32	1.05	1.33	1.99	1.89	2.04	0.28	0.32	1.11	0.88	0.36	0.36	0.49
C4	1.26	2.44	0.85	0.28	2.43	0.39	1.73	0.01	1.38	1.72	2.79	2.68	2.71	0.58	0.06	1.07	0.28	0.06	0.19	0.03
C4'	0.92	1.69	0.37	0.01	1.61	0.40	1.12	0.17	0.91	1.19	1.89	1.78	1.95	0.02	0.48	0.97	0.73	0.11	0.20	0.31
C5	1.33	2.64	0.92	0.33	2.71	0.39	1.93	0.03	1.52	1.85	3.07	3.05	2.89	0.67	0.01	1.07	0.21	0.05	0.22	0.09
C5'	0.89	1.72	0.31	0.06	1.69	0.34	1.16	0.13	0.92	1.19	1.96	1.89	1.98	0.07	0.55	0.93	0.69	0.08	0.22	0.28
C6	1.34	2.72	1.01	0.38	2.92	0.34	2.08	0.08	1.61	1.92	3.24	3.32	2.93	0.80	0.09	1.00	0.06	0.05	0.28	0.17
C8	1.28	2.46	0.78	0.25	2.44	0.44	1.73	0.04	1.38	1.73	2.81	2.72	2.77	0.49	0.11	1.12	0.41	0.04	0.13	0.03
N1	1.26	2.61	1.01	0.36	2.84	0.28	2.03	0.14	1.56	1.85	3.12	3.23	2.76	0.82	0.09	0.90	0.06	0.04	0.33	0.24
N2	1.07	2.21	0.94	0.30	2.40	0.17	1.75	0.21	1.35	1.60	2.61	2.65	2.28	0.77	0.04	0.72	0.22	0.03	0.41	0.33
N3	1.19	2.32	0.85	0.27	2.30	0.34	1.64	0.06	1.32	1.65	2.63	2.51	2.54	0.60	0.06	0.99	0.19	0.08	0.24	0.07
N7	1.34	2.64	0.88	0.31	2.69	0.42	1.91	0.00	1.51	1.85	3.06	3.03	2.92	0.61	0.03	1.11	0.30	0.04	0.18	0.04
N9	1.22	2.30	0.74	0.23	2.24	0.43	1.58	0.04	1.28	1.62	2.60	2.46	2.61	0.44	0.15	1.10	0.43	0.05	0.12	0.05
O2'	0.97	1.46	0.54	0.17	1.27	0.59	0.91	0.36	0.81	1.10	1.53	1.33	1.70	0.28	0.27	1.07	0.93	0.28	0.23	0.47
O3'	1.04	1.62	0.59	0.18	1.56	0.62	1.16	0.46	0.99	1.24	1.78	1.69	1.82	0.29	0.33	1.13	1.04	0.51	0.59	0.68
O4'	0.90	1.79	0.33	0.07	1.70	0.27	1.15	0.03	0.90	1.21	2.02	1.89	2.09	0.02	0.49	0.90	0.50	0.10	0.07	0.07
O5'	1.03	1.90	0.48	0.11	1.78	0.45	1.20	0.15	0.97	1.31	2.12	1.97	2.22	0.13	0.29	1.03	0.63	0.06	0.00	0.12
O6	1.36	2.81	1.06	0.41	3.07	0.33	2.19	0.10	1.68	1.97	3.37	3.56	3.00	0.86	0.14	0.98	0.01	0.05	0.29	0.20
OP1	1.06	2.01	0.51	0.10	1.91	0.43	1.28	0.09	1.01	1.37	2.27	2.15	2.34	0.19	0.27	1.01	0.54	0.08	0.10	0.03
OP2	1.64	2.74	1.02	0.57	2.78	0.90	2.12	0.58	1.78	2.07	3.09	3.08	3.02	0.65	0.12	1.58	1.08	0.60	0.58	0.69
P	1.29	2.26	0.69	0.28	2.20	0.62	1.57	0.29	1.29	1.63	2.53	2.44	2.57	0.36	0.12	1.25	0.77	0.17	0.14	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.26	0.00	0.01	0.65	0.15	0.43
C2	0.03	0.00	0.32	0.36	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.14	0.09	0.18	0.19	1.33	0.31	0.75
C2'	0.00	0.32	0.00	0.00	0.03	0.02	0.27	0.09	0.34	0.02	0.21	0.02	0.62	0.00	0.04	0.01	0.11	0.49	0.26	0.50
C3'	0.00	0.36	0.00	0.00	0.22	0.02	0.06	0.04	0.00	0.14	0.34	0.23	0.49	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.10	0.14
C4	0.01	0.02	0.03	0.22	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.31	0.03	0.02	0.10	1.28	0.14	0.57
C4'	0.00	0.03	0.02	0.02	0.10	0.00	0.17	0.00	0.18	0.07	0.04	0.11	0.06	0.24	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.13
C5	0.01	0.01	0.27	0.06	0.00	0.17	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.58	0.17	0.20	0.36	0.90	0.07	0.29
C5'	0.01	0.03	0.09	0.04	0.16	0.00	0.25	0.00	0.24	0.09	0.07	0.17	0.08	0.10	0.22	0.02	0.01	0.24	0.10	0.00
C6	0.01	0.01	0.34	0.00	0.00	0.18	0.00	0.24	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.59	0.23	0.27	0.38	0.71	0.09	0.23
N1	0.00	0.03	0.02	0.14	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.19	0.13	0.02	0.05	0.96	0.14	0.51
N3	0.02	0.01	0.21	0.34	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.13	1.47	0.30	0.76
N4	0.01	0.01	0.02	0.23	0.00	0.11	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.33	0.00	0.02	0.09	1.37	0.15	0.58
O2	0.02	0.00	0.62	0.49	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.51	0.24	0.36	0.43	1.44	0.45	0.90
O2'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.31	0.24	0.58	0.10	0.59	0.19	0.01	0.33	0.51	0.00	0.07	0.16	0.12	0.21	0.11	0.28
O3'	0.26	0.09	0.04	0.00	0.03	0.01	0.17	0.22	0.23	0.13	0.09	0.00	0.24	0.07	0.00	0.13	0.14	0.35	0.38	0.12
O4'	0.00	0.18	0.01	0.03	0.02	0.02	0.20	0.02	0.27	0.02	0.13	0.02	0.36	0.16	0.13	0.00	0.01	0.53	0.10	0.34
O5'	0.01	0.19	0.11	0.03	0.10	0.00	0.36	0.01	0.38	0.05	0.13	0.09	0.43	0.12	0.14	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.65	1.33	0.49	0.01	1.28	0.02	0.90	0.24	0.71	0.96	1.47	1.37	1.44	0.21	0.35	0.53	0.00	0.00	0.05	0.00
OP2	0.15	0.31	0.26	0.10	0.14	0.03	0.07	0.10	0.09	0.14	0.30	0.15	0.45	0.11	0.38	0.10	0.01	0.05	0.00	0.00
P	0.43	0.75	0.50	0.14	0.57	0.13	0.29	0.00	0.23	0.51	0.76	0.58	0.90	0.28	0.12	0.34	0.01	0.00	0.00	0.00