Doublet Group distance statistics: 48535

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.018, 0.034, 0.050, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.034 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.018, 0.034, 0.050, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.034 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.021, 0.040, 0.059, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.040 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.020, 0.040, 0.060, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.040 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.022, 0.042, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.042 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.024, 0.046, 0.067, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.046 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.024, 0.046, 0.067, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.046 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.020, 0.045, 0.071, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.045 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.035, 0.068, 0.101, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.068 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.033, 0.067, 0.102, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.067 std_dev=0.035
N2	A	0, 0.044, 0.085, 0.127, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.085 std_dev=0.042
O4'	A	0, -0.026, 0.148, 0.322, 0.524 max_d=0.524 avg_d=0.148 std_dev=0.174
C4'	A	0, 0.094, 0.341, 0.587, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.341 std_dev=0.246
C2'	A	0, 0.021, 0.269, 0.517, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.269 std_dev=0.248
P	B	0, 0.179, 0.434, 0.689, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.434 std_dev=0.255
P	A	0, 0.240, 0.630, 1.021, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.630 std_dev=0.391
C3'	A	0, -0.010, 0.408, 0.827, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.408 std_dev=0.419
OP1	A	0, 0.258, 0.679, 1.100, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.679 std_dev=0.421
O2'	A	0, 0.049, 0.474, 0.898, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.474 std_dev=0.425
OP1	B	0, 0.249, 0.677, 1.105, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.677 std_dev=0.428
OP2	A	0, 0.233, 0.683, 1.134, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.683 std_dev=0.451
C5'	A	0, 0.116, 0.588, 1.059, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.588 std_dev=0.471
O5'	A	0, 0.080, 0.579, 1.078, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.579 std_dev=0.499
O5'	B	0, 0.085, 0.615, 1.145, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.615 std_dev=0.530
C5'	B	0, 0.155, 0.756, 1.356, 1.989 max_d=1.989 avg_d=0.756 std_dev=0.601
OP2	B	0, 0.129, 0.744, 1.360, 2.011 max_d=2.011 avg_d=0.744 std_dev=0.616
O3'	A	0, 0.061, 0.727, 1.394, 2.124 max_d=2.124 avg_d=0.727 std_dev=0.666
C4'	B	0, 0.015, 0.827, 1.639, 2.573 max_d=2.573 avg_d=0.827 std_dev=0.812
O4'	B	0, -0.241, 0.727, 1.695, 2.865 max_d=2.865 avg_d=0.727 std_dev=0.968
O3'	B	0, 0.671, 1.830, 2.989, 3.977 max_d=3.977 avg_d=1.830 std_dev=1.159
C3'	B	0, 0.079, 1.262, 2.445, 3.790 max_d=3.790 avg_d=1.262 std_dev=1.183
O2'	B	0, 0.628, 1.816, 3.004, 4.046 max_d=4.046 avg_d=1.816 std_dev=1.188
C1'	B	0, -0.353, 0.926, 2.205, 3.757 max_d=3.757 avg_d=0.926 std_dev=1.279
C2'	B	0, -0.084, 1.264, 2.612, 4.184 max_d=4.184 avg_d=1.264 std_dev=1.348
C8	B	0, -0.247, 1.194, 2.635, 4.362 max_d=4.362 avg_d=1.194 std_dev=1.441
N9	B	0, -0.459, 1.137, 2.734, 4.676 max_d=4.676 avg_d=1.137 std_dev=1.596
N7	B	0, -0.346, 1.427, 3.200, 5.334 max_d=5.334 avg_d=1.427 std_dev=1.773
C4	B	0, -0.655, 1.456, 3.567, 6.144 max_d=6.144 avg_d=1.456 std_dev=2.111
C5	B	0, -0.626, 1.587, 3.800, 6.495 max_d=6.495 avg_d=1.587 std_dev=2.213
N3	B	0, -0.877, 1.593, 4.063, 7.090 max_d=7.090 avg_d=1.593 std_dev=2.470
C6	B	0, -0.873, 1.875, 4.623, 7.981 max_d=7.981 avg_d=1.875 std_dev=2.748
O6	B	0, -0.873, 2.036, 4.945, 8.494 max_d=8.494 avg_d=2.036 std_dev=2.909
C2	B	0, -1.113, 1.874, 4.862, 8.529 max_d=8.529 avg_d=1.874 std_dev=2.988
N1	B	0, -1.130, 1.996, 5.123, 8.958 max_d=8.958 avg_d=1.996 std_dev=3.127
N2	B	0, -1.343, 2.078, 5.500, 9.705 max_d=9.705 avg_d=2.078 std_dev=3.422

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.02	0.07	0.43	0.23
C2	0.02	0.00	0.09	0.02	0.01	0.06	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.10	0.10	0.14	0.02	0.05	0.40	0.12
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.09	0.05	0.12	0.09	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.08	0.25	0.10
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.12	0.19	0.07	0.03	0.01	0.18	0.10	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.21	0.03	0.06
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.15	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.01	0.05	0.11	0.02	0.09	0.43	0.17
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.09	0.08	0.08	0.06	0.05	0.08	0.06	0.07	0.03	0.00	0.01	0.10	0.15	0.14	0.04
C5	0.01	0.01	0.02	0.13	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.10	0.02	0.14	0.02	0.15	0.45	0.18
C5'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.15	0.01	0.16	0.00	0.19	0.10	0.19	0.19	0.16	0.13	0.10	0.06	0.03	0.01	0.01	0.20	0.13	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.12	0.02	0.09	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.14	0.08	0.04	0.17	0.00	0.14	0.42	0.16
C8	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01	0.08	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.22	0.07	0.07	0.03	0.19	0.49	0.24
N1	0.02	0.01	0.05	0.07	0.02	0.08	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.20	0.02	0.08	0.17	0.02	0.09	0.40	0.13
N2	0.03	0.01	0.12	0.03	0.01	0.06	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.30	0.17	0.13	0.15	0.02	0.05	0.38	0.10
N3	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.05	0.01	0.16	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.11	0.11	0.12	0.02	0.04	0.40	0.13
N7	0.03	0.01	0.07	0.18	0.01	0.08	0.00	0.13	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.21	0.05	0.12	0.04	0.21	0.48	0.22
N9	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.06	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.06	0.03	0.11	0.45	0.21
O2'	0.01	0.25	0.01	0.01	0.15	0.07	0.10	0.06	0.14	0.03	0.20	0.30	0.24	0.03	0.05	0.00	0.04	0.07	0.03	0.11	0.20	0.20	0.03
O3'	0.03	0.10	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.03	0.08	0.22	0.02	0.17	0.11	0.21	0.07	0.04	0.00	0.03	0.13	0.14	0.45	0.22	0.25
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.07	0.08	0.13	0.11	0.05	0.01	0.07	0.03	0.00	0.08	0.03	0.09	0.44	0.26
O5'	0.05	0.14	0.03	0.05	0.11	0.01	0.14	0.01	0.17	0.07	0.17	0.15	0.12	0.12	0.06	0.03	0.13	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.02	0.04	0.16	0.02	0.10	0.02	0.20	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.11	0.14	0.03	0.19	0.00	0.17	0.40	0.16
OP1	0.07	0.05	0.08	0.21	0.09	0.15	0.15	0.13	0.14	0.19	0.09	0.05	0.04	0.21	0.11	0.20	0.45	0.09	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01
OP2	0.43	0.40	0.25	0.03	0.43	0.14	0.45	0.03	0.42	0.49	0.40	0.38	0.40	0.48	0.45	0.20	0.22	0.44	0.01	0.40	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.12	0.10	0.06	0.17	0.04	0.18	0.02	0.16	0.24	0.13	0.10	0.13	0.22	0.21	0.03	0.25	0.26	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.66	0.18	0.25	0.31	0.25	0.15	0.40	0.27	0.22	0.51	0.85	0.59	0.16	0.11	0.19	0.17	0.14	0.29	0.17	0.16	0.19	0.16
C2	0.05	0.30	0.22	0.10	0.06	0.05	0.15	0.14	0.10	0.38	0.16	0.47	0.27	0.40	0.08	0.08	0.15	0.04	0.25	0.21	0.36	0.09	0.10
C2'	0.22	0.35	0.26	0.18	0.04	0.16	0.17	0.10	0.05	0.53	0.21	0.57	0.28	0.45	0.24	0.61	0.23	0.24	0.57	0.12	0.25	0.49	0.38
C3'	0.18	0.59	0.28	0.18	0.16	0.13	0.05	0.15	0.20	0.39	0.46	0.83	0.47	0.28	0.13	0.72	0.25	0.17	0.50	0.14	0.25	0.48	0.37
C4	0.07	0.54	0.13	0.09	0.21	0.08	0.06	0.23	0.16	0.30	0.41	0.74	0.47	0.26	0.04	0.18	0.14	0.06	0.32	0.08	0.29	0.12	0.13
C4'	0.29	1.07	0.23	0.36	0.64	0.40	0.49	0.49	0.66	0.09	0.94	1.30	0.96	0.17	0.35	0.22	0.38	0.32	0.22	0.58	0.16	0.23	0.19
C5	0.07	0.63	0.10	0.08	0.26	0.07	0.11	0.20	0.24	0.28	0.50	0.85	0.54	0.22	0.06	0.24	0.21	0.07	0.31	0.15	0.31	0.10	0.13
C5'	0.43	1.45	0.30	0.40	0.94	0.46	0.84	0.58	1.06	0.32	1.35	1.71	1.27	0.48	0.59	0.20	0.39	0.46	0.12	1.01	0.12	0.09	0.10
C6	0.07	0.56	0.14	0.08	0.21	0.06	0.07	0.17	0.17	0.30	0.42	0.77	0.47	0.26	0.04	0.18	0.24	0.07	0.29	0.09	0.34	0.10	0.12
C8	0.10	0.81	0.05	0.09	0.38	0.12	0.24	0.27	0.41	0.21	0.68	1.05	0.68	0.12	0.13	0.36	0.17	0.11	0.33	0.32	0.24	0.16	0.15
N1	0.06	0.40	0.19	0.09	0.12	0.05	0.09	0.14	0.07	0.35	0.26	0.58	0.35	0.35	0.05	0.10	0.21	0.05	0.26	0.13	0.36	0.11	0.10
N2	0.05	0.13	0.27	0.11	0.09	0.05	0.28	0.09	0.26	0.43	0.08	0.27	0.13	0.50	0.14	0.16	0.14	0.04	0.20	0.39	0.38	0.13	0.09
N3	0.05	0.36	0.20	0.12	0.10	0.07	0.10	0.20	0.05	0.36	0.22	0.53	0.33	0.36	0.06	0.07	0.09	0.04	0.29	0.14	0.31	0.10	0.12
N7	0.08	0.78	0.05	0.08	0.35	0.08	0.21	0.22	0.38	0.23	0.65	1.02	0.65	0.15	0.11	0.35	0.23	0.09	0.33	0.30	0.28	0.13	0.14
N9	0.10	0.67	0.11	0.13	0.30	0.14	0.15	0.29	0.28	0.25	0.54	0.89	0.58	0.18	0.09	0.25	0.10	0.10	0.32	0.19	0.23	0.16	0.15
O2'	0.35	0.11	0.31	0.21	0.25	0.30	0.42	0.25	0.32	0.74	0.09	0.30	0.08	0.69	0.44	0.56	0.18	0.43	0.74	0.41	0.33	0.70	0.55
O3'	0.52	0.28	0.63	0.39	0.18	0.35	0.29	0.23	0.13	0.69	0.15	0.54	0.15	0.57	0.45	1.07	0.37	0.50	0.72	0.19	0.39	0.79	0.61
O4'	0.47	1.11	0.47	0.52	0.74	0.56	0.59	0.69	0.73	0.20	0.98	1.31	1.02	0.28	0.50	0.12	0.43	0.49	0.08	0.64	0.10	0.06	0.07
O5'	0.28	1.38	0.11	0.22	0.82	0.30	0.74	0.45	0.99	0.20	1.29	1.66	1.16	0.38	0.46	0.40	0.22	0.32	0.20	0.96	0.16	0.13	0.13
O6	0.07	0.61	0.13	0.09	0.24	0.06	0.10	0.16	0.22	0.28	0.48	0.83	0.51	0.24	0.06	0.20	0.28	0.07	0.29	0.13	0.35	0.11	0.12
OP1	0.69	2.15	0.45	0.48	1.41	0.56	1.36	0.62	1.71	0.66	2.08	2.53	1.82	0.91	0.94	0.17	0.46	0.67	0.11	1.69	0.14	0.11	0.10
OP2	0.15	1.47	0.09	0.15	0.77	0.12	0.68	0.16	1.01	0.07	1.38	1.83	1.17	0.24	0.33	0.54	0.30	0.15	0.52	0.98	0.58	0.41	0.46
P	0.39	1.71	0.19	0.24	1.04	0.31	0.96	0.41	1.28	0.31	1.63	2.05	1.42	0.53	0.60	0.30	0.25	0.39	0.26	1.25	0.32	0.18	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.24	0.01	0.10	0.01	0.10	0.34	0.09
C2	0.03	0.00	0.33	0.18	0.01	0.09	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.22	0.24	0.06	0.02	0.27	0.79	0.37
C2'	0.00	0.33	0.00	0.01	0.15	0.02	0.03	0.12	0.10	0.23	0.23	0.41	0.33	0.16	0.02	0.00	0.02	0.02	0.52	0.06	0.59	0.26	0.45
C3'	0.03	0.18	0.01	0.00	0.16	0.00	0.19	0.01	0.21	0.14	0.20	0.17	0.16	0.18	0.12	0.01	0.01	0.01	0.33	0.23	0.48	0.03	0.29
C4	0.02	0.01	0.15	0.16	0.00	0.05	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.16	0.11	0.08	0.00	0.32	0.77	0.42
C4'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.11	0.29	0.03	0.16	0.09	0.27	0.12	0.14	0.02	0.01	0.01	0.16	0.15	0.27	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.19	0.01	0.15	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.24	0.10	0.02	0.20	0.01	0.58	0.96	0.62
C5'	0.04	0.08	0.12	0.01	0.19	0.01	0.34	0.00	0.32	0.49	0.19	0.08	0.06	0.50	0.24	0.02	0.09	0.01	0.00	0.40	0.09	0.31	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.21	0.00	0.11	0.01	0.32	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.17	0.11	0.07	0.21	0.00	0.64	1.02	0.66
C8	0.02	0.01	0.23	0.14	0.01	0.29	0.00	0.49	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.49	0.06	0.20	0.29	0.02	0.56	0.85	0.62
N1	0.02	0.01	0.23	0.20	0.01	0.03	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.17	0.17	0.11	0.02	0.46	0.93	0.53
N2	0.02	0.00	0.41	0.17	0.00	0.16	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.43	0.26	0.30	0.09	0.03	0.18	0.75	0.30
N3	0.03	0.01	0.33	0.16	0.00	0.09	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.29	0.23	0.23	0.06	0.02	0.17	0.69	0.29
N7	0.02	0.01	0.16	0.18	0.02	0.27	0.01	0.50	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.47	0.05	0.13	0.32	0.03	0.74	1.04	0.76
N9	0.00	0.01	0.02	0.12	0.01	0.12	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.18	0.13	0.02	0.08	0.01	0.25	0.64	0.35
O2'	0.02	0.26	0.00	0.01	0.05	0.14	0.24	0.02	0.17	0.49	0.09	0.43	0.29	0.47	0.18	0.00	0.06	0.15	0.44	0.25	0.64	0.40	0.47
O3'	0.24	0.22	0.02	0.01	0.16	0.02	0.10	0.09	0.11	0.06	0.17	0.26	0.23	0.05	0.13	0.06	0.00	0.13	0.23	0.08	0.43	0.11	0.24
O4'	0.01	0.24	0.02	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.07	0.20	0.17	0.30	0.23	0.13	0.02	0.15	0.13	0.00	0.10	0.03	0.06	0.42	0.19
O5'	0.10	0.06	0.52	0.33	0.08	0.01	0.20	0.00	0.21	0.29	0.11	0.09	0.06	0.32	0.08	0.44	0.23	0.10	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.02	0.06	0.23	0.00	0.16	0.01	0.40	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.25	0.08	0.03	0.28	0.00	0.80	1.12	0.78
OP1	0.10	0.27	0.59	0.48	0.32	0.15	0.58	0.09	0.64	0.56	0.46	0.18	0.17	0.74	0.25	0.64	0.43	0.06	0.01	0.80	0.00	0.00	0.00
OP2	0.34	0.79	0.26	0.03	0.77	0.27	0.96	0.31	1.02	0.85	0.93	0.75	0.69	1.04	0.64	0.40	0.11	0.42	0.01	1.12	0.00	0.00	0.01
P	0.09	0.37	0.45	0.29	0.42	0.01	0.62	0.01	0.66	0.62	0.53	0.30	0.29	0.76	0.35	0.47	0.24	0.19	0.01	0.78	0.00	0.01	0.00