Doublet Group distance statistics: 48536

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.009, 0.024, 0.038, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.014, 0.030, 0.046, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.030 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.013, 0.029, 0.045, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.015, 0.032, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.032 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.009, 0.025, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.011, 0.033, 0.055, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.033 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.026, 0.049, 0.073, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.049 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.009, 0.033, 0.057, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.033 std_dev=0.024
N2	A	0, 0.013, 0.040, 0.066, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.040 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.010, 0.041, 0.072, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.041 std_dev=0.031
P	B	0, 0.179, 0.350, 0.522, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.350 std_dev=0.172
O5'	B	0, 0.086, 0.300, 0.515, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.300 std_dev=0.215
C5'	B	0, 0.122, 0.340, 0.559, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.340 std_dev=0.218
OP2	B	0, 0.161, 0.433, 0.705, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.433 std_dev=0.272
OP1	B	0, 0.213, 0.541, 0.868, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.541 std_dev=0.328
C4'	B	0, 0.099, 0.491, 0.884, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.491 std_dev=0.392
O5'	A	0, 0.059, 0.462, 0.866, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.462 std_dev=0.404
C2'	A	0, -0.112, 0.414, 0.941, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.414 std_dev=0.526
O4'	A	0, -0.074, 0.459, 0.992, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.459 std_dev=0.533
OP2	A	0, 0.137, 0.816, 1.495, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.816 std_dev=0.679
P	A	0, 0.067, 0.810, 1.553, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.810 std_dev=0.743
O2'	A	0, -0.206, 0.630, 1.466, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.630 std_dev=0.836
O4'	B	0, -0.047, 0.841, 1.729, 2.093 max_d=2.093 avg_d=0.841 std_dev=0.888
C3'	A	0, -0.196, 0.737, 1.670, 2.071 max_d=2.071 avg_d=0.737 std_dev=0.933
C4'	A	0, -0.189, 0.775, 1.739, 2.154 max_d=2.154 avg_d=0.775 std_dev=0.964
OP1	A	0, 0.002, 1.045, 2.088, 2.530 max_d=2.530 avg_d=1.045 std_dev=1.043
C3'	B	0, -0.042, 1.022, 2.086, 2.513 max_d=2.513 avg_d=1.022 std_dev=1.064
O3'	B	0, -0.096, 1.183, 2.461, 2.981 max_d=2.981 avg_d=1.183 std_dev=1.278
C5'	A	0, -0.209, 1.076, 2.360, 2.908 max_d=2.908 avg_d=1.076 std_dev=1.285
O3'	A	0, -0.253, 1.088, 2.430, 2.996 max_d=2.996 avg_d=1.088 std_dev=1.342
C1'	B	0, -0.183, 1.292, 2.766, 3.374 max_d=3.374 avg_d=1.292 std_dev=1.474
C2'	B	0, -0.166, 1.376, 2.917, 3.552 max_d=3.552 avg_d=1.376 std_dev=1.541
O2'	B	0, -0.181, 1.464, 3.108, 3.794 max_d=3.794 avg_d=1.464 std_dev=1.644
N3	B	0, -0.058, 1.713, 3.483, 4.205 max_d=4.205 avg_d=1.713 std_dev=1.771
N9	B	0, -0.237, 1.553, 3.344, 4.078 max_d=4.078 avg_d=1.553 std_dev=1.791
N2	B	0, 0.108, 1.947, 3.785, 4.517 max_d=4.517 avg_d=1.947 std_dev=1.838
C4	B	0, -0.180, 1.746, 3.673, 4.460 max_d=4.460 avg_d=1.746 std_dev=1.926
C2	B	0, -0.013, 1.933, 3.880, 4.670 max_d=4.670 avg_d=1.933 std_dev=1.947
C8	B	0, -0.312, 1.721, 3.754, 4.583 max_d=4.583 avg_d=1.721 std_dev=2.033
C5	B	0, -0.262, 1.977, 4.216, 5.128 max_d=5.128 avg_d=1.977 std_dev=2.239
N1	B	0, -0.097, 2.164, 4.424, 5.344 max_d=5.344 avg_d=2.164 std_dev=2.261
N7	B	0, -0.336, 1.966, 4.268, 5.208 max_d=5.208 avg_d=1.966 std_dev=2.302
C6	B	0, -0.228, 2.208, 4.644, 5.637 max_d=5.637 avg_d=2.208 std_dev=2.436
O6	B	0, -0.291, 2.435, 5.162, 6.274 max_d=6.274 avg_d=2.435 std_dev=2.726

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.07	0.07	0.01	0.01	0.02	0.23	0.00	0.19	0.02	0.20	0.18	0.23
C2	0.07	0.00	0.27	0.38	0.00	0.02	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.06	0.22	0.15	0.02	0.18	0.13	0.20
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.13	0.01	0.03	0.16	0.08	0.20	0.18	0.34	0.26	0.14	0.03	0.00	0.02	0.01	0.60	0.05	0.54	0.47	0.57
C3'	0.03	0.38	0.00	0.00	0.37	0.00	0.46	0.01	0.49	0.36	0.45	0.34	0.31	0.44	0.30	0.01	0.01	0.02	0.33	0.54	0.23	0.11	0.20
C4	0.04	0.00	0.13	0.37	0.00	0.10	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.11	0.11	0.13	0.01	0.16	0.16	0.19
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.19	0.30	0.10	0.05	0.04	0.31	0.15	0.31	0.02	0.00	0.01	0.26	0.04	0.21	0.04
C5	0.02	0.01	0.03	0.46	0.01	0.21	0.00	0.32	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.35	0.28	0.04	0.08	0.01	0.07	0.11	0.09
C5'	0.03	0.12	0.16	0.01	0.18	0.00	0.32	0.00	0.33	0.39	0.22	0.07	0.08	0.44	0.19	0.13	0.20	0.01	0.01	0.41	0.08	0.36	0.01
C6	0.03	0.01	0.08	0.49	0.01	0.19	0.00	0.33	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.36	0.31	0.08	0.08	0.01	0.06	0.09	0.08
C8	0.02	0.01	0.20	0.36	0.00	0.30	0.00	0.39	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.36	0.26	0.15	0.07	0.02	0.07	0.15	0.09
N1	0.05	0.01	0.18	0.45	0.01	0.10	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.20	0.16	0.10	0.01	0.11	0.10	0.14
N2	0.07	0.00	0.34	0.34	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.26	0.17	0.02	0.21	0.14	0.23
N3	0.07	0.00	0.26	0.31	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.05	0.22	0.18	0.01	0.21	0.17	0.24
N7	0.01	0.01	0.14	0.44	0.01	0.31	0.00	0.44	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.42	0.35	0.09	0.09	0.03	0.03	0.10	0.03
N9	0.01	0.01	0.03	0.30	0.01	0.15	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.22	0.07	0.01	0.14	0.01	0.16	0.18	0.20
O2'	0.02	0.16	0.00	0.01	0.23	0.31	0.35	0.13	0.36	0.36	0.27	0.07	0.11	0.42	0.22	0.00	0.10	0.28	0.27	0.40	0.22	0.37	0.30
O3'	0.23	0.06	0.02	0.01	0.11	0.02	0.28	0.20	0.31	0.26	0.20	0.06	0.05	0.35	0.07	0.10	0.00	0.14	0.09	0.40	0.11	0.37	0.06
O4'	0.00	0.22	0.01	0.02	0.11	0.00	0.04	0.01	0.08	0.15	0.16	0.26	0.22	0.09	0.01	0.28	0.14	0.00	0.08	0.04	0.05	0.08	0.07
O5'	0.19	0.15	0.60	0.33	0.13	0.01	0.08	0.01	0.08	0.07	0.10	0.17	0.18	0.09	0.14	0.27	0.09	0.08	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.54	0.01	0.26	0.01	0.41	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.40	0.40	0.04	0.10	0.00	0.06	0.10	0.05
OP1	0.20	0.18	0.54	0.23	0.16	0.04	0.07	0.08	0.06	0.07	0.11	0.21	0.21	0.03	0.16	0.22	0.11	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.13	0.47	0.11	0.16	0.21	0.11	0.36	0.09	0.15	0.10	0.14	0.17	0.10	0.18	0.37	0.37	0.08	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00
P	0.23	0.20	0.57	0.20	0.19	0.04	0.09	0.01	0.08	0.09	0.14	0.23	0.24	0.03	0.20	0.30	0.06	0.07	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.12	0.05	0.33	0.26	0.09	0.34	0.25	0.30	0.44	0.20	0.05	0.14	0.44	0.32	0.06	0.64	0.34	0.22	0.35	0.38	0.18	0.21
C2	0.15	0.14	0.35	0.58	0.15	0.17	0.21	0.21	0.20	0.31	0.14	0.20	0.12	0.32	0.19	0.29	0.86	0.29	0.16	0.25	0.36	0.15	0.18
C2'	0.50	0.29	0.19	0.06	0.45	0.33	0.54	0.31	0.50	0.65	0.38	0.17	0.31	0.64	0.52	0.15	0.30	0.60	0.34	0.55	0.24	0.38	0.36
C3'	0.08	0.29	0.05	0.07	0.07	0.05	0.06	0.05	0.06	0.24	0.20	0.45	0.24	0.20	0.09	0.06	0.18	0.12	0.03	0.05	0.20	0.11	0.13
C4	0.17	0.06	0.30	0.55	0.15	0.16	0.22	0.21	0.20	0.31	0.11	0.11	0.06	0.32	0.20	0.26	0.90	0.31	0.16	0.26	0.35	0.16	0.17
C4'	0.29	0.06	0.19	0.02	0.15	0.03	0.20	0.17	0.13	0.36	0.01	0.19	0.03	0.32	0.26	0.32	0.11	0.21	0.22	0.17	0.23	0.22	0.21
C5	0.10	0.08	0.43	0.66	0.10	0.20	0.16	0.21	0.15	0.22	0.09	0.14	0.08	0.24	0.13	0.39	1.02	0.26	0.16	0.20	0.35	0.14	0.16
C5'	0.24	0.10	0.14	0.03	0.11	0.04	0.18	0.12	0.11	0.34	0.03	0.24	0.05	0.31	0.22	0.25	0.13	0.19	0.16	0.15	0.16	0.15	0.14
C6	0.09	0.13	0.50	0.71	0.11	0.22	0.14	0.20	0.14	0.19	0.12	0.19	0.13	0.21	0.13	0.46	1.07	0.23	0.15	0.18	0.34	0.14	0.16
C8	0.13	0.05	0.32	0.56	0.12	0.17	0.20	0.21	0.18	0.25	0.10	0.09	0.04	0.27	0.16	0.30	0.94	0.26	0.17	0.24	0.34	0.15	0.17
N1	0.11	0.16	0.46	0.67	0.14	0.20	0.17	0.20	0.17	0.23	0.14	0.22	0.15	0.24	0.15	0.41	0.99	0.25	0.15	0.21	0.34	0.14	0.16
N2	0.18	0.17	0.31	0.51	0.17	0.15	0.24	0.18	0.22	0.35	0.17	0.23	0.15	0.36	0.22	0.24	0.74	0.30	0.14	0.27	0.34	0.15	0.17
N3	0.20	0.09	0.26	0.50	0.17	0.14	0.26	0.22	0.23	0.38	0.13	0.14	0.08	0.38	0.24	0.20	0.80	0.33	0.17	0.28	0.37	0.17	0.19
N7	0.08	0.06	0.44	0.66	0.08	0.21	0.14	0.21	0.13	0.19	0.07	0.13	0.06	0.21	0.11	0.41	1.04	0.23	0.17	0.19	0.35	0.15	0.17
N9	0.21	0.07	0.22	0.48	0.18	0.13	0.26	0.21	0.24	0.34	0.14	0.07	0.08	0.35	0.23	0.18	0.83	0.31	0.17	0.29	0.35	0.16	0.18
O2'	0.47	0.40	0.08	0.19	0.46	0.15	0.48	0.05	0.48	0.49	0.44	0.34	0.40	0.50	0.47	0.10	0.62	0.56	0.10	0.50	0.32	0.12	0.09
O3'	0.39	0.81	0.25	0.20	0.57	0.33	0.50	0.34	0.59	0.27	0.74	0.95	0.74	0.33	0.42	0.16	0.07	0.45	0.39	0.55	0.19	0.36	0.30
O4'	0.39	0.15	0.14	0.17	0.30	0.05	0.36	0.32	0.31	0.47	0.21	0.06	0.19	0.45	0.38	0.28	0.39	0.33	0.34	0.35	0.47	0.35	0.37
O5'	0.09	0.05	0.19	0.42	0.08	0.24	0.15	0.38	0.13	0.22	0.04	0.14	0.04	0.23	0.13	0.13	0.69	0.10	0.37	0.18	0.46	0.35	0.36
O6	0.10	0.16	0.57	0.77	0.13	0.24	0.14	0.20	0.14	0.16	0.14	0.21	0.16	0.18	0.14	0.54	1.13	0.21	0.15	0.16	0.33	0.14	0.16
OP1	0.14	0.08	0.09	0.29	0.11	0.16	0.16	0.31	0.14	0.23	0.07	0.15	0.08	0.24	0.15	0.12	0.49	0.11	0.32	0.18	0.38	0.32	0.33
OP2	0.13	0.06	0.24	0.43	0.13	0.18	0.20	0.23	0.18	0.26	0.10	0.12	0.06	0.27	0.17	0.20	0.72	0.21	0.22	0.23	0.31	0.19	0.21
P	0.10	0.05	0.19	0.42	0.08	0.24	0.15	0.37	0.13	0.22	0.04	0.14	0.04	0.23	0.13	0.13	0.68	0.12	0.37	0.18	0.45	0.36	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.09	0.06	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.08	0.03	0.32	0.12	0.06
C2	0.06	0.00	0.32	0.18	0.01	0.17	0.01	0.30	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.37	0.27	0.35	0.40	0.02	0.50	0.42	0.36
C2'	0.00	0.32	0.00	0.01	0.16	0.01	0.06	0.02	0.13	0.22	0.24	0.38	0.32	0.13	0.02	0.00	0.03	0.01	0.09	0.10	0.47	0.13	0.13
C3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.08	0.00	0.04	0.02	0.08	0.18	0.14	0.22	0.17	0.12	0.04	0.01	0.01	0.01	0.11	0.06	0.48	0.12	0.15
C4	0.03	0.01	0.16	0.08	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.18	0.10	0.18	0.25	0.01	0.43	0.28	0.22
C4'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.09	0.00	0.05	0.00	0.07	0.06	0.13	0.23	0.16	0.04	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.24	0.06	0.05
C5	0.02	0.01	0.06	0.04	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.05	0.07	0.18	0.01	0.39	0.24	0.16
C5'	0.01	0.30	0.02	0.02	0.15	0.00	0.08	0.00	0.14	0.13	0.24	0.38	0.27	0.08	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.10	0.11	0.02	0.01
C6	0.03	0.02	0.13	0.08	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.15	0.11	0.14	0.24	0.01	0.41	0.30	0.22
C8	0.02	0.01	0.22	0.18	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.22	0.20	0.14	0.03	0.30	0.16	0.10
N1	0.05	0.00	0.24	0.14	0.01	0.13	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.27	0.21	0.26	0.34	0.02	0.47	0.39	0.32
N2	0.09	0.00	0.38	0.22	0.02	0.23	0.01	0.38	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.45	0.33	0.43	0.48	0.03	0.54	0.48	0.44
N3	0.06	0.01	0.32	0.17	0.00	0.16	0.01	0.27	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.36	0.23	0.34	0.36	0.02	0.48	0.37	0.32
N7	0.02	0.01	0.13	0.12	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.15	0.11	0.09	0.03	0.32	0.16	0.08
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.12	0.03	0.37	0.17	0.10
O2'	0.03	0.37	0.00	0.01	0.18	0.02	0.08	0.02	0.15	0.17	0.27	0.45	0.36	0.10	0.02	0.00	0.07	0.04	0.07	0.11	0.42	0.11	0.09
O3'	0.03	0.27	0.03	0.01	0.10	0.02	0.05	0.02	0.11	0.22	0.21	0.33	0.23	0.15	0.05	0.07	0.00	0.02	0.16	0.09	0.47	0.11	0.13
O4'	0.00	0.35	0.01	0.01	0.18	0.00	0.07	0.01	0.14	0.20	0.26	0.43	0.34	0.11	0.02	0.04	0.02	0.00	0.11	0.09	0.17	0.13	0.06
O5'	0.08	0.40	0.09	0.11	0.25	0.01	0.18	0.00	0.24	0.14	0.34	0.48	0.36	0.09	0.12	0.07	0.16	0.11	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.10	0.06	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.11	0.09	0.09	0.19	0.00	0.37	0.25	0.17
OP1	0.32	0.50	0.47	0.48	0.43	0.24	0.39	0.11	0.41	0.30	0.47	0.54	0.48	0.32	0.37	0.42	0.47	0.17	0.00	0.37	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.42	0.13	0.12	0.28	0.06	0.24	0.02	0.30	0.16	0.39	0.48	0.37	0.16	0.17	0.11	0.11	0.13	0.01	0.25	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.36	0.13	0.15	0.22	0.05	0.16	0.01	0.22	0.10	0.32	0.44	0.32	0.08	0.10	0.09	0.13	0.06	0.01	0.17	0.00	0.00	0.00