Doublet Group distance statistics: 48537

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.006, 0.023, 0.039, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.006, 0.024, 0.042, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.018
N2	A	0, 0.029, 0.076, 0.122, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.076 std_dev=0.047
O4'	A	0, 0.033, 0.114, 0.195, 0.206 max_d=0.206 avg_d=0.114 std_dev=0.081
C2'	A	0, 0.041, 0.157, 0.273, 0.262 max_d=0.262 avg_d=0.157 std_dev=0.116
C4'	A	0, 0.049, 0.174, 0.298, 0.307 max_d=0.307 avg_d=0.174 std_dev=0.124
C3'	B	0, 0.039, 0.166, 0.293, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.166 std_dev=0.127
C3'	A	0, 0.057, 0.199, 0.340, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.199 std_dev=0.141
O3'	A	0, 0.072, 0.215, 0.357, 0.358 max_d=0.358 avg_d=0.215 std_dev=0.143
C2'	B	0, 0.098, 0.246, 0.394, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.246 std_dev=0.148
OP2	A	0, 0.081, 0.247, 0.413, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.247 std_dev=0.166
O3'	B	0, 0.086, 0.254, 0.422, 0.484 max_d=0.484 avg_d=0.254 std_dev=0.168
C4'	B	0, 0.086, 0.260, 0.433, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.260 std_dev=0.173
O2'	A	0, 0.066, 0.255, 0.445, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.255 std_dev=0.190
C8	B	0, 0.145, 0.337, 0.528, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.337 std_dev=0.191
C1'	B	0, 0.109, 0.306, 0.504, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.306 std_dev=0.197
P	B	0, 0.085, 0.285, 0.485, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.285 std_dev=0.200
N9	B	0, 0.134, 0.334, 0.535, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.334 std_dev=0.200
N7	B	0, 0.159, 0.365, 0.572, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.365 std_dev=0.206
C4	B	0, 0.158, 0.371, 0.584, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.371 std_dev=0.213
OP2	B	0, 0.098, 0.315, 0.533, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.315 std_dev=0.217
C5'	A	0, 0.078, 0.299, 0.519, 0.518 max_d=0.518 avg_d=0.299 std_dev=0.221
N3	B	0, 0.163, 0.385, 0.606, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.385 std_dev=0.221
C5	B	0, 0.166, 0.389, 0.613, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.389 std_dev=0.224
P	A	0, 0.080, 0.309, 0.538, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.309 std_dev=0.229
OP1	A	0, 0.094, 0.332, 0.569, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.332 std_dev=0.238
C2	B	0, 0.180, 0.422, 0.663, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.422 std_dev=0.242
N2	B	0, 0.187, 0.441, 0.695, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.441 std_dev=0.254
O4'	B	0, 0.091, 0.361, 0.631, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.361 std_dev=0.270
C6	B	0, 0.164, 0.436, 0.708, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.436 std_dev=0.272
O5'	A	0, 0.062, 0.339, 0.615, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.339 std_dev=0.277
N1	B	0, 0.170, 0.449, 0.729, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.449 std_dev=0.279
O2'	B	0, 0.168, 0.455, 0.742, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.455 std_dev=0.287
OP1	B	0, 0.088, 0.394, 0.700, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.394 std_dev=0.306
O6	B	0, 0.149, 0.467, 0.785, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.467 std_dev=0.318
C5'	B	0, 0.092, 0.436, 0.779, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.436 std_dev=0.344
O5'	B	0, 0.049, 0.572, 1.094, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.572 std_dev=0.522

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.08	0.02	0.10	0.02	0.04
C2	0.03	0.00	0.07	0.04	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.06	0.05	0.14	0.01	0.13	0.06	0.10
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.05	0.03	0.06	0.09	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.06	0.16	0.07	0.08
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.12	0.02	0.03
C4	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.04	0.03	0.15	0.01	0.13	0.07	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.05	0.02	0.17	0.02	0.14	0.10	0.13
C5'	0.03	0.08	0.04	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.11	0.09	0.11	0.07	0.07	0.11	0.07	0.04	0.01	0.01	0.01	0.12	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.05	0.03	0.17	0.01	0.15	0.11	0.14
C8	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.03	0.15	0.02	0.13	0.08	0.10
N1	0.02	0.00	0.06	0.03	0.01	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.05	0.05	0.17	0.01	0.15	0.09	0.13
N2	0.04	0.00	0.09	0.06	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.16	0.08	0.05	0.13	0.01	0.12	0.05	0.09
N3	0.02	0.01	0.06	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.05	0.05	0.13	0.01	0.12	0.05	0.09
N7	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01	0.17	0.03	0.14	0.11	0.14
N9	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.13	0.02	0.12	0.05	0.08
O2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.04	0.11	0.03	0.13	0.16	0.12	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.08	0.12	0.19	0.11	0.11
O3'	0.04	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.05	0.08	0.05	0.04	0.04	0.02	0.00	0.05	0.02	0.06	0.11	0.02	0.03
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.05	0.05	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.05	0.02	0.07	0.09	0.08
O5'	0.08	0.14	0.08	0.02	0.15	0.00	0.17	0.01	0.17	0.15	0.17	0.13	0.13	0.17	0.13	0.08	0.02	0.05	0.00	0.17	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.04	0.01	0.03	0.02	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.12	0.06	0.02	0.17	0.00	0.15	0.12	0.15
OP1	0.10	0.13	0.16	0.12	0.13	0.07	0.14	0.07	0.15	0.13	0.15	0.12	0.12	0.14	0.12	0.19	0.11	0.07	0.02	0.15	0.00	0.01	0.00
OP2	0.02	0.06	0.07	0.02	0.07	0.04	0.10	0.02	0.11	0.08	0.09	0.05	0.05	0.11	0.05	0.11	0.02	0.09	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.10	0.08	0.03	0.10	0.02	0.13	0.01	0.14	0.10	0.13	0.09	0.09	0.14	0.08	0.11	0.03	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.09	0.08	0.07	0.08	0.06	0.05	0.20	0.04	0.08	0.06	0.10	0.10	0.06	0.10	0.13	0.20	0.11	0.33	0.03	0.26	0.20	0.04
C2	0.17	0.17	0.05	0.05	0.17	0.20	0.17	0.17	0.16	0.18	0.16	0.17	0.17	0.17	0.18	0.08	0.08	0.28	0.44	0.16	0.13	0.08	0.06
C2'	0.15	0.07	0.16	0.16	0.08	0.12	0.07	0.23	0.05	0.11	0.05	0.08	0.09	0.09	0.11	0.22	0.26	0.09	0.24	0.05	0.30	0.20	0.03
C3'	0.15	0.05	0.16	0.15	0.06	0.15	0.05	0.30	0.02	0.09	0.02	0.06	0.07	0.07	0.09	0.25	0.26	0.09	0.20	0.03	0.26	0.25	0.01
C4	0.15	0.12	0.05	0.06	0.12	0.13	0.10	0.06	0.09	0.12	0.10	0.13	0.13	0.10	0.14	0.06	0.14	0.20	0.43	0.08	0.21	0.13	0.06
C4'	0.17	0.06	0.12	0.10	0.07	0.10	0.03	0.32	0.02	0.08	0.03	0.07	0.08	0.04	0.10	0.22	0.24	0.08	0.31	0.02	0.18	0.27	0.08
C5	0.15	0.11	0.06	0.07	0.12	0.13	0.10	0.06	0.09	0.13	0.10	0.12	0.12	0.11	0.14	0.07	0.13	0.20	0.44	0.08	0.17	0.11	0.07
C5'	0.17	0.04	0.13	0.11	0.07	0.10	0.04	0.32	0.02	0.08	0.01	0.04	0.08	0.04	0.11	0.23	0.25	0.09	0.35	0.04	0.16	0.27	0.13
C6	0.15	0.13	0.06	0.07	0.14	0.15	0.13	0.10	0.12	0.15	0.12	0.13	0.14	0.14	0.15	0.08	0.11	0.23	0.45	0.12	0.11	0.08	0.07
C8	0.14	0.08	0.08	0.08	0.08	0.07	0.05	0.13	0.04	0.09	0.05	0.10	0.09	0.06	0.10	0.11	0.19	0.13	0.40	0.02	0.22	0.15	0.06
N1	0.17	0.16	0.06	0.06	0.17	0.19	0.16	0.16	0.16	0.18	0.16	0.16	0.16	0.17	0.17	0.09	0.08	0.27	0.45	0.16	0.09	0.06	0.07
N2	0.18	0.20	0.06	0.05	0.20	0.23	0.21	0.27	0.21	0.21	0.20	0.20	0.19	0.21	0.20	0.12	0.04	0.31	0.40	0.21	0.08	0.03	0.05
N3	0.16	0.14	0.04	0.05	0.14	0.17	0.13	0.09	0.12	0.15	0.13	0.15	0.15	0.13	0.16	0.05	0.11	0.25	0.43	0.11	0.21	0.12	0.05
N7	0.15	0.10	0.07	0.08	0.10	0.10	0.08	0.07	0.07	0.11	0.08	0.11	0.11	0.09	0.12	0.09	0.17	0.17	0.44	0.05	0.18	0.13	0.07
N9	0.15	0.09	0.07	0.07	0.09	0.08	0.06	0.13	0.05	0.09	0.07	0.11	0.11	0.07	0.11	0.09	0.18	0.15	0.39	0.04	0.24	0.16	0.05
O2'	0.18	0.11	0.22	0.22	0.13	0.17	0.14	0.20	0.12	0.17	0.10	0.11	0.12	0.16	0.16	0.27	0.28	0.13	0.18	0.12	0.37	0.21	0.13
O3'	0.13	0.05	0.16	0.15	0.06	0.20	0.06	0.34	0.03	0.10	0.02	0.07	0.06	0.08	0.09	0.26	0.25	0.14	0.06	0.04	0.32	0.23	0.07
O4'	0.18	0.12	0.08	0.05	0.11	0.02	0.08	0.26	0.08	0.10	0.10	0.13	0.13	0.07	0.13	0.15	0.20	0.13	0.42	0.08	0.21	0.28	0.15
O5'	0.16	0.03	0.12	0.10	0.06	0.06	0.03	0.24	0.01	0.09	0.01	0.02	0.06	0.05	0.10	0.21	0.24	0.08	0.42	0.02	0.17	0.30	0.16
O6	0.15	0.13	0.07	0.07	0.14	0.15	0.13	0.10	0.13	0.16	0.12	0.13	0.13	0.14	0.15	0.09	0.10	0.23	0.46	0.12	0.08	0.07	0.08
OP1	0.17	0.06	0.15	0.10	0.08	0.03	0.04	0.24	0.03	0.10	0.05	0.07	0.08	0.06	0.12	0.26	0.25	0.06	0.43	0.04	0.13	0.33	0.19
OP2	0.15	0.03	0.12	0.10	0.06	0.08	0.04	0.23	0.03	0.09	0.01	0.03	0.06	0.06	0.10	0.20	0.23	0.09	0.40	0.04	0.17	0.21	0.10
P	0.16	0.02	0.12	0.10	0.06	0.08	0.04	0.26	0.03	0.09	0.02	0.01	0.05	0.06	0.10	0.22	0.23	0.09	0.41	0.05	0.13	0.26	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.21	0.01	0.09	0.42	0.05
C2	0.02	0.00	0.17	0.11	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.27	0.05	0.10	0.27	0.02	0.07	0.44	0.11
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.00	0.04	0.03	0.08	0.08	0.13	0.21	0.16	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.44	0.06	0.36	0.19	0.22
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.08	0.14	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.29	0.04	0.38	0.21	0.19
C4	0.01	0.01	0.09	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.01	0.05	0.29	0.01	0.07	0.44	0.11
C4'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.41	0.06
C5	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.02	0.03	0.32	0.01	0.12	0.40	0.12
C5'	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.08	0.38	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.01	0.04	0.32	0.00	0.14	0.39	0.13
C8	0.01	0.01	0.08	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.06	0.07	0.33	0.01	0.10	0.43	0.12
N1	0.02	0.01	0.13	0.08	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.03	0.08	0.30	0.01	0.11	0.41	0.12
N2	0.03	0.00	0.21	0.14	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.35	0.08	0.12	0.25	0.02	0.05	0.44	0.11
N3	0.02	0.00	0.16	0.10	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.25	0.03	0.10	0.25	0.01	0.05	0.45	0.10
N7	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.05	0.03	0.34	0.00	0.15	0.38	0.14
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.28	0.01	0.05	0.45	0.09
O2'	0.01	0.27	0.00	0.00	0.12	0.00	0.06	0.04	0.12	0.11	0.21	0.35	0.25	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.46	0.09	0.44	0.14	0.27
O3'	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.03	0.08	0.03	0.05	0.03	0.04	0.00	0.04	0.15	0.01	0.35	0.24	0.13
O4'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.07	0.08	0.12	0.10	0.03	0.00	0.01	0.04	0.00	0.08	0.03	0.08	0.57	0.23
O5'	0.21	0.27	0.44	0.29	0.29	0.02	0.32	0.01	0.32	0.33	0.30	0.25	0.25	0.34	0.28	0.46	0.15	0.08	0.00	0.33	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.02	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.03	0.33	0.00	0.18	0.34	0.14
OP1	0.09	0.07	0.36	0.38	0.07	0.11	0.12	0.08	0.14	0.10	0.11	0.05	0.05	0.15	0.05	0.44	0.35	0.08	0.02	0.18	0.00	0.01	0.01
OP2	0.42	0.44	0.19	0.21	0.44	0.41	0.40	0.38	0.39	0.43	0.41	0.44	0.45	0.38	0.45	0.14	0.24	0.57	0.02	0.34	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.11	0.22	0.19	0.11	0.06	0.12	0.01	0.13	0.12	0.12	0.11	0.10	0.14	0.09	0.27	0.13	0.23	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00