Doublet Group distance statistics: 48554

back

Distances from reference structure (by RMSD)

7, 17, 19, 10, 11, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.010 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.020 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.013, 0.029, 0.046, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.029 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.007, 0.025, 0.042, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.011, 0.031, 0.051, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.031 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.012, 0.034, 0.056, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.034 std_dev=0.022
C2'	A	0, 0.080, 0.144, 0.209, 0.339 max_d=0.339 avg_d=0.144 std_dev=0.064
C3'	A	0, 0.052, 0.125, 0.198, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.125 std_dev=0.073
O4'	A	0, 0.044, 0.118, 0.191, 0.368 max_d=0.368 avg_d=0.118 std_dev=0.074
O2'	A	0, 0.177, 0.285, 0.392, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.285 std_dev=0.108
C4'	A	0, 0.026, 0.136, 0.246, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.136 std_dev=0.110
O3'	A	0, 0.031, 0.156, 0.281, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.156 std_dev=0.125
OP2	B	0, 0.102, 0.237, 0.373, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.237 std_dev=0.135
P	B	0, 0.098, 0.255, 0.411, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.255 std_dev=0.157
C5'	B	0, 0.129, 0.288, 0.448, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.288 std_dev=0.159
O5'	B	0, 0.126, 0.295, 0.464, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.295 std_dev=0.169
O3'	B	0, 0.101, 0.287, 0.472, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.287 std_dev=0.186
C3'	B	0, 0.103, 0.298, 0.493, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.298 std_dev=0.195
C4'	B	0, 0.089, 0.287, 0.485, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.287 std_dev=0.198
C5'	A	0, 0.014, 0.248, 0.482, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.248 std_dev=0.234
C2'	B	0, 0.100, 0.336, 0.572, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.336 std_dev=0.236
OP1	B	0, 0.106, 0.343, 0.580, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.343 std_dev=0.237
O4'	B	0, 0.075, 0.326, 0.577, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.326 std_dev=0.251
P	A	0, 0.078, 0.331, 0.585, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.331 std_dev=0.253
O2'	B	0, 0.126, 0.380, 0.635, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.380 std_dev=0.255
C1'	B	0, 0.071, 0.343, 0.614, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.343 std_dev=0.272
N1	B	0, 0.078, 0.376, 0.673, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.376 std_dev=0.297
O5'	A	0, 0.029, 0.340, 0.650, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.340 std_dev=0.311
C4	B	0, 0.095, 0.471, 0.847, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.471 std_dev=0.376
O4	B	0, 0.107, 0.516, 0.926, 1.923 max_d=1.923 avg_d=0.516 std_dev=0.409
N3	B	0, 0.083, 0.494, 0.905, 1.924 max_d=1.924 avg_d=0.494 std_dev=0.411
C2	B	0, 0.056, 0.471, 0.886, 2.092 max_d=2.092 avg_d=0.471 std_dev=0.415
OP1	A	0, 0.036, 0.522, 1.009, 2.095 max_d=2.095 avg_d=0.522 std_dev=0.486
OP2	A	0, 0.043, 0.572, 1.100, 2.227 max_d=2.227 avg_d=0.572 std_dev=0.528
C6	B	0, -0.112, 0.432, 0.976, 3.469 max_d=3.469 avg_d=0.432 std_dev=0.544
C5	B	0, -0.121, 0.478, 1.078, 3.862 max_d=3.862 avg_d=0.478 std_dev=0.599
O2	B	0, -0.109, 0.588, 1.286, 4.222 max_d=4.222 avg_d=0.588 std_dev=0.697

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.15	0.02	0.12	0.45	0.13
C2	0.03	0.00	0.07	0.07	0.01	0.11	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.08	0.08	0.25	0.01	0.34	0.22	0.16
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.09	0.05	0.02	0.07	0.08	0.07	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.09	0.05	0.14	0.34	0.08
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.07	0.09	0.07	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.10	0.05	0.20	0.32	0.07
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.05	0.04	0.26	0.02	0.28	0.36	0.18
C4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.08	0.03	0.10	0.13	0.10	0.04	0.02	0.04	0.03	0.00	0.02	0.07	0.15	0.35	0.08
C5	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.05	0.04	0.31	0.01	0.34	0.37	0.22
C5'	0.05	0.24	0.09	0.02	0.16	0.01	0.16	0.00	0.19	0.08	0.23	0.27	0.22	0.12	0.09	0.05	0.04	0.01	0.01	0.19	0.14	0.19	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.05	0.05	0.32	0.01	0.40	0.31	0.22
C8	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.03	0.28	0.02	0.26	0.49	0.21
N1	0.03	0.00	0.07	0.07	0.02	0.10	0.01	0.23	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.12	0.07	0.07	0.29	0.01	0.39	0.24	0.20
N2	0.04	0.01	0.08	0.09	0.01	0.13	0.01	0.27	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.14	0.10	0.09	0.21	0.01	0.33	0.21	0.15
N3	0.03	0.01	0.07	0.07	0.00	0.10	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.07	0.07	0.22	0.01	0.27	0.26	0.14
N7	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.03	0.32	0.02	0.32	0.45	0.23
N9	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.24	0.02	0.22	0.44	0.18
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.08	0.04	0.08	0.05	0.10	0.05	0.12	0.14	0.11	0.06	0.04	0.00	0.06	0.02	0.08	0.10	0.16	0.35	0.08
O3'	0.07	0.08	0.02	0.01	0.05	0.03	0.05	0.04	0.05	0.07	0.07	0.10	0.07	0.06	0.06	0.06	0.00	0.07	0.12	0.05	0.24	0.37	0.10
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.07	0.09	0.07	0.03	0.01	0.02	0.07	0.00	0.15	0.05	0.11	0.48	0.14
O5'	0.15	0.25	0.09	0.10	0.26	0.02	0.31	0.01	0.32	0.28	0.29	0.21	0.22	0.32	0.24	0.08	0.12	0.15	0.00	0.34	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.02	0.07	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.05	0.05	0.34	0.00	0.43	0.32	0.24
OP1	0.12	0.34	0.14	0.20	0.28	0.15	0.34	0.14	0.40	0.26	0.39	0.33	0.27	0.32	0.22	0.16	0.24	0.11	0.02	0.43	0.00	0.01	0.01
OP2	0.45	0.22	0.34	0.32	0.36	0.35	0.37	0.19	0.31	0.49	0.24	0.21	0.26	0.45	0.44	0.35	0.37	0.48	0.02	0.32	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.16	0.08	0.07	0.18	0.08	0.22	0.02	0.22	0.21	0.20	0.15	0.14	0.23	0.18	0.08	0.10	0.14	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.28	0.10	0.10	0.17	0.10	0.43	0.12	0.41	0.11	0.23	0.57	0.12	0.13	0.18	0.12	0.14	0.12	0.09	0.09
C2	0.09	0.24	0.10	0.10	0.13	0.10	0.35	0.14	0.34	0.09	0.19	0.49	0.13	0.13	0.14	0.12	0.16	0.07	0.11	0.07
C2'	0.09	0.29	0.09	0.09	0.19	0.09	0.47	0.11	0.43	0.12	0.25	0.60	0.11	0.13	0.21	0.11	0.13	0.14	0.10	0.09
C3'	0.10	0.30	0.09	0.09	0.18	0.09	0.49	0.10	0.45	0.11	0.24	0.63	0.11	0.13	0.19	0.12	0.13	0.13	0.09	0.08
C4	0.09	0.25	0.11	0.10	0.14	0.10	0.36	0.13	0.34	0.09	0.21	0.51	0.13	0.14	0.15	0.12	0.16	0.08	0.09	0.06
C4'	0.13	0.30	0.12	0.12	0.20	0.13	0.47	0.14	0.45	0.14	0.25	0.62	0.15	0.16	0.21	0.15	0.16	0.17	0.14	0.13
C5	0.10	0.24	0.12	0.11	0.12	0.12	0.31	0.14	0.30	0.08	0.19	0.47	0.14	0.14	0.13	0.12	0.17	0.06	0.10	0.06
C5'	0.24	0.36	0.24	0.24	0.29	0.24	0.51	0.24	0.49	0.25	0.32	0.64	0.25	0.26	0.29	0.25	0.26	0.27	0.26	0.26
C6	0.11	0.22	0.13	0.12	0.11	0.12	0.27	0.16	0.26	0.09	0.18	0.42	0.15	0.14	0.12	0.13	0.18	0.08	0.11	0.07
C8	0.10	0.25	0.11	0.11	0.13	0.11	0.35	0.13	0.33	0.09	0.21	0.51	0.14	0.14	0.15	0.12	0.16	0.08	0.09	0.07
N1	0.10	0.22	0.12	0.11	0.11	0.12	0.29	0.15	0.28	0.09	0.18	0.43	0.14	0.13	0.13	0.12	0.17	0.08	0.12	0.08
N2	0.09	0.25	0.10	0.10	0.14	0.10	0.36	0.13	0.35	0.10	0.20	0.50	0.14	0.15	0.15	0.11	0.16	0.08	0.13	0.08
N3	0.09	0.26	0.10	0.10	0.15	0.10	0.39	0.13	0.37	0.10	0.21	0.53	0.13	0.14	0.16	0.12	0.15	0.08	0.09	0.07
N7	0.10	0.24	0.12	0.12	0.12	0.12	0.31	0.15	0.29	0.08	0.20	0.47	0.15	0.14	0.13	0.13	0.17	0.07	0.09	0.06
N9	0.09	0.26	0.10	0.10	0.15	0.10	0.39	0.12	0.36	0.09	0.22	0.54	0.13	0.14	0.16	0.12	0.15	0.10	0.09	0.07
O2'	0.13	0.33	0.14	0.14	0.25	0.13	0.49	0.14	0.45	0.17	0.30	0.62	0.15	0.17	0.27	0.14	0.15	0.19	0.15	0.15
O3'	0.12	0.31	0.11	0.11	0.20	0.11	0.51	0.11	0.47	0.14	0.26	0.64	0.12	0.14	0.22	0.14	0.14	0.14	0.11	0.10
O4'	0.12	0.28	0.11	0.11	0.18	0.12	0.44	0.14	0.42	0.13	0.23	0.58	0.14	0.14	0.19	0.15	0.16	0.15	0.12	0.12
O5'	0.19	0.30	0.19	0.19	0.23	0.19	0.46	0.19	0.44	0.19	0.26	0.59	0.21	0.23	0.24	0.20	0.18	0.21	0.16	0.16
O6	0.12	0.20	0.14	0.13	0.10	0.14	0.23	0.17	0.22	0.10	0.17	0.37	0.16	0.14	0.12	0.14	0.18	0.09	0.12	0.08
OP1	0.28	0.26	0.34	0.37	0.28	0.34	0.55	0.33	0.54	0.26	0.21	0.54	0.39	0.46	0.27	0.28	0.26	0.23	0.21	0.20
OP2	0.52	0.54	0.44	0.38	0.47	0.46	0.57	0.43	0.58	0.50	0.51	0.71	0.45	0.33	0.45	0.55	0.37	0.43	0.30	0.34
P	0.18	0.27	0.16	0.16	0.23	0.16	0.47	0.15	0.45	0.19	0.23	0.54	0.18	0.21	0.23	0.20	0.14	0.19	0.12	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.18	0.08	0.07
C2	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.15	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.10	0.01	0.16	0.23	0.33	0.27	0.28
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.14	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.16	0.06	0.06
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.12	0.02	0.14	0.04	0.08	0.20	0.02	0.01	0.07	0.01	0.04	0.14	0.07	0.06
C4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.02	0.21	0.20	0.17	0.17
C4'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.05	0.00	0.17	0.01	0.19	0.03	0.11	0.31	0.05	0.01	0.05	0.00	0.02	0.12	0.06	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.17	0.00	0.30	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.12	0.01	0.13	0.45	0.52	0.48	0.48
C5'	0.02	0.23	0.01	0.02	0.11	0.01	0.30	0.00	0.32	0.07	0.17	0.48	0.06	0.03	0.11	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.19	0.00	0.32	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.12	0.01	0.17	0.46	0.51	0.47	0.48
N1	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.15	0.19	0.12	0.11
N3	0.02	0.00	0.06	0.08	0.00	0.11	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.01	0.10	0.18	0.26	0.22	0.22
O2	0.03	0.01	0.14	0.20	0.01	0.31	0.02	0.48	0.02	0.02	0.01	0.00	0.21	0.18	0.02	0.30	0.51	0.68	0.61	0.63
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.03	0.05	0.08	0.06	0.10	0.01	0.09	0.21	0.00	0.03	0.04	0.04	0.04	0.15	0.07	0.06
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.08	0.01	0.12	0.03	0.12	0.04	0.09	0.18	0.03	0.00	0.09	0.01	0.08	0.12	0.10	0.08
O4	0.02	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.00	0.02	0.21	0.19	0.17	0.17
O4'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.02	0.00	0.13	0.01	0.17	0.01	0.10	0.30	0.04	0.01	0.02	0.00	0.07	0.17	0.09	0.08
O5'	0.08	0.23	0.04	0.04	0.21	0.02	0.45	0.01	0.46	0.15	0.18	0.51	0.04	0.08	0.21	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.18	0.33	0.16	0.14	0.20	0.12	0.52	0.08	0.51	0.19	0.26	0.68	0.15	0.12	0.19	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.27	0.06	0.07	0.17	0.06	0.48	0.07	0.47	0.12	0.22	0.61	0.07	0.10	0.17	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.28	0.06	0.06	0.17	0.04	0.48	0.02	0.48	0.11	0.22	0.63	0.06	0.08	0.17	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00