Doublet Group distance statistics: 48557

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 9, 7, 8, 4, 7, 6, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.011, 0.017, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.012, 0.018, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.008, 0.016, 0.023, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.012, 0.020, 0.028, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.020 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.012, 0.020, 0.029, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.016, 0.026, 0.035, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.026 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.018, 0.028, 0.038, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.028 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.021, 0.035, 0.048, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.035 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.015, 0.031, 0.046, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.031 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.016, 0.034, 0.051, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.034 std_dev=0.018
N2	A	0, 0.040, 0.059, 0.077, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.059 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.020, 0.040, 0.060, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.040 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.038, 0.070, 0.103, 0.178 max_d=0.178 avg_d=0.070 std_dev=0.033
C3'	A	0, 0.062, 0.111, 0.161, 0.212 max_d=0.212 avg_d=0.111 std_dev=0.050
C2'	A	0, 0.045, 0.104, 0.163, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.104 std_dev=0.059
O3'	A	0, 0.080, 0.141, 0.202, 0.315 max_d=0.315 avg_d=0.141 std_dev=0.061
C4'	A	0, 0.033, 0.103, 0.173, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.103 std_dev=0.070
O2'	A	0, 0.038, 0.164, 0.290, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.164 std_dev=0.126
C5'	A	0, 0.031, 0.159, 0.288, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.159 std_dev=0.128
C5'	B	0, 0.185, 0.315, 0.444, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.315 std_dev=0.130
O3'	B	0, 0.161, 0.299, 0.437, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.299 std_dev=0.138
C4'	B	0, 0.161, 0.301, 0.441, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.301 std_dev=0.140
O4'	B	0, 0.215, 0.362, 0.508, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.362 std_dev=0.146
C3'	B	0, 0.192, 0.345, 0.498, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.345 std_dev=0.153
O5'	B	0, 0.248, 0.413, 0.578, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.413 std_dev=0.165
C2'	B	0, 0.252, 0.430, 0.607, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.430 std_dev=0.178
O2'	B	0, 0.298, 0.480, 0.662, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.480 std_dev=0.182
O5'	A	0, 0.013, 0.202, 0.390, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.202 std_dev=0.188
C1'	B	0, 0.234, 0.431, 0.628, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.431 std_dev=0.197
P	B	0, 0.264, 0.486, 0.708, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.486 std_dev=0.222
C6	B	0, 0.496, 0.718, 0.941, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.718 std_dev=0.222
N1	B	0, 0.348, 0.573, 0.798, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.573 std_dev=0.225
C5	B	0, 0.613, 0.873, 1.134, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.873 std_dev=0.261
P	A	0, 0.022, 0.295, 0.567, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.295 std_dev=0.272
OP2	B	0, 0.294, 0.568, 0.842, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.568 std_dev=0.274
C4	B	0, 0.614, 0.892, 1.170, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.892 std_dev=0.278
C2	B	0, 0.447, 0.730, 1.013, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.730 std_dev=0.283
OP1	B	0, 0.463, 0.747, 1.030, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.747 std_dev=0.283
N3	B	0, 0.560, 0.851, 1.142, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.851 std_dev=0.291
OP1	A	0, 0.068, 0.368, 0.669, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.368 std_dev=0.300
OP2	A	0, 0.052, 0.355, 0.658, 1.651 max_d=1.651 avg_d=0.355 std_dev=0.303
O4	B	0, 0.730, 1.036, 1.341, 1.608 max_d=1.608 avg_d=1.036 std_dev=0.306
O2	B	0, 0.496, 0.865, 1.233, 1.743 max_d=1.743 avg_d=0.865 std_dev=0.369

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.07	0.02	0.10	0.06	0.08
C2	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.09	0.03	0.11	0.01	0.20	0.10	0.13
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.08	0.06	0.07
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.03	0.04	0.07	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.02	0.13	0.01	0.20	0.13	0.15
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.16	0.01	0.24	0.18	0.19
C5'	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.08	0.05	0.04	0.03	0.08	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.07	0.02	0.04	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.17	0.00	0.26	0.19	0.20
C8	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.02	0.17	0.01	0.23	0.19	0.20
N1	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.14	0.00	0.23	0.15	0.17
N2	0.03	0.00	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.04	0.10	0.01	0.18	0.08	0.11
N3	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.09	0.03	0.10	0.01	0.17	0.09	0.11
N7	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.02	0.19	0.01	0.27	0.22	0.22
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.13	0.01	0.18	0.12	0.14
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.05	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.07	0.11	0.09	0.03	0.02	0.00	0.06	0.01	0.06	0.05	0.10	0.07	0.08
O3'	0.06	0.09	0.03	0.01	0.07	0.01	0.07	0.03	0.08	0.05	0.09	0.10	0.09	0.06	0.06	0.06	0.00	0.05	0.06	0.08	0.04	0.10	0.06
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00	0.07	0.02	0.08	0.06	0.06
O5'	0.07	0.11	0.05	0.05	0.13	0.01	0.16	0.00	0.17	0.17	0.14	0.10	0.10	0.19	0.13	0.06	0.06	0.07	0.00	0.18	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.18	0.00	0.29	0.22	0.22
OP1	0.10	0.20	0.08	0.04	0.20	0.02	0.24	0.02	0.26	0.23	0.23	0.18	0.17	0.27	0.18	0.10	0.04	0.08	0.01	0.29	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.10	0.06	0.07	0.13	0.04	0.18	0.04	0.19	0.19	0.15	0.08	0.09	0.22	0.12	0.07	0.10	0.06	0.02	0.22	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.13	0.07	0.05	0.15	0.01	0.19	0.01	0.20	0.20	0.17	0.11	0.11	0.22	0.14	0.08	0.06	0.06	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.16	0.14	0.09	0.14	0.09	0.21	0.07	0.20	0.14	0.14	0.24	0.24	0.08	0.14	0.14	0.12	0.11	0.07	0.07
C2	0.15	0.17	0.14	0.12	0.15	0.12	0.25	0.09	0.24	0.14	0.14	0.26	0.20	0.11	0.15	0.14	0.10	0.10	0.15	0.11
C2'	0.13	0.16	0.13	0.09	0.15	0.09	0.21	0.08	0.20	0.13	0.14	0.23	0.24	0.08	0.15	0.14	0.14	0.14	0.08	0.10
C3'	0.15	0.16	0.15	0.10	0.15	0.11	0.20	0.09	0.19	0.15	0.15	0.22	0.25	0.09	0.15	0.15	0.13	0.15	0.07	0.09
C4	0.14	0.17	0.14	0.09	0.14	0.09	0.24	0.07	0.23	0.13	0.14	0.27	0.23	0.08	0.15	0.12	0.11	0.07	0.11	0.07
C4'	0.16	0.17	0.17	0.11	0.15	0.11	0.19	0.09	0.19	0.16	0.15	0.23	0.28	0.09	0.15	0.17	0.12	0.14	0.08	0.09
C5	0.14	0.18	0.14	0.09	0.15	0.08	0.26	0.07	0.24	0.13	0.15	0.30	0.22	0.08	0.16	0.12	0.11	0.07	0.14	0.08
C5'	0.18	0.18	0.20	0.12	0.16	0.12	0.20	0.09	0.20	0.17	0.16	0.25	0.31	0.10	0.15	0.19	0.11	0.15	0.08	0.09
C6	0.14	0.18	0.13	0.10	0.17	0.09	0.29	0.08	0.26	0.13	0.15	0.31	0.20	0.09	0.18	0.11	0.11	0.09	0.17	0.10
C8	0.15	0.18	0.15	0.09	0.15	0.08	0.24	0.07	0.23	0.14	0.15	0.30	0.25	0.08	0.15	0.14	0.12	0.08	0.10	0.06
N1	0.15	0.18	0.14	0.11	0.16	0.11	0.28	0.09	0.26	0.14	0.15	0.29	0.20	0.10	0.17	0.12	0.10	0.11	0.18	0.12
N2	0.18	0.18	0.16	0.14	0.15	0.15	0.24	0.12	0.23	0.16	0.16	0.24	0.20	0.14	0.15	0.18	0.10	0.13	0.18	0.14
N3	0.14	0.16	0.14	0.10	0.14	0.11	0.22	0.07	0.22	0.13	0.13	0.24	0.22	0.10	0.14	0.13	0.10	0.07	0.11	0.07
N7	0.14	0.19	0.14	0.09	0.16	0.08	0.26	0.07	0.24	0.14	0.15	0.32	0.23	0.07	0.17	0.13	0.11	0.07	0.12	0.07
N9	0.14	0.17	0.14	0.09	0.14	0.08	0.23	0.07	0.22	0.13	0.14	0.27	0.24	0.08	0.14	0.14	0.12	0.08	0.09	0.06
O2'	0.14	0.16	0.13	0.11	0.17	0.12	0.23	0.12	0.21	0.15	0.15	0.23	0.22	0.11	0.17	0.14	0.18	0.17	0.12	0.14
O3'	0.16	0.18	0.16	0.12	0.19	0.14	0.21	0.11	0.21	0.17	0.18	0.21	0.25	0.11	0.19	0.17	0.13	0.16	0.07	0.10
O4'	0.17	0.18	0.18	0.11	0.15	0.11	0.20	0.08	0.20	0.16	0.16	0.25	0.29	0.09	0.14	0.18	0.11	0.12	0.07	0.07
O5'	0.18	0.20	0.18	0.11	0.18	0.12	0.23	0.10	0.22	0.18	0.18	0.27	0.28	0.09	0.18	0.19	0.15	0.14	0.08	0.09
O6	0.13	0.19	0.13	0.11	0.19	0.09	0.30	0.09	0.26	0.14	0.17	0.33	0.19	0.09	0.21	0.11	0.11	0.10	0.18	0.11
OP1	0.18	0.22	0.18	0.11	0.22	0.12	0.27	0.13	0.25	0.19	0.21	0.30	0.28	0.09	0.23	0.20	0.19	0.15	0.12	0.12
OP2	0.17	0.18	0.19	0.12	0.16	0.11	0.20	0.09	0.20	0.16	0.17	0.26	0.30	0.11	0.16	0.18	0.12	0.14	0.08	0.08
P	0.17	0.19	0.18	0.11	0.18	0.11	0.23	0.10	0.22	0.17	0.18	0.27	0.29	0.09	0.18	0.18	0.14	0.13	0.08	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.12	0.06	0.05
C2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.07	0.01	0.04	0.11	0.15	0.14	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.05	0.13	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.16	0.11	0.08
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.13	0.00	0.16	0.01	0.15	0.07	0.09	0.10	0.01	0.01	0.13	0.01	0.05	0.15	0.08	0.06
C4	0.01	0.00	0.05	0.13	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.00	0.02	0.18	0.25	0.23	0.22
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.02	0.05	0.02	0.07	0.00	0.02	0.10	0.03	0.03
C5	0.01	0.00	0.08	0.16	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.01	0.03	0.18	0.26	0.22	0.22
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.13	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.09	0.05	0.05	0.02	0.14	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.15	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.04	0.15	0.20	0.14	0.16
N1	0.00	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.01	0.10	0.14	0.10	0.10
N3	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.08	0.00	0.03	0.14	0.20	0.19	0.17
O2	0.01	0.00	0.13	0.10	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.12	0.01	0.06	0.08	0.15	0.12	0.10
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.05	0.05	0.05	0.06	0.03	0.08	0.16	0.00	0.04	0.05	0.05	0.05	0.14	0.08	0.05
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.13	0.02	0.17	0.02	0.16	0.06	0.08	0.12	0.04	0.00	0.14	0.02	0.06	0.13	0.07	0.05
O4	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.00	0.02	0.19	0.29	0.27	0.25
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.06	0.05	0.02	0.02	0.00	0.05	0.10	0.07	0.05
O5'	0.03	0.11	0.04	0.05	0.18	0.02	0.18	0.01	0.15	0.10	0.14	0.08	0.05	0.06	0.19	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	0.15	0.16	0.15	0.25	0.10	0.26	0.07	0.20	0.14	0.20	0.15	0.14	0.13	0.29	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.14	0.11	0.08	0.23	0.03	0.22	0.02	0.14	0.10	0.19	0.12	0.08	0.07	0.27	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.12	0.08	0.06	0.22	0.03	0.22	0.01	0.16	0.10	0.17	0.10	0.05	0.05	0.25	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00