Doublet Group distance statistics: 48559

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 1, 3, 1, 4, 3, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.010, 0.020, 0.031, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.009, 0.022, 0.034, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.015, 0.029, 0.043, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.029 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.026 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.009, 0.027, 0.046, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.027 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.010, 0.030, 0.049, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.030 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.022, 0.044, 0.067, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.044 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.011, 0.035, 0.058, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.035 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.010, 0.034, 0.058, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.034 std_dev=0.024
N2	A	0, 0.017, 0.047, 0.077, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.047 std_dev=0.030
C2'	A	0, 0.053, 0.107, 0.160, 0.193 max_d=0.193 avg_d=0.107 std_dev=0.053
O4'	A	0, 0.029, 0.086, 0.144, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.086 std_dev=0.058
C3'	A	0, 0.113, 0.216, 0.318, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.216 std_dev=0.103
C4'	A	0, 0.060, 0.163, 0.265, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.163 std_dev=0.103
O2'	A	0, 0.086, 0.217, 0.349, 0.524 max_d=0.524 avg_d=0.217 std_dev=0.132
C5'	A	0, 0.123, 0.267, 0.410, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.267 std_dev=0.143
OP1	B	0, 0.283, 0.514, 0.746, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.514 std_dev=0.231
O3'	A	0, 0.187, 0.436, 0.685, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.436 std_dev=0.249
P	B	0, 0.313, 0.567, 0.820, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.567 std_dev=0.254
O5'	B	0, 0.381, 0.657, 0.934, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.657 std_dev=0.277
OP2	B	0, 0.318, 0.645, 0.971, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.645 std_dev=0.326
C5'	B	0, 0.273, 0.624, 0.976, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.624 std_dev=0.351
O4'	B	0, 0.332, 0.684, 1.036, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.684 std_dev=0.352
C4'	B	0, 0.330, 0.700, 1.070, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.700 std_dev=0.370
C1'	B	0, 0.438, 0.840, 1.242, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.840 std_dev=0.402
N1	B	0, 0.488, 0.926, 1.365, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.926 std_dev=0.438
C6	B	0, 0.517, 0.957, 1.397, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.957 std_dev=0.440
C3'	B	0, 0.537, 0.992, 1.447, 1.928 max_d=1.928 avg_d=0.992 std_dev=0.455
C2'	B	0, 0.555, 1.012, 1.470, 2.034 max_d=2.034 avg_d=1.012 std_dev=0.457
O2'	B	0, 0.584, 1.063, 1.543, 2.162 max_d=2.162 avg_d=1.063 std_dev=0.480
C2	B	0, 0.591, 1.079, 1.567, 1.923 max_d=1.923 avg_d=1.079 std_dev=0.488
C5	B	0, 0.607, 1.104, 1.601, 1.785 max_d=1.785 avg_d=1.104 std_dev=0.497
C4	B	0, 0.691, 1.212, 1.734, 2.050 max_d=2.050 avg_d=1.212 std_dev=0.522
O2	B	0, 0.645, 1.175, 1.706, 2.108 max_d=2.108 avg_d=1.175 std_dev=0.531
O5'	A	0, -0.062, 0.473, 1.008, 2.584 max_d=2.584 avg_d=0.473 std_dev=0.535
N3	B	0, 0.643, 1.182, 1.721, 2.152 max_d=2.152 avg_d=1.182 std_dev=0.539
O3'	B	0, 0.693, 1.246, 1.800, 2.420 max_d=2.420 avg_d=1.246 std_dev=0.553
O4	B	0, 0.790, 1.364, 1.937, 2.334 max_d=2.334 avg_d=1.364 std_dev=0.573
P	A	0, 0.215, 0.836, 1.456, 3.115 max_d=3.115 avg_d=0.836 std_dev=0.621
OP2	A	0, 0.498, 1.149, 1.800, 3.327 max_d=3.327 avg_d=1.149 std_dev=0.651
OP1	A	0, 0.227, 0.895, 1.564, 3.353 max_d=3.353 avg_d=0.895 std_dev=0.669

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.07	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.11	0.02	0.10	0.21	0.06
C2	0.06	0.00	0.10	0.12	0.02	0.07	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.12	0.14	0.04	0.21	0.02	0.16	0.12	0.11
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.07	0.04	0.09	0.12	0.09	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.15	0.07	0.21	0.11	0.08
C3'	0.02	0.12	0.01	0.00	0.10	0.01	0.12	0.02	0.13	0.11	0.13	0.13	0.11	0.12	0.08	0.03	0.01	0.02	0.21	0.13	0.28	0.10	0.15
C4	0.02	0.02	0.06	0.10	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.02	0.24	0.02	0.16	0.11	0.11
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.06	0.08	0.06	0.07	0.03	0.09	0.02	0.01	0.01	0.06	0.11	0.21	0.04
C5	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.15	0.04	0.33	0.02	0.22	0.13	0.19
C5'	0.01	0.06	0.02	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.08	0.09	0.07	0.07	0.06	0.11	0.04	0.09	0.04	0.02	0.01	0.10	0.13	0.21	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.17	0.03	0.34	0.01	0.24	0.17	0.22
C8	0.03	0.03	0.04	0.11	0.01	0.07	0.01	0.09	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.12	0.06	0.34	0.03	0.19	0.10	0.16
N1	0.04	0.01	0.09	0.13	0.02	0.06	0.02	0.07	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.10	0.16	0.03	0.28	0.01	0.21	0.14	0.17
N2	0.07	0.01	0.12	0.13	0.02	0.08	0.02	0.07	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.15	0.16	0.06	0.18	0.03	0.15	0.12	0.09
N3	0.06	0.01	0.09	0.11	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.10	0.11	0.04	0.18	0.02	0.13	0.12	0.07
N7	0.02	0.03	0.04	0.12	0.01	0.07	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.16	0.06	0.39	0.03	0.24	0.15	0.24
N9	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.23	0.02	0.14	0.13	0.08
O2'	0.02	0.12	0.01	0.03	0.05	0.09	0.04	0.09	0.07	0.04	0.10	0.15	0.10	0.03	0.02	0.00	0.07	0.06	0.07	0.07	0.15	0.17	0.07
O3'	0.02	0.14	0.03	0.01	0.11	0.02	0.15	0.04	0.17	0.12	0.16	0.16	0.11	0.16	0.08	0.07	0.00	0.02	0.23	0.18	0.35	0.17	0.22
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.06	0.03	0.06	0.04	0.06	0.02	0.06	0.02	0.00	0.11	0.05	0.10	0.31	0.14
O5'	0.11	0.21	0.15	0.21	0.24	0.01	0.33	0.01	0.34	0.34	0.28	0.18	0.18	0.39	0.23	0.07	0.23	0.11	0.00	0.39	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.13	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.07	0.18	0.05	0.39	0.00	0.28	0.23	0.28
OP1	0.10	0.16	0.21	0.28	0.16	0.11	0.22	0.13	0.24	0.19	0.21	0.15	0.13	0.24	0.14	0.15	0.35	0.10	0.01	0.28	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.12	0.11	0.10	0.11	0.21	0.13	0.21	0.17	0.10	0.14	0.12	0.12	0.15	0.13	0.17	0.17	0.31	0.02	0.23	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.11	0.08	0.15	0.11	0.04	0.19	0.01	0.22	0.16	0.17	0.09	0.07	0.24	0.08	0.07	0.22	0.14	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.24	0.33	0.39	0.30	0.27	0.30	0.30	0.27	0.24	0.27	0.23	0.33	0.50	0.32	0.20	0.13	0.17	0.21	0.16
C2	0.18	0.21	0.24	0.32	0.28	0.26	0.30	0.35	0.26	0.21	0.24	0.22	0.21	0.39	0.31	0.18	0.15	0.17	0.15	0.14
C2'	0.20	0.24	0.31	0.37	0.31	0.25	0.31	0.27	0.27	0.23	0.27	0.23	0.31	0.49	0.34	0.18	0.14	0.17	0.23	0.17
C3'	0.20	0.24	0.31	0.37	0.31	0.25	0.31	0.27	0.26	0.23	0.27	0.22	0.32	0.49	0.35	0.18	0.15	0.17	0.24	0.17
C4	0.20	0.22	0.28	0.37	0.28	0.28	0.30	0.35	0.26	0.22	0.25	0.22	0.27	0.46	0.31	0.20	0.12	0.15	0.17	0.13
C4'	0.21	0.24	0.32	0.38	0.30	0.26	0.30	0.26	0.26	0.24	0.27	0.24	0.34	0.49	0.33	0.19	0.14	0.18	0.24	0.18
C5	0.19	0.21	0.27	0.35	0.28	0.29	0.31	0.37	0.27	0.22	0.24	0.22	0.25	0.45	0.32	0.20	0.14	0.15	0.17	0.13
C5'	0.22	0.24	0.33	0.38	0.30	0.26	0.30	0.27	0.26	0.24	0.27	0.23	0.34	0.50	0.33	0.19	0.13	0.17	0.24	0.17
C6	0.18	0.21	0.23	0.33	0.29	0.28	0.32	0.38	0.28	0.21	0.24	0.23	0.22	0.41	0.32	0.20	0.17	0.17	0.15	0.14
C8	0.21	0.22	0.31	0.39	0.29	0.30	0.30	0.35	0.26	0.23	0.25	0.22	0.30	0.50	0.31	0.21	0.12	0.16	0.20	0.14
N1	0.17	0.21	0.22	0.31	0.29	0.27	0.32	0.37	0.28	0.21	0.24	0.23	0.19	0.38	0.32	0.19	0.18	0.17	0.15	0.14
N2	0.17	0.21	0.21	0.29	0.28	0.23	0.30	0.34	0.26	0.21	0.24	0.23	0.19	0.35	0.31	0.18	0.16	0.19	0.15	0.15
N3	0.19	0.22	0.27	0.35	0.28	0.27	0.29	0.34	0.26	0.22	0.24	0.22	0.26	0.44	0.31	0.19	0.12	0.15	0.16	0.13
N7	0.20	0.21	0.28	0.37	0.28	0.30	0.30	0.37	0.27	0.22	0.24	0.22	0.28	0.47	0.32	0.21	0.13	0.15	0.18	0.13
N9	0.21	0.23	0.31	0.39	0.29	0.29	0.30	0.34	0.26	0.23	0.25	0.23	0.31	0.49	0.32	0.20	0.11	0.16	0.20	0.15
O2'	0.20	0.26	0.31	0.36	0.33	0.23	0.33	0.23	0.28	0.24	0.30	0.24	0.30	0.47	0.36	0.18	0.13	0.16	0.24	0.17
O3'	0.20	0.24	0.30	0.36	0.32	0.24	0.31	0.25	0.25	0.23	0.28	0.23	0.30	0.47	0.36	0.18	0.16	0.19	0.27	0.19
O4'	0.23	0.25	0.34	0.39	0.30	0.28	0.31	0.29	0.27	0.25	0.27	0.24	0.35	0.51	0.33	0.21	0.13	0.17	0.22	0.17
O5'	0.21	0.22	0.33	0.39	0.26	0.27	0.27	0.31	0.24	0.22	0.24	0.23	0.34	0.53	0.29	0.21	0.11	0.14	0.22	0.16
O6	0.18	0.21	0.22	0.31	0.30	0.28	0.34	0.38	0.29	0.21	0.24	0.24	0.21	0.39	0.34	0.21	0.20	0.17	0.16	0.15
OP1	0.21	0.22	0.34	0.40	0.27	0.28	0.27	0.30	0.23	0.22	0.24	0.22	0.37	0.55	0.30	0.19	0.10	0.15	0.26	0.18
OP2	0.29	0.28	0.44	0.52	0.31	0.40	0.32	0.40	0.31	0.29	0.29	0.27	0.46	0.67	0.33	0.26	0.19	0.24	0.23	0.17
P	0.24	0.24	0.39	0.46	0.28	0.33	0.29	0.33	0.26	0.24	0.26	0.24	0.42	0.61	0.31	0.21	0.12	0.16	0.21	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.01	0.10	0.11	0.10	0.07
C2	0.03	0.00	0.10	0.10	0.02	0.03	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.11	0.02	0.04	0.22	0.22	0.19	0.19
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.03	0.07	0.03	0.08	0.02	0.08	0.17	0.00	0.03	0.07	0.01	0.13	0.19	0.14	0.12
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.08	0.01	0.11	0.02	0.12	0.04	0.09	0.15	0.02	0.01	0.08	0.02	0.19	0.25	0.19	0.18
C4	0.02	0.02	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.10	0.01	0.03	0.33	0.33	0.33	0.32
C4'	0.02	0.03	0.03	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.03	0.04	0.06	0.08	0.03	0.07	0.01	0.02	0.09	0.15	0.03
C5	0.02	0.02	0.07	0.11	0.00	0.09	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.13	0.01	0.04	0.34	0.33	0.31	0.32
C5'	0.02	0.07	0.03	0.02	0.17	0.01	0.19	0.00	0.16	0.09	0.12	0.04	0.09	0.06	0.19	0.01	0.01	0.11	0.20	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.14	0.01	0.05	0.30	0.27	0.21	0.24
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.01	0.22	0.21	0.15	0.17
N3	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.02	0.12	0.12	0.02	0.03	0.28	0.28	0.27	0.26
O2	0.04	0.01	0.17	0.15	0.02	0.06	0.03	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.21	0.19	0.03	0.06	0.18	0.18	0.17	0.16
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.08	0.08	0.06	0.09	0.06	0.04	0.12	0.21	0.00	0.06	0.10	0.05	0.09	0.16	0.15	0.10
O3'	0.03	0.11	0.03	0.01	0.10	0.03	0.13	0.06	0.14	0.05	0.12	0.19	0.06	0.00	0.11	0.03	0.19	0.32	0.28	0.24
O4	0.03	0.02	0.07	0.08	0.01	0.07	0.01	0.19	0.01	0.02	0.02	0.03	0.10	0.11	0.00	0.03	0.35	0.37	0.38	0.35
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.06	0.05	0.03	0.03	0.00	0.09	0.09	0.18	0.11
O5'	0.10	0.22	0.13	0.19	0.33	0.02	0.34	0.01	0.30	0.22	0.28	0.18	0.09	0.19	0.35	0.09	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.11	0.22	0.19	0.25	0.33	0.09	0.33	0.11	0.27	0.21	0.28	0.18	0.16	0.32	0.37	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.19	0.14	0.19	0.33	0.15	0.31	0.20	0.21	0.15	0.27	0.17	0.15	0.28	0.38	0.18	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.19	0.12	0.18	0.32	0.03	0.32	0.02	0.24	0.17	0.26	0.16	0.10	0.24	0.35	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00