Doublet Group distance statistics: 48560

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 2, 1, 4, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.009, 0.013, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.006
N9	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.006, 0.015, 0.025, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.010
O6	A	0, 0.013, 0.025, 0.036, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.009, 0.023, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N2	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.023 std_dev=0.014
O4'	A	0, 0.023, 0.094, 0.164, 0.229 max_d=0.229 avg_d=0.094 std_dev=0.071
C2'	A	0, 0.026, 0.101, 0.176, 0.248 max_d=0.248 avg_d=0.101 std_dev=0.075
C4'	A	0, 0.059, 0.163, 0.268, 0.334 max_d=0.334 avg_d=0.163 std_dev=0.104
C3'	A	0, 0.067, 0.179, 0.291, 0.329 max_d=0.329 avg_d=0.179 std_dev=0.112
O2'	A	0, 0.077, 0.192, 0.308, 0.380 max_d=0.380 avg_d=0.192 std_dev=0.115
C2	B	0, 0.138, 0.259, 0.380, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.259 std_dev=0.121
C4	B	0, 0.109, 0.240, 0.371, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.240 std_dev=0.131
N3	B	0, 0.130, 0.266, 0.403, 0.477 max_d=0.477 avg_d=0.266 std_dev=0.137
C5	B	0, 0.136, 0.277, 0.419, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.277 std_dev=0.141
O5'	A	0, 0.136, 0.278, 0.419, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.278 std_dev=0.141
N1	B	0, 0.109, 0.251, 0.394, 0.521 max_d=0.521 avg_d=0.251 std_dev=0.142
C6	B	0, 0.158, 0.307, 0.457, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.307 std_dev=0.149
O2	B	0, 0.172, 0.323, 0.475, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.323 std_dev=0.152
O4'	B	0, 0.161, 0.313, 0.465, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.313 std_dev=0.152
O4	B	0, 0.116, 0.273, 0.431, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.273 std_dev=0.158
C1'	B	0, 0.148, 0.311, 0.473, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.311 std_dev=0.162
C5'	A	0, 0.105, 0.273, 0.442, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.273 std_dev=0.169
O3'	A	0, 0.099, 0.275, 0.452, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.275 std_dev=0.177
O3'	B	0, 0.203, 0.383, 0.563, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.383 std_dev=0.180
C4'	B	0, 0.124, 0.313, 0.503, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.313 std_dev=0.190
O5'	B	0, 0.188, 0.388, 0.588, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.388 std_dev=0.200
C5'	B	0, 0.147, 0.348, 0.550, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.348 std_dev=0.201
C3'	B	0, 0.144, 0.349, 0.555, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.349 std_dev=0.205
C2'	B	0, 0.130, 0.337, 0.543, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.337 std_dev=0.206
P	A	0, 0.140, 0.356, 0.572, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.356 std_dev=0.216
P	B	0, 0.179, 0.408, 0.637, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.408 std_dev=0.229
O2'	B	0, 0.140, 0.376, 0.613, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.376 std_dev=0.237
OP2	A	0, 0.167, 0.422, 0.677, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.422 std_dev=0.255
OP1	A	0, 0.151, 0.443, 0.734, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.443 std_dev=0.291
OP2	B	0, 0.283, 0.637, 0.992, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.637 std_dev=0.355
OP1	B	0, 0.177, 0.575, 0.972, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.575 std_dev=0.398

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.06	0.07	0.06
C2	0.02	0.00	0.05	0.09	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.02	0.14	0.01	0.15	0.22	0.17
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.07	0.06	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.05	0.04
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.07	0.09	0.10	0.09	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.10	0.12	0.07	0.07
C4	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.07	0.01	0.14	0.01	0.14	0.20	0.17
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.05	0.04	0.04	0.03	0.05	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.06	0.07	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.01	0.17	0.01	0.19	0.26	0.21
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.10	0.09	0.07	0.06	0.11	0.07	0.06	0.03	0.01	0.01	0.12	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.17	0.00	0.22	0.29	0.23
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.08	0.03	0.15	0.02	0.16	0.20	0.18
N1	0.02	0.00	0.04	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.01	0.16	0.00	0.19	0.26	0.21
N2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.02	0.13	0.01	0.14	0.21	0.16
N3	0.02	0.00	0.06	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.09	0.02	0.12	0.01	0.12	0.18	0.15
N7	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.18	0.02	0.21	0.27	0.23
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.12	0.01	0.11	0.15	0.14
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.07	0.06	0.06	0.06	0.08	0.03	0.10	0.12	0.10	0.05	0.03	0.00	0.03	0.05	0.04	0.08	0.09	0.04	0.04
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.07	0.02	0.09	0.03	0.10	0.08	0.10	0.12	0.09	0.09	0.05	0.03	0.00	0.02	0.08	0.12	0.18	0.13	0.12
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.02	0.05	0.08	0.06
O5'	0.05	0.14	0.02	0.04	0.14	0.01	0.17	0.01	0.17	0.15	0.16	0.13	0.12	0.18	0.12	0.04	0.08	0.04	0.00	0.19	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.02	0.10	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.12	0.02	0.19	0.00	0.25	0.32	0.26
OP1	0.06	0.15	0.11	0.12	0.14	0.07	0.19	0.05	0.22	0.16	0.19	0.14	0.12	0.21	0.11	0.09	0.18	0.05	0.02	0.25	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.22	0.05	0.07	0.20	0.02	0.26	0.01	0.29	0.20	0.26	0.21	0.18	0.27	0.15	0.04	0.13	0.08	0.01	0.32	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.17	0.04	0.07	0.17	0.01	0.21	0.01	0.23	0.18	0.21	0.16	0.15	0.23	0.14	0.04	0.12	0.06	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.14	0.11	0.13	0.12	0.11	0.12	0.10	0.12	0.09	0.15	0.23	0.12	0.20	0.13	0.09	0.12	0.24	0.29	0.18
C2	0.09	0.17	0.08	0.08	0.12	0.09	0.11	0.09	0.11	0.08	0.18	0.22	0.08	0.12	0.15	0.09	0.13	0.32	0.18	0.14
C2'	0.16	0.21	0.17	0.19	0.15	0.17	0.15	0.13	0.15	0.16	0.19	0.29	0.16	0.25	0.14	0.15	0.13	0.25	0.27	0.19
C3'	0.14	0.18	0.15	0.18	0.16	0.16	0.18	0.15	0.17	0.14	0.17	0.25	0.14	0.23	0.16	0.14	0.15	0.27	0.26	0.21
C4	0.09	0.14	0.08	0.10	0.10	0.09	0.13	0.09	0.12	0.08	0.15	0.23	0.09	0.15	0.11	0.09	0.13	0.25	0.22	0.16
C4'	0.08	0.12	0.09	0.12	0.11	0.09	0.13	0.08	0.11	0.08	0.12	0.21	0.12	0.18	0.13	0.07	0.11	0.26	0.27	0.18
C5	0.10	0.13	0.09	0.09	0.10	0.09	0.14	0.09	0.14	0.09	0.15	0.21	0.10	0.15	0.11	0.09	0.13	0.30	0.21	0.16
C5'	0.09	0.08	0.10	0.12	0.12	0.10	0.15	0.10	0.13	0.08	0.08	0.16	0.13	0.18	0.14	0.08	0.12	0.25	0.27	0.20
C6	0.11	0.15	0.09	0.09	0.10	0.09	0.14	0.09	0.14	0.10	0.16	0.20	0.10	0.14	0.12	0.10	0.14	0.36	0.19	0.16
C8	0.10	0.12	0.10	0.11	0.12	0.10	0.15	0.09	0.13	0.09	0.13	0.19	0.12	0.18	0.13	0.09	0.13	0.24	0.24	0.17
N1	0.10	0.16	0.09	0.08	0.11	0.09	0.11	0.09	0.13	0.10	0.18	0.21	0.10	0.12	0.15	0.10	0.14	0.38	0.18	0.15
N2	0.10	0.17	0.10	0.09	0.15	0.09	0.12	0.09	0.11	0.10	0.19	0.20	0.10	0.11	0.17	0.10	0.14	0.35	0.15	0.14
N3	0.08	0.16	0.08	0.09	0.11	0.09	0.11	0.09	0.11	0.07	0.17	0.24	0.07	0.13	0.12	0.09	0.13	0.25	0.21	0.15
N7	0.11	0.12	0.10	0.10	0.12	0.10	0.15	0.09	0.14	0.10	0.13	0.19	0.12	0.17	0.13	0.09	0.13	0.28	0.22	0.16
N9	0.10	0.13	0.09	0.11	0.11	0.10	0.13	0.09	0.13	0.08	0.14	0.22	0.11	0.18	0.12	0.09	0.13	0.23	0.25	0.17
O2'	0.15	0.22	0.15	0.17	0.14	0.13	0.10	0.10	0.11	0.15	0.20	0.32	0.16	0.23	0.13	0.12	0.14	0.36	0.34	0.23
O3'	0.15	0.20	0.16	0.19	0.17	0.18	0.18	0.17	0.17	0.16	0.19	0.28	0.15	0.23	0.17	0.15	0.17	0.34	0.24	0.22
O4'	0.09	0.09	0.11	0.13	0.11	0.11	0.12	0.10	0.11	0.07	0.11	0.17	0.13	0.20	0.13	0.09	0.13	0.24	0.29	0.18
O5'	0.14	0.12	0.15	0.17	0.18	0.16	0.22	0.15	0.20	0.14	0.13	0.17	0.15	0.22	0.19	0.15	0.17	0.21	0.28	0.21
O6	0.12	0.15	0.10	0.10	0.12	0.09	0.15	0.10	0.15	0.12	0.16	0.19	0.12	0.14	0.13	0.11	0.14	0.39	0.19	0.16
OP1	0.13	0.12	0.14	0.15	0.19	0.14	0.23	0.14	0.20	0.13	0.14	0.18	0.15	0.20	0.22	0.14	0.16	0.21	0.34	0.22
OP2	0.20	0.20	0.21	0.21	0.29	0.21	0.32	0.21	0.29	0.22	0.23	0.21	0.19	0.25	0.31	0.20	0.22	0.19	0.31	0.24
P	0.16	0.15	0.16	0.18	0.22	0.17	0.26	0.17	0.23	0.16	0.17	0.19	0.15	0.22	0.25	0.16	0.18	0.20	0.30	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.15	0.09	0.06
C2	0.03	0.00	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.10	0.02	0.04	0.11	0.25	0.11	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.02	0.07	0.01	0.03	0.11	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.14	0.15	0.07
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.10	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.08	0.17	0.02
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.15	0.35	0.20	0.18
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.08	0.14	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.04	0.01	0.04	0.16	0.37	0.21	0.18
C5'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.10	0.06	0.09	0.05	0.02	0.02	0.13	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.05	0.01	0.05	0.14	0.33	0.17	0.15
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.09	0.24	0.10	0.10
N3	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.09	0.01	0.03	0.14	0.30	0.15	0.17
O2	0.05	0.00	0.11	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.16	0.02	0.06	0.11	0.23	0.11	0.13
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.01	0.07	0.18	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.14	0.16	0.07
O3'	0.05	0.10	0.02	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.09	0.16	0.02	0.00	0.06	0.02	0.03	0.12	0.21	0.06
O4	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.00	0.03	0.17	0.38	0.23	0.21
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.12	0.09	0.05
O5'	0.05	0.11	0.04	0.01	0.15	0.01	0.16	0.01	0.14	0.09	0.14	0.11	0.04	0.03	0.17	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.25	0.14	0.08	0.35	0.08	0.37	0.05	0.33	0.24	0.30	0.23	0.14	0.12	0.38	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.11	0.15	0.17	0.20	0.14	0.21	0.13	0.17	0.10	0.15	0.11	0.16	0.21	0.23	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.07	0.02	0.18	0.03	0.18	0.01	0.15	0.10	0.17	0.13	0.07	0.06	0.21	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00