Doublet Group distance statistics: 48563

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 1, 1, 3, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.025, 0.044, 0.063, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.044 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.006, 0.026, 0.046, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.026 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.022, 0.043, 0.064, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.043 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.026, 0.048, 0.070, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.048 std_dev=0.022
C5	A	0, 0.027, 0.050, 0.072, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.050 std_dev=0.022
N1	A	0, 0.030, 0.056, 0.082, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.056 std_dev=0.026
C4	A	0, 0.036, 0.068, 0.100, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.068 std_dev=0.032
N9	A	0, 0.038, 0.077, 0.116, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.077 std_dev=0.039
O6	A	0, 0.062, 0.103, 0.145, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.103 std_dev=0.042
N2	A	0, 0.017, 0.059, 0.101, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.059 std_dev=0.042
N7	A	0, 0.056, 0.108, 0.160, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.108 std_dev=0.052
C8	A	0, 0.072, 0.142, 0.212, 0.252 max_d=0.252 avg_d=0.142 std_dev=0.070
O4'	A	0, 0.095, 0.228, 0.362, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.228 std_dev=0.134
C4'	A	0, 0.132, 0.318, 0.505, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.318 std_dev=0.187
C2'	A	0, 0.197, 0.397, 0.597, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.397 std_dev=0.200
C3'	A	0, 0.218, 0.478, 0.738, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.478 std_dev=0.260
O2'	A	0, 0.292, 0.578, 0.864, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.578 std_dev=0.286
P	B	0, 0.337, 0.649, 0.962, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.649 std_dev=0.313
OP2	B	0, 0.273, 0.609, 0.946, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.609 std_dev=0.337
O3'	A	0, 0.309, 0.678, 1.047, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.678 std_dev=0.369
C5'	A	0, 0.272, 0.642, 1.012, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.642 std_dev=0.370
O5'	B	0, 0.396, 0.766, 1.136, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.766 std_dev=0.370
C4'	B	0, 0.469, 0.859, 1.249, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.859 std_dev=0.390
C5'	B	0, 0.449, 0.843, 1.237, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.843 std_dev=0.394
C3'	B	0, 0.437, 0.844, 1.252, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.844 std_dev=0.407
OP1	B	0, 0.277, 0.698, 1.119, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.698 std_dev=0.421
O3'	B	0, 0.506, 0.939, 1.373, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.939 std_dev=0.433
O4'	B	0, 0.533, 1.041, 1.549, 1.832 max_d=1.832 avg_d=1.041 std_dev=0.508
C2'	B	0, 0.541, 1.071, 1.600, 1.843 max_d=1.843 avg_d=1.071 std_dev=0.530
C1'	B	0, 0.563, 1.113, 1.664, 1.957 max_d=1.957 avg_d=1.113 std_dev=0.550
C6	B	0, 0.619, 1.179, 1.739, 1.848 max_d=1.848 avg_d=1.179 std_dev=0.560
N1	B	0, 0.600, 1.166, 1.732, 1.810 max_d=1.810 avg_d=1.166 std_dev=0.566
O2	B	0, 0.579, 1.179, 1.779, 1.848 max_d=1.848 avg_d=1.179 std_dev=0.600
C2	B	0, 0.608, 1.221, 1.833, 1.906 max_d=1.906 avg_d=1.221 std_dev=0.613
C5	B	0, 0.673, 1.293, 1.913, 2.014 max_d=2.014 avg_d=1.293 std_dev=0.620
N3	B	0, 0.653, 1.334, 2.014, 2.131 max_d=2.131 avg_d=1.334 std_dev=0.680
C4	B	0, 0.696, 1.395, 2.093, 2.232 max_d=2.232 avg_d=1.395 std_dev=0.698
O5'	A	0, 0.231, 0.947, 1.664, 2.725 max_d=2.725 avg_d=0.947 std_dev=0.717
P	A	0, 0.021, 0.756, 1.492, 2.867 max_d=2.867 avg_d=0.756 std_dev=0.736
O4	B	0, 0.816, 1.652, 2.487, 2.652 max_d=2.652 avg_d=1.652 std_dev=0.836
O2'	B	0, 0.448, 1.387, 2.326, 3.839 max_d=3.839 avg_d=1.387 std_dev=0.939
OP2	A	0, -0.315, 0.948, 2.210, 4.574 max_d=4.574 avg_d=0.948 std_dev=1.262
OP1	A	0, 0.103, 1.383, 2.663, 4.956 max_d=4.956 avg_d=1.383 std_dev=1.280

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.04	0.59	0.46	0.31
C2	0.05	0.00	0.08	0.10	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.08	0.13	0.05	0.11	0.02	0.54	0.31	0.23
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.06	0.06	0.11	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.36	0.48	0.17
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.07	0.07	0.13	0.10	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.22	0.06	0.24	0.33	0.09
C4	0.02	0.02	0.04	0.05	0.00	0.04	0.01	0.10	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.13	0.02	0.53	0.26	0.24
C4'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.06	0.07	0.05	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.07	0.30	0.42	0.17
C5	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.06	0.00	0.13	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.03	0.16	0.02	0.51	0.22	0.23
C5'	0.03	0.10	0.01	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.13	0.13	0.12	0.09	0.08	0.14	0.09	0.02	0.03	0.02	0.01	0.15	0.07	0.07	0.01
C6	0.03	0.01	0.05	0.05	0.02	0.06	0.02	0.13	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.05	0.04	0.16	0.01	0.50	0.23	0.22
C8	0.02	0.03	0.06	0.07	0.01	0.07	0.01	0.13	0.02	0.00	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.07	0.04	0.18	0.03	0.50	0.24	0.24
N1	0.05	0.01	0.06	0.07	0.03	0.06	0.03	0.12	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.08	0.09	0.05	0.13	0.02	0.51	0.22	0.21
N2	0.07	0.01	0.11	0.13	0.03	0.07	0.03	0.09	0.02	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.11	0.16	0.07	0.09	0.03	0.55	0.39	0.25
N3	0.04	0.01	0.08	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.07	0.12	0.04	0.10	0.02	0.55	0.36	0.25
N7	0.02	0.03	0.06	0.06	0.01	0.07	0.01	0.14	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.04	0.20	0.03	0.49	0.30	0.25
N9	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.14	0.03	0.54	0.26	0.25
O2'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.03	0.05	0.02	0.07	0.04	0.08	0.11	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.04	0.08	0.09	0.44	0.70	0.26
O3'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.06	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.09	0.16	0.12	0.06	0.02	0.02	0.00	0.01	0.39	0.05	0.41	0.41	0.19
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.07	0.04	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.23	0.05	0.64	0.45	0.36
O5'	0.12	0.11	0.10	0.22	0.13	0.02	0.16	0.01	0.16	0.18	0.13	0.09	0.10	0.20	0.14	0.08	0.39	0.23	0.00	0.17	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.02	0.07	0.06	0.02	0.07	0.02	0.15	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.09	0.05	0.05	0.17	0.00	0.48	0.30	0.23
OP1	0.59	0.54	0.36	0.24	0.53	0.30	0.51	0.07	0.50	0.50	0.51	0.55	0.55	0.49	0.54	0.44	0.41	0.64	0.02	0.48	0.00	0.01	0.01
OP2	0.46	0.31	0.48	0.33	0.26	0.42	0.22	0.07	0.23	0.24	0.22	0.39	0.36	0.30	0.26	0.70	0.41	0.45	0.02	0.30	0.01	0.00	0.01
P	0.31	0.23	0.17	0.09	0.24	0.17	0.23	0.01	0.22	0.24	0.21	0.25	0.25	0.25	0.25	0.26	0.19	0.36	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.22	0.14	0.10	0.20	0.19	0.20	0.28	0.21	0.23	0.21	0.24	0.41	0.23	0.19	0.28	0.20	0.21	0.27	0.15
C2	0.24	0.24	0.14	0.11	0.23	0.24	0.23	0.30	0.24	0.24	0.23	0.24	0.18	0.23	0.22	0.39	0.20	0.13	0.12	0.09
C2'	0.24	0.23	0.15	0.12	0.21	0.23	0.21	0.34	0.22	0.23	0.22	0.25	0.36	0.27	0.21	0.29	0.19	0.24	0.32	0.20
C3'	0.21	0.21	0.16	0.13	0.19	0.20	0.19	0.32	0.20	0.20	0.20	0.23	0.37	0.26	0.19	0.25	0.19	0.24	0.32	0.21
C4	0.25	0.23	0.10	0.09	0.21	0.22	0.22	0.30	0.23	0.24	0.22	0.24	0.27	0.23	0.21	0.35	0.21	0.10	0.18	0.10
C4'	0.19	0.18	0.15	0.12	0.15	0.14	0.15	0.25	0.16	0.18	0.17	0.21	0.44	0.21	0.14	0.19	0.15	0.27	0.31	0.20
C5	0.25	0.23	0.10	0.09	0.22	0.22	0.22	0.29	0.23	0.24	0.23	0.24	0.25	0.23	0.21	0.36	0.21	0.10	0.16	0.09
C5'	0.19	0.19	0.16	0.13	0.16	0.15	0.16	0.26	0.17	0.18	0.18	0.22	0.44	0.21	0.15	0.20	0.17	0.25	0.29	0.18
C6	0.25	0.24	0.13	0.10	0.23	0.23	0.23	0.29	0.24	0.25	0.23	0.25	0.20	0.23	0.23	0.38	0.21	0.13	0.13	0.09
C8	0.26	0.23	0.12	0.09	0.21	0.21	0.21	0.29	0.23	0.24	0.22	0.25	0.36	0.24	0.20	0.32	0.21	0.13	0.21	0.12
N1	0.24	0.24	0.16	0.12	0.23	0.24	0.23	0.29	0.24	0.24	0.24	0.25	0.18	0.23	0.23	0.39	0.20	0.16	0.12	0.10
N2	0.23	0.23	0.20	0.14	0.22	0.24	0.22	0.30	0.23	0.24	0.23	0.24	0.20	0.22	0.22	0.39	0.18	0.18	0.12	0.11
N3	0.25	0.24	0.10	0.09	0.22	0.23	0.22	0.31	0.23	0.24	0.23	0.25	0.22	0.23	0.21	0.37	0.21	0.11	0.17	0.09
N7	0.25	0.23	0.10	0.09	0.21	0.21	0.22	0.28	0.23	0.24	0.22	0.24	0.30	0.24	0.21	0.34	0.21	0.10	0.18	0.10
N9	0.25	0.23	0.11	0.08	0.21	0.21	0.21	0.29	0.22	0.24	0.22	0.24	0.35	0.24	0.20	0.32	0.21	0.15	0.22	0.12
O2'	0.21	0.21	0.15	0.11	0.18	0.20	0.17	0.30	0.18	0.20	0.20	0.25	0.39	0.24	0.18	0.25	0.15	0.32	0.37	0.24
O3'	0.22	0.23	0.22	0.19	0.23	0.23	0.23	0.37	0.23	0.23	0.23	0.25	0.38	0.29	0.23	0.25	0.22	0.28	0.35	0.25
O4'	0.25	0.23	0.18	0.12	0.20	0.19	0.20	0.27	0.22	0.23	0.22	0.25	0.49	0.23	0.19	0.26	0.21	0.25	0.29	0.18
O5'	0.24	0.26	0.24	0.21	0.21	0.22	0.19	0.27	0.20	0.23	0.25	0.31	0.51	0.28	0.20	0.24	0.16	0.46	0.34	0.29
O6	0.25	0.24	0.14	0.11	0.23	0.24	0.24	0.29	0.25	0.25	0.24	0.25	0.19	0.24	0.24	0.39	0.21	0.15	0.13	0.10
OP1	0.58	0.65	0.47	0.59	0.66	0.58	0.64	0.50	0.61	0.61	0.66	0.67	0.45	0.54	0.68	0.63	0.56	1.08	0.83	0.85
OP2	0.91	0.96	0.86	1.01	0.93	0.92	0.90	0.78	0.89	0.92	0.96	0.98	0.62	0.96	0.93	0.92	0.79	0.98	0.89	0.90
P	0.33	0.38	0.26	0.41	0.38	0.36	0.36	0.29	0.35	0.35	0.39	0.41	0.30	0.36	0.39	0.37	0.33	0.70	0.57	0.55

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.02	0.01	0.04	0.07	0.03	0.22	0.03	0.01	0.07	0.18	0.12	0.16
C2	0.04	0.00	0.16	0.14	0.01	0.03	0.02	0.12	0.02	0.02	0.01	0.01	0.11	0.13	0.02	0.11	0.08	0.17	0.17	0.18
C2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.06	0.01	0.18	0.14	0.21	0.02	0.10	0.31	0.01	0.03	0.06	0.01	0.27	0.21	0.27	0.20
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.09	0.01	0.05	0.01	0.03	0.07	0.14	0.19	0.01	0.01	0.10	0.02	0.26	0.28	0.20	0.16
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.02	0.22	0.08	0.00	0.05	0.05	0.22	0.24	0.24
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.03	0.07	0.18	0.01	0.05	0.01	0.02	0.22	0.08	0.08
C5	0.02	0.02	0.18	0.05	0.01	0.06	0.00	0.19	0.00	0.01	0.02	0.02	0.33	0.08	0.01	0.08	0.05	0.25	0.26	0.26
C5'	0.07	0.12	0.14	0.01	0.17	0.01	0.19	0.00	0.17	0.11	0.14	0.11	0.06	0.20	0.18	0.01	0.01	0.23	0.17	0.02
C6	0.02	0.02	0.21	0.03	0.01	0.07	0.00	0.17	0.00	0.01	0.03	0.03	0.31	0.10	0.01	0.10	0.05	0.23	0.24	0.25
N1	0.01	0.02	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.03	0.11	0.13	0.02	0.03	0.07	0.18	0.18	0.20
N3	0.04	0.01	0.10	0.14	0.01	0.03	0.02	0.14	0.03	0.02	0.00	0.02	0.11	0.11	0.02	0.08	0.07	0.18	0.21	0.21
O2	0.07	0.01	0.31	0.19	0.02	0.07	0.02	0.11	0.03	0.03	0.02	0.00	0.31	0.18	0.02	0.17	0.09	0.18	0.14	0.15
O2'	0.03	0.11	0.01	0.01	0.22	0.18	0.33	0.06	0.31	0.11	0.11	0.31	0.00	0.06	0.24	0.11	0.15	0.06	0.25	0.14
O3'	0.22	0.13	0.03	0.01	0.08	0.01	0.08	0.20	0.10	0.13	0.11	0.18	0.06	0.00	0.08	0.14	0.09	0.28	0.08	0.08
O4	0.03	0.02	0.06	0.10	0.00	0.05	0.01	0.18	0.01	0.02	0.02	0.02	0.24	0.08	0.00	0.05	0.06	0.24	0.26	0.25
O4'	0.01	0.11	0.01	0.02	0.05	0.01	0.08	0.01	0.10	0.03	0.08	0.17	0.11	0.14	0.05	0.00	0.21	0.26	0.29	0.31
O5'	0.07	0.08	0.27	0.26	0.05	0.02	0.05	0.01	0.05	0.07	0.07	0.09	0.15	0.09	0.06	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.18	0.17	0.21	0.28	0.22	0.22	0.25	0.23	0.23	0.18	0.18	0.18	0.06	0.28	0.24	0.26	0.02	0.00	0.04	0.01
OP2	0.12	0.17	0.27	0.20	0.24	0.08	0.26	0.17	0.24	0.18	0.21	0.14	0.25	0.08	0.26	0.29	0.01	0.04	0.00	0.01
P	0.16	0.18	0.20	0.16	0.24	0.08	0.26	0.02	0.25	0.20	0.21	0.15	0.14	0.08	0.25	0.31	0.01	0.01	0.01	0.00