Doublet Group distance statistics: 48566

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.007, 0.019, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.007, 0.023, 0.040, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.005, 0.024, 0.042, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.024 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.006, 0.028, 0.049, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.028 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.014, 0.042, 0.069, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.042 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.008, 0.040, 0.072, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.040 std_dev=0.032
O6	A	0, 0.026, 0.059, 0.092, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.059 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.002, 0.041, 0.081, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.041 std_dev=0.039
N2	A	0, 0.020, 0.060, 0.100, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.060 std_dev=0.040
C2'	A	0, 0.067, 0.170, 0.273, 0.323 max_d=0.323 avg_d=0.170 std_dev=0.103
O4'	A	0, 0.058, 0.171, 0.284, 0.336 max_d=0.336 avg_d=0.171 std_dev=0.113
C4'	A	0, 0.105, 0.278, 0.450, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.278 std_dev=0.173
C3'	A	0, 0.115, 0.334, 0.553, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.334 std_dev=0.219
O2'	A	0, 0.099, 0.323, 0.548, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.323 std_dev=0.224
O5'	A	0, 0.197, 0.461, 0.725, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.461 std_dev=0.264
P	A	0, 0.177, 0.444, 0.711, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.444 std_dev=0.267
OP1	B	0, 0.177, 0.450, 0.724, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.450 std_dev=0.274
P	B	0, 0.223, 0.501, 0.780, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.501 std_dev=0.278
OP2	A	0, 0.164, 0.462, 0.761, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.462 std_dev=0.298
C5'	A	0, 0.157, 0.483, 0.810, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.483 std_dev=0.326
OP1	A	0, 0.207, 0.535, 0.863, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.535 std_dev=0.328
O3'	A	0, 0.200, 0.547, 0.893, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.547 std_dev=0.346
OP2	B	0, 0.293, 0.663, 1.033, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.663 std_dev=0.370
C5	B	0, 0.311, 0.692, 1.074, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.692 std_dev=0.382
C6	B	0, 0.324, 0.710, 1.096, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.710 std_dev=0.386
N1	B	0, 0.287, 0.724, 1.160, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.724 std_dev=0.437
O5'	B	0, 0.238, 0.691, 1.145, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.691 std_dev=0.453
O4'	B	0, 0.305, 0.759, 1.212, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.759 std_dev=0.453
C4	B	0, 0.245, 0.708, 1.171, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.708 std_dev=0.463
C1'	B	0, 0.297, 0.800, 1.302, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.800 std_dev=0.502
O4	B	0, 0.314, 0.833, 1.352, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.833 std_dev=0.519
C2'	B	0, 0.294, 0.844, 1.394, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.844 std_dev=0.550
C4'	B	0, 0.157, 0.720, 1.283, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.720 std_dev=0.563
C3'	B	0, 0.172, 0.755, 1.338, 1.592 max_d=1.592 avg_d=0.755 std_dev=0.583
C5'	B	0, 0.209, 0.795, 1.381, 1.724 max_d=1.724 avg_d=0.795 std_dev=0.586
O3'	B	0, 0.192, 0.849, 1.505, 1.771 max_d=1.771 avg_d=0.849 std_dev=0.656
O2'	B	0, 0.279, 0.938, 1.596, 2.255 max_d=2.255 avg_d=0.938 std_dev=0.659
C2	B	0, 0.108, 0.801, 1.494, 2.624 max_d=2.624 avg_d=0.801 std_dev=0.693
N3	B	0, 0.039, 0.761, 1.484, 2.564 max_d=2.564 avg_d=0.761 std_dev=0.722
O2	B	0, -0.013, 0.980, 1.973, 3.725 max_d=3.725 avg_d=0.980 std_dev=0.993

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.12	0.09	0.11
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.03	0.07	0.18	0.01	0.24	0.18	0.19
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.07	0.06	0.06	0.06	0.05	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.09	0.09	0.11	0.14	0.10
C3'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.12	0.15	0.09	0.05	0.05	0.15	0.09	0.01	0.01	0.01	0.13	0.16	0.11	0.17	0.12
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.14	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.06	0.03	0.17	0.03	0.21	0.17	0.17
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.11	0.07	0.08	0.05	0.11	0.06	0.05	0.02	0.01	0.01	0.12	0.04	0.08	0.06
C5	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.09	0.00	0.18	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.23	0.03	0.29	0.23	0.24
C5'	0.02	0.16	0.01	0.01	0.14	0.01	0.18	0.00	0.20	0.17	0.18	0.16	0.13	0.19	0.12	0.04	0.02	0.02	0.00	0.23	0.13	0.05	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.02	0.09	0.02	0.20	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.12	0.04	0.24	0.01	0.34	0.26	0.27
C8	0.03	0.01	0.06	0.15	0.01	0.11	0.01	0.17	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.07	0.22	0.06	0.22	0.21	0.18
N1	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.07	0.02	0.18	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.11	0.07	0.06	0.21	0.01	0.31	0.22	0.24
N2	0.03	0.00	0.06	0.05	0.01	0.08	0.02	0.16	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.14	0.03	0.09	0.16	0.02	0.22	0.17	0.18
N3	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.02	0.06	0.15	0.02	0.19	0.15	0.15
N7	0.03	0.02	0.06	0.15	0.01	0.11	0.01	0.19	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.18	0.06	0.25	0.06	0.30	0.26	0.25
N9	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.06	0.01	0.12	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.08	0.01	0.15	0.04	0.17	0.15	0.14
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.08	0.05	0.07	0.04	0.09	0.05	0.11	0.14	0.11	0.06	0.04	0.00	0.02	0.07	0.08	0.09	0.10	0.16	0.11
O3'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.06	0.02	0.12	0.02	0.12	0.17	0.07	0.03	0.02	0.18	0.08	0.02	0.00	0.02	0.16	0.17	0.16	0.24	0.16
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.07	0.06	0.09	0.06	0.06	0.01	0.07	0.02	0.00	0.11	0.05	0.13	0.09	0.15
O5'	0.05	0.18	0.09	0.13	0.17	0.01	0.23	0.00	0.24	0.22	0.21	0.16	0.15	0.25	0.15	0.08	0.16	0.11	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01
O6	0.04	0.01	0.09	0.16	0.03	0.12	0.03	0.23	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.06	0.04	0.09	0.17	0.05	0.27	0.00	0.42	0.31	0.33
OP1	0.12	0.24	0.11	0.11	0.21	0.04	0.29	0.13	0.34	0.22	0.31	0.22	0.19	0.30	0.17	0.10	0.16	0.13	0.01	0.42	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.18	0.14	0.17	0.17	0.08	0.23	0.05	0.26	0.21	0.22	0.17	0.15	0.26	0.15	0.16	0.24	0.09	0.01	0.31	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.19	0.10	0.12	0.17	0.06	0.24	0.02	0.27	0.18	0.24	0.18	0.15	0.25	0.14	0.11	0.16	0.15	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.24	0.22	0.14	0.26	0.06	0.28	0.09	0.26	0.21	0.27	0.28	0.18	0.17	0.29	0.16	0.22	0.21	0.25	0.11
C2	0.32	0.46	0.38	0.27	0.44	0.25	0.38	0.37	0.33	0.34	0.50	0.56	0.37	0.23	0.53	0.25	0.39	0.23	0.20	0.23
C2'	0.20	0.22	0.23	0.17	0.23	0.11	0.26	0.09	0.26	0.22	0.24	0.25	0.19	0.19	0.25	0.20	0.19	0.20	0.28	0.09
C3'	0.17	0.19	0.19	0.13	0.18	0.08	0.20	0.08	0.21	0.17	0.21	0.24	0.16	0.16	0.20	0.17	0.21	0.24	0.22	0.12
C4	0.26	0.39	0.32	0.21	0.41	0.16	0.37	0.25	0.32	0.29	0.44	0.47	0.30	0.19	0.49	0.20	0.32	0.20	0.21	0.17
C4'	0.14	0.19	0.17	0.12	0.16	0.07	0.17	0.10	0.18	0.15	0.20	0.24	0.16	0.14	0.17	0.13	0.27	0.32	0.19	0.19
C5	0.30	0.48	0.38	0.27	0.49	0.22	0.41	0.33	0.34	0.34	0.53	0.58	0.38	0.24	0.60	0.23	0.37	0.20	0.20	0.19
C5'	0.14	0.23	0.19	0.17	0.20	0.10	0.18	0.15	0.18	0.17	0.25	0.29	0.19	0.20	0.22	0.11	0.30	0.33	0.21	0.23
C6	0.37	0.57	0.46	0.35	0.54	0.31	0.43	0.43	0.35	0.39	0.62	0.70	0.48	0.32	0.67	0.28	0.43	0.23	0.19	0.23
C8	0.24	0.37	0.30	0.19	0.40	0.13	0.37	0.22	0.32	0.28	0.42	0.45	0.29	0.18	0.50	0.18	0.31	0.20	0.22	0.16
N1	0.38	0.56	0.46	0.35	0.52	0.33	0.41	0.45	0.35	0.39	0.61	0.68	0.47	0.31	0.64	0.30	0.44	0.25	0.20	0.25
N2	0.33	0.46	0.39	0.28	0.41	0.27	0.35	0.40	0.33	0.34	0.49	0.55	0.36	0.23	0.47	0.28	0.41	0.26	0.22	0.25
N3	0.25	0.37	0.30	0.20	0.37	0.16	0.35	0.25	0.31	0.28	0.41	0.43	0.28	0.18	0.44	0.20	0.32	0.20	0.21	0.18
N7	0.28	0.45	0.37	0.25	0.47	0.20	0.41	0.30	0.34	0.32	0.51	0.55	0.37	0.23	0.59	0.21	0.36	0.20	0.20	0.18
N9	0.22	0.33	0.27	0.17	0.36	0.10	0.34	0.18	0.30	0.26	0.37	0.39	0.25	0.16	0.43	0.17	0.28	0.20	0.23	0.14
O2'	0.26	0.23	0.26	0.21	0.22	0.18	0.25	0.15	0.28	0.25	0.23	0.25	0.22	0.22	0.21	0.26	0.21	0.27	0.29	0.14
O3'	0.22	0.20	0.20	0.13	0.17	0.14	0.19	0.12	0.22	0.20	0.20	0.23	0.19	0.15	0.17	0.23	0.24	0.31	0.19	0.17
O4'	0.14	0.22	0.19	0.15	0.21	0.08	0.21	0.13	0.20	0.17	0.25	0.28	0.17	0.18	0.24	0.10	0.27	0.29	0.26	0.20
O5'	0.26	0.33	0.27	0.18	0.35	0.11	0.37	0.09	0.34	0.29	0.35	0.37	0.28	0.19	0.38	0.20	0.24	0.22	0.23	0.16
O6	0.42	0.63	0.52	0.41	0.59	0.37	0.44	0.50	0.36	0.43	0.69	0.79	0.56	0.39	0.73	0.32	0.47	0.24	0.19	0.25
OP1	0.25	0.38	0.27	0.19	0.43	0.12	0.41	0.12	0.35	0.30	0.43	0.45	0.30	0.21	0.52	0.20	0.29	0.23	0.20	0.18
OP2	0.22	0.31	0.25	0.18	0.31	0.10	0.32	0.11	0.30	0.26	0.33	0.35	0.26	0.19	0.34	0.17	0.24	0.22	0.24	0.16
P	0.25	0.34	0.27	0.18	0.37	0.10	0.38	0.08	0.34	0.29	0.37	0.39	0.28	0.19	0.42	0.20	0.24	0.20	0.23	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.18	0.21	0.57	0.31
C2	0.04	0.00	0.05	0.14	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.16	0.01	0.03	0.25	0.23	0.56	0.28
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.08	0.02	0.09	0.03	0.08	0.04	0.06	0.06	0.00	0.03	0.09	0.01	0.11	0.25	0.37	0.13
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.15	0.00	0.15	0.02	0.13	0.09	0.16	0.17	0.02	0.01	0.17	0.02	0.16	0.30	0.14	0.12
C4	0.03	0.01	0.08	0.15	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.18	0.00	0.04	0.32	0.24	0.54	0.35
C4'	0.00	0.07	0.02	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.09	0.08	0.09	0.03	0.09	0.00	0.02	0.09	0.24	0.12
C5	0.02	0.01	0.09	0.15	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.01	0.04	0.36	0.33	0.56	0.42
C5'	0.04	0.11	0.03	0.02	0.13	0.01	0.11	0.00	0.11	0.07	0.13	0.12	0.08	0.02	0.14	0.02	0.00	0.03	0.09	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.01	0.03	0.35	0.33	0.60	0.44
N1	0.01	0.01	0.04	0.09	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.09	0.02	0.02	0.25	0.23	0.58	0.33
N3	0.03	0.00	0.06	0.16	0.00	0.09	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.19	0.01	0.03	0.29	0.24	0.55	0.31
O2	0.07	0.00	0.06	0.17	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.10	0.20	0.02	0.06	0.23	0.25	0.55	0.25
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.06	0.09	0.05	0.08	0.04	0.03	0.07	0.10	0.00	0.05	0.07	0.06	0.07	0.19	0.41	0.11
O3'	0.01	0.16	0.03	0.01	0.18	0.03	0.16	0.02	0.13	0.09	0.19	0.20	0.05	0.00	0.21	0.02	0.29	0.41	0.09	0.25
O4	0.03	0.01	0.09	0.17	0.00	0.09	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.21	0.00	0.04	0.33	0.23	0.51	0.34
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.06	0.06	0.02	0.04	0.00	0.20	0.21	0.55	0.36
O5'	0.18	0.25	0.11	0.16	0.32	0.02	0.36	0.00	0.35	0.25	0.29	0.23	0.07	0.29	0.33	0.20	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.21	0.23	0.25	0.30	0.24	0.09	0.33	0.03	0.33	0.23	0.24	0.25	0.19	0.41	0.23	0.21	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.57	0.56	0.37	0.14	0.54	0.24	0.56	0.09	0.60	0.58	0.55	0.55	0.41	0.09	0.51	0.55	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.31	0.28	0.13	0.12	0.35	0.12	0.42	0.01	0.44	0.33	0.31	0.25	0.11	0.25	0.34	0.36	0.01	0.01	0.00	0.00