Doublet Group distance statistics: 48584

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 5, 4, 6, 5, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.005, 0.009, 0.012, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.005, 0.008, 0.012, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.009, 0.013, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.007, 0.012, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.008, 0.013, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.005
O2	A	0, 0.021, 0.033, 0.046, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.033 std_dev=0.013
O4	A	0, 0.008, 0.025, 0.041, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.025 std_dev=0.016
O4'	A	0, -0.017, 0.099, 0.214, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.099 std_dev=0.115
C2'	A	0, -0.039, 0.099, 0.238, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.099 std_dev=0.138
P	B	0, 0.180, 0.374, 0.567, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.374 std_dev=0.193
O5'	A	0, 0.041, 0.244, 0.446, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.244 std_dev=0.202
C4'	A	0, -0.061, 0.146, 0.354, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.146 std_dev=0.207
C5'	A	0, 0.005, 0.228, 0.451, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.228 std_dev=0.223
P	A	0, 0.109, 0.350, 0.590, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.350 std_dev=0.241
C3'	A	0, -0.077, 0.167, 0.412, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.167 std_dev=0.244
C3'	B	0, 0.146, 0.398, 0.650, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.398 std_dev=0.252
OP2	A	0, 0.160, 0.415, 0.671, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.415 std_dev=0.256
O3'	B	0, 0.173, 0.436, 0.699, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.436 std_dev=0.263
C5'	B	0, 0.145, 0.412, 0.678, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.412 std_dev=0.267
OP2	B	0, 0.196, 0.467, 0.738, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.467 std_dev=0.271
OP1	A	0, 0.087, 0.363, 0.639, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.363 std_dev=0.276
O5'	B	0, 0.129, 0.425, 0.721, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.425 std_dev=0.296
O2'	A	0, -0.140, 0.158, 0.456, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.158 std_dev=0.298
C2'	B	0, 0.084, 0.456, 0.828, 1.918 max_d=1.918 avg_d=0.456 std_dev=0.372
C4'	B	0, 0.072, 0.444, 0.816, 2.096 max_d=2.096 avg_d=0.444 std_dev=0.372
O2'	B	0, 0.174, 0.553, 0.933, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.553 std_dev=0.380
O3'	A	0, -0.139, 0.286, 0.712, 2.390 max_d=2.390 avg_d=0.286 std_dev=0.426
OP1	B	0, 0.060, 0.563, 1.066, 2.424 max_d=2.424 avg_d=0.563 std_dev=0.503
O4'	B	0, -0.104, 0.475, 1.054, 3.279 max_d=3.279 avg_d=0.475 std_dev=0.579
C1'	B	0, -0.181, 0.488, 1.157, 3.712 max_d=3.712 avg_d=0.488 std_dev=0.669
N3	B	0, -0.420, 0.495, 1.409, 4.957 max_d=4.957 avg_d=0.495 std_dev=0.914
N9	B	0, -0.500, 0.465, 1.429, 5.288 max_d=5.288 avg_d=0.465 std_dev=0.964
C4	B	0, -0.566, 0.478, 1.523, 5.692 max_d=5.692 avg_d=0.478 std_dev=1.045
C2	B	0, -0.573, 0.579, 1.731, 6.259 max_d=6.259 avg_d=0.579 std_dev=1.152
N2	B	0, -0.577, 0.650, 1.878, 6.658 max_d=6.658 avg_d=0.650 std_dev=1.228
C8	B	0, -0.832, 0.522, 1.875, 7.373 max_d=7.373 avg_d=0.522 std_dev=1.353
C5	B	0, -0.872, 0.562, 1.996, 7.799 max_d=7.799 avg_d=0.562 std_dev=1.434
N1	B	0, -0.790, 0.662, 2.114, 7.925 max_d=7.925 avg_d=0.662 std_dev=1.452
N7	B	0, -1.048, 0.584, 2.215, 8.850 max_d=8.850 avg_d=0.584 std_dev=1.631
C6	B	0, -0.964, 0.674, 2.312, 8.937 max_d=8.937 avg_d=0.674 std_dev=1.638
O6	B	0, -1.181, 0.816, 2.812, 10.917 max_d=10.917 avg_d=0.816 std_dev=1.996

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.01	0.00	0.07	0.08	0.13	0.08
C2	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.06	0.01	0.02	0.04	0.07	0.09	0.05
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.07	0.06	0.01	0.04	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01	0.16	0.18	0.24	0.19
C3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.14	0.00	0.14	0.01	0.12	0.09	0.13	0.08	0.01	0.00	0.15	0.01	0.04	0.09	0.06	0.05
C4	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.07	0.00	0.02	0.06	0.07	0.08	0.06
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.05	0.03	0.13	0.01	0.06	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.09	0.01	0.03	0.07	0.07	0.10	0.07
C5'	0.02	0.03	0.07	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.02	0.05	0.09	0.07	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.07	0.01	0.03	0.06	0.07	0.11	0.07
N1	0.00	0.01	0.01	0.09	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.03	0.01	0.01	0.04	0.06	0.10	0.06
N3	0.01	0.00	0.04	0.13	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.05	0.00	0.02	0.05	0.07	0.08	0.05
O2	0.02	0.00	0.11	0.08	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.12	0.01	0.03	0.04	0.08	0.10	0.05
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.16	0.13	0.15	0.05	0.13	0.09	0.14	0.07	0.00	0.04	0.17	0.09	0.10	0.14	0.26	0.15
O3'	0.12	0.06	0.01	0.00	0.07	0.01	0.09	0.09	0.07	0.03	0.05	0.12	0.04	0.00	0.08	0.08	0.12	0.23	0.18	0.17
O4	0.01	0.01	0.02	0.15	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.08	0.00	0.02	0.07	0.08	0.08	0.07
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.09	0.08	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.03
O5'	0.07	0.04	0.16	0.04	0.06	0.01	0.07	0.00	0.06	0.04	0.05	0.04	0.10	0.12	0.07	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.08	0.07	0.18	0.09	0.07	0.06	0.07	0.04	0.07	0.06	0.07	0.08	0.14	0.23	0.08	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.09	0.24	0.06	0.08	0.02	0.10	0.01	0.11	0.10	0.08	0.10	0.26	0.18	0.08	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.05	0.19	0.05	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.06	0.05	0.05	0.15	0.17	0.07	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.43	0.95	0.29	0.15	0.85	0.16	1.03	0.10	1.17	0.81	1.14	0.83	0.78	0.98	0.70	0.18	0.08	0.32	0.21	1.26	0.53	0.17	0.08
C2	0.51	0.90	0.31	0.16	0.97	0.18	1.30	0.12	1.48	1.09	1.27	0.66	0.74	1.34	0.85	0.19	0.08	0.38	0.26	1.68	0.54	0.20	0.07
C2'	0.37	0.94	0.27	0.16	0.79	0.15	0.97	0.09	1.14	0.73	1.13	0.89	0.74	0.92	0.62	0.21	0.15	0.26	0.22	1.26	0.56	0.11	0.19
C3'	0.27	0.78	0.22	0.10	0.65	0.09	0.80	0.11	0.93	0.58	0.92	0.75	0.62	0.74	0.50	0.18	0.03	0.18	0.20	1.02	0.40	0.31	0.05
C4	0.49	0.58	0.28	0.16	0.86	0.18	1.26	0.12	1.31	1.20	0.96	0.24	0.50	1.45	0.85	0.18	0.09	0.38	0.29	1.55	0.50	0.22	0.08
C4'	0.26	0.72	0.22	0.09	0.58	0.09	0.66	0.08	0.77	0.47	0.80	0.72	0.60	0.59	0.44	0.19	0.03	0.18	0.16	0.81	0.44	0.23	0.06
C5	0.44	0.47	0.26	0.15	0.77	0.16	1.10	0.11	1.10	1.09	0.79	0.17	0.42	1.27	0.77	0.17	0.10	0.34	0.27	1.26	0.52	0.20	0.07
C5'	0.15	0.49	0.16	0.06	0.39	0.05	0.44	0.05	0.52	0.29	0.54	0.50	0.41	0.38	0.28	0.18	0.03	0.10	0.12	0.54	0.39	0.21	0.07
C6	0.44	0.61	0.27	0.15	0.79	0.16	1.05	0.11	1.09	0.96	0.87	0.36	0.54	1.13	0.74	0.17	0.09	0.33	0.24	1.20	0.53	0.18	0.07
N1	0.47	0.84	0.30	0.16	0.90	0.17	1.16	0.11	1.28	0.97	1.12	0.62	0.70	1.17	0.78	0.18	0.08	0.35	0.24	1.41	0.54	0.19	0.07
N3	0.52	0.77	0.30	0.16	0.96	0.18	1.35	0.12	1.48	1.20	1.17	0.47	0.65	1.47	0.88	0.19	0.09	0.40	0.29	1.75	0.52	0.22	0.08
O2	0.52	1.02	0.31	0.16	1.00	0.18	1.32	0.12	1.54	1.08	1.38	0.82	0.82	1.34	0.86	0.20	0.08	0.39	0.26	1.77	0.54	0.21	0.07
O2'	0.37	1.05	0.26	0.13	0.80	0.13	0.95	0.09	1.15	0.68	1.20	1.09	0.82	0.86	0.61	0.17	0.09	0.26	0.22	1.25	0.60	0.09	0.25
O3'	0.21	0.77	0.19	0.12	0.58	0.11	0.70	0.16	0.86	0.46	0.89	0.79	0.60	0.62	0.41	0.18	0.12	0.14	0.22	0.94	0.37	0.37	0.07
O4	0.49	0.48	0.27	0.16	0.82	0.17	1.24	0.13	1.28	1.25	0.88	0.15	0.43	1.50	0.84	0.19	0.10	0.38	0.30	1.56	0.46	0.22	0.11
O4'	0.38	0.81	0.27	0.14	0.73	0.15	0.82	0.11	0.91	0.64	0.90	0.73	0.70	0.77	0.59	0.18	0.07	0.28	0.19	0.94	0.49	0.20	0.06
O5'	0.12	0.38	0.13	0.04	0.37	0.03	0.47	0.07	0.53	0.38	0.48	0.32	0.30	0.47	0.30	0.14	0.01	0.07	0.15	0.58	0.37	0.22	0.08
OP1	0.08	0.26	0.06	0.02	0.16	0.06	0.22	0.06	0.29	0.10	0.31	0.27	0.18	0.18	0.08	0.13	0.01	0.07	0.21	0.33	0.20	0.18	0.14
OP2	0.04	0.17	0.05	0.04	0.23	0.11	0.38	0.14	0.41	0.36	0.31	0.11	0.11	0.45	0.21	0.07	0.01	0.08	0.24	0.50	0.22	0.22	0.15
P	0.03	0.22	0.06	0.01	0.21	0.06	0.30	0.07	0.35	0.24	0.31	0.18	0.16	0.31	0.15	0.09	0.00	0.03	0.19	0.40	0.24	0.19	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.30	0.05	0.08
C2	0.01	0.00	0.05	0.10	0.01	0.15	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.16	0.41	0.01	0.80	0.37	0.46
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.06	0.05	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.36	0.11	0.12
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.15	0.21	0.10	0.14	0.09	0.22	0.12	0.01	0.00	0.01	0.06	0.18	0.28	0.13	0.11
C4	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.08	0.20	0.01	0.40	0.11	0.07
C4'	0.01	0.15	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.18	0.09	0.21	0.15	0.16	0.06	0.11	0.02	0.00	0.01	0.08	0.17	0.10	0.06
C5	0.01	0.00	0.03	0.16	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.13	0.03	0.28	0.01	0.35	0.30	0.22
C5'	0.02	0.27	0.01	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.11	0.33	0.17	0.40	0.26	0.30	0.11	0.09	0.05	0.01	0.01	0.15	0.14	0.11	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.15	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.15	0.06	0.25	0.00	0.36	0.26	0.12
C8	0.01	0.01	0.03	0.21	0.00	0.18	0.00	0.33	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.10	0.11	0.50	0.01	0.60	0.54	0.56
N1	0.01	0.00	0.05	0.10	0.01	0.09	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.12	0.29	0.00	0.59	0.20	0.24
N2	0.01	0.00	0.06	0.14	0.01	0.21	0.01	0.40	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.13	0.20	0.57	0.01	1.10	0.61	0.72
N3	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.15	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.09	0.16	0.38	0.00	0.70	0.33	0.41
N7	0.01	0.01	0.03	0.22	0.00	0.16	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.13	0.07	0.48	0.01	0.56	0.58	0.55
N9	0.00	0.01	0.02	0.12	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.04	0.01	0.23	0.01	0.35	0.20	0.18
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.11	0.10	0.09	0.09	0.14	0.06	0.12	0.08	0.15	0.07	0.00	0.06	0.09	0.05	0.12	0.27	0.11	0.08
O3'	0.07	0.12	0.02	0.00	0.08	0.02	0.13	0.05	0.15	0.10	0.14	0.13	0.09	0.13	0.04	0.06	0.00	0.04	0.15	0.18	0.20	0.17	0.11
O4'	0.00	0.16	0.01	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.11	0.12	0.20	0.16	0.07	0.01	0.09	0.04	0.00	0.09	0.04	0.27	0.07	0.09
O5'	0.10	0.41	0.04	0.06	0.20	0.01	0.28	0.01	0.25	0.50	0.29	0.57	0.38	0.48	0.23	0.05	0.15	0.09	0.00	0.30	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.18	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.18	0.04	0.30	0.00	0.33	0.39	0.24
OP1	0.30	0.80	0.36	0.28	0.40	0.17	0.35	0.14	0.36	0.60	0.59	1.10	0.70	0.56	0.35	0.27	0.20	0.27	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.37	0.11	0.13	0.11	0.10	0.30	0.11	0.26	0.54	0.20	0.61	0.33	0.58	0.20	0.11	0.17	0.07	0.01	0.39	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.46	0.12	0.11	0.07	0.06	0.22	0.01	0.12	0.56	0.24	0.72	0.41	0.55	0.18	0.08	0.11	0.09	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00