Doublet Group distance statistics: 48586

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 2, 2, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.005, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.005 std_dev=0.002
C4	A	0, 0.005, 0.008, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.008 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.009, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.004, 0.008, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.006, 0.010, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.004
O2	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.008, 0.014, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.007
O4	A	0, 0.010, 0.027, 0.043, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.027 std_dev=0.017
O4'	A	0, 0.072, 0.182, 0.292, 0.323 max_d=0.323 avg_d=0.182 std_dev=0.110
C2'	A	0, 0.048, 0.197, 0.345, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.197 std_dev=0.149
C4'	A	0, 0.186, 0.342, 0.499, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.342 std_dev=0.157
O2'	A	0, 0.237, 0.411, 0.585, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.411 std_dev=0.174
C3'	A	0, 0.172, 0.359, 0.546, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.359 std_dev=0.187
C5'	B	0, 0.397, 0.599, 0.801, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.599 std_dev=0.202
O5'	B	0, 0.412, 0.639, 0.866, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.639 std_dev=0.227
P	B	0, 0.443, 0.685, 0.927, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.685 std_dev=0.242
OP1	B	0, 0.479, 0.737, 0.995, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.737 std_dev=0.258
C4'	B	0, 0.349, 0.611, 0.874, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.611 std_dev=0.263
C5'	A	0, 0.309, 0.586, 0.863, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.586 std_dev=0.277
O5'	A	0, 0.269, 0.547, 0.824, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.547 std_dev=0.278
OP2	B	0, 0.423, 0.704, 0.985, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.704 std_dev=0.281
O3'	A	0, 0.242, 0.529, 0.816, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.529 std_dev=0.287
O4'	B	0, 0.440, 0.749, 1.059, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.749 std_dev=0.309
O3'	B	0, 0.272, 0.586, 0.899, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.586 std_dev=0.314
P	A	0, 0.252, 0.574, 0.896, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.574 std_dev=0.322
C3'	B	0, 0.327, 0.660, 0.992, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.660 std_dev=0.333
OP1	A	0, 0.252, 0.616, 0.980, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.616 std_dev=0.364
OP2	A	0, 0.289, 0.681, 1.074, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.681 std_dev=0.393
C8	B	0, 0.679, 1.175, 1.671, 2.037 max_d=2.037 avg_d=1.175 std_dev=0.496
N9	B	0, 0.513, 1.010, 1.507, 1.902 max_d=1.902 avg_d=1.010 std_dev=0.497
C1'	B	0, 0.383, 0.891, 1.399, 1.797 max_d=1.797 avg_d=0.891 std_dev=0.508
N3	B	0, 0.475, 0.993, 1.511, 1.900 max_d=1.900 avg_d=0.993 std_dev=0.518
C4	B	0, 0.512, 1.030, 1.548, 1.984 max_d=1.984 avg_d=1.030 std_dev=0.518
N7	B	0, 0.719, 1.262, 1.805, 2.218 max_d=2.218 avg_d=1.262 std_dev=0.543
C2	B	0, 0.501, 1.052, 1.603, 2.050 max_d=2.050 avg_d=1.052 std_dev=0.551
C5	B	0, 0.602, 1.153, 1.705, 2.198 max_d=2.198 avg_d=1.153 std_dev=0.552
N2	B	0, 0.528, 1.094, 1.659, 1.988 max_d=1.988 avg_d=1.094 std_dev=0.565
N1	B	0, 0.519, 1.113, 1.707, 2.273 max_d=2.273 avg_d=1.113 std_dev=0.594
C6	B	0, 0.578, 1.181, 1.784, 2.360 max_d=2.360 avg_d=1.181 std_dev=0.603
C2'	B	0, 0.261, 0.913, 1.565, 2.573 max_d=2.573 avg_d=0.913 std_dev=0.652
O6	B	0, 0.633, 1.287, 1.942, 2.563 max_d=2.563 avg_d=1.287 std_dev=0.655
O2'	B	0, 0.080, 1.149, 2.218, 4.232 max_d=4.232 avg_d=1.149 std_dev=1.069

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.06	0.19	0.06
C2	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.00	0.03	0.16	0.12	0.22	0.13
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.23	0.07
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.06	0.04	0.09	0.11	0.01	0.01	0.07	0.01	0.06	0.07	0.23	0.07
C4	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.01	0.23	0.20	0.25	0.20
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.05	0.02	0.03	0.02	0.06	0.00	0.02	0.08	0.18	0.03
C5	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.02	0.23	0.20	0.23	0.18
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.13	0.00	0.14	0.00	0.12	0.07	0.11	0.05	0.03	0.02	0.14	0.01	0.01	0.09	0.15	0.01
C6	0.00	0.00	0.05	0.06	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.00	0.03	0.20	0.14	0.21	0.13
N1	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.15	0.09	0.20	0.10
N3	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.00	0.02	0.20	0.16	0.24	0.18
O2	0.01	0.00	0.10	0.11	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.13	0.01	0.05	0.13	0.09	0.21	0.12
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.08	0.00	0.02	0.03	0.04	0.04	0.08	0.22	0.06
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.07	0.04	0.09	0.13	0.02	0.00	0.08	0.02	0.14	0.10	0.26	0.11
O4	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.01	0.24	0.24	0.27	0.22
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.10	0.09	0.16	0.06
O5'	0.08	0.16	0.02	0.06	0.23	0.02	0.23	0.01	0.20	0.15	0.20	0.13	0.04	0.14	0.24	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.06	0.12	0.05	0.07	0.20	0.08	0.20	0.09	0.14	0.09	0.16	0.09	0.08	0.10	0.24	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.22	0.23	0.23	0.25	0.18	0.23	0.15	0.21	0.20	0.24	0.21	0.22	0.26	0.27	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.07	0.07	0.20	0.03	0.18	0.01	0.13	0.10	0.18	0.12	0.06	0.11	0.22	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.14	0.26	0.11	0.16	0.17	0.18	0.20	0.17	0.21	0.15	0.15	0.14	0.21	0.18	0.51	0.15	0.18	0.20	0.18	0.25	0.31	0.26
C2	0.26	0.15	0.31	0.12	0.22	0.19	0.24	0.21	0.21	0.30	0.17	0.12	0.17	0.29	0.26	0.66	0.19	0.24	0.23	0.22	0.28	0.33	0.28
C2'	0.16	0.16	0.31	0.11	0.16	0.15	0.18	0.16	0.17	0.20	0.17	0.17	0.16	0.20	0.17	0.59	0.10	0.17	0.17	0.18	0.21	0.29	0.22
C3'	0.12	0.14	0.29	0.09	0.14	0.12	0.16	0.14	0.15	0.18	0.14	0.16	0.13	0.18	0.14	0.52	0.08	0.14	0.17	0.16	0.19	0.26	0.20
C4	0.31	0.17	0.30	0.16	0.25	0.22	0.28	0.23	0.24	0.37	0.19	0.17	0.19	0.35	0.30	0.64	0.23	0.29	0.26	0.25	0.31	0.34	0.30
C4'	0.09	0.13	0.20	0.07	0.11	0.12	0.14	0.18	0.14	0.16	0.13	0.15	0.12	0.17	0.12	0.34	0.11	0.12	0.19	0.15	0.20	0.25	0.21
C5	0.22	0.15	0.25	0.13	0.18	0.17	0.21	0.20	0.18	0.29	0.15	0.18	0.16	0.27	0.23	0.55	0.21	0.22	0.24	0.19	0.29	0.34	0.30
C5'	0.06	0.12	0.11	0.04	0.07	0.09	0.10	0.18	0.10	0.13	0.10	0.17	0.11	0.15	0.07	0.16	0.09	0.06	0.21	0.13	0.18	0.23	0.20
C6	0.17	0.15	0.24	0.11	0.16	0.16	0.18	0.19	0.17	0.23	0.15	0.17	0.15	0.22	0.19	0.51	0.18	0.18	0.21	0.18	0.27	0.32	0.28
N1	0.19	0.13	0.27	0.11	0.17	0.17	0.19	0.20	0.17	0.24	0.14	0.13	0.14	0.23	0.20	0.57	0.17	0.20	0.21	0.18	0.27	0.32	0.27
N3	0.31	0.18	0.33	0.15	0.26	0.22	0.29	0.23	0.25	0.36	0.20	0.15	0.20	0.35	0.31	0.69	0.22	0.29	0.25	0.26	0.30	0.33	0.29
O2	0.27	0.16	0.33	0.12	0.23	0.20	0.25	0.21	0.23	0.31	0.18	0.12	0.18	0.29	0.27	0.68	0.18	0.25	0.23	0.23	0.28	0.32	0.27
O2'	0.15	0.16	0.30	0.10	0.16	0.14	0.17	0.17	0.17	0.19	0.16	0.18	0.15	0.19	0.16	0.55	0.10	0.17	0.18	0.18	0.23	0.30	0.24
O3'	0.14	0.18	0.29	0.10	0.16	0.13	0.17	0.13	0.17	0.19	0.17	0.20	0.17	0.20	0.16	0.48	0.11	0.16	0.17	0.18	0.17	0.25	0.19
O4	0.37	0.22	0.32	0.20	0.30	0.25	0.34	0.25	0.29	0.45	0.23	0.21	0.24	0.42	0.37	0.66	0.26	0.34	0.29	0.31	0.33	0.33	0.30
O4'	0.15	0.15	0.22	0.12	0.16	0.18	0.19	0.22	0.18	0.21	0.16	0.16	0.15	0.21	0.17	0.38	0.18	0.18	0.21	0.19	0.23	0.27	0.23
O5'	0.05	0.14	0.15	0.05	0.10	0.05	0.12	0.09	0.13	0.12	0.14	0.17	0.12	0.13	0.07	0.25	0.02	0.07	0.21	0.15	0.25	0.30	0.28
OP1	0.26	0.12	0.26	0.17	0.12	0.14	0.12	0.18	0.11	0.18	0.10	0.15	0.14	0.16	0.17	0.45	0.03	0.16	0.27	0.13	0.22	0.22	0.22
OP2	0.10	0.22	0.28	0.18	0.22	0.13	0.26	0.20	0.27	0.26	0.24	0.23	0.20	0.29	0.20	0.13	0.01	0.09	0.11	0.29	0.10	0.15	0.11
P	0.11	0.08	0.05	0.02	0.05	0.04	0.09	0.13	0.10	0.12	0.08	0.12	0.08	0.14	0.06	0.09	0.01	0.06	0.14	0.12	0.13	0.16	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.05
C2	0.02	0.00	0.20	0.09	0.01	0.13	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.25	0.17	0.21	0.15	0.01	0.17	0.14	0.16
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.03	0.10	0.07	0.14	0.14	0.24	0.20	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.05	0.25	0.15	0.22
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.10	0.01	0.14	0.02	0.14	0.14	0.12	0.07	0.08	0.15	0.10	0.02	0.01	0.01	0.12	0.15	0.14	0.14	0.16
C4	0.01	0.01	0.10	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.10	0.10	0.06	0.01	0.09	0.06	0.08
C4'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.03	0.14	0.08	0.18	0.13	0.11	0.04	0.17	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.14	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.05	0.03	0.07	0.01	0.10	0.07	0.08
C5'	0.03	0.19	0.10	0.02	0.09	0.00	0.06	0.00	0.08	0.15	0.14	0.25	0.18	0.12	0.04	0.07	0.15	0.01	0.01	0.07	0.06	0.04	0.03
C6	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.06	0.07	0.06	0.00	0.10	0.06	0.08
C8	0.01	0.01	0.14	0.14	0.00	0.14	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.31	0.05	0.16	0.16	0.01	0.16	0.15	0.13
N1	0.02	0.00	0.14	0.12	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.11	0.15	0.10	0.01	0.13	0.09	0.12
N2	0.03	0.00	0.24	0.07	0.01	0.18	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.34	0.21	0.26	0.21	0.01	0.22	0.20	0.21
N3	0.02	0.00	0.20	0.08	0.00	0.13	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.25	0.18	0.21	0.14	0.01	0.15	0.13	0.15
N7	0.01	0.01	0.09	0.15	0.01	0.11	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.05	0.11	0.14	0.01	0.17	0.14	0.14
N9	0.00	0.01	0.01	0.10	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.07	0.02	0.05	0.01	0.07	0.06	0.06
O2'	0.01	0.25	0.00	0.02	0.13	0.17	0.18	0.07	0.17	0.31	0.18	0.34	0.25	0.30	0.13	0.00	0.03	0.12	0.12	0.21	0.15	0.15	0.13
O3'	0.16	0.17	0.01	0.01	0.10	0.03	0.05	0.15	0.06	0.05	0.11	0.21	0.18	0.05	0.07	0.03	0.00	0.09	0.09	0.04	0.10	0.14	0.12
O4'	0.00	0.21	0.02	0.01	0.10	0.01	0.03	0.01	0.07	0.16	0.15	0.26	0.21	0.11	0.02	0.12	0.09	0.00	0.09	0.04	0.10	0.11	0.08
O5'	0.02	0.15	0.13	0.12	0.06	0.02	0.07	0.01	0.06	0.16	0.10	0.21	0.14	0.14	0.05	0.12	0.09	0.09	0.00	0.07	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.04	0.04	0.07	0.00	0.12	0.08	0.10
OP1	0.04	0.17	0.25	0.14	0.09	0.04	0.10	0.06	0.10	0.16	0.13	0.22	0.15	0.17	0.07	0.15	0.10	0.10	0.02	0.12	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.14	0.15	0.14	0.06	0.04	0.07	0.04	0.06	0.15	0.09	0.20	0.13	0.14	0.06	0.15	0.14	0.11	0.02	0.08	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.16	0.22	0.16	0.08	0.04	0.08	0.03	0.08	0.13	0.12	0.21	0.15	0.14	0.06	0.13	0.12	0.08	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00