Doublet Group distance statistics: 48588

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 2, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.011, 0.020, 0.029, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.020 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.027 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.021 std_dev=0.013
O4	A	0, 0.012, 0.027, 0.042, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.015
O2'	A	0, 0.028, 0.139, 0.249, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.139 std_dev=0.110
C2'	A	0, 0.006, 0.175, 0.344, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.175 std_dev=0.169
O4'	A	0, 0.003, 0.204, 0.405, 0.505 max_d=0.505 avg_d=0.204 std_dev=0.201
OP1	B	0, 0.153, 0.380, 0.607, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.380 std_dev=0.227
P	B	0, 0.135, 0.388, 0.642, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.388 std_dev=0.254
C3'	A	0, 0.021, 0.325, 0.628, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.325 std_dev=0.304
C4'	A	0, 0.018, 0.328, 0.638, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.328 std_dev=0.310
O5'	A	0, 0.032, 0.389, 0.746, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.389 std_dev=0.357
OP2	B	0, 0.099, 0.464, 0.830, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.464 std_dev=0.366
O5'	B	0, 0.161, 0.544, 0.926, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.544 std_dev=0.382
O3'	A	0, 0.044, 0.473, 0.902, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.473 std_dev=0.429
OP2	A	0, 0.113, 0.569, 1.025, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.569 std_dev=0.456
C5'	A	0, 0.027, 0.518, 1.010, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.518 std_dev=0.491
P	A	0, 0.018, 0.576, 1.134, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.576 std_dev=0.558
C3'	B	0, 0.096, 0.678, 1.261, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.678 std_dev=0.582
O3'	B	0, 0.025, 0.642, 1.260, 1.682 max_d=1.682 avg_d=0.642 std_dev=0.617
C5'	B	0, 0.057, 0.787, 1.517, 1.992 max_d=1.992 avg_d=0.787 std_dev=0.730
C4'	B	0, 0.093, 0.977, 1.861, 2.337 max_d=2.337 avg_d=0.977 std_dev=0.884
OP1	A	0, 0.065, 0.957, 1.850, 2.339 max_d=2.339 avg_d=0.957 std_dev=0.893
C2'	B	0, 0.138, 1.053, 1.969, 2.286 max_d=2.286 avg_d=1.053 std_dev=0.915
C8	B	0, 0.105, 1.173, 2.241, 2.457 max_d=2.457 avg_d=1.173 std_dev=1.068
O4'	B	0, 0.139, 1.268, 2.398, 2.845 max_d=2.845 avg_d=1.268 std_dev=1.130
O2'	B	0, 0.155, 1.324, 2.494, 2.974 max_d=2.974 avg_d=1.324 std_dev=1.169
C1'	B	0, 0.133, 1.365, 2.598, 3.003 max_d=3.003 avg_d=1.365 std_dev=1.232
N9	B	0, 0.101, 1.415, 2.728, 3.028 max_d=3.028 avg_d=1.415 std_dev=1.313
N7	B	0, 0.129, 1.449, 2.768, 3.014 max_d=3.014 avg_d=1.449 std_dev=1.319
C4	B	0, 0.134, 1.954, 3.774, 4.103 max_d=4.103 avg_d=1.954 std_dev=1.820
C5	B	0, 0.146, 1.984, 3.821, 4.147 max_d=4.147 avg_d=1.984 std_dev=1.837
N3	B	0, 0.168, 2.451, 4.734, 5.115 max_d=5.115 avg_d=2.451 std_dev=2.283
C6	B	0, 0.190, 2.609, 5.029, 5.454 max_d=5.454 avg_d=2.609 std_dev=2.420
O6	B	0, 0.230, 2.798, 5.366, 5.871 max_d=5.871 avg_d=2.798 std_dev=2.568
C2	B	0, 0.193, 3.014, 5.834, 6.263 max_d=6.263 avg_d=3.014 std_dev=2.821
N1	B	0, 0.201, 3.103, 6.004, 6.465 max_d=6.465 avg_d=3.103 std_dev=2.902
N2	B	0, 0.230, 3.588, 6.945, 7.422 max_d=7.422 avg_d=3.588 std_dev=3.357

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.06	0.03
C2	0.01	0.00	0.08	0.13	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.01	0.03	0.14	0.20	0.19	0.13
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.07	0.13	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.06	0.04	0.02
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.12	0.00	0.08	0.00	0.04	0.06	0.14	0.16	0.01	0.00	0.13	0.00	0.05	0.07	0.08	0.04
C4	0.02	0.01	0.04	0.12	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.15	0.01	0.02	0.20	0.28	0.30	0.21
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.06	0.05	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01
C5	0.03	0.02	0.02	0.08	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.01	0.05	0.19	0.23	0.25	0.18
C5'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.12	0.00	0.13	0.00	0.10	0.06	0.10	0.06	0.03	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01
C6	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.06	0.15	0.15	0.15	0.11
N1	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.11	0.13	0.13	0.09
N3	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.06	0.01	0.10	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.17	0.01	0.02	0.18	0.25	0.25	0.17
O2	0.02	0.01	0.13	0.16	0.02	0.05	0.03	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.18	0.02	0.04	0.13	0.19	0.18	0.12
O2'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.06	0.04	0.03
O3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.15	0.00	0.09	0.01	0.05	0.06	0.17	0.18	0.03	0.00	0.17	0.01	0.08	0.10	0.14	0.07
O4	0.01	0.01	0.04	0.13	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.17	0.00	0.02	0.22	0.33	0.35	0.24
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.06	0.03	0.07	0.04
O5'	0.05	0.14	0.02	0.05	0.20	0.01	0.19	0.00	0.15	0.11	0.18	0.13	0.02	0.08	0.22	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.20	0.06	0.07	0.28	0.03	0.23	0.02	0.15	0.13	0.25	0.19	0.06	0.10	0.33	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.19	0.04	0.08	0.30	0.01	0.25	0.01	0.15	0.13	0.25	0.18	0.04	0.14	0.35	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.13	0.02	0.04	0.21	0.01	0.18	0.01	0.11	0.09	0.17	0.12	0.03	0.07	0.24	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.76	2.16	0.64	0.29	1.44	0.31	1.27	0.11	1.61	0.44	2.06	2.39	1.87	0.62	0.89	0.64	0.08	0.54	0.09	1.41	0.16	0.11	0.10
C2	0.89	2.16	0.69	0.34	1.63	0.37	1.66	0.14	2.02	0.79	2.23	2.27	1.87	1.09	1.12	0.67	0.08	0.66	0.15	1.95	0.11	0.10	0.11
C2'	0.71	2.18	0.62	0.29	1.40	0.27	1.27	0.08	1.65	0.43	2.11	2.49	1.85	0.65	0.85	0.60	0.07	0.49	0.09	1.53	0.17	0.10	0.11
C3'	0.59	1.94	0.55	0.25	1.22	0.19	1.06	0.02	1.39	0.29	1.82	2.25	1.66	0.49	0.71	0.52	0.05	0.38	0.05	1.27	0.15	0.08	0.07
C4	0.72	1.48	0.54	0.28	1.24	0.30	1.29	0.11	1.44	0.77	1.52	1.53	1.34	1.02	0.94	0.49	0.08	0.56	0.16	1.39	0.09	0.14	0.11
C4'	0.55	1.81	0.52	0.21	1.10	0.18	0.87	0.04	1.15	0.18	1.60	2.13	1.58	0.32	0.62	0.54	0.04	0.36	0.06	0.99	0.16	0.13	0.10
C5	0.61	1.26	0.48	0.26	1.04	0.26	1.00	0.10	1.10	0.53	1.24	1.33	1.17	0.69	0.77	0.42	0.08	0.47	0.12	1.00	0.12	0.09	0.09
C5'	0.38	1.39	0.40	0.14	0.80	0.09	0.59	0.07	0.81	0.05	1.19	1.67	1.24	0.13	0.41	0.43	0.03	0.23	0.10	0.67	0.15	0.16	0.11
C6	0.65	1.49	0.54	0.28	1.16	0.27	1.05	0.09	1.20	0.43	1.43	1.59	1.37	0.60	0.80	0.48	0.06	0.48	0.08	1.05	0.15	0.09	0.08
N1	0.79	1.97	0.64	0.31	1.46	0.32	1.38	0.11	1.65	0.57	1.94	2.09	1.74	0.79	0.97	0.61	0.08	0.57	0.10	1.48	0.13	0.09	0.09
N3	0.87	1.90	0.66	0.33	1.52	0.36	1.61	0.14	1.88	0.88	1.99	1.97	1.68	1.20	1.10	0.62	0.09	0.66	0.18	1.87	0.09	0.13	0.12
O2	0.95	2.43	0.74	0.35	1.73	0.39	1.77	0.15	2.26	0.82	2.56	2.60	2.05	1.12	1.17	0.73	0.08	0.71	0.15	2.26	0.11	0.11	0.11
O2'	0.68	2.29	0.56	0.24	1.37	0.24	1.23	0.06	1.67	0.38	2.20	2.69	1.88	0.60	0.81	0.57	0.03	0.47	0.07	1.55	0.16	0.10	0.09
O3'	0.52	1.96	0.49	0.21	1.17	0.13	1.04	0.06	1.40	0.25	1.85	2.33	1.64	0.47	0.65	0.46	0.03	0.32	0.06	1.30	0.12	0.07	0.06
O4	0.66	1.28	0.48	0.25	1.10	0.27	1.17	0.10	1.30	0.77	1.34	1.33	1.17	1.00	0.86	0.43	0.07	0.52	0.16	1.29	0.10	0.19	0.12
O4'	0.69	1.93	0.62	0.26	1.25	0.28	0.98	0.11	1.24	0.27	1.70	2.17	1.74	0.39	0.75	0.64	0.08	0.48	0.09	1.01	0.18	0.15	0.11
O5'	0.25	1.12	0.30	0.11	0.64	0.02	0.47	0.15	0.66	0.12	0.97	1.34	0.99	0.09	0.29	0.29	0.01	0.11	0.16	0.55	0.17	0.20	0.16
OP1	0.05	0.84	0.13	0.01	0.40	0.14	0.27	0.26	0.45	0.22	0.72	1.07	0.71	0.12	0.10	0.13	0.01	0.08	0.23	0.37	0.22	0.23	0.21
OP2	0.11	0.54	0.02	0.07	0.22	0.28	0.17	0.41	0.28	0.34	0.46	0.69	0.44	0.24	0.10	0.04	0.01	0.24	0.36	0.24	0.27	0.31	0.31
P	0.05	0.74	0.11	0.02	0.36	0.13	0.24	0.24	0.39	0.24	0.63	0.93	0.64	0.14	0.09	0.10	0.01	0.07	0.22	0.32	0.19	0.21	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.06	0.10
C2	0.04	0.00	0.33	0.33	0.00	0.11	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.31	0.44	0.06	0.12	0.03	0.09	0.10	0.14
C2'	0.00	0.33	0.00	0.00	0.16	0.01	0.06	0.01	0.13	0.17	0.25	0.41	0.33	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.05	0.07	0.07
C3'	0.01	0.33	0.00	0.00	0.15	0.01	0.07	0.01	0.13	0.22	0.25	0.42	0.31	0.14	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.08	0.07	0.05
C4	0.01	0.00	0.16	0.15	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.18	0.05	0.11	0.01	0.10	0.08	0.13
C4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.11	0.08	0.15	0.10	0.09	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.04	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.04	0.13	0.00	0.13	0.12	0.16
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.08	0.12	0.09	0.12	0.09	0.12	0.06	0.03	0.02	0.01	0.00	0.10	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.13	0.13	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.13	0.18	0.05	0.13	0.01	0.14	0.15	0.18
C8	0.03	0.01	0.17	0.22	0.01	0.11	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.24	0.01	0.15	0.02	0.13	0.09	0.13
N1	0.03	0.01	0.25	0.25	0.02	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.24	0.34	0.06	0.13	0.02	0.12	0.13	0.16
N2	0.06	0.01	0.41	0.42	0.01	0.15	0.01	0.12	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.41	0.57	0.06	0.14	0.03	0.08	0.09	0.13
N3	0.04	0.01	0.33	0.31	0.00	0.10	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.39	0.06	0.12	0.02	0.08	0.07	0.12
N7	0.03	0.01	0.10	0.14	0.01	0.09	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.16	0.02	0.16	0.02	0.16	0.14	0.17
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.09	0.06	0.10
O2'	0.01	0.31	0.00	0.01	0.13	0.03	0.06	0.03	0.13	0.12	0.24	0.41	0.29	0.07	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.09	0.06	0.07	0.08
O3'	0.01	0.44	0.01	0.01	0.18	0.01	0.09	0.02	0.18	0.24	0.34	0.57	0.39	0.16	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.12	0.14	0.06	0.04
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.06	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.14	0.08	0.12
O5'	0.04	0.12	0.02	0.04	0.11	0.01	0.13	0.00	0.13	0.15	0.13	0.14	0.12	0.16	0.09	0.03	0.05	0.02	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01
O6	0.01	0.03	0.08	0.08	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.09	0.12	0.06	0.15	0.00	0.18	0.19	0.21
OP1	0.08	0.09	0.05	0.08	0.10	0.06	0.13	0.06	0.14	0.13	0.12	0.08	0.08	0.16	0.09	0.06	0.14	0.14	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.10	0.07	0.07	0.08	0.04	0.12	0.01	0.15	0.09	0.13	0.09	0.07	0.14	0.06	0.07	0.06	0.08	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.14	0.07	0.05	0.13	0.06	0.16	0.01	0.18	0.13	0.16	0.13	0.12	0.17	0.10	0.08	0.04	0.12	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00