Doublet Group distance statistics: 48590

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.004
O4	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.006, 0.015, 0.025, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.009, 0.023, 0.036, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.010, 0.024, 0.037, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.024 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.013, 0.032, 0.050, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.032 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.018, 0.042, 0.066, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.042 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.074, 0.198, 0.322, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.198 std_dev=0.124
C2'	A	0, 0.089, 0.247, 0.406, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.247 std_dev=0.159
O2'	A	0, 0.075, 0.283, 0.490, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.283 std_dev=0.207
C3'	A	0, 0.129, 0.365, 0.601, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.365 std_dev=0.236
C4'	A	0, 0.091, 0.332, 0.573, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.332 std_dev=0.241
P	A	0, 0.178, 0.462, 0.746, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.462 std_dev=0.284
OP2	A	0, 0.225, 0.537, 0.849, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.537 std_dev=0.312
O3'	B	0, 0.266, 0.632, 0.998, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.632 std_dev=0.366
O3'	A	0, 0.215, 0.584, 0.954, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.584 std_dev=0.370
O5'	B	0, 0.260, 0.637, 1.014, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.637 std_dev=0.377
P	B	0, 0.166, 0.553, 0.939, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.553 std_dev=0.387
OP1	A	0, 0.303, 0.717, 1.132, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.717 std_dev=0.415
O5'	A	0, 0.070, 0.505, 0.940, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.505 std_dev=0.435
C5'	A	0, 0.167, 0.617, 1.067, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.617 std_dev=0.450
OP1	B	0, 0.095, 0.551, 1.007, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.551 std_dev=0.456
OP2	B	0, 0.337, 0.800, 1.262, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.800 std_dev=0.463
C3'	B	0, 0.226, 0.699, 1.171, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.699 std_dev=0.472
C4'	B	0, 0.366, 0.882, 1.397, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.882 std_dev=0.516
C5'	B	0, 0.379, 0.903, 1.426, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.903 std_dev=0.523
O4'	B	0, 0.408, 1.022, 1.636, 1.519 max_d=1.519 avg_d=1.022 std_dev=0.614
C1'	B	0, 0.448, 1.097, 1.746, 1.594 max_d=1.594 avg_d=1.097 std_dev=0.649
C2'	B	0, 0.318, 1.049, 1.781, 2.068 max_d=2.068 avg_d=1.049 std_dev=0.731
N9	B	0, 0.256, 1.109, 1.962, 1.956 max_d=1.956 avg_d=1.109 std_dev=0.853
N3	B	0, 0.542, 1.442, 2.343, 2.221 max_d=2.221 avg_d=1.442 std_dev=0.900
C8	B	0, 0.237, 1.197, 2.157, 2.156 max_d=2.156 avg_d=1.197 std_dev=0.960
C4	B	0, 0.345, 1.311, 2.276, 2.255 max_d=2.255 avg_d=1.311 std_dev=0.965
C2	B	0, 0.633, 1.666, 2.700, 2.549 max_d=2.549 avg_d=1.666 std_dev=1.034
N2	B	0, 0.766, 1.836, 2.906, 2.587 max_d=2.587 avg_d=1.836 std_dev=1.070
N7	B	0, 0.402, 1.494, 2.585, 2.556 max_d=2.556 avg_d=1.494 std_dev=1.092
C5	B	0, 0.380, 1.507, 2.633, 2.612 max_d=2.612 avg_d=1.507 std_dev=1.127
O2'	B	0, 0.337, 1.492, 2.647, 3.245 max_d=3.245 avg_d=1.492 std_dev=1.155
N1	B	0, 0.652, 1.844, 3.036, 2.916 max_d=2.916 avg_d=1.844 std_dev=1.192
C6	B	0, 0.595, 1.841, 3.086, 3.004 max_d=3.004 avg_d=1.841 std_dev=1.245
O6	B	0, 0.752, 2.132, 3.512, 3.373 max_d=3.373 avg_d=2.132 std_dev=1.380

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.31	0.13	0.25	0.11
C2	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.03	0.01	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.02	0.01	0.01	0.40	0.09	0.24	0.11
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01	0.12	0.05	0.28	0.04
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.04	0.06	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.33	0.10
C4	0.02	0.02	0.03	0.07	0.00	0.11	0.00	0.28	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.44	0.13	0.21	0.09
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.11	0.00	0.13	0.00	0.12	0.06	0.07	0.03	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.16	0.37	0.04
C5	0.01	0.01	0.01	0.10	0.00	0.13	0.00	0.31	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.00	0.02	0.45	0.08	0.22	0.10
C5'	0.05	0.15	0.01	0.01	0.28	0.00	0.31	0.00	0.27	0.16	0.21	0.08	0.04	0.07	0.29	0.02	0.01	0.34	0.44	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.09	0.01	0.12	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.02	0.45	0.06	0.24	0.12
N1	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.41	0.08	0.24	0.12
N3	0.00	0.00	0.04	0.04	0.00	0.07	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.42	0.11	0.23	0.09
O2	0.02	0.00	0.09	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.08	0.01	0.00	0.37	0.10	0.24	0.11
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.04	0.00	0.04	0.01	0.02	0.06	0.12	0.00	0.04	0.03	0.03	0.03	0.05	0.31	0.08
O3'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.08	0.07	0.08	0.03	0.01	0.08	0.04	0.00	0.05	0.01	0.25	0.14	0.32	0.22
O4	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.29	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.43	0.17	0.19	0.08
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.34	0.27	0.22	0.17
O5'	0.31	0.40	0.12	0.01	0.44	0.01	0.45	0.01	0.45	0.41	0.42	0.37	0.03	0.25	0.43	0.34	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.13	0.09	0.05	0.05	0.13	0.16	0.08	0.34	0.06	0.08	0.11	0.10	0.05	0.14	0.17	0.27	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.25	0.24	0.28	0.33	0.21	0.37	0.22	0.44	0.24	0.24	0.23	0.24	0.31	0.32	0.19	0.22	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.11	0.04	0.10	0.09	0.04	0.10	0.01	0.12	0.12	0.09	0.11	0.08	0.22	0.08	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.51	0.41	0.73	0.43	0.30	0.25	0.13	0.18	0.12	0.11	0.25	0.52	0.46	0.14	0.28	1.17	0.29	0.28	0.26	0.12	0.13	0.22	0.21
C2	0.45	0.31	0.75	0.46	0.22	0.26	0.08	0.20	0.08	0.09	0.15	0.41	0.36	0.17	0.22	1.07	0.28	0.24	0.30	0.17	0.22	0.32	0.28
C2'	0.35	0.32	0.49	0.24	0.18	0.10	0.09	0.26	0.09	0.14	0.18	0.45	0.35	0.21	0.15	0.88	0.11	0.13	0.17	0.15	0.08	0.17	0.13
C3'	0.22	0.24	0.30	0.09	0.09	0.11	0.15	0.37	0.12	0.26	0.10	0.37	0.25	0.31	0.07	0.65	0.01	0.02	0.19	0.22	0.17	0.21	0.17
C4	0.31	0.12	0.65	0.43	0.05	0.24	0.15	0.21	0.18	0.16	0.04	0.22	0.19	0.28	0.07	0.83	0.25	0.18	0.27	0.31	0.22	0.29	0.26
C4'	0.31	0.29	0.39	0.13	0.14	0.05	0.13	0.32	0.11	0.23	0.14	0.43	0.32	0.29	0.11	0.88	0.09	0.08	0.19	0.21	0.19	0.24	0.18
C5	0.31	0.12	0.63	0.43	0.05	0.25	0.16	0.21	0.19	0.18	0.05	0.22	0.18	0.30	0.06	0.81	0.26	0.19	0.24	0.31	0.16	0.20	0.20
C5'	0.21	0.23	0.27	0.01	0.07	0.14	0.22	0.48	0.19	0.38	0.07	0.39	0.26	0.44	0.11	0.77	0.11	0.04	0.38	0.30	0.45	0.50	0.43
C6	0.40	0.22	0.69	0.45	0.13	0.26	0.08	0.20	0.10	0.12	0.05	0.32	0.28	0.23	0.14	0.95	0.30	0.22	0.25	0.22	0.13	0.19	0.19
N1	0.46	0.31	0.74	0.46	0.22	0.26	0.07	0.19	0.07	0.08	0.15	0.42	0.37	0.16	0.22	1.08	0.30	0.25	0.28	0.16	0.17	0.26	0.24
N3	0.38	0.21	0.71	0.45	0.13	0.24	0.09	0.20	0.11	0.10	0.07	0.31	0.27	0.22	0.15	0.96	0.26	0.20	0.30	0.24	0.24	0.34	0.29
O2	0.49	0.38	0.78	0.47	0.28	0.26	0.13	0.20	0.12	0.11	0.23	0.48	0.42	0.15	0.27	1.14	0.28	0.26	0.32	0.15	0.23	0.35	0.30
O2'	0.37	0.37	0.47	0.20	0.23	0.09	0.12	0.25	0.12	0.12	0.24	0.50	0.39	0.17	0.19	0.92	0.07	0.14	0.16	0.13	0.07	0.16	0.13
O3'	0.10	0.17	0.11	0.08	0.08	0.22	0.21	0.46	0.17	0.34	0.08	0.32	0.18	0.38	0.13	0.38	0.18	0.11	0.26	0.26	0.22	0.26	0.23
O4	0.26	0.06	0.61	0.40	0.04	0.22	0.20	0.21	0.24	0.20	0.11	0.15	0.12	0.32	0.04	0.73	0.22	0.17	0.25	0.37	0.23	0.29	0.25
O4'	0.56	0.42	0.76	0.45	0.31	0.28	0.14	0.14	0.13	0.13	0.26	0.54	0.48	0.15	0.31	1.26	0.36	0.33	0.24	0.13	0.09	0.16	0.16
O5'	0.24	0.12	0.21	0.16	0.05	0.11	0.08	0.11	0.08	0.12	0.01	0.19	0.16	0.17	0.05	0.40	0.02	0.15	0.23	0.14	0.27	0.20	0.25
OP1	0.19	0.45	0.02	0.01	0.23	0.16	0.10	0.41	0.18	0.11	0.34	0.60	0.43	0.09	0.10	0.01	0.01	0.02	0.21	0.11	0.28	0.21	0.23
OP2	0.07	0.09	0.05	0.06	0.20	0.13	0.36	0.42	0.33	0.49	0.19	0.14	0.08	0.52	0.25	0.03	0.01	0.13	0.33	0.42	0.35	0.43	0.34
P	0.14	0.19	0.03	0.02	0.05	0.08	0.09	0.29	0.06	0.22	0.08	0.30	0.20	0.23	0.03	0.07	0.00	0.05	0.15	0.12	0.13	0.16	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.20	0.01	0.11	0.01	0.12	0.12	0.13
C2	0.01	0.00	0.17	0.12	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.21	0.08	0.30	0.01	0.34	0.49	0.39
C2'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.07	0.00	0.03	0.14	0.04	0.14	0.11	0.22	0.18	0.10	0.03	0.00	0.02	0.02	0.28	0.03	0.31	0.35	0.31
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.14	0.00	0.18	0.01	0.18	0.19	0.15	0.10	0.10	0.21	0.13	0.02	0.00	0.01	0.15	0.20	0.15	0.11	0.15
C4	0.01	0.00	0.07	0.14	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.12	0.04	0.32	0.01	0.36	0.46	0.40
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.05	0.12	0.02	0.04	0.02	0.11	0.06	0.22	0.01	0.01	0.02	0.07	0.07	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.18	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.28	0.04	0.02	0.42	0.01	0.50	0.62	0.52
C5'	0.02	0.03	0.14	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.09	0.14	0.06	0.03	0.02	0.15	0.07	0.06	0.11	0.02	0.01	0.11	0.16	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.18	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.27	0.07	0.03	0.43	0.00	0.53	0.67	0.56
C8	0.00	0.01	0.14	0.19	0.00	0.12	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.30	0.05	0.06	0.44	0.01	0.48	0.51	0.49
N1	0.01	0.00	0.11	0.15	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.14	0.07	0.37	0.00	0.45	0.60	0.49
N2	0.02	0.00	0.22	0.10	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.27	0.10	0.26	0.01	0.29	0.46	0.35
N3	0.01	0.00	0.18	0.10	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.22	0.08	0.26	0.01	0.28	0.40	0.33
N7	0.00	0.00	0.10	0.21	0.00	0.11	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.05	0.04	0.48	0.01	0.58	0.68	0.59
N9	0.00	0.00	0.03	0.13	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.08	0.01	0.30	0.01	0.32	0.36	0.34
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.17	0.22	0.28	0.06	0.27	0.30	0.19	0.13	0.10	0.34	0.18	0.00	0.06	0.17	0.23	0.32	0.30	0.44	0.29
O3'	0.20	0.21	0.02	0.00	0.12	0.01	0.04	0.11	0.07	0.05	0.14	0.27	0.22	0.05	0.08	0.06	0.00	0.14	0.11	0.04	0.07	0.08	0.09
O4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.07	0.10	0.08	0.04	0.01	0.17	0.14	0.00	0.23	0.02	0.26	0.22	0.25
O5'	0.11	0.30	0.28	0.15	0.32	0.02	0.42	0.01	0.43	0.44	0.37	0.26	0.26	0.48	0.30	0.23	0.11	0.23	0.00	0.47	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.20	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.32	0.04	0.02	0.47	0.00	0.61	0.76	0.62
OP1	0.12	0.34	0.31	0.15	0.36	0.07	0.50	0.16	0.53	0.48	0.45	0.29	0.28	0.58	0.32	0.30	0.07	0.26	0.02	0.61	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.49	0.35	0.11	0.46	0.02	0.62	0.03	0.67	0.51	0.60	0.46	0.40	0.68	0.36	0.44	0.08	0.22	0.01	0.76	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.39	0.31	0.15	0.40	0.02	0.52	0.02	0.56	0.49	0.49	0.35	0.33	0.59	0.34	0.29	0.09	0.25	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00