Doublet Group distance statistics: 48614

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 6, 5, 11, 11, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.006, 0.010, 0.015, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.013 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.009, 0.034, 0.059, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.034 std_dev=0.025
O4	A	0, 0.009, 0.073, 0.138, 0.314 max_d=0.314 avg_d=0.073 std_dev=0.065
P	B	0, 0.255, 0.401, 0.548, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.401 std_dev=0.147
OP2	B	0, 0.268, 0.437, 0.607, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.437 std_dev=0.170
O5'	B	0, 0.198, 0.434, 0.670, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.434 std_dev=0.236
C4'	B	0, 0.191, 0.439, 0.687, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.439 std_dev=0.248
O4'	A	0, -0.128, 0.120, 0.369, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.120 std_dev=0.249
OP1	B	0, 0.209, 0.466, 0.722, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.466 std_dev=0.256
C2'	A	0, -0.129, 0.132, 0.392, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.132 std_dev=0.261
C3'	B	0, 0.113, 0.393, 0.674, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.393 std_dev=0.281
C5'	B	0, 0.174, 0.458, 0.741, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.458 std_dev=0.283
O3'	B	0, 0.020, 0.437, 0.853, 2.318 max_d=2.318 avg_d=0.437 std_dev=0.416
C4'	A	0, -0.220, 0.198, 0.615, 2.199 max_d=2.199 avg_d=0.198 std_dev=0.417
C2'	B	0, 0.017, 0.451, 0.885, 2.070 max_d=2.070 avg_d=0.451 std_dev=0.434
O2'	A	0, -0.221, 0.215, 0.652, 1.974 max_d=1.974 avg_d=0.215 std_dev=0.437
O4'	B	0, 0.082, 0.524, 0.965, 2.178 max_d=2.178 avg_d=0.524 std_dev=0.441
C3'	A	0, -0.236, 0.216, 0.669, 2.160 max_d=2.160 avg_d=0.216 std_dev=0.452
O2'	B	0, 0.034, 0.500, 0.966, 2.219 max_d=2.219 avg_d=0.500 std_dev=0.466
O5'	A	0, -0.161, 0.319, 0.800, 2.443 max_d=2.443 avg_d=0.319 std_dev=0.481
P	A	0, -0.110, 0.404, 0.919, 2.783 max_d=2.783 avg_d=0.404 std_dev=0.514
C5'	A	0, -0.249, 0.309, 0.867, 2.894 max_d=2.894 avg_d=0.309 std_dev=0.558
OP2	A	0, -0.143, 0.424, 0.991, 2.767 max_d=2.767 avg_d=0.424 std_dev=0.567
C1'	B	0, -0.059, 0.525, 1.108, 2.898 max_d=2.898 avg_d=0.525 std_dev=0.584
OP1	A	0, -0.152, 0.509, 1.171, 3.590 max_d=3.590 avg_d=0.509 std_dev=0.662
O3'	A	0, -0.362, 0.333, 1.028, 3.028 max_d=3.028 avg_d=0.333 std_dev=0.695
C8	B	0, -0.327, 0.586, 1.499, 4.541 max_d=4.541 avg_d=0.586 std_dev=0.913
N9	B	0, -0.341, 0.578, 1.497, 4.483 max_d=4.483 avg_d=0.578 std_dev=0.919
N7	B	0, -0.630, 0.673, 1.976, 6.336 max_d=6.336 avg_d=0.673 std_dev=1.303
C4	B	0, -0.690, 0.665, 2.020, 6.460 max_d=6.460 avg_d=0.665 std_dev=1.355
N3	B	0, -0.817, 0.711, 2.238, 7.274 max_d=7.274 avg_d=0.711 std_dev=1.528
C5	B	0, -0.871, 0.722, 2.316, 7.612 max_d=7.612 avg_d=0.722 std_dev=1.594
C2	B	0, -1.167, 0.808, 2.784, 9.321 max_d=9.321 avg_d=0.808 std_dev=1.975
C6	B	0, -1.233, 0.835, 2.903, 9.780 max_d=9.780 avg_d=0.835 std_dev=2.068
N1	B	0, -1.382, 0.871, 3.123, 10.561 max_d=10.561 avg_d=0.871 std_dev=2.253
N6	B	0, -1.418, 0.928, 3.274, 11.122 max_d=11.122 avg_d=0.928 std_dev=2.346

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.16	0.01	0.00	0.09	0.09	0.27	0.11
C2	0.01	0.00	0.10	0.14	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.07	0.01	0.06	0.12	0.07	0.22	0.08
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.09	0.09	0.02	0.08	0.18	0.00	0.02	0.06	0.01	0.21	0.25	0.38	0.25
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.23	0.00	0.24	0.02	0.20	0.14	0.18	0.11	0.02	0.01	0.24	0.01	0.13	0.12	0.14	0.07
C4	0.01	0.01	0.05	0.23	0.00	0.10	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.14	0.00	0.02	0.23	0.17	0.22	0.17
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.13	0.06	0.05	0.05	0.16	0.02	0.10	0.00	0.01	0.06	0.18	0.04
C5	0.01	0.01	0.08	0.24	0.00	0.13	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.18	0.01	0.05	0.25	0.18	0.20	0.18
C5'	0.04	0.05	0.09	0.02	0.13	0.01	0.17	0.00	0.15	0.06	0.08	0.07	0.07	0.10	0.14	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.20	0.00	0.13	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.15	0.01	0.07	0.20	0.11	0.16	0.11
N1	0.00	0.01	0.02	0.14	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.06	0.01	0.01	0.12	0.06	0.21	0.07
N3	0.01	0.00	0.08	0.18	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.07	0.01	0.05	0.17	0.12	0.22	0.12
O2	0.03	0.01	0.18	0.11	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.12	0.17	0.01	0.10	0.09	0.08	0.25	0.09
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.18	0.16	0.20	0.07	0.18	0.10	0.13	0.12	0.00	0.06	0.19	0.12	0.15	0.20	0.40	0.20
O3'	0.16	0.07	0.02	0.01	0.14	0.02	0.18	0.10	0.15	0.06	0.07	0.17	0.06	0.00	0.17	0.10	0.19	0.21	0.14	0.17
O4	0.01	0.01	0.06	0.24	0.00	0.10	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.17	0.00	0.02	0.25	0.21	0.26	0.21
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.05	0.10	0.12	0.10	0.02	0.00	0.07	0.07	0.27	0.11
O5'	0.09	0.12	0.21	0.13	0.23	0.01	0.25	0.01	0.20	0.12	0.17	0.09	0.15	0.19	0.25	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.07	0.25	0.12	0.17	0.06	0.18	0.07	0.11	0.06	0.12	0.08	0.20	0.21	0.21	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	0.22	0.38	0.14	0.22	0.18	0.20	0.13	0.16	0.21	0.22	0.25	0.40	0.14	0.26	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.08	0.25	0.07	0.17	0.04	0.18	0.01	0.11	0.07	0.12	0.09	0.20	0.17	0.21	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.52	1.64	0.41	0.11	1.20	0.12	1.30	0.27	1.56	0.78	1.72	1.37	1.59	1.04	0.84	0.31	0.08	0.28	0.11	0.24	0.10	0.11
C2	0.53	1.76	0.33	0.11	1.31	0.12	1.51	0.30	1.85	0.89	1.97	1.42	1.96	1.23	0.90	0.21	0.09	0.30	0.12	0.25	0.09	0.11
C2'	0.31	1.47	0.26	0.12	1.00	0.27	1.13	0.42	1.43	0.60	1.59	1.16	1.51	0.88	0.63	0.21	0.16	0.11	0.17	0.26	0.14	0.15
C3'	0.36	1.26	0.36	0.12	0.93	0.09	1.05	0.17	1.27	0.65	1.37	1.03	1.35	0.88	0.65	0.26	0.12	0.16	0.23	0.19	0.33	0.24
C4	0.46	1.41	0.25	0.14	1.15	0.15	1.38	0.31	1.63	0.86	1.61	1.16	1.76	1.20	0.82	0.16	0.15	0.28	0.14	0.26	0.11	0.12
C4'	0.36	1.10	0.36	0.10	0.82	0.07	0.88	0.13	1.05	0.55	1.15	0.93	1.09	0.72	0.58	0.27	0.09	0.19	0.18	0.17	0.28	0.18
C5	0.44	1.25	0.28	0.16	1.06	0.15	1.23	0.31	1.39	0.80	1.39	1.07	1.45	1.07	0.78	0.20	0.17	0.26	0.13	0.25	0.09	0.11
C5'	0.20	0.69	0.26	0.11	0.52	0.11	0.58	0.14	0.69	0.37	0.74	0.58	0.73	0.49	0.37	0.20	0.13	0.12	0.23	0.18	0.36	0.23
C6	0.48	1.36	0.36	0.15	1.12	0.14	1.23	0.29	1.41	0.79	1.47	1.18	1.44	1.03	0.81	0.25	0.14	0.27	0.11	0.24	0.09	0.11
N1	0.52	1.62	0.37	0.12	1.24	0.13	1.37	0.29	1.64	0.83	1.75	1.36	1.68	1.11	0.87	0.26	0.10	0.28	0.11	0.25	0.09	0.11
N3	0.51	1.64	0.28	0.12	1.27	0.14	1.51	0.31	1.85	0.90	1.89	1.33	2.00	1.26	0.88	0.17	0.12	0.30	0.13	0.26	0.10	0.12
O2	0.55	1.88	0.34	0.10	1.34	0.12	1.54	0.30	1.94	0.90	2.11	1.49	2.07	1.24	0.92	0.22	0.09	0.31	0.12	0.25	0.09	0.11
O2'	0.41	1.69	0.37	0.08	1.13	0.24	1.24	0.45	1.58	0.66	1.79	1.36	1.64	0.94	0.73	0.35	0.11	0.15	0.22	0.39	0.24	0.27
O3'	0.37	1.23	0.37	0.16	0.90	0.10	1.01	0.16	1.23	0.62	1.34	1.00	1.32	0.84	0.63	0.29	0.19	0.19	0.26	0.19	0.42	0.28
O4	0.42	1.29	0.20	0.15	1.05	0.17	1.31	0.31	1.55	0.83	1.50	1.06	1.73	1.18	0.76	0.14	0.16	0.28	0.17	0.26	0.14	0.14
O4'	0.50	1.34	0.44	0.15	1.02	0.12	1.06	0.18	1.24	0.67	1.36	1.17	1.24	0.85	0.74	0.32	0.11	0.30	0.15	0.22	0.19	0.15
O5'	0.14	0.61	0.20	0.04	0.48	0.11	0.55	0.14	0.66	0.35	0.68	0.51	0.71	0.48	0.32	0.22	0.01	0.07	0.22	0.22	0.39	0.28
OP1	0.14	0.12	0.07	0.02	0.08	0.08	0.16	0.13	0.21	0.11	0.18	0.08	0.27	0.18	0.04	0.09	0.02	0.16	0.28	0.27	0.49	0.33
OP2	0.11	0.33	0.10	0.04	0.26	0.22	0.36	0.20	0.44	0.23	0.42	0.25	0.51	0.35	0.15	0.11	0.02	0.20	0.31	0.31	0.53	0.38
P	0.08	0.27	0.09	0.01	0.21	0.12	0.29	0.11	0.35	0.19	0.34	0.20	0.41	0.28	0.12	0.11	0.00	0.13	0.26	0.25	0.45	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.13	0.00	0.09	0.20	0.11	0.06
C2	0.04	0.00	0.13	0.18	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.08	0.04	0.21	0.36	0.13	0.27
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.08	0.07	0.05	0.11	0.13	0.07	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.19	0.08	0.07
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.16	0.00	0.19	0.02	0.21	0.14	0.20	0.15	0.22	0.18	0.12	0.02	0.00	0.01	0.14	0.19	0.22	0.17
C4	0.02	0.01	0.07	0.16	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.05	0.02	0.21	0.33	0.12	0.22
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.08	0.07	0.07	0.06	0.09	0.07	0.04	0.14	0.01	0.00	0.01	0.16	0.10	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.19	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.09	0.02	0.25	0.40	0.16	0.28
C5'	0.04	0.08	0.08	0.02	0.08	0.00	0.11	0.00	0.11	0.10	0.10	0.07	0.13	0.12	0.07	0.07	0.09	0.01	0.01	0.15	0.16	0.01
C6	0.03	0.00	0.07	0.21	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.12	0.02	0.26	0.44	0.17	0.32
C8	0.01	0.01	0.05	0.14	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.07	0.03	0.24	0.32	0.15	0.19
N1	0.04	0.00	0.11	0.20	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.10	0.03	0.24	0.41	0.15	0.31
N3	0.04	0.00	0.13	0.15	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.07	0.04	0.19	0.31	0.11	0.22
N6	0.03	0.01	0.07	0.22	0.01	0.09	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.17	0.15	0.03	0.28	0.49	0.20	0.36
N7	0.01	0.01	0.04	0.18	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.11	0.02	0.27	0.40	0.17	0.27
N9	0.00	0.02	0.01	0.12	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.03	0.01	0.18	0.27	0.11	0.16
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.13	0.14	0.15	0.07	0.17	0.10	0.18	0.16	0.17	0.13	0.09	0.00	0.05	0.11	0.08	0.19	0.15	0.09
O3'	0.13	0.08	0.02	0.00	0.05	0.01	0.09	0.09	0.12	0.07	0.10	0.07	0.15	0.11	0.03	0.05	0.00	0.10	0.21	0.22	0.34	0.24
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.11	0.10	0.00	0.11	0.19	0.15	0.06
O5'	0.09	0.21	0.07	0.14	0.21	0.01	0.25	0.01	0.26	0.24	0.24	0.19	0.28	0.27	0.18	0.08	0.21	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.20	0.36	0.19	0.19	0.33	0.16	0.40	0.15	0.44	0.32	0.41	0.31	0.49	0.40	0.27	0.19	0.22	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.13	0.08	0.22	0.12	0.10	0.16	0.16	0.17	0.15	0.15	0.11	0.20	0.17	0.11	0.15	0.34	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.27	0.07	0.17	0.22	0.04	0.28	0.01	0.32	0.19	0.31	0.22	0.36	0.27	0.16	0.09	0.24	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00